result

Gene information

Detail information of AfisC3G02908

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G02908	chr3	518497402	518502428	-

Sequences

CDS

>AfisC3G02908
ATGAAGCAATTCATGGCAAGAGTTAATTTTCTAGTTCTAATAATAAGTCTTGCCTCCATATTTTCAGTTGTCAACAGTGCAACCGATTCTAATGATTTAGTCATCATCCGAGAATTTCTCAAGGGAATACAAAATCCAGAAACACTTAACTGGGAAGGAGATGATCCATGTGGTTCATGGAAATTTATATTCTGTCATGATACTCGTATTACTCAAATCCAAACCAAGGATATCAATTTACATGGCAGTCTTCCTCAAAATCTTAACAAACTTTCTGAGCTAACTGATCTTGGTCTTCAAAACAACAATTTGTCTGGAACATTACCGTCACTTTCTGGGTTGTCAAAACTTAAGCGTGCCTTTTTTGGAAACAATAAATTCGACACAATTCCTTCTGATTTTTTCACAGGACTTGAAAGTTTACAGGTTATTTCTTTGGAGAGAAATCCTTTGAATGCAACTACTGGTTGGGTGTTGCCTTCTGAACTAAAAAGTTCTATCCAGTTAACCAATTTATCTTTATCCCAGTGTAATCTTGTAGGCAAAATGCCTGACTTCTTAGGAAGTATGAGTTCATTGATGCTTCTTGATATGTCTTATAATCGTCTGTCTGGTGAAATACCGACTAGTTATTCTGGACTGCCATTGCAGATATTGAAGCTTAACAACCAGGATGGATCTGGACTTAGTGGAGGTATTGATGTTATAGCTTCTATGACACAACTAAGTCTTGTTTGGATTCATGGAAATGCTTTTACCGGTCCTATACCCGAAGCTATAGGAGCATGCACATCTTTAAAGGAATTTGTGATCAATAATAATAAACTCGTTGGACTTGTTCCTACCAATCTGACAACATTGCCCGAGCTTGATATGCTGCAATTGCAAAATAATAACTTAATGGGTCCGATTCCAAAGGTTTCTTTCACAAACTTCACCTTTCTCCCAAATAAGTTCTGTCAATCCTCTCCTGGTATGCCATGCTCACCTCAAGTTACTGCCCTTTTTAATTTTCTTGATCATATGAATTATCCAAGTGAAATTTCAGACACTTGGTCGGGTAACAATCCTTGTGATTCGTGGAGGGGAATTTTTTGCTCGAACAAAAATGAGGTTACTCGTATAAACCTTCCAAATCATCAACTGAATGGCACAATCAGTCCTTCACTTGGAACATTAATCTCTCTAAGTGAGATTTCACTTGAAGGAAATAACATAAATGGAACTATTCCTGATGACATTGCAGCTTTGCCATTGCTAAGTACGTTCAATATATCTGGTAATGACATTGCTCCTCCTCTTCCACCATTCAGAAAAAGTGTAAAACTAATTATCGATGGCAATCCAAAACTAGACAACAAAACTCCACCCAAATCTCCTCCTACCACTCCATCTAATGATGACAATGGCAATGGATCTGACACGAGCAATGAACCAAACAGGTCTAACGGGTCTAATGGGTCTAATGGGTCTGATGGGTCTAACAGGTCTAATGGGTCTGATGGGTCTAAACTTCTAGTAATCATCATACCAATCGTTGTAGGTGTGGTGCTTATATGCATAGTTGTTTTATTCGTGTATTGTTGCAAGAAAGAGAAAAATGAAGATGTTCCTCCACCAAGCTCAGTTGTTGTACACCCTAGAGATTCATCGGATCCTGAAAACACAGTTAAAATTGTTGTTGCTAATAATAGTGCTACTTCAAGTGATCTTCGAACTCATACAAGTGGTGATACATGTGATACACATGTTATCGAATCAGGGAATTTAGTAATATCGGTTCAAGTACTGCGAAGTGTAACAAAGAACTTCTCTAAAGAGCAAGAACTTGGACGTGGTGGCTTTGGCGTTGTTTACAAGGGAGAGTTGCATGATGGTACGAAAATAGCAGTTAAAAGAATGGAATCCGGGGTGTTGAGTTATAAAGCATTCGATGAATTTGAAGCTGAAATTGCAGTTCTTTCGAAAGTTAGACACCGTAATTTAGTTTCTTTGTTGGGGTTTTCTGCTGAAGGCAATGAGAAACTATTAGTTTACGAGTACATGTCAATGGGGGCTTTAAGTAGACATCTTTTTCATTGGAAGGAGTATGGTTTGGAGCCTTTGACTTGGAAAAGAAGGATTAATATTGCTTTGGATGTTGCTCGAGCGATGGAGTATTTACACAACTTAGCACATCAGTCATTTATTCATAGAGATCTCAAGTCTTCAAATATATTACTCGATGATGATTATCGAGCAAAAGTTTCAGATTTTGGACTTGTGAAACTTGCACCTGATGGTAAATATTCTGTTGCGACTAGACTGGCTGGAACATTTGGGTACCTAGCTCCTGAATATGCTGTGACAGGAAAAGTAACAACAAAGGTTGACGTGTTCAGTTATGGAGTAGTACTAATTGAACTAATAACGGGCATGACAGCACTGGATGAAGATCGACCTGAAGAAACCCGCCATCTAGCCTCATGGTTCTACCATATAAAATCTGACAAGGATAAACTCAGAAACTACATTGATAAATCTCTTGATAGATCAGACGAAACATTCGAAGAGATGTACATAGTTGCGCAACTAGCCGGCCATTGCATATCAAGAGAGCCTAACCAAAGACCCGACATGGGTCATGCAGTCAACGTTCTTGCTCCCCTAGTCGAGAAATGGAAGCCCGTCAACAACGATTCAGATGATTCTGTAGGCATCGATCTAGGGCAGCCTCTTTTGGAATTGGTAAAAGGTTGGCAAGATGCAGATGGTAAAAATTCTAGCAGTTTGAATCTCGATGATAGCAAAGGAAGCATTCCTTCACGACCAGCTGGGTTTGCCGATTCATTTACTAGTGCTGATGGTAGATGA

