result

Gene information

Detail information of AfisC5G04375

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G04375	chr5	802888531	802897102	+

Sequences

CDS

>AfisC5G04375
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Protein

Gene

>AfisC5G04375
CAATATTCCCTCGTTAGCTAAATTTCTACATCCAATCCGTACGTTGACTTAATCTCCAAAGTCCTCCAGTTCTACATTAAGATTCTACTTCCCAAAAGTTAGTTCAATAAAAAGGCAAAAATAAGCTTTATGCTTCCCAAAAGCTAGAAACTGTGACACACGTAAAGGCAGATACAGTCGAAAGCTATTACGTTTTGTCGATAATCATATGGCTCTGGTAAGCCCTTCGTTACCAATTCAAATGATGCAAAAACGCATGTGTCTGTATACTAGAGAATCGAGCGTTAGAACAATGAGCAATATAGTCGAAATAGAGGAGGATAGAAATGATGATGATGATCATGGTCAAGAAGAAGTGGAGAAAATATATGTGGCAGTTGGAAAAGAGAGTAAAGACGCACTGATATGGGCGCTTAGATATATTTCTAAAGAGAAGATTTTGGTGCTTGTTCATGTTCATAGGCCAGTGCAAAAGATTTCCATCAGTGAGTTCACTTAACCTTTTTTTTTTGTTTCATTATGTGCTGTTTATATATATGTTGTCAATTTTCCAACTATGTTTCATTATACGTTAACAGTTTACAAAAGTAGTTAAGGGATAGATGAAAAATTAATGAAATATTAGTTTGATTTTTAAATTTAGTGTTAGAAATAGCTGAAGTATAAGGCCATCCACAGGGTGCAGGCTCATTCGTTTGCAAAATATTTGAAGTGGTAAAAGTAAAACAGCTAAATAGACCCCTTATGGATTCTATTCTACCTTTAGAATACAGCAGGAAAAAAACGGAAGAAAAGAAAGAACACAGCTTCATTTCATTGGGTTGCTCGGTAATATACTATTGATCAGCGATATATAATTAGTTGGTAATATACTAATATATAATATATCGAAAAATAAAACACATGTGGTGATGTAGTGCCACTTGACAATTTAACACCAGTTGGATAATGTGTATTTTAAAGATGAACAATACGACTTTACAGAAAAAATAAAAATAATAATAATAAAGTTCAACAATATTAAGTACAAATTGAGGTGCACTTAGCACCATCCTCATTTTACTTGCCCTCTTCTCCATGCAATTGCGACGTTTCTCACTTTCTCTTATCACAATGTACCAAATAGAACTGTTTGACGGAAATATGAATATCTAGTTAAGTTAACAGATCAGTGTTGGTGAAGAGGTTTCACGCTATTAATATAAGAAATCAAATAGGTGAAACAATTTAATTGGTCATTAAAACTATATGTTAATTTTCCTAGTAAACAAAAGGTGGACAGATAGATGATTGCTCACTAAAAAATTGTGAAACCTTCTCACCAACATTTTTTGGTTAAGTTAAACATAAAAATCTGAGAATGACTAGTTTAATATAAGTATTCCACCTTGTAAAATCTAATTCTAAATACCTTTCAATTTTATGCAAACTCGACTTCGCTTACTTTTCAAAATATTAATAAAATTATAAGTAATAAAGGTTTTAATCCAAACAATTCCGAAAACAAATTTGATAAAAAGTTTAATATTATGTTCTGAATTAAAATTGAACATATTTCTTTTCCCAAAAAAAAGTGCAATTTAGAAAATTTAATATTTGAAAGAATGCGGCGCAGTGAAAAGGAGGCTTGGCTTCTGGTAAAAAGATCCAGGTTCGATTTCTACCATGCGCTTCCCTATCGTATATAAATTTACCCGGAGTATGGGGGCTTGGATCAGCGGACGGCTTTACTATACCCTCCTCAGGAGTTTACCGGTCCGTCGGATTCTCTTTGGTTTAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAATTGTAATGAATGTTTAGAACATTTGGAGTGTATGACATTACACCTTCGTAACATTTATCTATAATTATTGTCAATGTATGGCCTATGAACATATGTAAAGAACGATAGTTATGTGCTAAAGGGCAAAAAATATATTTTAAATGCATTATTTTATCCAAACAACCTAAAAAATTGATGGAATTCAAATGGATTATTAAGGTAATTTGACAACCTTAACATGTACCTTTAACATTTTCCTTTATCTATTATTTGACCAGTCCACTAGAGCATGGGCCCTTCATGCTGTTATAATGAATGATAAATATATACTAAGGTCTATTTGTGGTTAGATGCATGCATGTCTTTTTTTCAATAAATCCACAGAACATCATCATGGGGTGAGGTTTAAATTTTTGGAACATCCTATTAATCATCGCCAACCATTACTCACTATCTGCTTACATATCACAAACACCTCCTTCAGTTTAGAGAAGACCATCTCAATCTAATCAGCCGTGCTTCAATTTCTATTTTACTTGTTTTTTTGTTATGAATCATTAAAATTAAGCCCAAATGCTCGTAAAATATTATTTGCCGCAAAATGAGCTTATAAATTGTTAACAAGCCAAACCAACAACTTTTAGATAATTAAAATCATGTTGAGATTAAAATTTTACAAAGGCATTATTAGTATTGAATAGGTTACTTCTGTCGATTGAAGTGGTGTGTCACATATTCTTGTGATTTGGCTCATTTGAGAAAAAGAGATTTTGGTCTATATACAGCGTAGCTAGGATTCCAAGTTAGTAGGGTCACAAATAAAAGAAAATTGGAGTTTTCATGGATGATACCTAAGATTATTTTAGCCTTTAATTCAAATAGTTAAAAAAAAGAGAGACTAATGCTCATAGAAGTAAATAATTCATAACAAATTATCAAACAATCATAACTAAAGTGTTGATATAATAATTTATTATACAATAATTTTAATGTTATATAAACTAATTTTAATAATAAGAATGCAGTATTTTATTACAAAAAAGAATATATGATTTGTGTTTTTGATACTTTCCAAGTAATTATAATTTAAAACCCATGAATGAATTCATGGTAAGGAAGGTATGGTAACCAAATGAAATAGATGAGTTCATGGTAACGAAGCATAGGCAGGTGGGAGTGAAATAGAAAAAAATATTTTTTCCAGTGCAACAAATTTTCTTTTTTTATTCACATATTCTCCCTACCAAAATTTTCTGTTTCAAACCCAAGAAAGTATCTTCAGTTTTTCGACAATAATACTCAAAATTTCTGGCAGGGTCATTTGCCCTTCCCTACCACAATGTGTCTCCACCCCTGTTGTAATGTGTTTTTGGCATGTCAATGGAGCAGCATTTTAATATAGGCTGATGTTTCATTTATTCTGTGTTAATTGATTGTGAATGTTGGTTGGAACAGTGAGCACAATTAAAATGAAAATCTAATGTGTTGAACACGGTGTCTTCTTCCTATTTTTTTTTTTTttTAAACCATGATAATTATTTCCTTAGTATAAACATTAATGTATGGTTTAACTATCTTCAGTGGGTGCAAAATTTCATGTGAATCAACTTCATGAAGAGCAAGTTAGAGGATACAGGGAGATGGAAAAAAAGAACATGAATGATACTTTGAAGGATTACCTTAGGCTATGCTCACTTGCAAAGGTATATCAAATAAACTACAAATGCGCATGCTCAGTATATGAAGATGGGCATATTTAATATATGAATAAAAAGTTCGGTGTTGCAATTACTCACAGATTCAGGCCGACACACTAGTAATTGAAATGGATGATGTGGACAAAGGACTTGTAGAGCTTGTTGCTCAACATGGAATAACTAAGCTTGTCATGGGTGCCGCTGCAGATAGGTATTGTATTCAAATATTAGAATCACATATGCATGAAAATATGAGCTAAATAAAGATAAATATCTAATTCCAAAAAACTTAATAAACAGAAAACTAAAAGCACTCAAATCAAGGACGGCAATGAGAGTGCAGAAACAAGCTGAGCCATCCTGCAAGATATGGTTTGTTTGCAAAGGAAATATGATACTAACAAGGTAGCACACATGATTCTTTTTTTGTTTGTTTTAGAAAGAATTAGGTTATTTCTATTTTATAATTTTCTTCTAACAAAATGATTAAAGCTTGGATAATGTTAATAGCTGTCAAAATGATTATTGCTAGTATAAAATATAAGATGTTATACAATCTACAGATCCCATAACTAATTCACATCTTTAGTTCATCATTTATAATATTGTTGTTTTCATTTCCTTAAGATTTCTTCGCCTTGTGAAATAAACTATTAACATGACAAACCTTTTTTCTAATATATACGCAGAGATATGCTGCAAGATGGAACAGGAATAACAGTTTCACCTACAGACAGCTTAAACTGTAGCAATTCAAACAAATTGAAGTCGAGATCAGCCCAACAATTTCAAACAAACACCCCAGATTGGCCTGTTAGTCCTATTCATAGATCAAAATCCATAAACTGTGATGCGGTCTCCCAGCATAAAAATCTTCATAATAGCATGTCAGTATACAAAAGCAATAACTTGTGTTCAGGTAGGATTTCTACCGATTCATTGGAAGGTAGTTCAAATTCTACTTATAGTGAAATGTTGAATAAGGAAGAGGACAGTGTAGTGAATACTCTAACGTTGCCTTCAGTACATGAATCTGAAAGAAATCCGGAGCTTTCAAGTCCTGAGACAGTAGGTTCTTACACTATCTTTTCTTCACAAAGTCATTCCTAGGAAATAAACTCAGGGATTGCGGAGATGGATAAAAATGGAGTGGCTATCTTTTGCAGGAAAATAGCGTGGAAGGCACAGAGATAAATGATTTGATGCAAAATGCTCTCAAAGAGGCTGAAGACTTGAAGAATGAAGCTTACACAGAGTCATGCAAAAGACAAAAGGCTGAAACGGATGCAATTGCAGCAGCTAGAAAAGTACCCTTTTTATTTTTAATTTTTGCTAAGCTACTGCTTCAGTTTAATATCTCTAATTAATGGAAGATTAATGCTTATTGCTATTTTAGTCAAATAAATACCGTGCTTTAAAAAAAAAAAAAATAATAATAATTTTCAGTTTTGTTATTTTAAGCTCATGATGAAAATTCATAAAGCTTTTGGTTTGAACTATACGCAACCAAACATGTGAATGGC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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020274864.1	1.9e-261	U-box domain-containing protein 33-like
Swissprot	Q8GUH1.2	8.0e-164	Serine/threonine-protein kinase
trEMBL	A0A5P1EDP0	8.9e-261	RING-type E3 ubiquitin transferase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G45910.1	45.19	0.0	678		U-box domain-containing protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G04375	AT2G45910.1	821	386	12	51	841	45	831	45.19	0.0	678
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AfisC5G04375	AT3G49060.1	510	260	6	358	839	307	801	40.59	2e-100	363

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	507	757	138.7	2e-40
PF04564.12	U-box	Domain	773	844	65.8	2.6e-18

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0002224	P	toll-like receptor signaling pathway
GO:0002229	P	defense response to oomycetes
GO:0002446	P	neutrophil mediated immunity
GO:0016020	C	membrane
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0004842	F	ubiquitin-protein transferase activity
GO:0016567	P	protein ubiquitination
GO:0043231	C	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0007166	P	cell surface receptor signaling pathway
GO:0010726	P	positive regulation of hydrogen peroxide metabolic process
GO:0010942	P	positive regulation of cell death
GO:0016310	P	phosphorylation
GO:0043123	P	positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
GO:0044444	C	cytoplasmic part
GO:1990266	P	neutrophil migration

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network