result

Gene information

Detail information of AfisC4G05176

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC4G05176	chr4	958410674	958419347	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC4G05176
ATGAGGAAGAGAAAGGAGATGAAGAAGGAGAAAATCCAAGATCCTTATTTAGCTGCAGTAGGATTGATATTTATAGAGAAACATATATACAGGTTCAAGAGCCCGCTTGAATTGAAGCCCAAAAGCAAGCCGAATGTCGTACAAGTGAGCACGTGGGCCTACGAGCCATTTAAACCTCTTGGTACAAAAAGGTTTTTCTTAGTTACCGAGTGATTTTGCTTTGTGCAATTTCCACTTCCTTTGCCTGTTTCATTCTTAcTATCTCATATTTGATGCGTTTCTGGTCTCTTTTCCATTGAGTTTGGGTTGATTCCGATGATTACTTCGATAACACTTGTCTTATTCTTCTTTCTTTGATTTCTTCTCACAATCATGAAAATTACCCGTCTATATCCTTGAGGAAAGCTCTTGATAACTAGTGGTTGACATGTAGAtATGAAGCATATAGGGTTTATGAGGTCAAAAGGGAGGGAAATACCCCTCGGTATTACTTAGCTCCAAACTTGATGGTTTTCCTTGAGTTCCACTCTTATCCTTCTGATCGTGTTTCCAAGTTCTCGAGTTGTTTTGACCTTCTACATCTTTTCAAAATTCTGGTTTTAGGAACCGTCGACCGATTGATAGGGATACCCACCAATCGACCGCTGGTACCCTGGATATGAAAATTCAGAAAAAAGGTGGGTTTTAAGCCTTAAAAAGATATTTAAACATTTCTAAAGATCATGGAAAAAATTCAAAAATGAATCTTAAAGATATATTTGATGATGGGCGAAAATTAGAGTGATTTGGAGATTATTTGCGGGTTTGTTTCAATTCAAAGGTAAAATGATTTGATAAGGACTTAACTGAAAACATAATTCATTTTGTAGCTCTTTGGTTAATCCTAGAGTATTTCTCTGAGCTTCACTTGATTCATTGACTCCAATTTTTGGTTGAATGCTTGTACGTCATTCTGTAACCTTATTAACTTCATCATAATTGTAATAtAATGTATATGACAATCCATAATCGTGCATGCATATAAGCTTATTTCTTCCTGTTACAATGTTCTCATAACTTACTATTGACCTGTAAGTGTTGTTAAAGATTTAGCAATATTTTTTGTAGCGTACTCGTCATCAAAAGTGAGAAATTCGGGTTAACATATGACAAATCCTTAACTCTATCAGTCTCTTTATTCATTTCAATCTTTTCATACAAAAATAATCATATACCCTTCTTCAATGGCTTCCCACCGAATAAAATAAAGATAAGAAGACTAGATAATATTTTGCTCAAAATAATTAGCACAACATTACACATCACTTTGGATAGTTATTTCAACAATACCAACAATCAATGGTGGAAATATCGATGAATTTGTGATGAAATAACGATGAATTAGCAACATATTTGTGCATTAGCAAAGGTTAATACACTTTAACAAATTAATAATTTTTATATAGTATTTTCTTTTCTGCATTTGTAATGTTTTTAGAGTATTTTCTTTGATGCGCTTTATTAATTTCTGATATCTTTATGGCTAAATATAGATTCATCGAAGGTGAGGGAAAACTAGTATTTAAAATGGGAAAACTtAATTTATAAACCCTACATAAAACGGCGATTGGATGTTAGATCCAAATTAATGCAATTAGGGGTTAAAATATGATATCTAGGGTTTATCCATGATTTGTTCTTATCTATTTCAATCCAAAAATAGTAAGAAACTAAGTTGCCTGGATTATAAACATATTTAGTTAATTACTAAATTACTAAATTTTCTTTTGGAaATGAACAAACATATTTCAAACGATTATATATGCACGTCCATGTGGGCCTGCATTTAATCACAACATGCATACTTTTATAGTTGCACCATGAAAGTAGATTTGACAGTAGCGTTGCTAGCATAAACTGAACCTGAGGCAACGACCGAGAAGACTGAGACAACTGAAAAGAACATTCATAGAACTAATAAGTTTGAAAGCATTCGTAGTTTTATTATTCATTTCTTTTGTTTTAGTTTATTTTATACTACTAAAATGGAAATAATACTTGTACAtTTTATATGCTTATGTTCTTTTAACTAATGTGAGTTTGTGAGCAAATATATATCAAAATATATCAGCGATTAATTGTTTCTTTACCACTCTTTTGTAGTTTTTTTGTCTTTTATACTTTCAAGTTACTTCTTTTGGAAATCAATTTTCAAATTACTATTTTTTCTTTTGGAAACCAGTAATTTCATATTTGTCTTTCTTAAGTTTGTACTGCTTATtTTTAATAGGGTTAATTACCCGAGTAAAATCTTTATATTTTATTTTCATTTTAATGATATTTTTCTTCATTTGTTCGGCATTCAAGAAAGGAAACATGAACCTCAaAAGAATAGACATGAAAAGAATAAAAAAAAGAAATAATAAAGGAATTATTGGTTTGTAGATGTAAACCTGGTATTCAGATAGGGCAAGAATTCTTGAGGTTACACGTATAATAAATCCCAGAGGTGTATTGCAGTTGTTCCACTATTACAATTAAAATATGAAAGCCAATGTCTTCCTTAACATAACACTGAATTTGAAATATATCCTAAACTTAATACATACACAACCTTTAACAAAATAATACCAACCGATAAGCCTAAATAGAAAAGCATCCATAAGAAAAAAAACAAATGAATACACAGAATAGAATTATTCACAAACAGTAAGCAATAAGCACACCTTACTCACTGGATAAAGATTTGAAATGGGAGCAAACAATAAGCACATGTCAGAATAGAATTATTGATTTATTCTACTCATAAAATAAAAAACCTTCAAaaAAAAACTTTTAGCATCACACGAAAAACACCATCTCTCTATATTTTTCTGTtTGAACAACACTATACTGCATTGTTTTGTTCAGATTGCAATAACTCCTTCATACTAACTTGGAATCAGGCCAGACTTACTTATTCTCcAATGAAATGAATTTCTCTTTATTAATAGTAGAGTTAGAAATTGAGATATGTTTAGTCTGCCAGGcTTACTTATTCCCAATCGCAGACGTTTTGATCTTGCATaACAACACCATAGATGCATAAAGAATATGTCCATTCTATCAACCATAAGACCAAGTAATTAAATGTTTATGCCGATACATAGTTGACCAAACTCTGAATGGTATACTAAAACTCAAAGCCCTGTACTTTATTTTATCTGTGTCCCTTTGACTCGGCTACTGTTTACAAAACTTTTTGTGCTTTATGGATATATGAATATAATATAGGGTGTATATGTATAAGTCTACGTGTACTGGTGTGTTGGCTGTTGCGCTGTGATAGTTTAGTTTTGTATGGGAATTATTATGCATGGGTATGATATCGGATTGTGTGTGGGTGTTACTACAGCTGTATATAACCCATGAGGAAAACTGGAATCTCGGTAGGAGTGGCTGTGAATATAGATGTAAATATGAGTCAAGTTTAGTAAATAAACAAAGTTTAAGAAATGTAAATATAAAATGATATTCAATTGTTGCTTTATACTGCTAAAAATACTCCCTTGTTCCACGTACATACATTTTGCTAAGAGCATTCATGCTTAACTTGATCTATAGCCTAGCACTAAGCTTGTCTCCATGCACAAAATGCCAACTTTTATATATATTTCGTGAGCTGATATTTCTATACCTCGTTAGTTATTAGTTGTTTAATGCATTTACTTTTAGCCTATCAATGTAAAATACATGGCTTTGCATTATAACCCATATAATTCCTGTTTTGAACACGTATATAATTGATTGTAATGTTTTATAGTAGAAATTAGTTGCAATAATTGTAGGAATAATGTTATTCATAATATTTGGTTTTATAATCTATTTGCAGGGTTTTAAAGTAGCAAGTATGATTCCTGAGTATCTTAGCGTTATTTAAATTAATAATTAGAACTTATATAAAGAGGTAGAACTAAAGAATTATAAAATATTAAGTTTTGTATTGAGTTATAATTATTTATCTAAATTTGATAAATTAATGACAATTATGAGAACTTTTTAGCTTATAATATAGAGTATGTTTGCGTGGTTGTGTCTGGGGAAGTGGCTGCATTTGCATTCTTCGATATGGTGGAGAGATGTGTATGAGTAAGTCAATTTGGGTGCAATATATATGCGTCTATTTAGGTAAGTGGGTAAAAAGAATTGAAGCTAATGTTTGGGTTTATAAATTAGGTTAGTCCCACATCGTCCAAGACATATCTTTTCTTAGTGTATATAAGATAATATATGAAGCAACAATCAAAATGATGTTGATAAACATAGCATGCCCCTAACGTGGATGGCATGTACAAATGAATTGAGGCATTTTTTCAACGTATATATTTCAACTCACAAAATTTCACTTTGCTCGACTTGCATTCACTTCAATTTCTACTGCTGTCATATATATGCAAAGGGCATTTTCGGGATTTCAAAAGGACACAGTTGAAGTTATAAGTAGACATTTACTGATGTAGAGGGGAAAAAGGGCGAAGGACATCTGGATGTAAAATGGAAGAAGGATGAAGGGTATTATAGGTATTTCAAAAAGACACCGAGTAAATTAATGGAATGAATTCTTTTTATTAATAGTAGAGACAAGTATTAGTGTGACAAAATTATACATAGTGAAAGACTGTTACATCAAATATTTGTACTACTGAGAAAACTATGTTATAACTTTACTTATTTAAATGTATATAATAAAATACATCATATTGAAAATTCATGGTCAAATTACATCATTCTGATGTAGAAAGTCCAATAATGATAGTCCATGTGTAAATTCATGGTCATTTATGGTGTTGGTTTGCACCGTATTGAAACTGTTGTACCGTATTGATTGCTCAATCAGTGCGCTCCACATGTTCTATTGACGTCACATGAATTTTCTGTAACTTAATCTTGCCTTTTAACCCGACTCATAATTTCAGATCCCAACAATTTTTATTCTTCCAGCTAGTCTCATGGTTTCAATGCCTAAAATATTCAGATTTTTA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	RRT60931.1	1.0e-25	hypothetical protein B296_00019704, partial
Swissprot	Q9SB48.1	1.6e-07	NADPH--cytochrome P450 reductase 1
trEMBL	A0A426ZAD1	7.5e-26	Myb-like domain-containing protein (Fragment)

