result

Gene information

Detail information of AfisC3G04281

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G04281	chr3	770193991	770201509	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC3G04281
ATGAACGGGAGTGTGTCGTTACTTGTACCTGGTTCAAATTGCTCACCGTTGGCTGGTCCTAAAGTAATGTTTTTAAGAAGGGCAGCATTTTTGAAGCACAATCTTTTGGTGACTCCATATAAACGTGATGAAATGTATCCTGGAGGAGCGTTTCCTAATCAGAATCATCGCCAAAATGAGGGTTTAGCTACTTGGGTCAAGAAGAATAGATCTCTTGAGGAAACCAATATTATACTGTGGTTAGTGATATTTTTGACATGTGCATCATTATTCAACATCATTTTTGAATTGTCTTTTTTATTTATTAAATTTATCTTCTTTAAGTATTAGGCCTTACTGGTATTAATTCAGCATTAAAAAAAGGGTAGTAAAAAAAGTTTGGCATATTTAGGCATCAGTTTTAAATTTTGTGCCATAAATTTGTTTAAATCGATTCGTATTTTACTTGAAATATATATTGTTAGTATAAGTTCAGTTTGTTGGATATTTAGGAAATTTCTAGATTTATCTCCAGTTAAGATGAGTTGTATAAAATGTACAGACGCGATTGTTATAAAAATAACAGGGTGTTAAGTGAAGAAAAAGTATAACTCATATTTCCTAAATTTGGCGAAATAGATTGCCACTAACCTTAACCAGCAACCTTTTTTGATGGAATGACAAAATGATTATAAAAATCATCCTATTCCATTGGCAATAAGTTTAGTTAAAGACCCCTCTCACTGTTTTTTTCTAATAAATAAAGAAGAAAATGCTTTGGCATTGTCCTAATCCTAGATGTTTAAAATGTACGCTGTTTGCTTTCACGGCTATTTCTCTGATATGTTGCGTTTTCTTCTGATTGTCTAGGTATGTGTTTGGAGTGACTCACATACCTCGTCCTAAAGATTGGCCTATTATGCCTGTAGAGCACATAGGTTTCATGCTCATGGTATTTACATTTTTCTTATCTCTTCAGTCTTTCTCGATTTATGTTTTAATTTGGTCATAGATTCTCTTTGCTTATTTGACTGGCTTTCTAGAATATATCATAAATATTAACGTACAACATACAACACGTTTCAAATAAATTGGGTTAAACAAAAAAACAAAACAAAACATATCTCAACAGTTATGCTATTTCAGTTCAGCTAAATTGCTTTATGACTATACTAGTTTCATGTATAAAATACAGTTAAAGTTCAGTAGAATTTGCAAATGAACTCGTAAGGCCTTTCAGATACTCATTTTCAAACTCATGACCAAGGTTTGTTTTGTTGGGCTGTGTCTTTCTGTGCTATCTTCTCACTTTTGAGCTTGACATGGCACTGATAATTGTGCATGAATTTTTAAGACAGGCAGTTGGGCGAGAGCATTTGTTGGGCACTACGTATTGTATATTGGAACATACACATTTCCATTCTAATGTAAACACAACCCATTCCTAACTGTCTTGTGTTGTCATTTGATTTCATTCATTTATACATGCACTCAACATATTATAAGTGAAAAAATTACTAAAGCTACTGTGTTTGATCTAGCTGAAAGTACCTCAGTAATGAAGATGGAGACCATCATAAGATGTTCATATTCTACGGAAACTGATAGACATGTATAAATTATTTCATCAATAAGATATCAAGTGGGCTATCCAAAATAATAAATTTTAAAATAATGTGATTTTAGACAAGAAAGGATTTGGATAAAGTCACTTGGATATCGTTCCTATTTTAAGTTGCAGTTTACCTTATTCCATCATTTTTTTGCCTTTTAAATGCAGACAAAAATATTTTAGTTTGATTATTTTTTTTAGTTGGTTAAGTCAGAATGCTATCTATGTTAGACAACTCACCTTTATTTAAGAAATTTCTTTAATGAAAACTGCTATCAAAATATACAATTTGATGACTATGCTGATCTTAATTTTGAGAAATGATGTAGTGAAAGCAAAAAGTAAAAATAAAAATAGGGAGTAAAGAAATAAAACAATAGTAATAGGTTATAATTTGACGAAGTTCAGTAACGACAAGTAGTAATTATTTTGATATGGTTTATAACAAAAATTTAGGCTTACTATCTTTGAATTTTAAATGAATAAGCAAAACTTACTTGAGAAATTTCTATCGAATGTATAGATATTGAACCAACTTACGAATTTTTTGGTTGTTGAGGACAATCTTTGCATTCTAAATTATTTTCACTACCAGATTTCATTTTTGTAATTCCATTCCTGAGCCATATATCTTTTATCATGTCTTTAATATACTTTCACTACGATGTAATAAATAATTAAAGTTATAATACGATATATAATACTAATATTTTGTTGTAGTATTAATTCACTTACCACTTTCAGTATTTCTTCCGCATATGTCCATTTTGAAAAAGATTTTAGTTTTATTGAATTATAGTGGCACCATTGCAAATCTTCATAATCAAGGACTAGTAATGTCCAATGTGATTGTTGATGACATTCTGGCAAGAATATTTTGTACAATTCTAGCTCCTTTTTATGGTACCTGACCATTCTAATTCTTTAGCCAATAGAATTTGAGTTGTTGATTTCAAATCCAACAATATCCAATGCTACGAAACAAAACATAATAATGATATTATAATATTCACTTTATTCTACAATTGAAATACATTTTTGTAAAGAATGTCAAATAAAAATACATACCGTTTCTTTGGGTCTTACATAAAAATTGTTTGGATAGTGCGGTCTCAGCTTGGTTACTTCGAACCAATGGATTACCTGTGAATTTTACATTAAAAAAATGTATACAGACTATAAATATATGGTACAGACTATAAATAGCTTGGTTACTTAAAATACTTTGACTGATTTTATTATTAAAACAGATTGCATCAATAGTAGAAGAATAGCCAGCATTGTCTGTTCTGGAAGTATATCAACATTTTTCTGGCTTACTTTATAGTTTGATGAAGATTATTACATGTAGATGAGATTTGTTTTTTCAAATATGAGGGTAATGATACATTGTTGGTTTTTTAAGTTAACTCTATTTTGTTGTTTTCAATATTCGATATGTATTTAGTATGGTCGAAATTGTGAACATGATGCTCTAATCTTACCTGTTTGTTGATAAGTGGTCACAAAATATTGGAAGAAATTGTGGAAAAACCAATAGAAAACGTAAGGAAGTATGGAACTATCAGTTCAGTTGGAAACAAGGTACATGAATGTAATGTACAAAACGATAGTTTACAATCTGTACTTGTTTATTTTAAATAGGATAACGTTGTTATAACATTTGCAAGTTGTTTAGCTCCTAATTTTAGTTAGTGAACTTTTTTTCTTATCGTGAAATATTATTCAGTGTTTGGCCAGCTAATTAGTAACTAGGTAAGGTCATGTAAGTAATATGATGATTTTATAAAATGTGTAAATTTTATAAAATTAATTTATTAAACTAAATAATTGGTTTCGACACATTTCAAATTGAGTTTATCGACATTTCTACTGAGCAATAAAAAATTTGTATCCTCATATGAAAATTATCTCAAATTGTGATGGATCTCGTCAACCAATTAGTCATCCAGCTAATTTTTTTAAGTATCATGTAAGTAAGCATTAACTATTGAATAAAATAAGGTTCAATGTTTTCTCTTTGTATCTTAGATTTTTATTATATATAGCCAAAAGTATAGAAAAATTAAATTGCAAACTCGTTCACAAGCTTGTGTTCTTATGTAAAGAAAAATTTACATCTTTTACAACAGAAATTTTCAATCCAATTATGCACAACGTTCAACATTTGGATCTTTCAACATCATATCCCTGATCATTCACATACTTCACAACCAAACAAGGAATTCACAGATCTTTCAACATCATATCCCTTTTGTCACTTTGAACCTTATTTCTCTTTGTTGAAGAAAGTGAAAGATCAAGTGGGAGGCTCGAGTAGCAACATGACAAAGTTTGAAGCTCGAGTACAAGCACAGTTGAAGAAAGTGAAAGATCAAGAGGGAATTCAGGAGGATCTATTCGTCAGTATAACCGATCAAAGACACCTAGGCTAAGGTGGACTCCAGATCTTCATCTTTGATTTTTACATGCAGTTGAGAGACTCGGTGGTCAAGAAAGTGAGTCAAACTTCAAATTTTAGAATATGGACTCGCTTCTTCTTCATTAGTTTTGAATATATAAAAATATTTTTCTATATAATATTTTGTGGACTTATCATTTGATTGCAGGAGCAACTCCAAAGCTAGTTTTACAAATGATGAATGTTAAAGGACTTAGTATTGCTCATGTCAAGAGTCACTTACAGGTAATTACTAATTAAAAAATGTCTCTACAGTATATAGTTAACTATGTTGCCTAATTGGTTAACTGACTTTCTTTCTAATTCCTTTTTGCTTAACCGATAGATGTATAGAAGTAAAAAGATTGATGATTTTGGTCAAGGTACTTGTATATTTGTATAATTTTCCATATCAAGTAATATTGCAGTAAAATTGGATAAATATTAATGTATTATATGCTTAACTCAGTTATCGGTGAACAAGCAAATGAGATCCAAGGAAAAGAGCAGTACATTAGCAGTCTAAGCCACTTTCCAATGCTACATGGAAGACCCTTTGCCACTTCAAGGTTCTTATATAGTTAATTTTTAAGTATATATGATTGATAATTACATCTCATAATCAATGATTATATGATTTGGATGTTTGGCTAATTAGATAAGGCGCATCCTCTTAGAGCAGTCATGGATACTAGGTGCATAATAGATGCCTTTTCATAATTTTTGAACAAATTAATGGTGAAAATCAATCATTACCTATTCATACCATAACATGTGAACAGCCGATACTAATTTTTGTTTGAATAATTGTGTGATACTTTTGATTTTTAATATATTGTGCATTACCTTAATCTGGTATTGCAACTGTTGTTTTGTTCCTTTCTTCCCCCATTTGATATAGGATTGTAATGGAACCATGAATGCTTCTGTATGCTGCTATGAAGAAAGAGAATTAACACAAAAAATAAT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_008777611.1	1.0e-43	uncharacterized protein LOC103697515, partial
Swissprot	Q07121.1	1.9e-18	MAOXI
trEMBL	A0A8B8ZVD1	7.4e-44	Amine oxidase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G42490.1	74.00	1e-42	169		Copper amine oxidase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G04281	AT2G42490.1	100	26	0	8	107	633	732	74.00	1e-42	169
AfisC3G04281	AT2G38300.1	75	25	1	146	219	70	144	65.33	1e-20	97.1
AfisC3G04281	AT2G40260.1	74	26	1	144	217	96	167	62.16	3e-18	89.0

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF01179.17	Cu_amine_oxid	Domain	8	107	102.0	3e-29

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000719	P	photoreactive repair
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0003913	F	DNA photolyase activity
GO:0005618	C	cell wall
GO:0005634	C	nucleus
GO:0055114	P	oxidation-reduction process
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007623	P	circadian rhythm
GO:0009536	C	plastid
GO:0009650	P	UV protection
GO:0009944	P	polarity specification of adaxial/abaxial axis
GO:0009956	P	radial pattern formation
GO:0010051	P	xylem and phloem pattern formation
GO:0010158	P	abaxial cell fate specification
GO:0010229	P	inflorescence development
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0016036	P	cellular response to phosphate starvation
GO:0052597	F	diamine oxidase activity
GO:0055063	P	sulfate ion homeostasis
GO:0071486	P	cellular response to high light intensity
GO:0080060	P	integument development
GO:0097185	P	cellular response to azide
GO:1905392

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network