result

Gene information

Detail information of AfisC3G04827

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G04827	chr3	859459659	859464551	-

Sequences

CDS

>AfisC3G04827
ATGCCGTCTAATATGTACATGTATTCAGTAATGAATATGAAGTTTGCATTTTTCTTACTCATCTCTCATCTTTTCTATTATTCTTTTGCCACAGACCTTATATCTCCAAATCAAAATTTATCCGAAGGAGAACAACTAATTTCATCAGGCAGAAAATTCGCACTTGGATTCTTCAGCCCCACGAACACAAGCAACAAATATATCGGTATCTGGTACCATAACATCAAACCACAAACTATAGTATGGGTTGCTAATCGCAATATTCCAGTCACAAACCATAGCATGAGTGTAAGTTTAACAATATCTCCTAATGGCACTCTTTCTATAAATGCTAATGGTACCTCTTCCATCATCTTGTTTCTGCCCTCTTCATCCGTACCGAATCCTATTGCACAGTTATTAGACACTGGAAACTTCATTGTTCGAGATTCTAAAAACGATCAAGAAAACATGTACGCATGGCAAAGTTTCGACTACCCAACTGATACGCACCTGCCACACATGAAGCTAGGCTGGGACCTAACTAGGGGCTTGGCCCGTAACCTCACTTCCTGGAAATCTGAATTCGACCCATCTCCAGGCTCCTACTCTCTTGCCATAGACATCCGCGGCGGTCACGAACTCTCCCAATTCAACGGTGCTGAACGGGTTTGGAGATCCGGAATGTGGGACGGGTTAGAATTTAGTGGGTTACCCGATTTCAACACCTACGGTGACTACAACTTAACATTTATAAACACCACTTCAGAAATATCGTTACAATACGAAATGACCAACCCTTCAACGCTTGCAAGAACGGTAATCACGTACACTGGTTTTACGAATAGGTACATATGGGTCGATAGTTCGGGTGCATGGAACTTAATATGGTCTGGGCCCACTGGTAGGTGTGATAAGGACAGTGTATGTGGGGTGAATGCTAAGTGCAACCCGAGCACGTTGCCTGTATGCGAGTGTTTTCATGGGTTTGGGCCTAAAAGCCCAGCGGACTGGGCTATTAGGGATGCGAGTGAGGGGTGTGTGCGTAGGACTGGGCTGGACTGTAGGAATCGGACTGATCTGTTTTTCAAGATGGAGCATGTAGTGCTGCCTGATACTTTAAGTGCAACTATTGATGCAAGTATTATAAGTCTTGATGACTGTAAAGGGAGGTGTTTGAGAAATTGCTCTTGTACTGGGGTTGCAAATACGGATGTGCGTTATGGTGGAAGTGGTTGTGTTATGTTTGTTTCTGATCTTATTGATGTTGGCGATCTTGGGAATGATGGTCAGGATTTCTATCTCAGGTTGGCTGCAGCTGACGCAGATCGATATAATGAAGAGAACTGGAATGAGGAAAGTAAAGTGGAAGATGAAGATCTAGAGTTACCATTATATGATCTAGAGACTATGGTTGTTGCGACTGATAATTTTGCAGTTGCTAATAAACTTGGAGAAGGTGGATATGGTCCAGTGTACAAGGGCATCTTACAAGGGGACAAAGAAATTGCAATCAAGAGATTGTCTAAAGATTCCAACCAAGGAATTGATGAATTTAAAAATGAGGTTTTATTGATCGCAAAACTTCAACATAGAAATCTTGTCAGACTATTGGGTTGCTGCACACAAGGGGAGGAGAGGATGCTAATATATGAATATATGCACAACAAAAGCTTGGATGCTTTTCTATTTGATAAAGCAGAGGGCGTAAGCTTGGATTGGCCGACGCGCTACCATATTATTACAGGAATTGCACGAGGGCTTCTGTACCTTCATCAAGACTCTAGGTTTAGAATAATCCATAGGGACTTAAAAACTAGCAATGTTCTTCTTGACATAGATATGAATCCCAAAATTTCAGATTTTGGATTAGCAAGAATTTTCGGTGGGGATGAGGCAACCACGAGGACAAGACGGGTGGTTGGCACATATGGTTATATGTCTCCCGAGTACGCAATGGATGGTATTTTCTCAATCAAATCTGATGTGTTTAGCTTTGGAGTTATAGTACTTGAAATTGTAAGCGGACAAAGAAGTAAAGGCGTGTTCCTCGCTGGACCACAGTCTAACCTCTTAATGAGAGCATGGCATTTATTGACTGAAGGCAGAGGAGAAGAACTAATTGATCCATCTATGAGTCCAGGCTTCTCTTTGGATGAAATTATAAGATGTATAAAAGTAGGCGTGCTATGCGTACAAGAAAAACCAGAAGCCAGACCAACAATGTCATCGGTGGTGGTCATGTTGAGTGATAATCAAGATGCATCGGTTTGTCAGCCACAAGAACCGGGGTTTGCAGCAAAAAGAGATCTATCCTTTCCAAATTCTCCTTCTAGTAAACATGATATATTTACTGGTAATAGCATTTCCTTTTCAATGGAAGTGGGTAGATGA

