result

Gene information

Detail information of AfisC1G09159

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G09159	chr1	1684420534	1684431527	-

Sequences

CDS

>AfisC1G09159
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Protein

Gene

>AfisC1G09159
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020271978.1	9.9e-184	probable inactive histone-lysine N-methyltransferase SUVR1 isoform X1
Swissprot	Q8W595.2	1.7e-127	Suppressor of variegation 3-9-related protein 4
trEMBL	A0A5P1EDL7	7.1e-184	SET domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G04380.1	55.64	3e-131	466	SDG31;SUVR4	SET-domain containing protein lysine methyltransferase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G09159	AT3G04380.1	399	154	5	304	682	78	473	55.64	3e-131	466
AfisC1G09159	AT3G04380.2	330	121	2	353	682	119	446	62.73	1e-130	464
AfisC1G09159	AT5G43990.2	727	381	16	10	682	32	739	37.55	3e-126	449

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF10440.6	WIYLD	Domain	7	61	57.7	6.7e-16
PF05033.13	Pre-SET	Family	354	502	50.3	2.8e-13
PF00856.25	SET	Family	522	644	59.5	4.8e-16

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000122	P	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0000183	P	chromatin silencing at rDNA
GO:0000228	C	nuclear chromosome
GO:0000793	C	condensed chromosome
GO:0000976	F	transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0003682	F	chromatin binding
GO:0004518	F	nuclease activity
GO:0005677	C	chromatin silencing complex
GO:0006302	P	double-strand break repair
GO:0007049	P	cell cycle
GO:0018027	P	peptidyl-lysine dimethylation
GO:0033553	C	rDNA heterochromatin
GO:0046974	F	histone methyltransferase activity (H3-K9 specific)
GO:0047485	F	protein N-terminus binding
GO:0048511	P	rhythmic process
GO:0051567	P	histone H3-K9 methylation
GO:0071456	P	cellular response to hypoxia

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network