result

Gene information

Detail information of AfisC3G07157

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G07157	chr3	1277251218	1277257206	-

Sequences

CDS

>AfisC3G07157
ATGTTCCCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCTTTTTCTCTATCTCACAAACACAGCAAATCGATTTATCGGCTTTACTCGACCTCCGATCAAGTCTCGGCATCCGATCCATCCACTGGCCCAAGAGAACCGACCCATGCACCAACTGGACCGGCATATCTTGCCGCTCCAACCGCGTCATTTCCATCAATTTGTCTTCTTTGACCCGAACCCGACTTGGTCGGTTGAACCGTAGATTCTCCGTTGATGGTTTAAAGAAACTCGACCGGCTTGAGTCTTTCAATTCAACTGGCTTTCCACTTCCCGGTCCGATACCTTTCTGGTTCGGTTCCGAGCTTCCAAAATCTTTAAATGTTCTTGTAATTAGTTCTGCGTTTGTTAATGGTAGCGTTCCTTATAATATTGCACAGCTTGGCAATCTGACTGTTATAGATTTGTCAAACAATTTTATATCTGGGTCTGTTCCTTCTACTGTTGGAGCTTTGTCTAAATTGAAAATATTGAATTTTTCAAAGAATAGGTTTACTGGTTCAATTCCGGAGTCTATGTGGTTACTGGAGTTGAATGTTTTCAACATTTCAGGCAATAATTTGAGTGGGATTTTGCCTGAAGTTGTTCAGGCTGAGGTGAACCCTGACGTTGGTGTTTCCACTTTTGATATCTCCAACAATTTGTATTATGGTTCGGTTTCAAGTGCCTTTGGAATGTATTTTAAGAGATTTGGTGTTGTTGATTTTTCGGGAAATTATTTTCAAGGTATTGTTCCATTGAATGATAATATTAGAAACTATTCCTATGGACTGAACTGCTTTCGAAGTGCATTGAATCAACGTAATTTGGCTGAATGTGAAGAGTTTTACAAACTTAGAAAAGTAGCTTATATTGGTCCGATGACTCCAAAATCAGCTGCACCACCACCTACTTCTCCTATAAGTAGGAAGAAGAAAAGTCAATTATGGAAGTACATTTTGATAGGATTTTTTGGATTCATTGGTCTAATAGTTACTGCAGTTTTCATGTTTGTGTTTTGTTGTGTGAGAGCAAAAACGCATACTTCAGATCAAGAGGTTGGTGTTAGAGCCGTTACTTCTGGAGTAGGACCTCCTATGGGTACTGGAGTAGTTTCAAAAAATCGCTTGTCACGTGAACAATCCATCACTTATAACCTTATAGGTAAAGAGACGTTCACTTTTGAACAGTTGGTTCAAGCTACATCTGAATTTAGTGATGCTAATCTTATAAGAAAAGGACACTCGGGTGATTTGTATAACGGTGTTCTTGAAAATGGGTTTAGTGTAGTAGTAAAAAGGATTGATATTAACAAGCTTATGCATAAAGGGTATGCTGCAGAATTGGAGTCGCTTGCAAAGTGTTCACATATCAGAATTGTTCCCTTTCTTGGGCAATGTTTGGAGAAGGAGAATGAGAAGTTCATGGTTTATAAGAAAATTAAACATGGTGACTTGTCTACTGCTTTGTATAATGATAATATGAAGAAGAAGGACGAAGAGGACAAAGAGGGTTTGACATCATTGGATTGGATTACAAGGTTGAAGATTGCTGTTGGAATGGCCGAGTCTCTTTCTTTTCTTCATCATGAGTGCAAACCACCGCTTGTTCATAGAGATGTCCAAGCAAGCAGTATTCTTCTTGACGATAAATTTGAAGTGCGGCTTGGAAGTTTAAGTGATGTCTGTACACAAGTAGGTGACGGAAATCAAGGTGTATTCACAAGGTTTTTGAGAGGATCACAGGCATCTGAACAAAGCACGTCTGGTTCTTCAACGGCAACATGTACATACGACATACACTGTTTTGGCAAAGTCCTGCTAGAACTAGTAACAGGAAAGCTCGGCCTAAGTGGGTCCGTGGATCCTACAGCAACCAAATTCATCGACCACACACTTCACCAAATCAGCACCTATGACAAAGAAACAATAACAAAACTGGTAGACCCATCCTTAATCTTAGACGAAGATCTAACTCAAGAAGCATGGGCAGTAATGGTAATAGCAAAATCCTGCCTCAACCCGATACCGTCTAGAAGACCAATAGCTAGATATGTGCTCAAAGCATTGGAAAACCCGTTAAAGATATTAAGGTTGTACAGTGGGTCGAATTCTATGGGGCTGAGAACATTGTCATCCAGAGCTTCGTGGCATGGAGCTTTTATGGGAAGTTGGAGGCACAGTTCTGATAGCATGGTGGGGCCTGGACAGTTGAAAAGGTCGGGCACTGATAGGTCCCAAGGAAGCTTGGGTGATCACTCGTTTTCTTATAAAAGACGATCTATGGAGATTTTTCCTGAGCCTATCAATGGCATGAGCAATGGTTATGAATGA

