result

Gene information

Detail information of AfisC2G07390

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G07390	chr2	1185878952	1185898676	-

Sequences

CDS

>AfisC2G07390
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Protein

>AfisC2G07390
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Gene

>AfisC2G07390
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020247102.1	2.1e-254	lysine-specific demethylase JMJ25-like isoform X2
Swissprot	Q9SSE9.1	8.6e-165	Protein JUMONJI 25
trEMBL	A0A804ILB7	6.7e-215	JmjC domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G00990.1	48.47	2e-148	523		Transcription factor jumonji (jmjC) domain-containing protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G07390	AT4G00990.1	557	255	6	468	992	282	838	48.47	2e-148	523
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02373.19	JmjC	Domain	839	935	50.6	2.1e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003006	P	developmental process involved in reproduction
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GO:0032452	F	histone demethylase activity
GO:0043414	P	macromolecule methylation
GO:0044446	C	intracellular organelle part
GO:0044702	P	single organism reproductive process
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GO:0048523	P	negative regulation of cellular process
GO:0048731	P	system development
GO:0071310	P	cellular response to organic substance

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
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Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network