result

Gene information

Detail information of AfisC6G04123

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G04123	chr6	735809594	735816423	-

Sequences

CDS

>AfisC6G04123
ATGGAGAAATCGAGTTCATCGGGGCCGTCGGATTTCCCGCCGAAAAAGCTAGTTCGTCAGCTCGATTTCACGACTTCGTATAGCACTGGAGCTCCCGCGCCTCCTACTCAATCAGTTGCCGTACAAAGATCGTCTTTGCCTCCGCCGCCGTCGTCACAGCAGCCGAGTTTGCGCCCTGCAGTATCTGTTTCGCGAGCTCCGCTGCCAGTTTTAGTTCCAGCGAGGTCGGAATCTCCGAAACCACGACAAGTGAAAGATGGCACCCCAACAAGGAAAAAGAACTGTAACTGCAAACACTCCAGGTGTTTGAAATTATATTGTGAATGCTTTGCATCGGGGGTTTACTGTGATGGATGCAACTGTGTGAATTGTTGCAACAATGTTGAAAATGAAACTGCCAGACATGAGGCAGTTGAAGCCACATTAGAGCGCAATCCAAATGCTTTCAGACCAAAGATTGGTAACAGTCCACATGCCAGCAAGGACAATAAGGTTGAAGCAGGAGATTTAGCTATGGTAGGGAAGCACAATAAAGGATGCCATTGTAAGAAGTCAGGCTGCCTTAAGAAGTATTGTGAATGCTTCCAAGCCAACATTCTCTGCTCAGAAAACTGCAGATGTATGGATTGCAGAAATTTTGAAGGGAGTGAGGAAAGAAGATCAATTTTCCATAGTGAACAGGCAAACTCCTTGTCGTACATGCAGCAAGCAGCGAATGTTGTAGTTAATGGAGCAATTGGTCCATCTGGCTATGGCTCTCCGATATCAAAAAAGAGAAAATATCATGAGCTACCATATACTGCTACATCAGCTAAAGATCAATCTGTTCACAGGCTTGCACCATTCCCACAAGCTAGCCATTTGAAGGCTTCTTCGGGACCTTCCTCTTTACCTCCCTCACCTGTACCGCGTGCCATGACACTTGTATCCCCAGTTCCATCTAAAGTCACATACAGATCGCTTCTAGCTGATATTGTACAACCAGATGATCCCAAAGAGCTCTGTAGGGTTTTGGTATTAGTGGCTAGTGAAGCTGCCAAATCATACTCTGCTAGAAAAGCTCAAGAGGAATCAGCAGCAGGAGAGGAAGTAACACAGAGTTCTCTTGCCTCAGCAGACAACTCAAGAAATGAAACCCCAGAAGTGCAAAATTCTGCACTTGATATGTTAAGTGAGACCCTCACAGGCAAACCAAACACAAACGAATCCAGATTAAGCAATGCTGATGATGCACATAAAGACAATAGACCAATGTCACCTGGAACACTTGCATTAATGTGCGATGAACAAGATACAATGTTCATGGCTTCTAGAAACCCTAGCCCATCTCCAAGATTTGAAGAAAATGAAAGCATATCTGAGCAGTACATCGATCAAGAGAGACATGTGCTGACTGCTTACCGTGACTCTCTCCTAAAACTTATCAACTGTGGTAGAATGAAAGAAAAAAAGTATGCTTCGGTGGCAATGAGTTCTGAATCACCTTCTCATAATGAGCCAATGACTAATGGTATTGCAAAAGTTGCAACAGTAAGATCGGAGGCTCCTCATCAAGCGCCCCTTACAAATGGTAGTACACACAGTATGCCATCTACCTCTGCACAAGTATCGCCTACTGTAGATGGGACCTATGTTTCAGTTAATAACCACTTGCCTCAGAAAGCTGAAAGAGTGACAATAAATGGAAGTGCAAAGCCTGATATTCAAAACTCTGCCACGCAAGGAAAATCATAG

