result

Gene information

Detail information of AfisC1G08221

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G08221	chr1	1502274100	1502287417	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC1G08221
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	THU58099.1	3.4e-44	hypothetical protein C4D60_Mb03t10610
Swissprot	Q9LMN8.2	5.8e-33	Wall-associated receptor kinase 3
trEMBL	A0A1U8A4T1	6.0e-43	putative wall-associated receptor kinase-like 16

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G79680.1	44.94	2e-35	145	ATWAKL10;WAKL10	WALL ASSOCIATED KINASE (WAK)-LIKE 10

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G08221	AT1G79680.1	178	92	2	6	177	533	710	44.94	2e-35	145
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AfisC1G08221	AT1G21230.1	177	90	2	5	175	506	682	45.76	2e-34	142

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	9	169	92.2	3e-26

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0009311	P	oligosaccharide metabolic process
GO:0009620	P	response to fungus
GO:0009751	P	response to salicylic acid
GO:0009826	P	unidimensional cell growth
GO:0009992	P	cellular water homeostasis
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048527	P	lateral root development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network