Protein

Gene

>AfisC3G02908
CAAAATCTTAAAAAAGGAAAACTCGCGGAGGACATAGTGAGGATTGACACCCTTAGCCGAAAGATTCTCAACTACTCCTAGGTACTCCATTCTATCAAACCTTTTTAAATTCCACTCTAATATCATATTTCCACCTAAAAACTGGAATTTTGATGCACATTCTCCTGCTACTACAAAGTAGCTCTCTCCTTCTTGCTTCACTCAATATTTTTGTTTGTTTTGAGATTTTGGTTCAATTGCAAATTTCCAAGAGGTTTGATGAATTTTGCTTGACTCCGGTGTGGAGATATGATATTGAGTTAGATTCAAAGAATTTCATTTTTGTCAAGCCGTTAGATAAAAAAACTGGTGTTGATTTAATCCTTTCGTCTGTTATCTGATGCTGGAAAGGTAATTATCTGTGTTTTTTTTAGAAGTTAAGAATCGGAACGGTTGTTGTCTAATTATTGCTTTAGTTTGAACTCTTTTCATGCAATTTCATAGTAACTCATTTTGACTAGTCAGTAATAATTCTTATGCCTTAATTTTTGGCGTATATTTAACATCAAGCCGTTATCTATGATTTTTTATCAAAATATAAAATTGTTGCATGAAAACATGTGTTCATACTCAGACTGATTAAAAAGTTAACAATGAGTTAAAATTTTCCTTTATTGTTTGACGTTCAAAGTTAAACAATTTCTCATCTGGATTGTTCTTCATCCTTCTACTTAGTTTTTTCTTAGTAACCTTGTTTTTACGCTCTTACTTCTAGAACATCTTTTAAGGGTATATTTATTTATTTATTATTATTATTATTTTGATCCAAGTTTGAAATAAGTTGGATACAAAATTTATAAGATTGAATGATTGAACTACTCTTTTTTCCCTGGACGTTGTGTAATCTAAAGTAATTTGCATTTGTGAAGTATAGGTGATGCACTTCTGCTCACATCTTGTTGATAAAGTAGAAAGAGAAAAAGGAAAAGAAGATGAAGCAATTCATGGCAAGAGTTAATTTTCTAGTTCTAATAATAAGTCTTGCCTCCATATTTTCAGTTGTCAACAGTGCAACCGATTCTAATGATTTAGTCATCATCCGAGAATTTCTCAAGGGAATACAAAATCCAGAAACACTTAACTGGGAAGGAGATGATCCATGTGGTTCATGGAAATTTATATTCTGTCATGATACTCGTATTACTCAAATCCAAACCAAGGATATCAATTTACATGGCAGTCTTCCTCAAAATCTTAACAAACTTTCTGAGCTAACTGATCTTGGTCTTCAAAACAACAATTTGTCTGGAACATTACCGTCACTTTCTGGGTTGTCAAAACTTAAGCGTGCCTTTTTTGGAAACAATAAATTCGACACAATTCCTTCTGATTTTTTCACAGGACTTGAAAGTTTACAGGTTATTTCTTTGGAGAGAAATCCTTTGAATGCAACTACTGGTTGGGTGTTGCCTTCTGAACTAAAAAGTTCTATCCAGTTAACCAATTTATCTTTATCCCAGTGTAATCTTGTAGGCAAAATGCCTGACTTCTTAGGAAGTATGAGTTCATTGATGCTTCTTGATATGTCTTATAATCGTCTGTCTGGTGAAATACCGACTAGTTATTCTGGACTGCCATTGCAGATATTGAAGCTTAACAACCAGGATGGATCTGGACTTAGTGGAGGTATTGATGTTATAGCTTCTATGACACAACTAAGTCTTGTTTGGATTCATGGAAATGCTTTTACCGGTCCTATACCCGAAGCTATAGGAGCATGCACATCTTTAAAGGAATTTGTGATCAATAATAATAAACTCGTTGGACTTGTTCCTACCAATCTGACAACATTGCCCGAGCTTGATATGCTGCAATTGCAAAATAATAACTTAATGGGTCCGATTCCAAAGGTTTCTTTCACAAACTTCACCTTTCTCCCAAATAAGTTCTGTCAATCCTCTCCTGGTATGCCATGCTCACCTCAAGTTACTGCCCTTTTTAATTTTCTTGATCATATGAATTATCCAAGTGAAATTTCAGACACTTGGTCGGGTAACAATCCTTGTGATTCGTGGAGGGGAATTTTTTGCTCGAACAAAAATGAGGTTACTCGTATAAACCTTCCAAATCATCAACTGAATGGCACAATCAGTCCTTCACTTGGAACATTAATCTCTCTAAGTGAGATTTCACTTGAAGGAAATAACATAAATGGAACTATTCCTGATGACATTGCAGCTTTGCCATTGCTAAGTACGTTCAATATATCTGGTAATGACATTGCTCCTCCTCTTCCACCATTCAGAAAAAGTGTAAAACTAATTATCGATGGCAATCCAAAACTAGACAACAAAACTCCACCCAAATCTCCTCCTACCACTCCATCTAATGATGACAATGGCAATGGATCTGACACGAGCAATGAACCAAACAGGTCTAACGGGTCTAATGGGTCTAATGGGTCTGATGGGTCTAACAGGTCTAATGGGTCTGATGGGTCTAAACTTCTAGTAATCATCATACCAATCGTTGTAGGTGTGGTGCTTATATGCATAGTTGTTTTATTCGTGTATTGTTGCAAGAAAGAGAAAAATGAAGATGTTCCTCCACCAAGCTCAGTTGTTGTACACCCTAGAGATTCATCGGATCCTGAAAACACAGTTAAAATTGTTGTTGCTAATAATAGTGCTACTTCAAGTGATCTTCGAACTCATACAAGTGGTGATACATGTGATACACATGTTATCGAATCAGGGAATTTAGTAATATCGGTTCAAGTACTGCGAAGTGTAACAAAGAACTTCTCTAAAGAGCAAGAACTTGGACGTGGTGGCTTTGGCGTTGTTTACAAGGGAGAGTTGCATGATGGTACGAAAATAGCAGTTAAAAGAATGGAATCCGGGGTGTTGAGTTATAAAGCATTCGATGAATTTGAAGCTGAAATTGCAGTTCTTTCGAAAGTTAGACACCGTAATTTAGTTTCTTTGTTGGGGTTTTCTGCTGAAGGCAATGAGAAACTATTAGTTTACGAGTACATGTCAATGGGGGCTTTAAGTAGACATCTTTTTCATTGGAAGGAGTATGGTTTGGAGCCTTTGACTTGGAAAAGAAGGATTAATATTGCTTTGGATGTTGCTCGAGCGATGGAGTATTTACACAACTTAGCACATCAGTCATTTATTCATAGAGATCTCAAGTCTTCAAATATATTACTCGATGATGATTATCGAGCAAAAGTTTCAGATTTTGGACTTGTGAAACTTGCACCTGATGGTAAATATTCTGTTGCGACTAGACTGGCTGGAACATTTGGGTACCTAGCTCCTGAATATGCTGGTATGTTCATCCTTAAGCTCCTTTGATAGAGAGAATTTCATTTAGCAAGTAGCAACCTCTGAAAATTTTCGTTATTAGTTTAGGATGCAATCTGAAAATTGCTAAAGTTCACCTATTTAATCATAAATCCAATGACCCCAATTATAGTACCCTTCCTCTGATTTTCCACCAGAGCGTAGCATAACAGTCCATTTAGTTTTCACAGTTATAACAAATTATATCAATTTAAGCATGTGATGGTTTTCTGACTTTTTACCAGTAAACAAATTATTGCACCATATGGAGGTTAGGTGAGTTCCCTCGATTTCCTTAATTTAAGCAAGCACATTTTGACATGTATTTTAATCATATTCACTTTGCTTATCAAGTTGTGGGATTTGGGGATTAAAAAAAAAAAACATAAACAAAATATAATTTGCCACGCCACAATTCTACCATATCTCTGCACTTCTTAAAACTACACACCTTGAGCAAAATCCTAATTTTGTAAGTATATTTTTCTATCTCTCTAGAGTCTAGACCATATTCATGAAAATTTAGTTTGTTTGAATAATTCTAATGTATTTCAAATCACTATTTCAAAAATAAATATTTAGTGACTAATACCGACTTAACATTTTGAACATGTTAGAAATTTCGACCGCATTTTTTGTGGAGATGATACATGTGGATTCAACATCCATAATGTTTTGTGTCATTATATCTAACTCTAAAGAATATAAACGTGTCGGTTGTAGTGCAGTAGGAAAAGTGGGATTTAGTTGAACTCTCTCCACTTGTGTGTGTGCGCGCACGCACGCACAGACACGGATGTGTGTATCACATGTTTTCCTTTTCTTTTTTCTTTTTTATTTTTTTTATTTTACCATTGTATAATTATTTCATGTCAACGAATTCACAGTGACAGGAAAAGTAACAACAAAGGTTGACGTGTTCAGTTATGGAGTAGTACTAATTGAACTAATAACGGGCATGACAGCACTGGATGAAGATCGACCTGAAGAAACCCGCCATCTAGCCTCATGGTTCTACCATATAAAATCTGACAAGGATAAACTCAGAAACTACATTGATAAATCTCTTGATAGATCAGACGAAACATTCGAAGAGATGTACATAGTTGCGCAACTAGCCGGCCATTGCATATCAAGAGAGCCTAACCAAAGACCCGACATGGGTCATGCAGTCAACGTTCTTGCTCCCCTAGTCGAGAAATGGAAGCCCGTCAACAACGATTCAGATGATTCTGTAGGCATCGATCTAGGGCAGCCTCTTTTGGAATTGGTAAAAGGTTGGCAAGATGCAGATGGTAAAAATTCTAGCAGTTTGAATCTCGATGATAGCAAAGGAAGCATTCCTTCACGACCAGCTGGGTTTGCCGATTCATTTACTAGTGCTGATGGTAGATGAAATGGTCTAAAAAGGAATTTTTTATGATTGAATGTTCATGTTTGTTTGTTTTATTCAAATTGTTGCAATTTTGTACATATTGTGGATTTTTGTCTGAAAATCTTGTGACGTGAAAAATGAGTTTCAAATGAGCTCATTGCATCATTGAAATGGATTATGTTTTAGCTTGTAAGTTACTCATCAGATATGGTCATGGAAAATAATGTGAGCTGTGGGTCACATATTCCTTTAGAAAAACAATGTTTGTTTGTAGTACAGTTTTTATCATTTCGTGTGCTAAGTTGGGATTAGTTTATGCTTTT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020260416.1	4.9e-298	receptor-like kinase TMK3
Swissprot	Q9FYK0.1	2.1e-165	Transmembrane kinase 2
trEMBL	A0A5P1F0T4	3.5e-298	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G01820.1	47.15	0.0	826		Leucine-rich repeat protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC3G02908	AT2G01820.1	965	454	18	10	950	11	943	47.15	826
AfisC3G02908	AT1G66150.1	947	454	18	27	950	23	942	46.78	794
AfisC3G02908	AT1G24650.1	958	448	19	5	950	1	886	44.47	719

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	34	65	12.5	0.12
PF08263.9	LRRNT_2	Family	330	367	25.8	8.3e-06
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	606	878	161.7	1.8e-47

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0046658	C	anchored component of plasma membrane
GO:0005794	C	Golgi apparatus
GO:0040007	P	growth
GO:0009505	C	plant-type cell wall
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009555	P	pollen development
GO:0010068	P	protoderm histogenesis
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0035420	P	MAPK cascade involved in innate immune response
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048367	P	shoot system development
GO:0071323	P	cellular response to chitin
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900426	P	positive regulation of defense response to bacterium
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway
GO:1905393

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K00924	E2.7.1.-; kinase	EC:2.7.1.-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network