result

Gene information

Detail information of AfisC5G00132

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G00132	chr5	22459495	22464180	-

Sequences

CDS

>AfisC5G00132
ATGTATTTGAAATTCGCTCTAGCTCTCTCATTCGGCCTGCTTGCCTTCGTCCTCCTCATCGTTGTTGCGATCTCCGTTTTCAGACGCTTCTCCCGTGGCCGCTGCCCGGATGACGTGGAGCGCACGCCAAATGAGAAAGAAGAAGGAAACGTCGGCAAGGACACGGGAGCGGTTCGGGTGTACAAGTGGGTGGAGGTGGAGGAGATGACGTCCGGGTTTACCGCCGTGATTGGAGAGGGCGGGTTCAGTACAGTGTACGCGGGTAGTCTGCCCGGTGATATTTTCGGTAAGGAGGCGAGGAGCGCGTTTAAGGTGCAGCGTAGCAGTGAGAGACTGTACCGGGCTTTTTTGGAGGAGAGGGACGTTTTGCTGAGGTTGCGGCATCCCAATATCGTTCGGCTGATTGGCTATTCTCATGACCACGATCAAGGAGTTCTGATACTGGAATACATACCAAACGGAACCCTCCATGACAAACTCCACCCAGCTCAAATCTCATCATCACCGCCCCTCCCATGGCCCCGCCGCATGTCAATCCTCTTCCAGATTGCCACAGCCGTCGATTACCTCCACAACGGCAGCGATCTACAGATCATTCACGGCGACATCACTGCTTCCAACGTCCTTCTCGACTCCAACCTCGATCCTAAGCTCTGCGACTTCGGATCCGCCCGCATGGGCTTCTCTGCGGCAGTTCTACCCGCATCTGCCGGTCATCTCACCGGATCTCCAGGTTACGCCGACCCCCACTATTTGAGGACGGGGATTATCTCGAAGAAGAGCGACGTGTACTCTTTTGGGGTTTTGGCGTTTGAGATGATTAGTGGGTTGTTGGCCGTTGGATCGGATGGGAGGTATTTGACGGATGTGATGAAGGATCGGAAGGTGGAGGATTTCGTGGATGGGGCGATGGGTGGAGATTTTGATGCGGGTGAGTTGGGGGTGGTGGGTGCCATGGCGAAGAGGTGCGTTGGTGAAGTGGGAATTAGACCTGGAATGGGGGAGATTGTGAGGATCATGGAGGAGAATGTGCGATTGATCTGA

