result

Gene information

Detail information of AfisC4G01117

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G01117	chr4	200931686	200937410	-

Sequences

CDS

>AfisC4G01117
ATGGATAGTGGCTCTGATGATGAGTCACTTAGAGATAACAACGTAGATCTCAATGATGACAACTTAGACCATTTGGCATTGGATGTGAGCAACCACTTAGGTGAGGCAGATGCTATTTTTCCATCCCAGGAACAAAACTTGGAAAATACCGAACCATTTATAGGCATGGAATTTGAATCTGAAGATGCTGCAAAATTATTCTACATGGCATATGCTAGTCGTGTAGGTTTTTCAGTGCGCATTAGTAAATCCCGACGATCAAGAAACGATGAATCGATTATCATGCGTCGTTTTGTTTGTTCTAAAGAAGGATTTCACATGAAGAAGGATAATTTAGATGATGGTAAAAAGAAGAGGAGGAGGGCTACTATAAGAGAAGGCTGTAATGCAATGATTGAGGTAATTAAAAAATATTATGGCAGGTGGGTTGTCACTAAACTAGTGACTGAGCACAATCATATAGTGGCAGCACCAAGCAGGGTCCGATATATTGCACCCGAGGAATATGCTCATATTGAGCCATCTATTGGCATGGAGTTTCCATCTCATGAAGCGGCACAAACATTTTATTATGCATATGCTACTCGAGTTGGGTTTGATGTGCGAATTAGACTTTCACGTCGTTCAACCCGTGATGAATCTTTTGTGATGCGTAGATTTGTGTGCACTAAAGAAGGCTTTACTCCTTTCGAAGAAAATGGTGATGAGAGTAAGAGAAAGAGGGCAAGAGCTCCAGTAAGAGAAGGATGTAAAGCGATGTTTGAGGTTATTAAGAAAGAATGTGATAGGTGGGTTGTTTCTAAGCTTGTATTGGAGCATTCTCATGAACTTGTTGTTGAACCAAGCAAGGTGCACTACATACAATCACAAAGTGAGGTTGTTGTTCTTGGAAATAGCACAAATAATTGTGAGAAAACGACCCCTATTACCAATTCAACTATAGATACTAATTCCTTTATTGAGCAAGACTTGATAAGTGATAGTAAAGACCGTAGACAAATTGCCTATGGTTTTGAAGACACTCAAAGCTTTTTGGAAAATTTCAAAAGAAAGCAAGCAGAAAATCCAGCATTTTTTTATGCATACCAAGTTGATACGGATAATTGTTTAACTCATGCCTTTTGGGCAGATGCGAAAGCTAAAATGTCATATTTTTGTTTCGGCGATGCAGTAAAATTTGACATTTCTTACATGGATGATAAAAATATGATACCTTTCTTTCTGTTTAGTGGTGTTAATAATCACTTGCAATTGGTCATATTTGGATGTGGATTGCTTACCGATTTCTCAGAGCTATCATTTGTGTGGCTCCTTGAAAATTGGCTTATTGCCATGTGTGGTCGGCCTCCTGTTTCTATAGTTTCAGATTATGATGATTCTGTGATGCAAGCAATTTCCAAAGTATTTCCTCACACTCCTCACCGTCTGGACAAGTGGCATATTCTAAACAAAGTAAAGGAAAAATTGTCAAATATATATTTCACTCGACCTACTTTTGAAAGAGATCTGATGAGATGTATTGATGAGTCTCAAACGGTAGATATATTTGAACTACGTTGGAAGTCACTACTCAATGAATATAACTTAAGCGAGTGCTCATGGCTAGAATTTCTATACAATATTCGTGAAAAATGGGTTCCTGCTTACAATAAGCATATTTTTACTGCAGAAATTTCTAATGATCATAGACCAGAGTGTTTGAATAAGTTCTTTGAGAAGTATTTCAATACGAAGACAACTCTTCCTGTATTTGCTTATTTATTGGAACATGCTCTAATTGGCTGGCATGATAAAGAAAACTTAGAGGATTTTGCAACTTCATTTACCAGACCAGTATTACACACTCCATCCAATATGTTAAAACAGCTTTCAGAAATCTACACAAGAACAGTTTTTGATATATTTCAAGAGGAATTTATTGAATCTTTGGCTTATTATGCTGATAAAGTTGAGGATGGGTTGGTTTGTAAATATAATGTTGCCAAAGATGAAGACCTTGAAAGCATGAGCACTGTGATGTATAATCCATCAGAAAGAAGAACAAGTTGTAGCTGCTGCAAATTTGAAACTTCAGGTTTATTGTGTAGGCATATATTGAGGGTCTTTTTAACAGTTGATGTGCGTGTAATTCCTGATTTTTATATATTGAAACGGTGGACAAAGGATGCCAAAACTGCTTTTGGAGACATTACTTGA