Protein

Gene

>AfisC3G04827
TCTAAGTCAATTATAGCACCTACTATTTGCACATAAATGACAAATCCTATCAAGTTCTTATATGCCGTCTAATATGTACATGTATTCAGTAATGAATATGAAGTTTGCATTTTTCTTACTCATCTCTCATCTTTTCTATTATTCTTTTGCCACAGACCTTATATCTCCAAATCAAAATTTATCCGAAGGAGAACAACTAATTTCATCAGGCAGAAAATTCGCACTTGGATTCTTCAGCCCCACGAACACAAGCAACAAATATATCGGTATCTGGTACCATAACATCAAACCACAAACTATAGTATGGGTTGCTAATCGCAATATTCCAGTCACAAACCATAGCATGAGTGTAAGTTTAACAATATCTCCTAATGGCACTCTTTCTATAAATGCTAATGGTACCTCTTCCATCATCTTGTTTCTGCCCTCTTCATCCGTACCGAATCCTATTGCACAGTTATTAGACACTGGAAACTTCATTGTTCGAGATTCTAAAAACGATCAAGAAAACATGTACGCATGGCAAAGTTTCGACTACCCAACTGATACGCACCTGCCACACATGAAGCTAGGCTGGGACCTAACTAGGGGCTTGGCCCGTAACCTCACTTCCTGGAAATCTGAATTCGACCCATCTCCAGGCTCCTACTCTCTTGCCATAGACATCCGCGGCGGTCACGAACTCTCCCAATTCAACGGTGCTGAACGGGTTTGGAGATCCGGAATGTGGGACGGGTTAGAATTTAGTGGGTTACCCGATTTCAACACCTACGGTGACTACAACTTAACATTTATAAACACCACTTCAGAAATATCGTTACAATACGAAATGACCAACCCTTCAACGCTTGCAAGAACGGTAATCACGTACACTGGTTTTACGAATAGGTACATATGGGTCGATAGTTCGGGTGCATGGAACTTAATATGGTCTGGGCCCACTGGTAGGTGTGATAAGGACAGTGTATGTGGGGTGAATGCTAAGTGCAACCCGAGCACGTTGCCTGTATGCGAGTGTTTTCATGGGTTTGGGCCTAAAAGCCCAGCGGACTGGGCTATTAGGGATGCGAGTGAGGGGTGTGTGCGTAGGACTGGGCTGGACTGTAGGAATCGGACTGATCTGTTTTTCAAGATGGAGCATGTAGTGCTGCCTGATACTTTAAGTGCAACTATTGATGCAAGTATTATAAGTCTTGATGACTGTAAAGGGAGGTGTTTGAGAAATTGCTCTTGTACTGGGGTTGCAAATACGGATGTGCGTTATGGTGGAAGTGGTTGTGTTATGTTTGTTTCTGATCTTATTGATGTTGGCGATCTTGGGAATGATGGTCAGGATTTCTATCTCAGGTTGGCTGCAGCTGACGCAGGTATGTGCCAAAAAATGTAGTTTTTTTCAGTTATTACCGTTACTAGACCCCAGTGCTTGAATATTATCTCTGTCTTCTAAAAGACGTTCAATTTTTTTTCTATCTTGATACAAATGGACAAAGTGAAACACTTTTTTGTCCGTTTTATAGAAGTTGATGATGATTGATGAAAAGATGCAACTATTTGTGTTAAAACAGTCACATGTGTTTGCAAAATATGAGTAGAGTTTCAACGGCCATATACCCACTGTTTCACCTTCTTGACCCCTGGTTAGGCAAGAAATGTTTGAATGGACATAATTTAAAATTTATCCCATGTTATGAACCAACAATTTTTACTAACATTTAATGTATCATCACTATCATCTACAAATAATAATGTGGAATTAGACATAGTCGTGAAATGAAGGAAAATATTGAATTTTCTGTGGTCAATTTTAGAATGGTATGATCTATTTTAATATTAGTTGAGTCACATTTTAAAACACATTAGGCAGCTTCCTCCCTTGTAGTTAAGTACTAATTTTTTATGTTTAGAGCTTAGAAGCCACAGTATATAGTTTTTCTTAATGGTGGTTGAGTTTGAAAAGATGAAGTACTTTCCTGTCTGTTAAGGAGTTAATGTACTATTAATACTTGATACAATGTTGAAATTATGTTTGGTATTATTGACTTAGCAATGTGCCTTTAAAAATATATTCTTGACCAAACAGTTGCCAGCATCAACGCATTATGCATTTTTTATTTTTTGGCTTTTGACTTTTGAAATCTTCCAGGTGCACAACTCAAGCAACCATTTTTTATTTCTGTAAATAATAATCAAAGATCAACACAGGAATATAAACTTTTCATATTACGAAACCAGACATGCGTATATACATGGGATGTTTTAGACTGGGTCCCGGAACTGCATGATTTGTTATGATTTAAGATCCCGCTAACTGCAAAAATGTTCCACCTACGAATGATTGAATCAATCTCTTTAAGTTAGAAGCTACTGTTCCTATTTTCATTTGTTTTCATCACTGTTAAAGTACCATAGAAATAAGTTCTTATTATTCAACATATTAAATTCTCTTCAACCACAAAATGTGTTTAATTCAAAAATAAAATAAAATTGATACCTTAACAGCTATGTCGACATCACAAAGCAATTCTAGCAAGAAAGAGAGTAGAATCATTGCAATCACGGTGAGCCTTGTCATCGCTTTATTGCTTGCCTGCATCATGTACTGCATATGTAGAAAGAAGAAAAGAATTAGAAAAGGTACACTTGCACAGTGATCGGTTTTATATTCCATCTGATATGTATATCTACATGTGAATATCTGCAATATTTTAACATCATATGAGGGAAAATAATATCTGAGATTCATTATAATGTGGATGAGAACATTTACATATGATATAGATCGATATAATGAAGAGAACTGGAATGAGGAAAGTAAAGTGGAAGATGAAGATCTAGAGTTACCATTATATGATCTAGAGACTATGGTTGTTGCGACTGATAATTTTGCAGTTGCTAATAAACTTGGAGAAGGTGGATATGGTCCAGTGTACAAGGTAGGATTACATATCCAATTAGCATTATTTATGGACTACCATTACTTCTGTTTCATTTCCACAGTTACTGTTGAAACTAATTCATATTTTTAATTACATTCCTACCTCTAGATATAGGATTGATATATAGTTGCAATCATACCTTATTGTTTCCTCCTTACTGTAAACTCTTCTAAAACAATTGATTGGATACACCTAAACTTACTAGTTACTATATCAGAAACAAAATGCATCATAAAAAACCACTCATCCAATGGATTTACTTTACTTTTTTTCCCCCTTTCCAGAAAGTCGATAAGAACACGCCCATTTTTTATACCACTTTTGAATTTTGCATCTCTTCAATATACAAACTTTACTTTCACAGAATTCATGTTAGATAATTCAGTAGCTTTTCACATTAGAATAACCTGAGAACTAACTAATCTCTTAATATGAAAATTAGTTATCCTAATGTACAATTTAATGTATGTCAGGGCATCTTACAAGGGGACAAAGAAATTGCAATCAAGAGATTGTCTAAAGATTCCAACCAAGGAATTGATGAATTTAAAAATGAGGTTTTATTGATCGCAAAACTTCAACATAGAAATCTTGTCAGACTATTGGGTTGCTGCACACAAGGGGAGGAGAGGATGCTAATATATGAATATATGCACAACAAAAGCTTGGATGCTTTTCTATTTGGTAATTTACTTATATTCCATCAATTAGAGAAACATAATTATCATAACCTTTTTTTTTTAGAAATTCAGTAATTGACATCCAAATGATATTAATGGTCCACAACTGATTATTATATAACAAATCATAACACCACCAATGACAGATAAAGCAGAGGGCGTAAGCTTGGATTGGCCGACGCGCTACCATATTATTACAGGAATTGCACGAGGGCTTCTGTACCTTCATCAAGACTCTAGGTTTAGAATAATCCATAGGGACTTAAAAACTAGCAATGTTCTTCTTGACATAGATATGAATCCCAAAATTTCAGATTTTGGATTAGCAAGAATTTTCGGTGGGGATGAGGCAACCACGAGGACAAGACGGGTGGTTGGCACATAGTAAGAGTAAACTCCTTTAACAACATGTTTTTACACAATTTTTCGTTCTTTCAGATATTTCTTTTTATTTATGTATCTTAAAATATGCAGTGGTTATATGTCTCCCGAGTACGCAATGGATGGTATTTTCTCAATCAAATCTGATGTGTTTAGCTTTGGAGTTATAGTACTTGAAATTGTAAGCGGACAAAGAAGTAAAGGCGTGTTCCTCGCTGGACCACAGTCTAACCTCTTAATGAGAGTAAGTTTTAGAATATCCACTCAGAGCACATTTAGTAACACGTATATGCAGTCAACAATTTATAACTTATTTATATTGTATGTTTGGCAACAAGAAAATAAATAAATAAGTTGTTCTAAAGTTGATAGGTCACAGACTCACGGTTATCAAACATTTGCTTCTCGTTCCAAACATTCCAGTCTTTGCTATCACTTAAAACTACTTGATAGATAAAACTTAGAAGTTACTTTTAAGTGGTTATAAATAAAGTTGTTCCCAGATGGACTCAAACATTGTTTGTTGTGATTTGGTTAGATAATAATGTTGTGCATTGATAACATGGTTCTAAAAATAATTTCAGGCATGGCATTTATTGACTGAAGGCAGAGGAGAAGAACTAATTGATCCATCTATGAGTCCAGGCTTCTCTTTGGATGAAATTATAAGATGTATAAAAGTAGGCGTGCTATGCGTACAAGAAAAACCAGAAGCCAGACCAACAATGTCATCGGTGGTGGTCATGTTGAGTGATAATCAAGATGCATCGGTTTGTCAGCCACAAGAACCGGGGTTTGCAGCAAAAAGAGATCTATCCTTTCCAAATTCTCCTTCTAGTAAACATGATATATTTACTGGTAATAGCATTTCCTTTTCAATGGAAGTGGGTAGATGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020256468.1	2.0e-289	receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-8
Swissprot	O81832.4	4.8e-203	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290
trEMBL	A0A5P1FCT7	1.7e-285	Receptor-like serine/threonine-protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G27290.1	47.01	0.0	713		S-locus lectin protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC3G04827	AT4G27290.1	787	398	9	11	786	1	779	47.01	713
AfisC3G04827	AT4G21380.1	801	374	12	27	762	25	819	44.44	672
AfisC3G04827	AT1G11340.1	843	420	13	12	790	68	901	41.52	635

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF01453.21	B_lectin	Domain	78	188	81.9	2.7e-23
PF00954.17	S_locus_glycop	Domain	218	326	90.7	7.3e-26
PF08276.8	PAN_2	Domain	348	416	62.6	2.3e-17
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	473	741	165.2	1.5e-48

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005773	C	vacuole
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0051707	P	response to other organism
GO:0009875	P	pollen-pistil interaction
GO:0031625	F	ubiquitin protein ligase binding
GO:0045087	P	innate immune response
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0050789	P	regulation of biological process
GO:0071215	P	cellular response to abscisic acid stimulus

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network