result

Gene information

Detail information of AfisC4G02043

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G02043	chr4	380835808	380841378	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC4G02043
AGGACAGTGAAATGAATACTCTGACGTTGCCTTCAGTACATGAATCTGAAAGAAATCTAGAGCTTTCAAGTCTTGAGACATTAGGTTCTTGCACTATCTTTTCTTCCCAAAAGTCTTTCCTAGGAAATAAACTCAGGGATTGTGGAGATGGATAAATATGGAGTGGCTATCTTTTGCAGGAAAATAGCATGGAAGGCACAGAGATAAACGATTTGATGCAAAATGCTCTCAAAGAGGCTGAAGACTTGAAGAATGAAGCTTACACAGAGTCATGCAAAAGACAAAAGGCTGAAACGGATGTAGTTGCAGCAGCTAGAAAAGTACCCTTTTTTACTTTTAAATTTTTGCTAAGCTACTGCTTCAGTTTAATATCTCTAATTAATGGAAGATTAATGCTTATTGCTATTTTAGTCAAATAAATATTGTTCTTTAAAAATAATAATAATAATATTTTTTTTAGTTTTGTTATTATAAGCTCATGATGAAAATTCATAAAGCTTTTGGTTTGAACTATACGCAACCAAACATGTGAACGACCTACCTTTTAAAATTACTTTGAATACCCATGATTTTTCATGTAAATATTGAAGTCCAAAACATGTATCTCAAATATATTTATGATAACAGGAAGTCAGGAACAAATGTGAGAAAAACATTATAATCTGGTCTTAGTAACACGCTATTTGTGTGCAGGGTTCAATGTAGGTTTATAACATGCAAACCCATATAATTATTACCCAAATGCATGTTAAGGCATACACACATTTCTTAGAAGTTACACTCAGCGTCTCCATTTTAGAATCAAATGGTATCTCGTTTTGCCTGAGTTTTAACATGTCAATAAGAAGTGCAATAAATGAATCCTACAGACGACGATAAATCCCTTTGAATTACTTGCATTTTATGTTGTGGAATTAAAGCATATTATTTAAAAACTTGCACATATGCAGGCTAAAGCATCAGAAAACTTATATGCAAAGGAGCTTCAACAAAGAAAAGAAGTAGAGGTAAAACTTGCTGTTGAAAAATTAAAACTTGAAACACTTAAGACTCACCATAAAGAACTCATGGAGGAACTCCAAAAAGCGAACCAAAGAACATCAAACATGGAACTTCAAATTGCAGAATCTCAACAACTAACCAAATATTTTCAAGACAAACTATCACAAGCAAAAATCCTCCTCACTTCTCTTCAAAGAGAGCTCGATGAACTACAACAAGAAAGCATAAATGTATTCACAACATTAGAGGAGAATACAGCTAACTTGGGCTTCAATTTTTTTGAGTTCAGGTATGAGGAAATCGAGAAGGCGACTAATAATTTTGATAGTTCATTAAAGATTGGAGAAGGAGGGTATGGATGTGTTTACAAAGGACTCCACCACACCACAGTTGCTATAAAGGTGTTGAAGTCTGAAAGCATGCAAGGAAAAGCTGAGTTCTACCAAGAGGTACTAATTATATTATATGAATTTGAAATAAAAAAAACATTTTTTAGAGATGTCTGTTGCGATATTTACAAACGGAAGCTGCAACCACATTGCAAAATAGAATTACCATAACTAGAGTGCTGAAGTATTATTAGAGAACCACTTATTATCCAAAATAAGTTGCCAATATAAAGAGTAATATCTTATCTTGGACCGATATTTATACTTGGTGACATGGATCACTTGCGACGGTTAAGGTTTGACTACCCATTTGATATATAGTAGAAAACCGTGCCACGACACATGTAGAGATTTTAGTCATTGAGGCAGAACATATGCAGTTTTTCTTCTTCATATACTTCATAATAAAAATAAAAATATTTTTAATACCCATAAATCTTATATTAATATTCTAATTCAAGCATAACAAAATATTACAACTCGTAAAGTGTTTACAAACAAACCTATTTAGGTCTTCAACAAACCAACCAATAGGCAAAAGGTGAATTTAAACTATGTTCTATAGACAAACAAGAAATACCAAAACAAACATATCATTATGAATAAACAAGTACAAATTGACAACGTAAAAAGCGATGTAATCATATTGACCCTAAATTATGTATTGTCAGCATACACAAATAAAGTCTATATGTAACCTAACAGTCTGTTTTATGTTTTAAAATAAAAGGGAAGACCAAGAAAAAGAGTTTAGCACTGTTTTCGTGCTTTTTAAGCCTAATCCATTCTTTTGTGCTTAAATAATCTGATAACTGTATATCATCAAGGGAAAATGTTAGTCACTGATAATATTGTAAGTAAGATTTACTTACAATAGAGGAATTCATTTGTGGGACTCACGACACATGTGTGGTCCCTATGATCATTTTCTCTTTTGTAAGTAAGATGTACTTGCGCATTTGTAAGTAAGAGTAGCATTGTTCTTTGAAAATGGACTTTGAATGTTTATTAGTCCAATAGAATCTTTTATTGCTAGTTTGGACAAAATTATAAAAAACAAAATTTGAATTAGTGGGGCAAGCAGCCTCAATGAACCTTACCTATATCCATTCTTGAAACCATATGCTGTAATAACAAAAAACAAATTGGTTTATAAATATTAACTAGTTTATAAATAACTAGTTAATTATGTTTTATAAAAATTAAACGAGTCTATAACAACAACAACACTAATAATAAATTAACCAAATTTATAAAAATTAACTAAGTTTTATAAAAATTCAATAAGCTTATAAAAATTAACCAAGCATTATAAAAATATAACTAAATAATAATAATAAATTTTACGAAAAATTAACTAAGTATAATAATAATAACAATTTTATAAAAATTAACTAAGATTTATAATAACAACATCAATAAGTTAACTAAGATTTATAATAATAATAATTAAACGAGTCTATAATAATAATAATTAAACGAGTCTATAATAATAATAAATTAAGTAAGTTTATAAAAATTAACTAAGTTTTATAAAAAATTCAATAAGTTTATAAAATTAACTAAGTATTATAAAATTATAACTAAATAATAATAATACTAATAATAAATTTTATGAAAAATTAACAAAGTATAACAACAACAACAAATTTTATGAAAAATTAACTAAGTATAATAATAATAATAAATAATTTTATAAAAATTAACTAAGATTTAGAATAATAATAATATAATAACAATAATAATTAAACGAGTGTATTATAACGACGACGACAGCAGCAGCAATAACAACAACAACAATAAATTTACTACGTTTTATAAAATTCGATAAGTTTTTAAAAATTAACTAAGTATTATGAAAACATAACTAAATAATAATAATAATAATAATAATAACTACATAATAATAACAATAACAACAATAATAAATTTTATAGGAAATTAACTAAGTTTAACAACAACAACAACAATGACAATAATAAATTTTATAAAAAATTAATTAAGTATAAAAATAGTAATAATAATAAATAATTTTACAAAAATTAACTCAGATATATAATAATAGTTGTAAATTAACTAAGATTTATAATAATAATAAGTTAAGTAAGATGTATAATAATTATGATAAGTTAACTAAGATGTATAATAATAATAATAAAAATTAAAAGAGTATAATAATAATAAGTTTTATAAAAATTAACTAAGGTTTATAAAAATTAACTAAGTTTTATAAAAATTCAATAAATTTATAAAAATTAACTGAGTATTATAAAAATATAACTAAAAATTAACTCAGAAGTACTTAGGATCCAGCTAGCGGTAAGGAATGAATGATGCGTCATGGTGACATGGACTCATGTTTTTGTATGTGTACATATATGGAGTACATGTCATGATGCTTCCTTTCCGGTTCTGATGAAGGACAAGATCAAACTCTGATATATAGGTTACTATATATTTATATATATGTTATACATAATATTATTGCTTCATCTATTTTAGTATGTTCATATATATGTTACAATCGCATCTTGTAGCACTTCCGTCCAAGCGTCTTTAAAGAAATATGCATTCATCTTTGATCATACTTTAGATGATTAGCAAATCAATTATTGCTGTTACTTATATTTTAATCTTTGTACGTTTCATTAAATATATAAAGTTATATATTAACAACTGATTTGAATGAACCTTCCAGCTAACTAGAAGCCATCCATGTGAAACATCATCAACAAACCAAATATTTAATAATTCCTACTAATTCCTTTCTCATAGCATGAAGCAAAAAATGATTCCTGACATTATATTACCGATTATCTTTATCCACATCGATGATATAATTAAATTTTGAGGTTTTATTAACCACAATTCTAAATCACCTTACAGATTCTATATTAATTTGGTTAATGTATATATAATGAGTCCTTAATATGTTTATATTTTTGGACATTTTGCAGAAAAAAACATTAGCAGTCCTGCGAAGAAGAATCTGCTTTCGCATTGCAATGAATTACAAGATCTGGTATCCATGTTTTATTAATTTTGCAATTTAACGATCATTTGGTTTGTAATACATATGTTTATATAGCTCAACTACAATCAAAGCGAGTTCATGTTTTGAATTTTATATCACTTTGCTCACAATTTTTTATTTATTTTACTGTTTCAAATGCATAATAATTATTAAATGCTTATATTAAGGCCAAAATTTGCTATATAGCTATAAATCACCAAATTTGTAGCAACAAGACAATCATTTGATGAATTTCATAATTTACAAAACGTACTACTGTCAGTTTCTTTGCTTGTACATGCCACGTTCTTTTTCCTTTTATTTTGAATTTCATAATTTACACAACATGACTAGATGGGTTGAAGGAATGACACCTGTTTTCTCTCTAGCAGCATGGCGATGCGTTTGGCATCTCATTCAGGTTTATATTTGAACATTAATATAGATTTTTTTTAGTTATCCACTTAATCATTCTATATTAATGTATCGTTTAGCTATTGACGTTTATTAAAAAATAGAAAGTTAGTACAAGAAATCGTAAAACTTCCAATACAATTCATTTTAAATTTGTTTTTAGTTAAATTCTTTCTAAATTAGTTTTAATCAAATTCACTTTTTAAATTAGATTATGAAATTAGTTTATACGGATATCAGATTTGAATTATTTTTTTGTTAAATTCGTTCTAGACCATTTTTTGATCAAATTCAATTATGTAGTAGTTAAATAGAGTTGAACTATTCTAAATGATATATAAATTAAATATTATAGTTAGCTCAATGAAGAAGTTTTTGAATATTTGCTTGAACAAGAAGAATGAAACTAATATGGATGTTACCTGACATTATTCCTCAAATAAATCTTTATTGGATCAGATGATATTATGAAGATAAGTATCCATAAGCTCGGCTGTAATATATACATCATGGAAAGCATTAAGTACAGGAGGTGGAACTACATCTTTTATTCCTATAACCAATTTTAGCATGCAAAGCACACATATTAAGCTATCACATTTCAGTGAAAATACATTAAGTAAATTTCCTTGGCATACCTATTCATGACACAATTTCACATTCTACCATATTCGTTCTTTATTGCTAATCTTTAATTGCATTTTTTATAGGCATATTGGACTTTTGAAGGAGATGGGTTTGGACTTTCCATGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ONK63998.1	8.8e-50	uncharacterized protein A4U43_C07F21060
Swissprot	Q8GUH1.2	6.4e-21	Serine/threonine-protein kinase
trEMBL	A0A5P1EDP0	6.3e-50	RING-type E3 ubiquitin transferase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G45910.1	42.66	7e-37	150		U-box domain-containing protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G02043	AT2G45910.1	218	117	2	10	219	315	532	42.66	7e-37	150
AfisC4G02043	AT3G49060.1	205	127	2	24	219	307	511	33.66	5e-15	78.2
AfisC4G02043	AT1G78940.1	81	44	2	141	219	348	428	43.21	6e-14	74.7

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
-	-	-	-	-	-	-

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0006468	P	protein phosphorylation
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0044763	P	single-organism cellular process
GO:0048522	P	positive regulation of cellular process
GO:0098542	P	defense response to other organism

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network