Protein

Gene

>AfisC4G01117
CAGCTCTTAAATCAAACTTTCCCCTCTTCTCCTTGTACTTTCTTCATGTATTCTTCATAAGAACCCCCTAATCCAATAAACCCTAAAACTTTGCTTCTCTGTACTTCAATTTTCTGACTCTGATTTATAAGCTCGAAAAAGTTCGGACATTCCTTATCGAATATTTCTGGTATTTTTACAGCAAAATAATCCCTACTTTCTTCATATTCACAATCGCTGGCGGGGTTCAACCCCTCTTTATTTATTTTTACAATTTTCAGGGGAATGTGCACACTTCCCTAATATTAATTCGCTGCAGCCTTCCGCCTCTCCTCGAGTCGTTCGTTGAACCGCTGCCTTCCACTACCACGCTCTGCCTTCAATCCCGCCTCCATTAGTCCCGCCTCTAACTTCGGTAATTCTTGATTGCTTAAGAATTAAAGTTTGTTTGATAAATGATAATTGTTTTGATTGATTGAATCTTTTGATTGAAAGACAGTACTAATAGTTAGTGGATTTAGAATCATAGGAAGACAAGGTTTTTAGGTCTGCTTCTAGTTCTATTATTTAGAAACATATTGGTTTTTTTTTAAATGATTAATCCATTGCTTAGTGCACTAGTAATTGTTTTGATATCTGTGGATTGATCATGTTTGATGAGTTTGATTGTGTTTGATCTTGTCAGATTCGTTTGATTGTTAGTAAGTCAGTGGCTTGCTCATGTTTGATTACAAAATCATTAGTGGACTTGGTCTGAAGAAATTGTATGTATGTCAGTTTTTTTTTTGGAATTTTACCCTAAAATATTTTCTTTTGTGCATTCCTGTAACTATAATAACACTACCATTAAGAACATAATAAGCAAAAAAAATAGTAATAACAACTTTAAAATCCAGCCCACTCCACCTAAGTCTACCCTTGTACAACAATGCAGATATGGTTTTTCTCTTTTGTGCATTTCTGAGATTGTTTCTTGTAAAATCATATATAGTGTATAATAAAATAACAGCGGTGGATATTATATTCAATTTTCTTTTACATACTTTATCTCAGATATACATCTTAAAATATTGAGATATTAATTAAGATACAAAGTGAATGAACTTTTGTTTTTTAATCTCTTACGCTGACTTCATCACTACTCTATTAAATCTGTAAAAAGATCTACTTTTTTTAATCATAATGCTTATATTATCTAATCGGATTTTATATACTTTTGGCATTACAACATAGCTTGAGATATTTTTATAATCTTTTGATTGAAATTGGACTTAAATGATCTCATCAATGGTTCAAATTCTGTGCTTGATATTTGATGTATAATTATGAGTTGGGCATTTTAATCATGACTGGCAGGGCTTGTTGTACATAAATAGTCAAACTCCAATTGAAATAAAATCTTTAGGAGGTATCAATGTATAACCTTTCGTTTGTTTTGTAAATTCTTCAACACAAACTAAATATATTGCCTTGCCTAGATCAAGTATCCAAGTATCTGAAAACATATTGGACAAAGTATCCATTTTTACTATTTTAGATAGAATAAAAGTTTCCCTTTTAAAAATGATTTGTTAGGAATGTAAAGCTGTTGCTGGCTGTACATTTTTGATGTTTTCTATAATTCATAAGTTAAGAGGCGATAAGTTGTATCACATACATACTGAACAAGTTTGTTTGGTTTCATGTCTATAGCTGGACACTTTATTCAGTAAAAAACAGAAATTCTGAATAAATGTTACTAATAATATTCCAAATCTTTGTTAATACAATGTTGAACTAAATTATATTCTGAATAATACAATATCAATTCAATTCTTTGGAGTTGTAACTGATCATCAGAAAACAAAATAGCTAAAATTCTAACTTGGTTGCTTTATTTTTGTTTACAAGCCTGTGCTGTTAATTTTAAAGCTGCTAGGTCAAGATCAGAATGAGGCACAAAAAGATTTCTGAACCGTACAATAGAACATTGTTGCTTTGATAAAAACATTTCCACGAAGACTCCAAATTTTTTTTCCCTACAATAGGTATGGGTATAAAATTGCATGTAAATTTGCTCTCTTTTCCATGATGAGGTTATAGGGGATCAGGGAAAAAAGAGAGAAAAAAAGGAAGATGTATCATTTTTTTTCCTTTCCATGTTCACGATGGAAAGTAATGCTGAATTATACGTTCTTTTCTGCATTCGAATATTGAATTCCCAAAAAAGACAAGGACAAATGCAAAATCCCACCATCCTCCTTTATAAAGAAACGCAGCCCTTTCAGCATTGCCCTTAAAATAATTAATGCAAAAAATAGAATTCGGTTTATCACTTAGTTTAAGAGTTAGACTGGCCGACTTATGCAAAAATAGGCTTTGGTTAAAACATATTACAAAGATAGACCTTGTTTTAAGTTAATGCCAGTGCATTCTAAAAATACACATGCTTTTTTCTATTTTGTACACGCGAATCTCTAAAATGTGCATGTACAATCTCAATCTATGCATGTGCACTTTGAAATTTTGCATGTGTATTTTGTCATGCGTACTGAAAATGGGTCCTAATTTTGTATAATATTTCAAACAAGGTCTACTCCTACAATAAGTTTTTTTAGTACGCCTATTTCTACCATGAATCCCTTAGTTAAATTGTAAGCTTGATGATGTAATTAATTGCATTATTATTCATACACTCGTATTTGGTTAATCCATGGGATTTCATTTGTCCAAAAGCTGTTTGAATTATTATTATCTTTTGTTTCAGGTTATTAGTATTTGCTTATGGATAGTGGCTCTGATGATGAGTCACTTAGAGATAACAACGTAGATCTCAATGATGACAACTTAGACCATTTGGCATTGGATGTGAGCAACCACTTAGGTGAGGCAGATGCTATTTTTCCATCCCAGGAACAAAACTTGGAAAATACCGAACCATTTATAGGCATGGAATTTGAATCTGAAGATGCTGCAAAATTATTCTACATGGCATATGCTAGTCGTGTAGGTTTTTCAGTGCGCATTAGTAAATCCCGACGATCAAGAAACGATGAATCGATTATCATGCGTCGTTTTGTTTGTTCTAAAGAAGGATTTCACATGAAGAAGGATAATTTAGATGATGGTAAAAAGAAGAGGAGGAGGGCTACTATAAGAGAAGGCTGTAATGCAATGATTGAGGTAATTAAAAAATATTATGGCAGGTGGGTTGTCACTAAACTAGTGACTGAGCACAATCATATAGTGGCAGCACCAAGCAGGGTCCGATATATTGCACCCGAGGAATATGCTCATATTGAGCCATCTATTGGCATGGAGTTTCCATCTCATGAAGCGGCACAAACATTTTATTATGCATATGCTACTCGAGTTGGGTTTGATGTGCGAATTAGACTTTCACGTCGTTCAACCCGTGATGAATCTTTTGTGATGCGTAGATTTGTGTGCACTAAAGAAGGCTTTACTCCTTTCGAAGAAAATGGTGATGAGAGTAAGAGAAAGAGGGCAAGAGCTCCAGTAAGAGAAGGATGTAAAGCGATGTTTGAGGTTATTAAGAAAGAATGTGATAGGTGGGTTGTTTCTAAGCTTGTATTGGAGCATTCTCATGAACTTGTTGTTGAACCAAGCAAGGTGCACTACATACAATCACAAAGTGAGGTTGTTGTTCTTGGAAATAGCACAAATAATTGTGAGAAAACGACCCCTATTACCAATTCAACTATAGATACTAATTCCTTTATTGAGCAAGACTTGATAAGTGATAGTAAAGACCGTAGACAAATTGCCTATGGTTTTGAAGACACTCAAAGCTTTTTGGAAAATTTCAAAAGAAAGCAAGCAGAAAATCCAGCATTTTTTTATGCATACCAAGTTGATACGGATAATTGTTTAACTCATGCCTTTTGGGCAGATGCGAAAGCTAAAATGTCATATTTTTGTTTCGGCGATGCAGTAAAATTTGACATTTCTTACATGGATGATAAAAATATGATACCTTTCTTTCTGTTTAGTGGTGTTAATAATCACTTGCAATTGGTCATATTTGGATGTGGATTGCTTACCGATTTCTCAGAGCTATCATTTGTGTGGCTCCTTGAAAATTGGCTTATTGCCATGTGTGGTCGGCCTCCTGTTTCTATAGTTTCAGATTATGATGATTCTGTGATGCAAGCAATTTCCAAAGTATTTCCTCACACTCCTCACCGTCTGGACAAGTGGCATATTCTAAACAAAGTAAAGGAAAAATTGTCAAATATATATTTCACTCGACCTACTTTTGAAAGAGATCTGATGAGATGTATTGATGAGTCTCAAACGGTAGATATATTTGAACTACGTTGGAAGTCACTACTCAATGAATATAACTTAAGCGAGTGCTCATGGCTAGAATTTCTATACAATATTCGTGAAAAATGGGTTCCTGCTTACAATAAGCATATTTTTACTGCAGAAATTTCTAATGATCATAGACCAGAGTGTTTGAATAAGTTCTTTGAGAAGTATTTCAATACGAAGACAACTCTTCCTGTATTTGCTTATTTATTGGAACATGCTCTAATTGGCTGGCATGATAAAGAAAACTTAGAGGATTTTGCAACTTCATTTACCAGACCAGTATTACACACTCCATCCAATATGTTAAAACAGCTTTCAGAAATCTACACAAGAACAGTTTTTGATATATTTCAAGAGGAATTTATTGAATCTTTGGCTTATTATGCTGATAAAGTTGAGGATGGGTTGGTTTGTAAATATAATGTTGCCAAAGATGAAGACCTTGAAAGCATGAGCACTGTGATGTATAATCCATCAGAAAGAAGAACAAGTTGTAGCTGCTGCAAATTTGAAACTTCAGGTTTATTGTGTAGGCATATATTGAGGGTCTTTTTAACAGTTGATGTGCGTGTAATTCCTGATTTTTATATATTGAAACGGTGGACAAAGGATGCCAAAACTGCTTTTGGAGACATTACTTGAAATATATCAATACAGTATCTGAAGATATAGCCGAGACAGCGATTCTCTGTCTAGAGTTTTCA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020242495.1	0.0e+00	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Swissprot	Q9SZL8.1	1.7e-117	Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5
trEMBL	A0A8B8J882	5.1e-305	Protein FAR1-RELATED SEQUENCE

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G38180.1	40.14	5e-117	418	FRS5	FAR1-related sequence 5

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G01117	AT4G38180.1	568	325	5	172	726	71	636	40.14	5e-117	418
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF03101.12	FAR1	Domain	67	155	92.4	2e-26
PF03101.12	FAR1	Domain	189	278	81.5	5.1e-23
PF10551.6	MULE	Domain	392	483	67.8	7.8e-19
PF04434.14	SWIM	Domain	676	704	30.4	2e-07

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005488	F	binding
GO:0043231	C	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0006950	P	response to stress
GO:0007623	P	circadian rhythm
GO:0010017	P	red or far-red light signaling pathway
GO:0010218	P	response to far red light
GO:0016620	F	oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, NAD or NADP as acceptor
GO:0044710	P	single-organism metabolic process
GO:0044763	P	single-organism cellular process
GO:0048518	P	positive regulation of biological process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K17604	ZSWIM3; zinc finger SWIM domain-containing protein 3	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network