result

Gene information

Detail information of AfisC4G02054

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G02054	chr4	382398828	382405007	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC4G02054
ATGGTAATTATATCAACATCCTGCCTAAACTATGTTTATTGTTGATCGGTAGTTAATTTCATTGCTTCTACTACACTTATACCATGCAGTATTGGTTGGGTTGCTATAGCAGAACAGACAGCCGACGCTTAATGATGTGACATTAGAAGAGTTTTTAGTTAGAGCTGGTGTTGTAAGAGAAGAAAGCAACGTTAATGTTCAACACCAGTTGCAAGTTGTAAGTAGTAGAGCACAAGAGAGTAGCATGAATAATGGCAACTTTATGTTTTTTGGTAATGGTAACCAGGGACTCGGTCTAGGGTTCGGTCAACATTCAAGTGGTGTAGGGACTGCTAGGCCTTTTCAAGCACAATTGCAAGGGGGAAGTAATGTGGATAATGGAAGAGGAAGGATGGTTGCGGTTGGAGATCAGGGAATGAATAATGGGTTGATGAATGGGGTACAGGGTTTGGGTGGAGTAACAACTGAGACAGTTAGGTCCCCGGATGTGATTGAGAAGCCTAATGGAGATCTATCATCATTGTGGCCTGATCCGTATAATGTATTCGGGTCGGGTACGAGGGGTAGGAAATGTAGTGGATCAGTGGAGAAGGTTGTGGAGAGGAGGCAGAAGAGGATGATCAAGAATCGTGAGTCGGCTGCTGGGTCACGAGAAAGGAAACAGGTAACCTTTAATATGAATCAGTATGCTAGTATGCATAAGTAGACTTACTTTTCTGGGTATTAATGTGTACATTTTGCACTAGTTTCAAGAAATTAAAATATGTTAATAAATGAATTTTTCAAAACAAACCAGATGTTCTATCTGAATATTTGAATATTTAAACAGAACATCTGTAACCCCACGGGATTCATCAGTGGGTAAGTTGCACAATTAGCTAACAAAGGTTACAGGTTCGAATCTCGCATCTGACAACCATCGTCACCAGCCTTGTGATTTGGAACATGTTTAGGGGTCCATTGCATACTCCTTAGGGGTTTATAAGCGGAAGCTTGGTTCTCTAAGATATCAGAAGGAAATAAATAAATGAACGAATGAATAAATCTGTTGCAATTTAGCAAGATCTATAAGTTGGTATTAAGAAGCAAATAGAAATCAAATTCACTAGAATATGTGTCATATGAAGCATCCTAGTCACAAAAATTTTCTTTATGTTGATATATATCAGAACCATGAATGAATAAGGGTCAACATGCTATCAATATTCTATAAGTGCCTGTATTTTAAATTTTACTCCTCTTATCTTATTAGGCTTATACCATGGAGCTGGAAGCCGAAGTAGCCAAATTGAAAGAACAAAACCGGGAATTGGAGAAGAAACAGGTATCTTGTTCCTGAACTTGCAAACATTTAGTGGCATCTGCAAGGAAGTTAGTAGTTTATATATGAAACTTTGAACTTTGTTGTGCAAAAGCTCAATGAACTTTTATAGCTTCTATGAGCCGCTGTATATGCATTTTATGTTGGAATATGCTATAATTTCCATATGTTACTTCAATTTTGCAGGCTGAGATCATGAAAACACAGAAAAATCAGGTACTTATTTTACCTGTTCGCAACATTAGTTTTGGTAGTAATTTCTGGTAGTAACTCTTGACTAAATATATGTTTAGCCCCGTCTTTTTCCTATTTATCTCACATTTCTGATTTTTGGAACTTTATTTGCTTAGAATATGTGATGCTAGATGGGTTCATATCCAACCCTGTTGCACAATATAACTCCATGTTTCAATAGCACATACATGTTCATATTTAGTACCTAAATTCGAGCTTAGATATAAATGTAAAACAAAAATCAGCTTTAACATCGTCCATCTTATTATTGTTGCTATTATTATAAATGTATGCCTTTTACACCCTATTGCTATGTTCTTTGATCCTTGTTGTATTTATTTTGTTACTACCTGAATTTGTGTATTTAGCAGGGAAAAATCCACGAAGAATGTAATTAACCATAGCTTTATTTTTTTAAGTTATAGGTTATATATAATGAGTACATGTTCTGCACACTTGGTGCAAGTACGTATGATAGCACTAGTAGAGCTCTTGAAGAATGACCGGGAAACTATAGGTTCTGTCCCACCATAGGTAATGAATAACTAAGCTGGTTGTTTATGTAGATATGTTTTATTTATTTGCAAGATATTATGCAAAATTTTGAATCATTTCAAAACTTTTAACTCCTATCCGGCAGTTTACTTTTGTCCAATGTTTAGAACATTGAGAAAGTTATATAATTTGTCTTTTTTTCTCAATTCATTATGTTGCAAGTCCTACTCATGAGAGAATCCATTAATAAGAAAATATAAATATATTGTGTGGTGAAGGGGACTTTTTACTGAGCTGACGATTGGAAAGGATGGTTGTTCAAATGGGACAGTCGGTTACATGCATTTCTATAAAAAGGATGCAAATTTTTATAGTGGATGGGTGATTGTTAGTGCTCAAGTGCCATTAGGATGTGGCATTACTTTTGGGCAGAAGTACATGACGGACGAGAACATGACGTTTGGCACGTATGGGGATGGAGTTGTGAATCAGGGGTGGTTATTTGAAGCTTTTAATATGAGCGCATTCTGGAACTTGCCGGTTATCTTAGTTTGCGAGAATAATCATAGTTGATTTTGGACGTTTATTTGTTACAAAAAAAATTAAGTTGTTTTTATTTTTGATTTGTACTAGTGTTGTCTAATGAAATTGTTTGACTGATTTTGTAGATGGCATGGGAATTGCTGAAGATCAACCAAGAGTCCAACATATTATAAGCATGGAGACCATGTACCTGGGTTGAAGGTAATTATGTTTGTTTTTGTAAATGCAGGGAGATTTTGTAGTTTAACATAGCTTAGTTTGAATGCAGATTTTTTTATCTTCGTTAACTTGATCTCCTAAGTTGATTTAGGACAAATTAGATCATGTCCCTAAGCATGTACATCCCCTTTTATACATTAGACAATTGATTCCATTCTCAATTTGGGATGATTTTGATAGCTTAAATCAATTTTTTTTGTTATTCAGATTTGGACAGTTGATCCTTTTAAAAATTAGAGACCTCTGTTAGTGTTGATATATTACACACTATTTTACATACGCACGCACCCAATACAAATTTTTGTCAATGAAAAACACATAAAGTTATCAGGTTTTCTTAATGTCAGTTATCTTTCCCTTGTAATCCATTCTCAACCAATTGGTTGTTGTACTGTTAATTAGAAGCACATATAAATTTGTCTTTTTTCATTATGTTTTCTATAATTATATATTACTGTTACCAAGCCTTAGATGATGGTCATGGCATAATGTATAGGAACAACTGCTGAAATCAGAGGGAAGAAACCGTGAGGCATTTCGTAAGCTGATGGATAAACACGTTTCTTTTGGAATTCTTACAGGAAAATGCCATTGGAATGATTATTATGCTCAGGTTAACTCCAGATTTAATTTTACAGGATGTTACAGACTATATATTCAGTGAATTTTCATCATCTAATTTTTATGTAGGTTAAGGACTTGTCGACTATCTTAGATTTGTCATCTAACACCTCTGGTCTAACTGCCAAAGAAGCTTTATTCTTATGTGTTAATGCTTTTTGTATTTGGCTATTATGAAACTAGTTGTCATGTGTATGTTAGAACTATGTCAATATAAACTTATCTAACTTTTAGTCTTTTCGTATGTAATTTTGGTTGTTTTATGATATTTATTACTCGTTAAATTATTCATTATTGGTATGGATGTACTACATGGATACTGCTGTAATTTTTTTTAAATTTGCATTTATTTTGCAACGGTCAGAGCATGTTGTTATACGACCTTTTTACAATGGTCCATGCATGTTGTCAAAAGGGATTTCGCAACGGTCAATGCATGTTGTGAAATAGGCTATGCAACTTGTATGGTAGTATGTTGCAATGGTTAGAAATCGTTGCAATATCATGTATTACAACGGGCTTTAATTGTTGTCATAGAGTCTATTACAAGGGCTGATGCCCATTGTAAAAATGTGTATTACAGCGGTCTTTTACAACGTTTATTGCCTGTTGTAAAACACGGTCGACCTATTACAACGAGGCCTAATACAACAGGCGCATTCCCGTTGTGAAATCCATATTACAACGGGCATTGTTCGTTGTAAAAAGGATGTTTTGTTGTAGTGAATGGAGATACTCTCCTTGGTTTACTCCTTTATTACCATTTCCGGATCCAATTTTTGGACCCTTTCCTCATTCCTTTCTCACTATAGCAACCATATTATAATGCTATATAGGCCTTAAAACATTCGAAACGGGTTTAGCATTCACTCACATTTAAATCTAATTTATATGCATATTAACACCATATATCGATTCGTACATGTATAACTTTTACATATGCACCCAATTAATTACTAATGGTGCCTATAAAATATAAATGACAACCAATTCATCAAATAAGTAATATTTTATTACTATTAATTAATTTATAGCAATTATAAATCAACCAAATCATGGGGTATTTGAAGAATCTACAATTGCGGTTGTGCGACTCAGAGATGTAAATTTAGCTAGTGGTTGATATCAAACAATTCGAATATTAACGTTCATACGTTACCTTAACTAATGGTATGACGGTTTGGTCAAATTTGTCGCTTATACATTTGTATCATTAAAAAATCTAATTTAATAGTTTTAAGCGGTACGCTCTAGTAATGATTATTTAGACCAATTCTCTTTGTTGATAATATATAACTTTAGGCCTTATGGAATTAGGTTTTTGGTCAAAATTCTAATATCGTCAACATTCCTCTTGTAGTGTTATTCAACATTTGAACCGAGTGACTTCTTAGTGAATCTAGACTTTGAGTTGAAGACAAAATGGATTAAGAACTTATGGGGTTGCTCAGGATGGTGGAATGATGAAGCATAAGAAGTTGGAGTCGATTTGGAGTGCATATATTATGGTCAGTACTGATCACAATTATGGTCGGTACTGAAATAAGTTTAGGAAGGGGACCCACTTTTGAATAATTAGCTAAACCACTCCTATACTTAGTAGAAAAAGACAAGTTTCACATTAGACAAATCATGTTCGTTTTGACATGATTTGGTGGAACAACTTTGAAAACTAAGTTTGGAAACTTGATGATATAAACATGTATAAAGAAGAAATTATTTCGACGAGGAGCAATTACACTCGGTACAGACTATATTGTGGTCGGTATCAATATATTTTGTTCATAAAAGACACATGTTCTTCCTTCCTATTCACATGGATCTAAATTTTTACTTGGTCTTCCACGAGCTAGCGACTATAGTTGATGATTTCGTCTATATATACGAGTGATACTGCAATGAGAAAGGGACTTTTGGCACTTTGGACTCTGAATCTTGATTTCTGTTCTCTTCCTTAATCAAAGTTTACAACAAATTGCTGTCAAACTTGGATTTACATAGTTTTCAAGGTATGAAATTGTGTAACTTGTTTATAATCAAGCCAAGTCTCAAGTTGTAAAATTAAAGTGGACGTAGCAATGATTTGAGGCTGAACCACTATAAAAATCCATGTGTTCTGGTTGTTCATTTTCTATTTATTCTTGTTTGTGATCGATTCGAGGTGTTGTATCACTTTTTTTCAAAACGTTTTCGGTGCTTTCACTGAGAAACAAGATTCTCAAGTGAAGATCTAGCTTAAAACTTTAGATTTAAAGCATCCATAAGTTAGACCTAGGAGTTTGTTACTATAGATCTGAATTTACTTGGATTTGAAGAAGAATCTAGATCATATAGAAGGATATGGCCCATAAAAGAGCTGCTACTACATTCAGAGCTATTGATGGAGAAGATGAAGCTATTTGACATAATGAAGAGACAACTCAGTCAACACATGAATTGTTAGGACCTTCTTACCTATGGGAGATGGTGACAAAAGATTAAATGGATAGATAATAGCTGAGATAAATAACAAGATGCTTGATAGCCAGAATGACATCTTTGAAAAAATGGAGAAAATCTTTACTTTGTTATCCCAGTAACTACAAAGGTGTAAGAATAGCCTTAGAGATTCATCATCTTCAAGTTCTAAGGAAGAAAGTTCATCTTCATCAGTTCAGAATAGGAGAGAAGGCAAGCAAAAGATGAAGAGAAAGGTTGATGGAACATCAAAGAAGCAAACTGGGGAGATGGAGTTATTCTGGCCATGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	QEO19195.1	2.9e-41	putative ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 5 isoform X1, partial
Swissprot	Q9M7Q4.1	5.4e-32	bZIP transcription factor 36
trEMBL	A0A5C1YVF3	2.1e-41	Putative ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 5 isoform X1 (Fragment)

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G45249.1	43.49	2e-41	166	ABF2;AREB1;AtABF2;ATAREB1	abscisic acid responsive elements-binding factor 2

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G02054	AT1G45249.1	292	95	9	6	240	135	413	43.49	2e-41	166
AfisC4G02054	AT1G45249.3	303	95	10	6	240	135	424	41.91	6e-39	157
AfisC4G02054	AT4G34000.2	282	82	11	3	219	166	428	41.13	5e-33	138

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00170.18	bZIP_1	Family	165	217	44.7	9.6e-12

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006950	P	response to stress
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009911	P	positive regulation of flower development
GO:0010182	P	sugar mediated signaling pathway
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0043621	F	protein self-association
GO:0044763	P	single-organism cellular process
GO:2000028	P	regulation of photoperiodism, flowering

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14432	ABF; ABA responsive element binding factor	EC:-	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network