result

Gene information

Detail information of AfisC5G05097

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC5G05097	chr5	932812776	932827641	+

Sequences

CDS

>AfisC5G05097
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Protein

Gene

>AfisC5G05097
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020098683.1	3.2e-175	SWR1-complex protein 4
Swissprot	Q8VZL6.1	1.3e-138	SWR1-complex protein 4
trEMBL	A0A8K0I9Z4	6.4e-178	SWR1-complex protein 4

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G47210.1	61.28	2e-148	522		myb-like transcription factor family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC5G05097	AT2G47210.1	452	145	7	2	439	5	440	61.28	2e-148	522

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF16282.2	SANT_DAMP1_like	Domain	106	180	105.7	9.4e-31
PF05499.9	DMAP1	Family	307	371	30.9	2.1e-07

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0043968	P	histone H2A acetylation
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KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K11324	DMAP1, SWC4, EAF2; DNA methyltransferase 1-associated protein 1	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network