Protein

Gene

>AfisC5G00132
ATCGAATCTCCTCTTTCTCTCTCTCTCCAAAACCATGGCTAAAGCACCATTATAGTCAACTCATTCAGATCCATTCCCCAGCCATTAATAGCTATAAAATAAAAATCAAATATAATACTAAATTAAAATAAATAAACGATTCACATGTATTTGAAATTCGCTCTAGCTCTCTCATTCGGCCTGCTTGCCTTCGTCCTCCTCATCGTTGTTGCGATCTCCGTTTTCAGACGCTTCTCCCGTGGCCGCTGCCCGGATGACGTGGAGCGCACGCCAAATGAGAAAGAAGAAGGAAACGTCGGCAAGGACACGGGAGCGGTTCGGGTGTACAAGTGGGTGGAGGTGGAGGAGATGACGTCCGGGTTTACCGCCGTGATTGGAGAGGGCGGGTTCAGTACAGTGTACGCGGGTAGTCTGCCCGGTGATATTTTCGGTAAGGAGGCGAGGAGCGCGTTTAAGGTGCAGCGTAGCAGTGAGAGACTGTACCGGGCTTTTTTGGAGGAGAGGGACGTTTTGCTGAGGTTGCGGCATCCCAATATCGTTCGGCTGATTGGCTATTCTCATGACCACGGTCAGTTTTACCTAATTTCTTTATATTATTATTATTATCGATTACTGAATTACATACGTTATTTTATATTATAAAAAGTGCATATTTTATCTAATTTGCTGTTCATTTCAAACCCATGTGTAAATTAGTTTTTGTCACGTGGACTGTTGACCTTTATTATGTATTGACAACCTTGGGCTCACTAGCTATGTGGTACCAGTTTTGAAAGGTTTTGAATCAGTGATCATACTTACATAAAATGTTGTTATAACCGATCAATGCATGTTTGAGAGTTTAACACACATCGGTTTTGAGAGTTTTCAATTAAAATAACATTACATATAAATCTTTGTATTTTGAAAAGTTTAATTCTACAATATAAGTAGTGGGGGCATAATTGGAAAAAAAATTATAGCCCCTCAAAACATCCTAATTTGATGGGGTGAGAATTGTCATGAAAATTGCACTGCAGCGGTTTTATAACCAACAACAAACGATGTAAAAAAAATCCTACAAATAAGAGTTATGACGACACCTGAAATACAGAGCCCTTCAAAACCAGACAAAACCGATAGAAAAAAAACTCCAAAGCAGAGCCTATTTTCTATCGGTTTTGACTAGTTTTGGACGGCTCTGTATTTTAGGTGTTGTCATAACCCTTGCTTGTAAGATTTTTTTCACATCGGTTATTAGTGGTTATAAAACCAATGTAGTGTAATTTTAAAGTTAAATTCAATCCATAAATTCAGGTGTTTTAAGGAGTTATATCTTTTTTCTCCAATTATACCTCTATTATTTCTATTGAAAAATTAATATTCATAAAACTATAGAATATATATGTAATTTTACTCTAGGTGAAAATTCTTGAAACCGGTGTATATTAAACTCTTAAGCATGTGTTGATACGCTATAACAACACTTCATGTAAACTAATTAAAACCGCTACGATCATTGACGGTCAAAACCGGTACTCTCATTAGCGAGAAGTCTCGAATTAGTACCATCCTACAACAATAAGAACCAACCTACATATATTTTTATTCAATTTATCATATTAAGAATGTAAAATATACAATTCTATAAAGTTAATTCAAAAATTTTGTTTTCTTCAAAAAATTAACCTTTTTACACAAATTTTGAAATTTTTATTCGTTTATCAAAATATAATTTTTAATTTATCCGACAATTTTCAATTTTATTAATTATTTTCTTCAAATTTTCCGAGATACTTTGAATATTAACAAAACTTTAGTTCTTTTTTTTCAAAAAATGGTTCATTTAACAAAACTTCAACTTAGGCACGAAAGAAATAATTTTATACTATTTTCTATAACTTAGGAATTTTTAAATTTTTTCTTGAAAGGATTAAACAATTTTATGGAACAAACTTATGTTTTGAAAGGTTATTTTTAGAAATTATTTGGATTTTTTTCCAGTATAGCATACTTTTTTAAAAGTATAAATACCGGAGTTTTTAATTTATCCATTTATTAATGTAATATTGAAAAATTACTAAGAGAAAAGCAGTGCGAAGGTATTAAAAAAAGATATATGATTTACCTTGCATTTCAATTTTTTAATTTATATACATGTTTTTATGGCTTAAATGGTTTCATTTTGCGTCATTATCTTTATTGGTGGGTTTGATGAAAAAATAATCAATTTTTGTTTTCAACACTCAAATCAAAATTTTAGCTGAGAAATCTTGAGTTAAAAAGTTAAACTTAACAAGTAAATTTTGTTAAAATAATTATATCTATTATTTTCCAGCTTTTTATCTTGAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTAATTCTAAATCCAGCTTATAAAATAATGAATACAATTTTAAATGAAATCAGCTTATTAAATAGTTCTACATTTATCTTTATTAATAGTTGAAATAATAACAAAATTTTTAGTCTAACCACGAAATTCCCAAAATGTCCTCCGTACATAAGTCTATATGTTAAAATTGTTGTTATTTCATATCAACGTATAAGTAGAAAAAGTTAAATCATCCTATAATTAGTTCTAAAAGTATTCAAATACAAATATTGAATATTCCATGGTACATCGGATTGAAACTGTTCAAATCACGTTAATACACAACCCCCATCATATTCATTTCAATACTAGATTTTTTTGCATCTTTGAACGAATCCTCAAAGCTAGTGATTCAACTATATCTACATGTTCAAACTTTATCCCTAACATTGCATGTTAGAGAAAACCACAGATCCTTTAAATATCCTAAGAACTCCATGAGTGCTATCATGCTCGAAAAGTGAATCAACTTTTTTTCTCATAAATGTCCAGCGAAATCTCATTTAAAAAATAATCTTTTCTTACACTTCAATCTATCTATTCAAGCTCCGTTGCTCCTCCACCACTCGTCGCTCTCCACCGTTCTCCATTGTTTACTGTTATACGTCATTGTTCTTCATCACTATCCGATGTTAATCGTTGTTCGTCGTTATTCACTGTTGCTTTGTAGTTTGTATTAATTATTTTGCAGGTGTCTTTCTACTAAATATATAGTCTTGCATTTTGAGACATATATTGTTTGTACTAAATTTCTTCTCCACGCACGGGCTCTTGAAACTCATTAAAAATAATTCGTTAACTATTAAGAGGACCATCACACTCTTTTACCACATAATTAACCGAAAAATTTGGTCAAACACACTTCAAATATTTCAAAATAAAGTGTATTCCCTTTCAAAAACCCGTTCCACGAAACACTTAATGGAATTATTATTTTTAAATTTATTTTCTGTAACTTTTTCACAACTTAATCTGTATTAAATCACAACTTAATCTGAGCTATAATTTGCATTTTTTAATGTAAAATACTTGCAACTTTTAGTGTAAATACTTGCATTTTCGGTAAATATCTACAATAAAATTGCAAATTTTCAAGAAAAGGTACTGCGAAATTTCAAAAATAGTTGGAAATGGGTTTCTTGGATTGCTTTGCACCACCGAATAATAAAATTTTCGGTTTTAAAATATCACTTAGCAACTTTAGGTAATTTATTTGATAATCAGACTAAGTTTACAATTTTTTTCTCGAAAGGAGAATAATAATAATGCTCAGATCAAAATGCACGGTATATAACTAGTAGATAAAGAGAATTAGGGTGTATATTAATATTGGCACATGCTGAATTAGCATTAGATTATAATAATAATAATTACATAAAGTAAAAATGAAATCACAAGTTACAATTGCAAAATTAATTACGAATCTCACTGATTCCAAGCTCCAATTTATTCAATTTATTTACAGATCAAGGAGTTCTGATACTGGAATACATACCAAACGGAACCCTCCATGACAAACTCCACCCAGCTCAAATCTCATCATCACCGCCCCTCCCATGGCCCCGCCGCATGTCAATCCTCTTCCAGATTGCCACAGCCGTCGATTACCTCCACAACGGCAGCGATCTACAGATCATTCACGGCGACATCACTGCTTCCAACGTCCTTCTCGACTCCAACCTCGATCCTAAGCTCTGCGACTTCGGATCCGCCCGCATGGGCTTCTCTGCGGCAGTTCTACCCGCATCTGCCGGTCATCTCACCGGATCTCCAGGTTACGCCGACCCCCACTATTTGAGGACGGGGATTATCTCGAAGAAGAGCGACGTGTACTCTTTTGGGGTTTTGGCGTTTGAGATGATTAGTGGGTTGTTGGCCGTTGGATCGGATGGGAGGTATTTGACGGATGTGATGAAGGATCGGAAGGTGGAGGATTTCGTGGATGGGGCGATGGGTGGAGATTTTGATGCGGGTGAGTTGGGGGTGGTGGGTGCCATGGCGAAGAGGTGCGTTGGTGAAGTGGGAATTAGACCTGGAATGGGGGAGATTGTGAGGATCATGGAGGAGAATGTGCGATTGATCTGATTTTTTTTTTTTAATTATGATTGGGGTTGTAAATACATTTGTCTTTGTTTAGCAATAAAATATTTTCGATAATTCTTCTTCAACCGGATGAAAGACATACGGCAATATGCGTTAGAAATTTTAAGCACGTGGTTGGATTAGCCCCCGGTATTCTCCATTGTTTTCCAGATCCGCACTCATTTTTGTTGTTAATATAAGTTATTAAGTTTTAG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_008801797.1	2.3e-80	probable receptor-like protein kinase At1g33260
Swissprot	A2XW02.1	9.2e-74	Receptor-like cytoplasmic kinase 154
trEMBL	A0A8B8Z9J7	5.2e-82	salt tolerance receptor-like cytoplasmic kinase 1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G33260.2	39.09	4e-62	235		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G00132	AT1G33260.2	330	161	8	43	344	19	336	39.09	4e-62	235
AfisC5G00132	AT1G33260.1	331	161	9	43	344	19	337	38.97	5e-61	231
AfisC5G00132	AT4G10390.1	323	161	9	38	336	11	322	39.32	1e-59	226

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	74	275	122.0	2.2e-35

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0007165	P	signal transduction
GO:0043231	C	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0006468	P	protein phosphorylation
GO:0009653	P	anatomical structure morphogenesis
GO:0009409	P	response to cold
GO:0009611	P	response to wounding
GO:0042221	P	response to chemical
GO:0044444	C	cytoplasmic part
GO:0044446	C	intracellular organelle part
GO:0048364	P	root development
GO:0048869	P	cellular developmental process
GO:0098542	P	defense response to other organism
GO:0098588	C	bounding membrane of organelle
GO:0098805	C	whole membrane

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network