result

Gene information

Detail information of AfisC1G00834

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G00834	chr1	136372252	136389123	+

Sequences

CDS

>AfisC1G00834
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Protein

Gene

>AfisC1G00834
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Swissprot	O82175.1	4.0e-111	Suppressor of variegation 3-9 homolog protein 5
trEMBL	A0A6J0PHE2	1.8e-140	histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH6

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G35160.1	47.55	3e-111	399	SGD9;SUVH5	SU(VAR)3-9 homolog 5

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G00834	AT2G35160.1	469	192	11	286	728	354	794	47.55	3e-111	399
AfisC1G00834	AT2G22740.1	477	217	11	286	728	319	790	46.33	4e-109	392
AfisC1G00834	AT2G22740.2	477	217	11	286	728	319	790	46.33	4e-109	392

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02182.14	SAD_SRA	Domain	296	432	111.8	2.1e-32
PF05033.13	Pre-SET	Family	451	548	60.6	1.6e-16
PF00856.25	SET	Family	567	698	80.2	2e-22

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0006260	P	DNA replication
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000790	C	nuclear chromatin
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0004518	F	nuclease activity
GO:0006302	P	double-strand break repair
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GO:0007154	P	cell communication
GO:0007275	P	multicellular organism development
GO:0010200	P	response to chitin
GO:0010216	P	maintenance of DNA methylation
GO:0018024	F	histone-lysine N-methyltransferase activity
GO:0018027	P	peptidyl-lysine dimethylation
GO:0031048	P	chromatin silencing by small RNA
GO:0034968	P	histone lysine methylation
GO:0051052	P	regulation of DNA metabolic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K11420	EHMT; [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT	EC:2.1.1.355	Lysine degradation	ko00310
K11420	EHMT; [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT	EC:2.1.1.355	Longevity regulating pathway	ko04211

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network