result

Gene information

Detail information of AfisC5G03651

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G03651	chr5	663156300	663162790	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC5G03651
ATGGAGGAGGAGCTGTCTGGATCCATGAACGGAAAAAATGTGGAGAATGGCACTATCTGTTCAACTGAGGAAAATCACAATGATGATGACGAACCTGAAAAGAAGAAGAGAAAGCTAAGGCACACTCCGTGGCAGGTTCATGGAATGGAGATGTAAGTTCTGCTTTTTTCTCTGCATGAGAAAATACCATGCATCAATATTGATCATTCAGATAGTTCTGTTTCTAAAATTTCACATTTTGTTAGGGTTAGCACAGTTAGGTAATTAGATTTGGATTTAATTAGGAGATAATAAGATCTAAATTGTGATCATTCTTAATTAGTTAATCAGAATGACAGTCTTTTTAACCAAGAAGAAAAACATCATAGCGTTATGATAAAATGAACAATTGAGAGCCTAAAGTGTTAAACCTAATTTAGTGAGGTAAATCTTGTTATCCTGAAACGTGTTAGGGTCATGATTTCCGTAATGGTGGTTCTTCATTATCTTTTTTCAATGGCGGGTAATCAAAATCCTTACCAATACTTTGATATATTTTTTAAACATAATTTAGAAAAATTATATCCAACACATAGCATTGGAGATATTTTGCTTAATTAGTCTAAGTAAATGCATGAAGATTGAACTTCTTATATTTGCTATTAAGTTTATTTAGAGCTATTTGCATTTTGGGAACAAATTGGTGGATTCATTTTTTTAGTACAAATGGATGATTTTAAACCTTTGATATTTTAGGGCTTAAGATATATATATTTATTGATTAGCTATGGAATCAGACTGCGAGCTTATTCTGATAATGAATGAAAATTGAAAAAAAAAATTAAAAAACAAAATGCATTGTGGATCATTTTGATAATTCAGTTTCTAACAACATACATCTTGTTAATTTGGTTTACTGTATATTGATATGATTAGGGATTTATTTAGGATATAATAAGTACATATTGTGGTTATAAATTATAATCAGTCCATCAGATGGCGTATCTGATTAGCCAAGTAGAAAAACACCACACATTATGATAAACTAGACTGTCAAACCTAAAATATTACTCATGATTTTGTTTTGTAAACCTAGTTATTTTGAACTGGTAATTGTTTCATAGTTTTCATAATGGTAGTGTTTCATTATCTTTTTTCGAAAGCAGGTAATAAAAATACTAAGCAAATAGTGTTTGACACAGTAAATGCATTAGGAATGTTCTCTTTTGTCGTATAGAGAAAATGCACGAAGATTAGATTTATATAGTTGATGTTATGTTTGTAGTTATAATTTACATTTTGTCTGAACAGTTGGGTTTTTAATTAGTTAATGCAAATGGTCCAAGTTTTGATCAGATACTTTTATGAAAGTGACTGCTTACTGCTTATTGTGATTAGTTAGTGCAAATGGTCCAATTTTCCACTGCTTACTGCTTAGCCAAGTAGAAATATACCATGTTCATAGACATTCAAACCTAAATTATTACACTAAATTTGGATAAAAGTAAACCAAGTTACGATTCTGAGCTGTGTTTGTTGGTTCAAATTTTACATAATTCTAGCCTTTCATTGTCCTTTTGCCATTGTGGGCAATCGAAATTCCTAGCAGTAATTTGACAAAAAAATGTTCACTTTAACCATAATTTAACTATATTAAAGGTTCTTTAAGGAATGCCCTAACCCAGACGAGAAGCAGCGATTAGAACTGAGCAAGGAGTTGGGACTTACAGTTCAACAAATTAGATTCTGGTTCCAAAACAAACGCAATCAAATTAAGGTATCATTTATCTTCACATTCTAGAACAAATCCAGGTATTATATACCTACAAAATATGGATACATGTGTTGTAGGTGCAACAAGACAAGAACGAAAATGCGATACTCAAAGCTGAAATAGAATACCTGAAAAATGACATTTCAAGACTTGAAGCTGCAATTGGAAATAAGACATGTCGTAATTGCAGTGGGACTGCCAATATTATAGGACAAATGTCCTATGTTGAACAACATCATCTCCGACTTGAAAATGCCCGCATCAAATATCAGGTGTATATACATGATTCATTTATATAATTAAGAAGAAATATGGTACTATACATTCATTTAAGTTTTAACAATCTTTTTTTTTTCTCAATAGCTTGAACATGCATCTTGCATTAGCAGCGCTTCTGGACACACAAATCTTGCTGAAATGAAATCTTCTATTCATGATATGAATATTTATCCACGGCATTTCAACAAGCAACAACAAGCAGTAATGGGAGTTTGTAATAGTATAATAGCTCCTGTTCAAGATAACAGTATTTTAGTCAAGGATCAAGCAAAAGGATTGGCATTAGATTTGGCTATCACTGCTACTGAACATTTGTTGAAGTTATGTACAATGAATGAGCCTCTGTGGATTAAGACAAATGGAGAACTTGTTGCTGAAGTTATGAATTACGAAGAGTACAAGAGATTTTTTAATTGGTCAATCGAACTTAAGCAACAATGCCAAGAGTTTAGTATTGAAGCCACAAGAGATAGTGGGATTGTGAGGATGGATAGTATTACACTGGTTGATGCCTTCTTCGATGCTGTAAGTTTCTCTCACACACACAAATTATACACACACATATAAATACATACATACATACATATCCATATATATGTATGTATGTATGTATGTATAGACTGATTGATATATGATGATGTTTTTTCTTGTTATTGTGATAGATATTTTTGTTTTATGTTTTATGTTTTCGGTTTCTAGAATAATTGGATAGAATCAATTATTTCATACTATTTTAGCAAGGCGAAAACACAACAAATTATAGCCAATGGAATATCTAGTCATGATGGCAAAGGCTCTCTTCATTTTATGTTTATGTATATCTCTTTGGTTATATGATGTTATATGTGTATATATGATTTTGTATGTGTATATTGCCATTAATATATGGCGATGATGTTTCTCGTATTCATTATATAGATATTTGAGTTTATGTTTTGGGTTTGTAGAATAAATGGATGGATTTATTTCCTACTATTGTTAGCAAGGCGAAAACATTACAAATTATAACCGATGGAGCATCTGGTTATCGCAACGGCTCTCTTCATTTGGTAAATTTCAAAACTTAATTGGCTGAAAATTTCCAGCTTATTATTTTATGTAGTGTCTTCACTTACGATTTTTAACTTGTGAAGTTTTTTGCGGAGTTTCAAGTTCTTTCCCCGTTGGTGCCAACACGTGAGGCTCACTTTCTTAGATATTGTCAACACAACGTTGAGCAAGGAACTTGGTCCATTGTTGATTTTCCTATTGATGGATTTCATGATGGACTGGAAATGTCTTTGACTCGTTATCGGAGGCGTCCTTCCGGCTGTATCATTAAAGACATGACCAATGGTCATGCAATGGTAAGCGGTCTAATCTTTGGTTCCTATGAATTACTATTGGAATAGTTTACTTTTCTTTAAGGTCCATCTGCAAATTCTTGGATAAGGTATGTCTCAATTACTGTCTGTTCTTTACATGCTTTACATTAACTCGTTTGATACATATGTTATTACATGTATTATATATAATACAAGCTCATTTCACTCATAGAATTACTCGTTTTCCTAAAAATTTACTTCAGGTGACATGGGTGGAACACGCAGAATTACAAGGTAAAAGAGTAGCCCATCATATTTTCGATACAATACTTAATAGTGGTGTTGCTTTTGGTGCAGCAAAATGGCTTTCCATTTTGCAAATTCAGTGTGAAAGACAAGCTAGTCTTATCATGGCCCGAAACATTCCTAATCCTGAAGGTAATGCGCTCTTTCACTTACATAATATACTATCTAAAGTTAGATTTTACATCATTTCAGTTTTAACCTTTCAGTTGTTCCATCTGCTGAAGCGAGAAAGAAGTTGATGAAATTGTCGCAAAGAATGATAAGAATATTCTGCGCAAACATAAGTTGGTCCAACAGCCAGACATGGACTGCACTGCCTGAAACATTCGATGATACAATTAGAGTAACGGCTCGAAAAAATACAGAACTTGCCCAGCCAATTGGAGTTATACTTACTGCAGTATCTACAGTTTGTCTTCCCTTTTCACACAGTCGAGTGTTCGAGCTTTTATCCAATGAGCAAAAGCGAACTCAGGTGCATACTACTATTACCACTAATAATACTAATAATAACTACTGCTGCTACTATTACTACTACTATTCTCAAAAGATACTTGTTTTCTTCAGCTATTTTTTTTAAAGAATAAAGTGATATTTTATTCAAAAATCAGAGCCGTTTATTTTGATTTCTCGAGTATTCAAAACCCGACCTCTAAAATCTTAATAGAAAGTGTCGTACCATTTGGCACTTAACTAGTGGTCCTTAACTTTTTTTCAACTACTTTTAAAATGTGTTTTATGTTTCGTTGCAGTTCGATGCGCTTTCATATGGAAAATCGTTGCAGGAGGTGGCTCACATTGCAAATGGCTTGCATCAAAGGAACCGCATCTCTGTTCTGCGTGCAAATGTGAGTTCAAATATTTTTTTTTATTTCATTACCATTGTCAATTGAATGAATAATTAGCATCATAGTTATCATAACCGAACAATGATAATACATAGCTAGAGGTTTTGATGGTTAGATTGCCCATGCCATAAGAACCATGTCAGTGACTTCTATTTCTTAATGTAAAAAATGTTAGATTTGAGGAAAATTTTTGGCATAAAACAAACGTGGGAATCGAAATTTTAAACTACACCATTAGTTTCACTTCACCTCGCTTCGGTCATCAGCTATGCCAAAAGACGTTTTAATAAATAATAACAGTTGTATTTTAGTTGAAAGCCAAAAGGATTCATGAAAACAATGTTCCATGTCCCGCAAAATGGTGGAAGGCAATTTACTTTTCACTACAAAAGAATCTTCCTTCAGATTCAAGCGTCGCAGCCTTCCTTTGATCCTTCCCAGGTTACCAATTTGGGCAATTTGGTTGGGTTTTTTCTTAAGAAATGACCAGTTTTTGTGTATTGAACCACGATTCTAATGACCATGTAATAACAACTCACCGCTTCTATTTTATCCGGACTGAACCAGACCATGGAATGCGGTTTTTCATGGCTGGACTGGCACTCCAGTGTGGTCTTGATAACAGTGGTTCCGAGCTTATATTAGGGAAATTGCAGGATAAAAGCATAACGAAATATGCTCGTTTTTAAGTTGGCAGTTATTTGCATGATGGTAAATTAAAAATAAGATTTTAGCTGGTACAAATTTTGGAACTTAAAAATTCGATATTTGTAGGGCATAAGGTATATACTATCTAATTAGATAATGAAATCTGACTGCTAACTGTGATAGGTGCTGAAGTTGAAATACACCATTTACTATGAACCATTCAAATAGATGGTTCAGTTAGTAAAATTACATGTTTTTAAATGGATATAGCAATATTAACAAAATGGGGAAAATGCAGATGAGAGAATGAAAACTAAATTAGCTAATAGAAATATTAGTGAATATATAACAGCATACAACAAGTAGATAGAGTGTAAGTCTGTAGGCATGATTGTTGTATTGAATTTGCATGTGCATTCTTAATCATGGACTACACAAGAGACAGAGGTAATTAGTTTAAATGAGAAACTTGAAACCGATTTTAGTCTGAAAGACACAACACTCAATGCTATATTAATGTAGAATCTGATACAACAGAATATTATATTAAACTATGATCGTATAAACAAAGTCCTAAATTAAACTACCATCGGGTGAACCACACTAGACGAACTAAAATAGCATTCATGTTTACAGCTAAAAAAATAACAAATTAATGTATCATTACACATACATATTGCTAAGTTTATATAGACTATGCTTATGTAGTGCTAAGTTCACATAACATTCGTTTTCATAGTTCGTATATATGTTTTATTCGATGTTATATGAATATAGTATCTAGTGTATTTCAGACTATATTTTAAATCTATGTTCTGCATTCAAAAATATAGCTGAAGTTTATATATTTCCATGAATTTATGCATGTATGGATTTACACAGGCAGCAAGCAGTCACTCATCCAAAGACAAGACAGAACTCCTAGTACTACAAGAAAGCAGTACACACCAGAGAGGTGGCAGCATTGTAGTCTATGCCCCGATGGATGGGGACATGTTTCAAATTTCAATGAATGGGGAAGCCCAATCATCTCATGATAATATTCCCCTCCTTCCTACTGGATTTGTAGTCCTACCAGCTCCTTGCCCCGTTAACAATTCTTCCACTACCGGATGTCTTCTCACGGTGGGAATGCAAGTCCTCGTAGGCTCCGCTCTGTCCGTCAATGAGGTTAGCCTTTCCACCATCACCTCACTGACTACTCAACTAAGCAGCACCATGCAACAGATAACCAACGTGCTTGGCAGTAATGGACAGAGTTACTCCGCTCTGGTGGATAACCGGTGTGAGACTTCAGCTTCTGTTCTGGATCGTATGATCAGGGATCTAATGGTTCGTAACGGTGCACTGTAG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_010919976.1	1.2e-198	homeobox-leucine zipper protein ROC3
Swissprot	Q336P2.1	9.5e-169	Protein RICE OUTERMOST CELL-SPECIFIC 3
trEMBL	A0A6I9R3P1	8.5e-199	homeobox-leucine zipper protein ROC3

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G46880.1	43.89	7e-161	564	HB-7;HDG5	homeobox-7

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G03651	AT5G46880.1	736	350	17	17	709	93	808	43.89	7e-161	564
AfisC5G03651	AT4G17710.1	694	320	16	24	707	76	703	42.94	3e-143	506
AfisC5G03651	AT4G04890.1	708	390	19	21	703	49	731	37.85	1e-132	471

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00046.26	Homeobox	Domain	35	90	53.9	1.1e-14
PF01852.16	START	Domain	224	451	109.9	9.6e-32

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000976	F	transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009828	P	plant-type cell wall loosening
GO:0009845	P	seed germination
GO:0009913	P	epidermal cell differentiation
GO:0010091	P	trichome branching
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0043481	P	anthocyanin accumulation in tissues in response to UV light
GO:0048497	P	maintenance of floral organ identity
GO:0048765	P	root hair cell differentiation
GO:0048825	P	cotyledon development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09338	HD-ZIP; homeobox-leucine zipper protein	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network