result

Gene information

Detail information of AfisC6G00401

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G00401	chr6	53231388	53241398	-

Sequences

CDS

>AfisC6G00401
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Protein

>AfisC6G00401
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Gene

>AfisC6G00401
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ATTCTTTACCA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020268792.1	0.0e+00	paired amphipathic helix protein Sin3-like 4
Swissprot	O48686.3	0.0e+00	Transcriptional corepressor Sin3
trEMBL	A0A8K0NBM4	0.0e+00	Paired amphipathic helix protein Sin3-like 4

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
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>>>Show top 3 blast result

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AfisC6G00401	AT1G24190.2	1356	511	27	6	1244	2	1317	50.74	1217
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02671.18	PAH	Repeat	35	79	61.2	6.7e-17
PF02671.18	PAH	Repeat	116	159	60.6	1.1e-16
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PF16879.2	Sin3a_C	Family	981	1224	171.6	2.6e-50

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0051716	P	cellular response to stimulus

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K11644	SIN3A; paired amphipathic helix protein Sin3a	EC:-	Mitophagy - yeast	ko04139
K11644	SIN3A; paired amphipathic helix protein Sin3a	EC:-	Thyroid hormone signaling pathway	ko04919

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network