result

Gene information

Detail information of AfisC2G07286

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G07286	chr2	1171411542	1171420270	-

Sequences

CDS

>AfisC2G07286
ATGGCCTGTTTTCCATGTTTTGATTCCAGAGAGGAAGAAACTTTGAATCCTAAGAGCAATGGGAAGGGCGATGATAGAAGAGAAGAACAGCCTATGGTTGCTCCCAGAATGGAGCGATTGCCTTCGGGACTTGCAAAGACAACATCAAGAGGTAATTTGAGCGGCAGGAAAGAATCGATATTTCCAAAAGAGGGTTCGGGTGTTAATATATCTTCCCAAACTTTCACATATCGAGAGCTTGCAATTGCTACTAAAAATTTCAGACCTGAATCCTTTATCGGGGAAGGTGGATTTGGTAGGGTTTATAAAGGGAGACTTGAAAGCACAGGACAGGCTGTGGCTGTAAAGCAGCTTGATAGGAATGGGTTACAGGGGAACAGAGAATTTCTGGTGGAGGTTCTGATGCTCAGTCTATTGCATCATACCAATCTTGTTAATTTAATTGGCTATTGCGCTGATGGAGATCAGCGTCTACTTGTGTATGAGTTTATGCCGTTGGGATCTTTAGAAGATCATTTGCATGATCTTCCACCCGATAAGGAACCATTAGATTGGAATACAAGAATGAAGATAGCAGCAGGTGCAGCAAAAGGATTAGAATATCTGCATGATATAGCAAACCCACCCGTTATATACAGAGATTTTAAATCGTCCAATATATTATTGGATGAAGGGTTTCACCCCAAACTCTCTGATTTTGGTCTTGCTAAGCTTGGTCCTACAGGTGATAAATCTCATGTATCAACGCGAGTGATGGGAACTTATGGGTACTGTGCTCCTGAGTATGCTATGACGGGTCAACTCACTGTTAAATCTGATGTTTATAGTTTTGGAGTTGTTTTCCTGGAGCTGATCACGGGTAGGAAAGCCATTGATAGCACCAAATCTCATGGAGAGCAAAATCTTGTTAATTGGGCTCGACCAATGTTCAACGATCGAAGAAAGCTGTCACAGCTAGCAGACCCAGGCCTACAGAAAAGGTACCCTACAAGAGGGCTGTACCAAGCACTAGCCATAGCTTCAATGTGCATCCAGGAAGACGCCACAACGCGCCCTTTAATAGCAGACGTCGTGACTGCCCTTTCATACTTAGCGTCCCAGGGCTACGACCCATCTGCCCACCGACCGTCCGCAGCATCAGCCAGCGGCAGGGCTGCAGCAGCTGAAAAATTCGAAAACGGGGAAAATTCAAGGGAGAAAAACGAGTCCCCTAGGGACTTCACGCCTTCAAAGTTCGATAGGGAGAAGGCCATTGCCGAGGCGAAGATGTGGGGCGCTAATAGGAGGGAGAAGAGAGAAGAAGAAGGAAGCAATGTATGA

