result

Gene information

Detail information of AfisC5G02462

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G02462	chr5	466122498	466147781	-

Sequences

CDS

>AfisC5G02462
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Protein

Gene

>AfisC5G02462
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	BAD06448.1	2.7e-148	alliinase-like
Swissprot	P31756.1	1.6e-134	Cysteine sulphoxide lyase
trEMBL	Q76BK3	1.9e-148	Alliinase-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G34060.1	43.74	6e-109	391		Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G02462	AT1G34060.1	455	235	10	12	459	9	449	43.74	6e-109	391
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF04863.10	EGF_alliinase	Domain	36	87	76.9	9.8e-22
PF04864.10	Alliinase_C	Domain	93	458	517.7	1.3e-155

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0042742	P	defense response to bacterium
GO:0004021	F	L-alanine:2-oxoglutarate aminotransferase activity
GO:0004838	F	L-tyrosine:2-oxoglutarate aminotransferase activity
GO:0043231	C	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0009641	P	shade avoidance
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GO:0009723	P	response to ethylene
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GO:0010087	P	phloem or xylem histogenesis
GO:0010588	P	cotyledon vascular tissue pattern formation
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GO:0030170	F	pyridoxal phosphate binding
GO:0044425	C	membrane part
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GO:0047312	F	L-phenylalanine:pyruvate aminotransferase activity
GO:0048467	P	gynoecium development
GO:0050048	F	L-leucine:2-oxoglutarate aminotransferase activity
GO:0050362	F	L-tryptophan:2-oxoglutarate aminotransferase activity
GO:0080022	P	primary root development
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GO:0080098	F	L-tyrosine:pyruvate aminotransferase activity
GO:0080099	F	L-methionine:2-oxoglutarate aminotransferase activity
GO:0080100	F	L-glutamine:2-oxoglutarate aminotransferase activity
GO:0080130	F	L-phenylalanine:2-oxoglutarate aminotransferase activity

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K16903	TAA1; L-tryptophan---pyruvate aminotransferase	EC:2.6.1.99	Tryptophan metabolism	ko00380

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network