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G35640.1	40.00	7e-19	91.3		Homeodomain-like superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC4G05176	AT2G35640.1	115	59	2	152	257	30	143	40.00	7e-19	91.3
AfisC4G05176	AT1G31310.1	94	43	1	172	256	63	156	44.68	9e-19	90.9
AfisC4G05176	AT4G31270.1	126	77	3	163	288	38	152	30.16	5e-09	58.5

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF13837.3	Myb_DNA-bind_4	Domain	159	214	31.5	1.5e-07

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000162	P	tryptophan biosynthetic process
GO:0000166	F	nucleotide binding
GO:0000302	P	response to reactive oxygen species
GO:0000981	F	RNA polymerase II transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0001135	F	transcription factor activity, RNA polymerase II transcription factor recruiting
GO:0002213	P	defense response to insect
GO:0002238	P	response to molecule of fungal origin
GO:0003958	F	NADPH-hemoprotein reductase activity
GO:0005829	C	cytosol
GO:0005783	C	endoplasmic reticulum
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006357	P	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0009698	P	phenylpropanoid metabolic process
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009753	P	response to jasmonic acid
GO:0009759	P	indole glucosinolate biosynthetic process
GO:0010438	P	cellular response to sulfur starvation
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0016301	F	kinase activity
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0030154	P	cell differentiation
GO:0030586	F	[methionine synthase] reductase activity
GO:0043168	F	anion binding
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0044425	C	membrane part
GO:0050662	F	coenzyme binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network