Protein

Gene

>AfisC2G07286
AACTTTATCTTTTGTTTATTTATAACATCTATAGCAGGGTGAAAAAAAATCCACAATAAAGGAAGTTACAAGTATTCACAATATGAACACGCAGCATCCTCTCCACCATCTTTCTTCTCTTTATTCACAAAGCAGCAAACTTAAAAAAACGCTCTCTAGTTCAGATATTTTAAAAAAGCTCATCCCTTTCTCCACTTGGATCTGAAACTACTGAAAAATCCATATATAATCCAATGCAAAGTCTCAATTATTGTTAGAAAACAGAATCGACATCAGATCCTTTGGTATAAATCGTGATTTTTGGACTGTTTTGTTGAATTGGTTATGGCCTGTTTTCCATGTTTTGATTCCAGAGAGGAAGAAACTTTGAATCCTAAGAGCAATGGGAAGGGCGATGATAGAAGAGAAGAACAGCCTATGGTTGCTCCCAGAATGGAGCGATTGCCTTCGGGTAAGTTCTATTCTTTTTATTTGTTTCATCTTAATTTTTATAATGTTAGTTTGATTTTGCTTGAACTGGGTCATTTGTTTCAATTCAATTTTTTTATCTGCACAGTTACTAGAATTACATTGTTGGTAAAGGATATCAATAATGAATCCAATATAATTTGCTCAGCTTTTATTTTTGTTGTTATCGTGAAGATACATCTTTGTTGGCAAACGATGAGATTGTATTTGAGTTCTATTGGACAAAGTGAGTTAAAAGTTATTGTTTATTTTGTAAGTTCAATTGTTAGTGGGTTAGGAACAAATGGTGCTTATTGATTCTAGATCTTAATTGATAAGCCTTGATTTGTTTTGAGAACTAATTTTGCAACAGTTTTATTGAAGATCCCAAAGATAACGATTGTTTTGTTCCATTTCATTGGAGTTAAAACACAATCAGCTGATAACATCTTAACTCCTATTATTCTTATGTTAAAATTAGCTGAGAGCTATATGAATATTATTAACTATATATGTGTGTTGTTGACCAATATTTGTCCTGCCTATGGTAGGTTGACAACCACTGTTGACTCAAATGATATCCATATCAACCGATTTGACACTACTTCTTTTTCCTTTCCTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTCTTTTGTGTTTGTGTGTGAAAAAATTAACTATTTATTTATGTACTACAAGGATGTGTTTATCTTAGTTTGTTAGGGATCAATGTACATGCTTCTTTGATAAGTATGTCTAGTGAGTAGTTGGTCATCAACTGTTAATTTTTTTTTTTAAAGTGTGTACTCAATTTTACGGAATATCATAAACAGCTAATTCAATTTGAGATACAAGATTGGTTTGAAGACGAGCTTTATGTCTGATTCTCTGTCGATGTAATATTAGAGGGTGTTTGGTAATAGCTTAGTAGTAAAAGTACTTACAAGTTATTTCTGTAATTTGGAATGTTTGCTAACAACTTAATTTTTTGACTTAAGAACAGTACATAAGTTGATAAGTCTTAAGCAACAAATTCTACTTGTGTCTTATGTCAAAATTTACAACCAAATTGTCACGTCACACTTTCAATTTATCTATCCTGACCCTTTATTCATTCAACTCACTTAGAAGTTACTATTCAAACACTTTTTAAGCAGATTTGACTTAAGTTATTGCAAAGCAAGCCTTAGTCTTAAGATATGCACATACACAACATTTTGCGTCGTGAAAAGTAAGGAGATTTATTTCAGTACATATGTCTGGCTTAATATTTCACTCCTATTCAAAACTCCTTTCAAGGGGATTTAAAATATATTGCGGTCAAAAAAAAAATTTAGTCTTAAGATAAGCACATACATAATATTTTGCGTTATGCAATGTAATGAGATTTGTTTCAGTGCATATCATTTCAATTGGCCATATTTTTTTCATTTCATAATAATTGTTTTGATGTATCGATTGTATAAAACTTTCCCCAGTGATATATGTTGGTCCCTTTGAAAATTTGCTCTCAAGTTTGTTATTTTTATTATGTATTGAGTGCAAAATTTGAAATATTGTCTTCTGTGTATGCTCACATCTATATTGTGCACAAACAAATAAATATAAGTTTGCTCATTTGTGTTAGTTTATTTATTTTAGGACTTGCAAAGACAACATCAAGAGGTAATTTGAGCGGCAGGAAAGAATCGATATTTCCAAAAGAGGGTTCGGGTGTTAATATATCTTCCCAAACTTTCACATATCGAGAGCTTGCAATTGCTACTAAAAATTTCAGACCTGAATCCTTTATCGGGGAAGGTGGATTTGGTAGGGTTTATAAAGGGAGACTTGAAAGCACAGGACAGGTACTTATATATGTGGGCTTAGTTATGCCCCTGCGATTATGTTAGTACCATAAATGTCAACAGTGGTTTTCATTGTCTTAAACTAAATGTTTTGTACTAAAAGAAAATTGGTTAGGTACAAGGAAAATGGTATTCCCTACTGTATAGGAAAAGAGCTTTGGCAAAAAATCTATGCTAAAATCACCCAAACCCAGAAATTTTGCACATGATGAAAATTAACCAATCGGTCAGTTGAAAACTGTCGGCTAAAAAAAAGTGAGATCGAAATTCTTTAACAGTGTATCTTCAATTTCGAATACTCAGTAAAACTGCAACAAACAACCATTAGAAACAGTACATAAACGACTAACTTAAACAGTTTAAAATCAAATAGCTGAAGTCTATTGTGTGACGTAAACACCAAACTTACTCAGAACAACTGATCGACGGTAACAGAAACATGTATTTCCAACGGTATTAGAATGCCGCTTGACATATATACTATGAACTACCAATTGAAAGCGGCTGAAGCAGTTGTGTTATTTTTTGTTTACTATAATTTTAAGCAGAGCTGTTATGGTAATAGTTACCGCTACCATTTCACAAATACCATCACCGTACCATTTTTATTCGTAAACTAAAACTACTTACGGTTGCTGATTTGTTGGTATACCGAAGGTTTATATACCAATAACCGGTAACTGTTATTACACTGATAATGGTAAATTGCTGTTTGTTTGAAAAATTAAAAAGTTGATATTTTTACATTGTAATAATGCTTCATCTTACAGTTCATTTAGTCACGTAATAAAGGATATTAATGAGAAAGGGAAAAAAAAAAGCAATTAGCATCATTTGAATCAAAATTCTGAACTAAACATGACCATTTACTTTATTTCTAAATGTCTACAATACAACATTTTATATGAATATCTATGTAGTATATTTGACTGATAAATTACCTTTACTGTCAAGTTTGAAAAAATGTTACCGATGTTTTACCTTATAAAAAGGTAAAATTTACCGATACCATGTGAACATACTGGTATAATGACTTAATTAAAAATGGGTAACCAATTGATTCGTAATAGTATGATAATGAAAAATTTACTCTTACTGTAACAATCCTAATTTGAAGATGGGTTGGATAATTTTAAGACAGGATAATTTAAGTGTAAATTTTGGAGTGAATAGTAATGCAGCTAAAACTCATCTTAAAAAAAGCTATACAGTGAGCAAGCCTGACAATATATACTAAAACTTGAGGTATGAATGCACTTCACAGCAGCGCATATAATACATAAGTGGTTGCACTTGCTAAAGTGCACCATCTCAAGGACAAGAAAAAAATAGTGAGATCTGGCTGTCTTTTGTATTTCATACACTGTACTCATTTAAATTTGCTGAAGTTAGACATTTGTTGAAAGCTATAACTATATAATGTAATTATAAAATTCAGGCTGTGGCTGTAAAGCAGCTTGATAGGAATGGGTTACAGGGGAACAGAGAATTTCTGGTGGAGGTTCTGATGCTCAGTCTATTGCATCATACCAATCTTGTTAATTTAATTGGCTATTGCGCTGATGGAGATCAGCGTCTACTTGTGTATGAGTTTATGCCGTTGGGATCTTTAGAAGATCATTTGCATGGTATTATTTATATTCGAATTTCATAATTCATAAATTTGAGTTTGAGGTTGATGTTACAACTTCAACGTTTTTTAGGATTATTTTTCTCGGTCTTCATCTCTTTTCTTTTCCTTCATTGTTGGTTTTTCTAATCTTTGTAATTTGTGCTTTTTTGCTAAGGTGTGGACTGATAAATTCCTAAAAATTGGATAAGTATAGCAATCAAGCAGATGTAGCTTTAACAAAGACTAGCATCTCCAACAAAACAACTTATATAGCATATAGATGCAACATGAACAAAGTTGGCAGTTGGCAAGGGCATAGAAATAAACTCATAAAATTCCAGCTAAACCTGAAAACTGTACTTTTGCAAGTGAAATAATCCGGAACATCATGATTTATCAATTTTGGTTACCTGATCAGCATCATGCTTTAGCTTCAAGCTTTATCAAACACTTTATTGCTCGTCTTCTCCAGTGGCTGCAAGTCTTGCTCTCTTCTTGGGATGTCTATTAGAAACTTGAATTGAACTGCTACTGGGTCTTGGTCAAGTAATAATAGTCATTAGTGACAACCTCACCGTAAATGGCAACTCGCTCACAATGATTAACCCTGAAACACCAATTATCAATTTCAAAGAGGAAAAATAATAATAATTGAACTTGATGGCTTATGCAATCCGCCTTTTTGCGTTAATTATCTTTAATTATATGGTTGATGGGAATGGATTGGTTACACCTCACTTGTGCTACACTTCGTCTACATCTATACTTTTTAAAGCTACATAGTTCAAAGCGAAATCAATTTTCGAAAATGTTTATACTAACACCATCACCTCAACAAGAAAATGAGTTCATTTCAAAATCTCTAACATGTTCAAACTATTAGGTCAATATCAACCGTTAAAACTTTATTTTTCACCGTCAATCTGAAACATTATTCTTAATAATGGGATCATTTAAGTGAATCAATGATTAGTGAAGAAGATTTTGAGTGATGTAAGAAAGTATCAATGAATTATTATTTTCAAGTCGGATTGTGTAGCTCTAAAATAGTAAATATATAAGAGTGTGAACCAGGTGTAGCGAAAGTGAGGTGTGGC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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020246443.1	1.2e-193	serine/threonine-protein kinase PBS1-like isoform X1
Swissprot	Q9FE20.1	2.0e-174	AvrPphB susceptible protein 1
trEMBL	A0A5P1E7Y4	8.3e-194	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G13160.1	70.79	0.0	637	PBS1	Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G07286	AT5G13160.1	445	118	4	1	434	1	444	70.79	0.0	637
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AfisC2G07286	AT5G18610.1	371	92	1	3	373	4	369	73.85	5e-163	571

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	90	358	157.6	3.4e-46

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0016021	C	integral component of membrane
GO:0002221	P	pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0046658	C	anchored component of plasma membrane
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0040007	P	growth
GO:0007166	P	cell surface receptor signaling pathway
GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009941	C	chloroplast envelope
GO:0010183	P	pollen tube guidance
GO:0035420	P	MAPK cascade involved in innate immune response
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0071323	P	cellular response to chitin
GO:0090404	C	pollen tube tip
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900426	P	positive regulation of defense response to bacterium
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13430	PBS1; serine/threonine-protein kinase PBS1	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network