Protein

Gene

>AfisC3G07157
CTTTGTTTCTCCCATAAATACACTCGTGAAAACCCCATTCAAATCAATTAAATGAAACAGTAAAAAAGAAAATATGTTCCCCCTTCTCCTTCTCCCTCTCTTTTTCTCTATCTCACAAACACAGCAAATCGATTTATCGGCTTTACTCGACCTCCGATCAAGTCTCGGCATCCGATCCATCCACTGGCCCAAGAGAACCGACCCATGCACCAACTGGACCGGCATATCTTGCCGCTCCAACCGCGTCATTTCCATCAATTTGTCTTCTTTGACCCGAACCCGACTTGGTCGGTTGAACCGTAGATTCTCCGTTGATGGTTTAAAGAAACTCGACCGGCTTGAGTCTTTCAATTCAACTGGCTTTCCACTTCCCGGTCCGATACCTTTCTGGTTCGGTTCCGAGCTTCCAAAATCTTTAAATGTTCTTGTAATTAGTTCTGCGTTTGTTAATGGTAGCGTTCCTTATAATATTGCACAGCTTGGCAATCTGACTGTTATAGATTTGTCAAACAATTTTATATCTGGGTCTGTTCCTTCTACTGTTGGAGCTTTGTCTAAATTGAAAATATTGAATTTTTCAAAGAATAGGTTTACTGGTTCAATTCCGGAGTCTATGTGGTTACTGGAGTTGAATGTTTTCAACATTTCAGGCAATAATTTGAGTGGGATTTTGCCTGAAGTTGTTCAGGCTGAGGTGAACCCTGACGTTGGTGTTTCCACTTTTGATATCTCCAACAATTTGTATTATGGTTCGGTTTCAAGTGCCTTTGGAATGTATTTTAAGAGATTTGGTGTTGTTGATTTTTCGGGAAATTATTTTCAAGGTATTGTTCCATTGAATGATAATATTAGAAACTATTCCTATGGACTGAACTGCTTTCGAAGTGCATTGAATCAACGTAATTTGGCTGAATGTGAAGAGTTTTACAAACTTAGAAAAGTAGCTTATATTGGTCCGATGACTCCAAAATCAGCTGCACCACCACCTACTTCTCCTATAAGTAGGAAGAAGAAAAGTCAATTATGGAAGTACATTTTGATAGGATTTTTTGGATTCATTGGTCTAATAGTTACTGCAGTTTTCATGTTTGTGTTTTGTTGTGTGAGAGCAAAAACGCATACTTCAGATCAAGAGGTTGGTGTTAGAGCCGTTACTTCTGGAGTAGGACCTCCTATGGGTACTGGAGTAGTTTCAAAAAATCGCTTGTCACGTGAACAATCCATCACTTATAACCTTATAGGTAAAGAGACGTTCACTTTTGAACAGTTGGTTCAAGCTACATCTGAATTTAGTGATGCTAATCTTATAAGAAAAGGACACTCGGGTGATTTGTATAACGGTGTTCTTGAAAATGGGTTTAGTGTAGTAGTAAAAAGGATTGATATTAACAAGCTTATGCATAAAGGGTATGCTGCAGAATTGGAGTCGCTTGCAAAGTGTTCACATATCAGAATTGTTCCCTTTCTTGGGCAATGTTTGGAGAAGGAGAATGAGAAGTTCATGGTTTATAAGAAAATTAAACATGGTGACTTGTCTACTGCTTTGTATAATGATAATATGAAGAAGAAGGACGAAGAGGACAAAGAGGGTTTGACATCATTGGATTGGATTACAAGGTTGAAGATTGCTGTTGGAATGGCCGAGTCTCTTTCTTTTCTTCATCATGAGTGCAAACCACCGCTTGTTCATAGGTATCGTTTGAACTTTCAAAATGCTTACTCGACTCTTCAATATCACAACCGCATCGTAAAATCTTGGCACAGTATAACAATATAATATATTGCTGTTATTTGTTCTCAAATTTAGTTTTATTTTTTTATTTTTTCTATTATCATGACATCACCCTAATGAAATCTTCATTATTTTGCAATTCAGACTAAGTTATTGCCTATGTTTTTCATTACTGGTTACCATTAAACTGACTTGTGATAATGCACGGTATTATTACCTAAACTATCACTCTTACGAGTTTTATTGAGACAAAAGATATATGCAAATATGTTTTGAACTTTACATAAGACTGTTTCACTGATTCAGTTGTTTAAGGCACGGTATATGATATGCAGTTATGCACAAAATTAAAACTATATGGCTGGGACCAGTAATGTTCAGAATGTATATATAATTAATCAAAATTCGTTATTAAAGATCAGATTCTAAATCCAAATTTCAGTCCACTTCCTAATCATGTTGAATATTAAATTATGCACTTGTTTATATTAAACTATATTACACCAACATCATTAGTTACTTAGCTGAGGAGGCGCGTTCTAATTTTGTTTATGTCTTGAAGCTTTCATCCGATTGAACATACTACAACAAATCTTTTAGTAACTCTTTGGTCCAGTTAATCATAAACTAGAATATGAGATGTTCCACATATCTTTGACATTTAGTTTAATGAGGTAGACCTCTTTGTTGGTACATGGATGCTATAAATATCAACAAATTTCTCAGATAAATATTGCAGCAAACTTTTTATAAACCTGTTTCCTGACATTCCAAATTGATAATTTGGTACTAAAATGTATGAATTCTTATTGGATGCATAGAAGTAGGATGTTATTTATTTTTTGATTATCTAACAAGTTTGAAGTTTAAATTGAAACCAAAATGGTACTTCGCTGCATTCCTGTAGGCTGTAGGTATATGATAACAAAATCACTAAGTCAGGGTTCTCAATTTTTTTCCCTTCCTCAACATTTTACGTCTACTTTGTTCTGATGTTGCGGACAAAATTTGTACTGAAGTACCTTGTAACATTCAGCCTTTACACAAAATCATGTTCTGAAACATAATTGAACAAAAATTTCTTTTGACATAGTTATTTGTATAGTTCATGTATTGGAAACCAAGCAAGGCCCTTTCTGTACAGAGCGGTTTATGATTATTTCTTATTGTTAATAGTAGAAAGAAATACCGTTTCAATTTGTTGCAGAGATGTCCAAGCAAGCAGTATTCTTCTTGACGATAAATTTGAAGTGCGGCTTGGAAGTTTAAGTGATGTCTGTACACAAGTAGGTGACGGAAATCAAGGTGTATTCACAAGGTTTTTGAGAGGATCACAGTAAGTTTCTTTTACCATTGATAACTCCTAGTCATATTTTCCTGGTAGAACTGGAACTAAATATCATAGTTTCTTTCATCATTAAATTTATTAATTGATAATCATATCTCTCTAGGTAGGATTTGAAATACATCTCATGGCTTATCGTTGCATATTTGCTGCACAATGCATACAAATGCCACATTAGTATGGGTATTTTCCTTAATTTTAATAAGAGATATAAACTCAGAAACGTTCATCCTATTTGACCAACTAGGTGTGCGAACAACACAAATGTTACTAAACAACAACATGCTTCGAAAAATAAAGCATTCCCTTACCCAATTACGTAAAATATAGCAAGCTATGAAATGTGCATTTTTCATTTTTGTAAGTTCTAGGTATAATTAGAAGGGTAATTTCAACATGTGCCCTAAGGGCATATATTAGGAATGAATGATTATGCTAAAAGAAAAAAACTTTTTTTTGAAATGCATATTTTGTCAAAACACAAAGGTTGACGTGTGTATCTCAGCAGGTGATTTGGATAAATTAACAACCTTAACATCACAAGTTAACATTTCCCTAATTAGAATTAGTTAAATTTTGCTTAGGATAAAACAACTAAAAGTTCTTTTGGTTATACTTCTCATTTATGACTTTTTATTTAGTAATCTATTTATAAGTTGCCAAAACTTGAAATACCAAAACACCATTCATTTCTGTGCATGTTACCTCAGCTTGAAAAGTTGAGGTGCGTTCACGAATTATATATTGTCATAAAAGGGTGGCTATTATATTAAAACAGTTGGAGAATTCTATATTAAGATTCCTAGCATTTAAAAATAAGATAGTATACTGACAATGTCAATGCCGAATAATTCAAGTCATTAACAATCACTATCAATATTCTAAACATTCTTGTTATGAAATGCTCTGTTTTTGTATCGTTGTCAAAATTCAAAGTAACAACATGCTTACACTTTCTAGTTATCTCTATTCTTATTCTGGTTGATGGTGTCCATTATTTTAAGCCAGCGTATCATTTTCCCTTTGTTAGAGAGTTATACATGGGTTGAGAAAACTTCAACAGTATTAGATTAATTCCATTATGCGTATTTTAATTGGCAAATGACATACATAGGCTTTATTCCATATTTATTACTATAACAACTATCCACTTGACTGCGATACATGGCTGTATGAAAGATTTGAATTCTCATGAGTTGAACTGAAAATAATAATCGTCTGGACACTAACCATTCAACTATTGGTACATTAGTTAATGAAATATAGTGTGATGGAGAATCAGTCTGACCAAATTTAATTAGCAATGGAGATGTTGAAAGTTCATTGTCCAAATGAAGAATTTGATTAAACAAAATGATAAATTATCATAAATTAATTCAATAGTGTATATTGTTAAGCGCACATAAACTTTTCTTGTTGTAGATGTCTTATAAGCATCAAAAAGAAGGGGAAAATGTCAATGGGGAGGGCAAAGAAGCAAAGATGAGTGACTACTGCAGTCAAAACCAATAAATTAATTGATGAACAAATTAATGCATCAAATGTTTACAAAAACACATCTAAATGCCTACCTCGTTTTAGCTTTGCTTTAAAATAATATTAAAAAAATGTCTACCCCGTTTTATCAGCTACTTTTTCATTGGTTGTTCGGGTGATTTACAAAGCAACATATAATGTATATTCAATCGCAATATTTTATATGATCCTATTATACCCGATTTACTTCCTCATGGCTTCATACTCTAATTCAAATATTTAATGTCTATTGCAGGGCATCTGAACAAAGCACGTCTGGTGAGTATACTTGTAAATCACCATTCTCTCCCTGGATCAAAATCAATTTGGATTTAGAAACATAGAAGCTAAAGCGTCAGAATCAATTTAAAAGATATAACTTATTAATGTGGCAGAAAGATTCTATATTTTCACATATTTAAATATCATAAAATAACCTACTTACGACAAAATTATTAGAATAAAAGTATATATGTACATTACAATATAAAGCCACTGAATCTAAGATCCATGATTTAATGCTTGTTTTGCTCTGAAATTTGAACTTCATGATTCCAATCTCGTTTTGAAAACGTTGTTGGTGAATGTGGAAGCTTTGTATCATCTGCATTGGCGAGTAATGAAGGCCTATATCTATTATAAAATTTTAATTATAAGCATAGTCTTTCGTGATTCAGGTTCTTCAACGGCAACATGTACATACGACATACACTGTTTTGGCAAAGTCCTGCTAGAACTAGTAACAGGAAAGCTCGGCCTAAGTGGGTCCGTGGATCCTACAGCAACCAAATTCATCGACCACACACTTCACCAAATCAGCACCTATGACAAAGAAACAATAACAAAACTGGTAGACCCATCCTTAATCTTAGACGAAGATCTAACTCAAGAAGCATGGGCAGTAATGGTAATAGCAAAATCCTGCCTCAACCCGATACCGTCTAGAAGACCAATAGCTAGATATGTGCTCAAAGCATTGGAAAACCCGTTAAAGATATTAAGGTTGTACAGTGGGTCGAATTCTATGGGGCTGAGAACATTGTCATCCAGAGCTTCGTGGCATGGAGCTTTTATGGGAAGTTGGAGGCACAGTTCTGATAGCATGGTGGGGCCTGGACAGTTGAAAAGGTCGGGCACTGATAGGTCCCAAGGAAGCTTGGGTGATCACTCGTTTTCTTATAAAAGACGATCTATGGAGATTTTTCCTGAGCCTATCAATGGCATGAGCAATGGTTATGAATGAACCTTGATGGTGGTTTTAGGCTTGTATTCTATGTACATTTTCTTTTTCTTTTTATGTTTTATGGGTGTTGTAAATGGATAATTAGGTTATTGTAAGTTATTAACGTACAAAGATGGTGTCCAGGATGGTATAGATGATGAAATTTTGGATAAAG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020256288.1	9.1e-218	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250
Swissprot	C0LGK4.1	1.5e-116	Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250
trEMBL	A0A5P1FAR8	6.6e-218	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G16250.1	44.55	3e-145	512		Leucine-rich repeat protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G07157	AT2G16250.1	624	302	12	125	735	260	852	44.55	3e-145	512
AfisC3G07157	AT2G16250.1	254	134	4	24	256	40	291	38.19	4e-40	163
AfisC3G07157	AT4G39270.1	799	372	20	38	737	51	831	38.80	2e-137	486

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	20	53	24.0	3.1e-05
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	412	628	55.0	6.2e-15

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0006952	P	defense response
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0007165	P	signal transduction
GO:0005768	C	endosome
GO:0006468	P	protein phosphorylation
GO:0046983	F	protein dimerization activity
GO:0042802	F	identical protein binding
GO:0009416	P	response to light stimulus
GO:0009505	C	plant-type cell wall
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0051707	P	response to other organism
GO:0009741	P	response to brassinosteroid
GO:0009908	P	flower development
GO:0048646	P	anatomical structure formation involved in morphogenesis
GO:0032989	P	cellular component morphogenesis
GO:0048519	P	negative regulation of biological process
GO:0048580	P	regulation of post-embryonic development
GO:0048827	P	phyllome development
GO:0097159	F	organic cyclic compound binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network