Protein

Gene

>AfisC6G04123
CATAACCATTCAAATCCGTCAGATCATCCAGTTTCCAAAATCCAGCTGTCCAATATATGAATGAAAATAAATTTGATTTTCAAAACTGGAGGGGGAGAGAGAAAAAGAAAAACTCCATTAGCTTGTTGTCATCTTATTTTTCAAAATATCAAACCCTAATTTCTCCTTTATTTGATCGAATTGCTAGCTTTAATTCTGTTTGTATCGGGTCTTTCCGTTGATTTAAATTCAGTGGCCGAGATCTGACAAAATCTTGAAAATTTGAATTTTTCATGGTTAGGGTTATAATTTGGAGTGCTGGTTTTTGAAATTTTGTTTGATTTGTGAACCTTGGACGGCTCTGATGGAGAAATCGAGTTCATCGGGGCCGTCGGATTTCCCGCCGAAAAAGCTAGTTCGTCAGCTCGATTTCACGACTTCGTATAGCACTGGAGCTCCCGCGCCTCCTACTCAATCAGTTGCCGTACAAAGATCGTCTTTGCCTCCGCCGCCGTCGTCACAGCAGCCGAGTTTGCGCCCTGCAGTATCTGTTTCGCGAGCTCCGCTGCCAGTTTTAGTTCCAGCGTGAGTTCTACCATTTCTTTTCATAACTTGGGTAGATACATTTCGCAAAGTTGAAAATTTGATGATTATTGGAACGAGGTTTACTGTTTGGGAGATTAGAGGGGCTTCTTTGTAGTTAAATATTTCTGGTATTATTTTAATATTATTTTTGAAAATATTTTGTACTTAGCTGTTACATATGTACGTTATATCGTTAAATTTTGAAGTTTATTATGTTCCCGATTTCTGCTATGGTTTTGTTTGGGGTAATATTTTGAAAATCAAAAAGTAGGATGAGTTTTTTCAATGGGTATGCAATTTGATTCAATTAAACACATTTCCCCCCCTCCTCTGTATGACAATTTAATGCTTGATTCAAACGCTAATCTAAAATTTGAAGTTAAAAAAGGAAGCAAATTTACATGTTGATACCTGGTTACCTTATATCAGCATTGAATTTCCTTTTTCAATCTGTGTAATGTTGATTCAAATACATTTTCTTTTTAATTACCAGCTATATAGGATATTGTGGATTATGTCAAAGAGATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTCCTCTTTCTCTTATGTCGTTTTGACCAGTTTGCACAGTTCATTTCTTGTGATTTGTCACGGTTGTTAAAATCATGTATAATATGAGAACTGTTTTTTTTTCTCCTAGGAGGTCGGAATCTCCGAAACCACGACAAGTGAAAGATGGCACCCCAACAAGGAAAAAGAACTGTAACTGCAAACACTCCAGGTGTTTGAAATTGTATGTCTACTGACTCTAGTTTACATCTCTTTAACAATTATTTGAAATTGTATGTCTACTGACTCTTGTTTACACCTCTTTAACAATTATTTGAAATTGTAATGCATATTGTTGCTATGTTCATTTTTGTTTGGTAACCCATTGACTTAGCATACAAGCGTTGCATGTTCATCTAGCAACACATAACTTCAGGTATGGCAATAGTACAGTCCTTTTTTATGATAGTGTACTGTGCTATATACTTCTATAGGATGTCCATATGTTGTAAAAGTTGGTTCTGAATTGCTCTCCCCTGCATATCTGTGTCTCTGTGATTATACTCTATTAGGTGTACTAAATGATCAGGGTCATTCATAATGAAAAGATAGTTTAATGCAATGTTCCTGATGTTTTCATTGGTAAGATACACTGTATTCTCAATAGTACATTAGAAATTTAAATACATGTAACAGTTCAGACTGCACATCCTTGTAGCTTAAGTTGGACGTGTACTTGTAGTTTTTTGCCTATTTATTCTTTATTTGAGTTTCATTGCATTTGCCTGCAACCTTAACTTTTACTCTCAAATCCTCTTCTGTTTCTTTAGTAAGAAGCAGTATCCCATGGTTTTTTCATACGTAAATCATTTTTTTTTTCAATATGCTAGTACTAAAGTCATGTATATTTTTTAAAATCCTCGTTCTTGTAGGATTTGCATATTAATCATAGTGATTAGCTTGTTCATGTGGACATGAACACCAAGTCCAGGTGAAAAGAATAATTTGGAGCTTGATAAATACAATACTCTGCAAGTTTAAGTGAATCTGACCTGACTAATTAATTTTTCTATTTAATTGTTACCTTAGGTTTAATATATCAAATAAATCATATTACAATTTTTCCTTGACTAAGAAAAAGTTAGCATAGCCTAAAAAGAAGCATATTTACATAATATGGAATTTCCCAATTAAGTTACTTCAGGAAGCTTATTATTCTTAATTAGCATGCTGTTTCCCTTAATGTAGTAAATACTCATTGAATCTAAGACACCTTCCATTCTGGGACATTAGCAAAGAGGGTTTAGTTTATCTTCTTTGGCCTATAACAATCAATATGATACCATTTGTTGTTTTTTTTTCTGAGTAAAGATGCTATTTGAATTTGAATAATGCTTTTATCTGTTTATTTGTTGTATTCGAATAAAAAGTAGTCTTTTTGTACCAAAATTAAATTGAAGATATGTTTTGATCTTTCAAAATCATTGAACGATATTTTTTAAAGTGATGCAGAAGTTGGTATATATAAAATTCATAAAACTATATTCGATTGAACTATAATTCTGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACACCTGATTTATCAGGCAAAAGAATAAAGCATGAAGAAATGTACATAAAAGAGCAATAAAAAACAGGCGGTTATAATCTGTGATTTTAAATTTAGTGATAAGTATTTCAAATACAAGAGGATTGTCATTGTATTATAAGTTAGTAGTTAAAGCAGCAGCAATATTTAAGTCTGTAGCGTATAAAAAAAACTATCAGTTGGTATCTATTGTTTTGCGGTAGTACTAGTACTTTTGGATGTACATGCAATATCAACTTTCAAGCTTTACCACAGTATTGAGCCTTCAAGTCTTTTAACACATGTGACAGCCACTAACTTGATGGTTAGGTAGTTTTCTCTTGAACAGCTGGACACGAATTAGTTGTCATCTGTAGATTTCTTGTTTTTTCACTTAAAAAGGGTGAATTTAATCAACAAAGAACTGTACAGCCTTGCATAACATACCATATTATATCTGTTAACCGGCTGCGTTATCTCTTCTATAATTTGCTGTACCTTGCGTTACTAAATTTACATTTTCTCTTGTACATCCATCTCTGTATATTTTCCATCGAAAGGCTACTTGTCAATGGTTACTGGCAATACCATTTGGTTTTGGTGCTACATATTTTTCAGGTTCCTAGCATTATGTTGGTACTTCACACCTACTTCATATGAACCACAAACCCAAAAAAATAAAAAAGAGAGAGAAAgGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGAGGCTAGTAATACCTTCCTAATATGCAATATTGTTACAATGTGTCATTTTGCTTCCTACAATGCAATAGCGAATATTCTGTCAACTTTGATTTTCATATATTGTAATTGTTTTCATGAAAATGCAGATATTGTGAATGCTTTGCATCGGGGGTTTACTGTGATGGATGCAACTGTGTGAATTGTTGCAACAATGTTGAAAATGAAACTGCCAGACATGAGGCAGTTGAAGCCACATTAGAGCGCAATCCAAATGCTTTCAGACCAAAGATTGGTAACAGTCCACATGCCAGCAAGGACAATAAGGTAGGCTTCTTGCTATGTTTTCCTCATATAATTTGCATGCACCCAGTGATACTTTCATCAACCTTTTACACATGCAGTTGTGGCCTATTTTAGTTTCTTCTTTTAGTGCTACAGACGTGTTACTTTTGAAATATTGGTGTAGTGGTACAGGGGTTTCATTTCTGCTTATATTTGACAAAGAGTCAGTTATTTCCAGGTTGAAGCAGGAGATTTAGCTATGGTAGGGAAGCACAATAAAGGATGCCATTGTAAGAAGTCAGGCTGCCTTAAGAAGTATTGTGAATGCTTCCAAGCCAACATTCTCTGCTCAGAAAACTGCAGATGTATGGATTGCAGAAATTTTGAAGGGAGTGAGGAAAGAAGATCAATTTTCCATAGTGAACAGGCAAACTCCTTGTCGTACATGCAGCAAGCAGCGAATGTTGTAGTTAATGGAGCAATTGGTCCATCTGGCTATGGCTCTCCGATATCAAAAAAGAGAAAATATCATGAGCTACCATATACTGCTACATCAGCTAAAGATCAATCTGTTCACAGGCTTGCACCATTCCCACAAGTAACCTACCATAAACTACTTTGATTACATTGTAAATTACATCCAAAAATTTCAACCAATATGAATATTAGCACATATCGATTTAAAACTTCTTTTCTCATAATATTTAGTAAAAACATATTGAAAAGTATCAAACTACAGATTTTGATATCTTTCTAGTTGTGATGAATTTTCCTTAATCCATGTATGTGCAACAATTATAAAGCATCAGAATTTTACTGTTTCCCCTTCTGTGGATATTTTTATTGTTTGACCTAACAAATATGTAAATTTAACATGCAATCAGCAATTGATTTAGTGAAATAAAAAGTTGCTCAACTTCTAACAGAGTTTTAATTTCTTTGATTGTCAGGCTAGCCATTTGAAGGCTTCTTCGGGACCTTCCTCTTTACCTCCCTCACCTGTACCGCGTGCCATGACACTTGTATCCCCAGTTCCATCTAAAGTCACATACAGGTATATTTATTTTTGTTTTTGCATGTTTTGCGCCTGAAGTTCTTATCAAAAATCATGTTCTGATTGTATTAAAATCTCTCTCTCTCTCTTTGTAGATCGCTTCTAGCTGATATTGTACAACCAGATGATCCCAAAGAGCTCTGTAGGGTTTTGGTATTAGTGGCTAGTGAAGCTGCCAAATCATACTCTGGTATGAACAATAGGCTTTATTCTAAATATTGCCCAGTAATTTTCTTACAAATAACTATATGCACCAAATTTCGTCTTCTTGTTTCCTGTCCCTTCTGCAAAGTTTTTGCTTTATGATAATATAATGTTAGCAAATAAGTATTATCATTTGTCATGATAACTAGATTGTGTTCTTATGTCAACATTTACATAGTTAGAAATATACTTGTATTTGAATGGCATGTGTAGATGGTTGTGCATTACTTTGGTATCTTTCTGGTTTTTCTTTTGGTTAATATTTACATGGACTGTAATTTACTACTGGAACATTATGCATTAGTGAATGAGCATTACTTTGCCTCCTTATTTATTGTTAAAAACGTATAAATATAGTTTAACATAAAACATTTACTACAATATGTTGGTTTTTTTTTTTTGGCCACACCTGGGCTAACTCTGGCTATGCCCTTGTTAAAGGGTGAAGCTGAAATACGTATGTTTGATATATCCATAAATGATTGAATGCCGCAGCTAGAAAAGCTCAAGAGGAATCAGCAGCAGGAGAGGAAGTAACACAGAGTTCTCTTGCCTCAGCAGACAACTCAAGAAATGAAACCCCAGAAGTGCAAAATTCTGCACTTGATATGTTAAGTGAGACCCTCACAGGCAAACCAAACACAAACGAATCCAGATTAAGCAATGCTGATGATGCACATAAAGACAATAGACCAATGTCACCTGGAACACTTGCATTAATGTGCGATGAACAAGATACAATGTTCATGGCTTCTAGAAACCCTAGCCCATCTCCAAGATTTGAAGAAAATGAAAGCATATCTGAGCAGTACATCGATCAAGAGAGACATGTGCTGACTGCTTACCGTGACTCTCTCCTAAAACTTATCAACTGTGGTAGAATGAAAGGTAATTTTTATTAATTGTCATCATGCATATAAAATATTCACAACAAACCAGTTCATTTCTAGACACATGAATTAATTAACATAGGACATTGGAACCATATACTAATATTGATTTGCACATTAACAATGAGATTACGAGGGGCATCAGTATTGTTATTACTCTTTCCACATGCTTGTGTTTAATTGTAAAGGAACCTATACAAAGCTTTTGAAATTGCATGCTTGCAATTAAAATATGATATGATAGTACCATTCTCTTAAGTGGTAATTATCTACTTTAACTTGCTGTATCAGAGCATGACAAGAATAACGTGGTAGTACATATATATTGTAGAATTTCGAAATTTTGACTTTCAATATATCTTTTTGGGAGTGCCTACAGAAAAAAAGTATGCTTCGGTGGCAATGAGTTCTGAATCACCTTCTCATAATGAGCCAATGACTAATGGTATTGCAAAAGTTGCAACAGTAAGATCGGAGGCTCCTCATCAAGCGCCCCTTACAAATGGTAGTACACACAGTATGCCATCTACCTCTGCACAAGTATCGCCTACTGTAGATGGGACCTATGTTTCAGTTAATAACCACTTGCCTCAGAAAGCTGAAAGAGTGACAATAAATGGAAGTGCAAAGCCTGATATTCAAAACTCTGCCACGCAAGGAAAATCATAGTAAAAGTTCAAACTATGCTATTTTCTTATTTTGCATTCTACTGTGTTAGAATGTCAGTTATGGGTTACAATTGCTAATTTCATCTGGCTATGTGGTCGCAGTGGAAAATAAGTGAAAGATAAAGAGATAAAAAAATCAAATCTTTTGATTTTTTTATACATTGGGATTGTGTAATTTATATACATAGTTGTACATGTTCCTTGTAATTTTATCTGATTTCTTTTATTGCCAATGCTTAACTCTCGGTGAATTTTACATTTACTAAATATGACATAGTAGAGATGCTAATGCTCCAATATGTATATTTGTTGCTTGATTCCTCTATAGATTGGCG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020263972.1	6.6e-165	protein tesmin/TSO1-like CXC 5, partial
Swissprot	Q9SZD1.1	6.1e-115	Protein tesmin/TSO1-like CXC 5
trEMBL	A0A6I9RD14	1.8e-151	protein tesmin/TSO1-like CXC 5 isoform X1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G29000.1	48.23	3e-128	455		Tesmin/TSO1-like CXC domain-containing protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G04123	AT4G29000.1	564	221	20	12	528	21	560	48.23	3e-128	455
AfisC6G04123	AT2G20110.1	587	231	19	12	556	10	539	43.78	1e-114	410
AfisC6G04123	AT2G20110.2	587	238	19	12	556	10	546	43.78	1e-112	404

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF03638.12	TCR	Domain	92	127	38.9	7.3e-10
PF03638.12	TCR	Domain	178	213	47.2	1.8e-12

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000122	P	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000794	C	condensed nuclear chromosome
GO:0000785	C	chromatin
GO:0001046	F	core promoter sequence-specific DNA binding
GO:0051726	P	regulation of cell cycle
GO:0004181	F	metallocarboxypeptidase activity
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0005700	C	polytene chromosome
GO:0006875	P	cellular metal ion homeostasis
GO:0007283	P	spermatogenesis
GO:0007307	P	eggshell chorion gene amplification
GO:0008340	P	determination of adult lifespan
GO:0010038	P	response to metal ion
GO:0009791	P	post-embryonic development
GO:0010008	C	endosome membrane
GO:0010082	P	regulation of root meristem growth
GO:0030317	P	sperm motility
GO:0030849	C	autosome
GO:0031523	C	Myb complex
GO:0048608	P	reproductive structure development
GO:0070176	C	DRM complex

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K21776	LIN54; protein lin-54	EC:-	Cellular senescence	ko04218

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network