result

Gene information

Detail information of AfisC6G01324

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G01324	chr6	205892703	205917082	-

Sequences

CDS

>AfisC6G01324
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Protein

Gene

>AfisC6G01324
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Functional annotation

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nr	XP_020267222.1	2.2e-186	serine/threonine-protein kinase HT1-like
Swissprot	Q9ZQ31.2	1.2e-165	Serine/threonine/tyrosine-protein kinase 13
trEMBL	A0A6I9QV59	2.4e-171	serine/threonine-protein kinase STY13

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G24360.1	72.77	4e-168	587		Protein kinase superfamily protein

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Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G01324	AT2G24360.1	393	92	3	23	410	29	411	72.77	4e-168	587
AfisC6G01324	AT4G31170.3	411	110	6	9	410	12	412	68.61	5e-167	583
AfisC6G01324	AT4G31170.2	411	110	6	9	410	12	412	68.61	5e-167	583

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	130	383	224.7	1.1e-66

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000077	P	DNA damage checkpoint
GO:0000186	P	activation of MAPKK activity
GO:0000287	F	magnesium ion binding
GO:0001666	P	response to hypoxia
GO:0007010	P	cytoskeleton organization
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004709	F	MAP kinase kinase kinase activity
GO:0004712	F	protein serine/threonine/tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005789	C	endoplasmic reticulum membrane
GO:0007050	P	cell cycle arrest
GO:0007224	P	smoothened signaling pathway
GO:0007257	P	activation of JUN kinase activity
GO:0009314	P	response to radiation
GO:0009658	P	chloroplast organization
GO:0009686	P	gibberellin biosynthetic process
GO:0009744	P	response to sucrose
GO:0009750	P	response to fructose
GO:0009873	P	ethylene-activated signaling pathway
GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0045892	P	negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0018107	P	peptidyl-threonine phosphorylation
GO:0042733	P	embryonic digit morphogenesis
GO:0043065	P	positive regulation of apoptotic process
GO:0043425	F	bHLH transcription factor binding
GO:0043433	P	negative regulation of sequence-specific DNA binding transcription factor activity
GO:0044822	F	poly(A) RNA binding
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048510	P	regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase
GO:0071281	P	cellular response to iron ion
GO:2000035	P	regulation of stem cell division
GO:2000069	P	regulation of post-embryonic root development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network