result

Gene information

Detail information of AfisC6G06901

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC6G06901	chr6	1194366156	1194372505	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC6G06901
ATGTACCATATCAATTTAATTTTAAGTGCTTTAGGAATTGTACTGATTACAATATTTTCGAAAGTTTTAGTGTTTATAATATGGAGGCCTTCATATATAACAAAGAGATTAAGAAAGCAAGGTGCAAATGGACCTCCTTATGAAATCTATTCAGGCAATCTAAATGAGATAAGAAGTTTGAGAAATGATGCGAAATCTATTGAAATGGACATCAGATCTCATGATATCGTACCTAGAGTTCTTCCACATTATCTCAAGTGGATGTCTCAATATGGTGAGTTCTATATCTAGTTTTTCCTTATATTTTTTCACAAATAACAAGTTATGTGATATGGCATGTTTGACTAACAACAATGGAAGGGGTAAAACAAGCAAACACCACAATGTAAGTGATTGTTAAGGGATCAAGGACAAATAAAAGAATAGCTGTCAATTTATTTTTGTCAAATTTGATACGCAAAAAATGATTATTCAAATTTTCTTACACTGTTTTCAACAGGCAGACATTAATTGTGTTTCTGGCTTGAAAATAAAAACGCGCATGTAATTATTATGTAAAATCCTAGTCATGACAACAAAGGAGAGAATAAGATGAAAGAAGGTAGTTTATTATATGGGAAGTTTTGCCAAACACCCTTCTATAATTTCAAAATACACTTCCGTCCTTTTCCAAAAACAAGGTTTACGAACCACCCCTGTAATTATTTTCAGAAAAAATCTACAGTTTTTAGTGCATGTATTTGTAGTTAAAATTGCAAATATTTACAGTAAATACTGCAAATAATTGCAAAAAAAACATATTTTTGTAAAAAACAAATATTGCGCTAAAAGTGTAAATATTGTAGTTTTTGGTGCAGATATTTGTTGTATTTACTACAAATATTTGCAGGTTTAACTCGAAATATTTGCACTAAAACTATAAATTTTCACTGAAAATAATTACATATCGTAAAACCTGCTACTGAGAAGGGTTTTACGCGTATTGAGTTTGAAAATATGGTGCATTTGTTTTCCACTTTTTATATTTTCCGAAATACGTACAAGGAGAAAAAAATCATTTTCAATTTCTTATCTTTAAACTGCTTTCCAAGTATGATAATTTTCCAATCCTCTTTACTCTCATGTTCATTTTGTATACATGCTGAAAACGCAAAACACAAAATTCATTTTCTAACCAAACAGACCCTGAAATTCTTTGAAAATTTCAATGGAACTATCTAGCATTCGGTTTGCATTTTGCAAGTATTGTTTGTATTTTTTAAATTAAGAGACTAAGCTTCTTCAGATAAATCTTAACTTTTTTCTAAATTAAGAGATTTCTAGAACTATTAAAATAAATATCTTGAAGGATATATATATATATATATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTATATGTATGTGTATGTGTATGTATGTGTGTGTATGTGTATGTATATAAGTATGTATGTATATATGTATACGTATGGATGTATATATGTATATGTTTATGTATGTATCTGAGGTAGTAGTTGATATTTTAGTGATTACGATGTATCTTTTTGCTATAAGGCCGTGTCATTGCATATGAACAGTTGTAATAATTTGTAAAAAATATGTAATAATTGTAGAAGTTGTATCTATTAAAGATGTCTATTCACCATCTACAAATAGTTAGCAATGATGGTGTCTAATCCTATGTTATATTAAACACTAAGTGAAATGAGGCAACAAAACTATTGCAGCACAAGGTTATCAAAATGGGATTCAAATCGTAAATTGTAAAATTCGAATTTTAAATCGAAACGGGATTTAAATCGACAATTGTAGATTCAAAAGGTTCATACTTTAAGGTTTGTACACACTTTATAATTGATTATGATGTTTGAAATTTTACGTCGAAACTTAAACATTAGTTGTTCCTCTTGTTTCATTTTTATTTCACTTAGAAAACAATAGAATTCGGATTGTGGATTTAAATAAGCATATTGAATGTATAAGTATGTATTGAATGATTTTTCTCAACTGCGGTTTAAATAAGTTTGAATCGGAATGTAAATCGAATCGGAACGGAAGAGATCCGATCTGAAACGGGATTTAAATCGTAAAATTCTAAGATTTTTTTATAACAATGTTGTTGCATTTACTGGTGCTTAATCTTCACTTAATTTTTAATGCAAAACGTTGTCTCTATTATTAGACCAGAAATTTGTAAGCTGCTGCTTATGAATTAGAACATTGTTGTCAAAAATCCTAAAATCCTACGATTTAAATCCCGATTCGAATCGGATATCTCCCTTAACGATTCGATTTACATTCCGATGCAAACTTAGTCAAAACCGCAAATAAAAAAACATTCTATTTATATACTAACATACTTAATATGTTTATTTGGATTCAAAATTCAAAATACAATGTTTTCAAAATAAAATAAAAATATGATAAGAGAGGAAATTGGGTTTTATGTTTAATTGTAGAAGTTCAAACATCAAAATCAATTTCAAATTGTGTGCAAACCTTCAAATACTAATCTTTTGAATCTAAGATTTATGATTTGAATCTCGTTTCGATTTAAAGTTTGAACTTTGCGATTTACGATTTAAATTCCGTTTTGAAAACATTGGATTAGAAGTTTTACAACTAAAATTTACTTTTATAACATAATATATAAACCTTCATAATAGTTACATAAAGTTCTACAAAAAAATTCACGCTTTTTTTTAAGCTAGACCATTTAATTTTTGCTTAAAAATATAGCAACACGCTATTAAGCATAAGACAATCAGTTAACACTTACCATATAATTATAGTAAATTTTGGATAAAGTAAGCATAAGACAATCAATTTACGTTTAAAAGTCATCCATGCACTTTGTAAAAACATTGAGATTAGTAACAAATTTCTGTTGTCCTTGTATAATAAATTCTCACTTTTCTTCTCATTCATTTTTATAGTTTCCTATAGATATGATTTTAGCTAAATTTATAGCCATTAATGCATGACAAAAAATATATGCACTAACACAGTAGAGAAAAGGTACCATGTACACTAAAATTTGACATACAGATAACAATATCGTTCATCTTCATTCGAATAAGGTTAGTGCTTTCTTAATAACAAAAGCTCACACCTTGACTTAGTCCATGTGAACGAGATGATAAAGCTGGAAATTGTATTTGAGTTGTTTATGGACGTAGATTGTTACATGCATTTAGCATGAACTTCTACAAAGCTCACTGCCCAATTAAAACTAAACTCATATTTCAACTCTTACCGACTACAAAATATTGAATATGAATGTTCTTGAGTTTTTGTGATTTGTGCATGTAATGCAGGAGGAAACTTTTTGTATTGGTTCGGATTGGAGCCAAGGATCTGCATCACCGATATTGAGCTTGTTAAACAAATTCTATCGAACAAATTCGGATTCTATCCGAAGCCTAAAATACACTCGAGTTTATTAGCTATTTTTGGTAAAGGGTTAGTTTTTACTGAAGGTGCAGAGTGGGCTAGGCACAAGAGGGCAGTTAGCCCTGCTTTCACTATGGACAAGCTCAAGGTTTGATTTGTTTTTTGAGCAATATGAATATTTTACATAACATAGGAATTTATGTATGCTACAAAACAAGAATTACCGAAATATTTTCATACCTGAATTGAAATTTAGAGGGGGTTCATTGATATTTGGTAATTTCACATGATTATTTTTCTGTTAATTCATCTATTTTCAATTTTCATTATATCAAGGGAAAGAGGTACATGCAGTAATCATGACTAACAATGTCAGCTGTTTTTTATAGATGATGACAAAGCAAATGGCAGACTGCACACTGTCAATGCTAGATAAATGGGATTCCATGATGAAACATAATGTGATAGAGGTCAATAAACAATTTCTTGAGCTAACTTCGAACATAATTTCACATACTATTTTTGGGAGCAGCTATGCCAAGGGAAACGAAGTCTTTGTGGCACAACAAGAGCTCGTATTGCACTTTTTAGCCACCAGTCTCAGTGTTGAAATCCCTGGATTCAGGTAACTTTACAGTTTCTTTTTTCGCCTTTCACTACATGTGGAAAGCTCTAAAGTGCATAAAAGGAACAAATTAAAATGATCTAAGATGATATTGCAAATTCAACCAACCACAGTACGCATATTTTTGGTCATAAGTTGACTTAAAATAAAAATCAGTATGTTAATAAATTAGCATTCAGATAACTTACAACTTGTACTTGTTAGATTCAAACCATGGTTCAAACTTCGGGTCAGAACGTCGGATTCCCGGTGATACCGTTCCGGTTCCGGCTCCGGCGTCGACCGGACCAGAATAAGAGGAAAATCCCGATTTCGGATCTAGGGTTAACAGAAATAAAAATTACCAGGTAGGAAGTGGTAACAAGTTGAAGTAGGAACTATCGAACTACAAAGCAATGCAATTTAGTAGCCATCGCCATTTTTCTTTTTGGGTTCATCAGCTGGACGAATTTGGGGCACGAGCAAAATAGAAGAAGAAGAAAGGAAACGCATTGTTGTGGGGAGTTAAAATCAGACTGGACTGCAGATATACTTTATAAACTAAAAGTAAATTAGATAGTTGATGGGCCGGGCTGCTTAATATTTAGTAAATCAGCTTGTTTAAATAATTTGGAAATAGTTAATTGATGGGTTGGCTGGCTATATAATTTTAAACTATTTAAATTAAATGTATTTAAATAAATTTAGCTTATAAAATTTGTATAAACATTATCAAAAATTATTTATAACTTTAAGTAGTTGATTATGCCAAATCGTAATATTGTTTGGAATTACTGTATTACATTCAGTGTTAAATGCTTTGTATCCTGTATATAATTTCAAGAATGTACTATGAATTTATATTAGTATTGAATATTTACGACAATAGCACCGGAATTAGCTAACCGGAATTAAACTGGAATTTCCGGAATTTGCAGAACGGAAACGAAATTTTAAAATTATCAAATGGCCAGAACGGAAACGGAAAACAGAATTTTGAACCTTGATTCAAACATGTTATATTTGCAGTTATTTTCCATCTAAGAGAAACATAATGAAAAGAAGGCTTGAAAGACAAATGAGGGACACGCTAGTAAGCATCATTCAGGGCAGGCTATCAACTAAAGACTCAAATTATGGCGACGATTTACTTGGTTTACTAATGGAGCCACTGCAAAACAAAGATGGAAATGGGCTGAGCATATATGATATCATAGATGAATGCAAGACTTTCTTCTTTGCTGGGCATGAGACAACTTCACATTTGTTAACTTGGACCATCTTTTTGTTAAGCACGAACTTAGATTGGCAAGCAAAGTTGCGAGATGAAGTTGTGAGAGAATGCGCGGTGGAAGTACCAAATGCGGACAGTCTTAGCAAGCTCAGAATGGTAACACAATCATGCATACATAAATATGCAATATCTTACACAATATATGCATTTTCCTAATACGTTTAAAATACAAACTTTAGCAATTTTTCTTACCATCTTAAGCCAACACCAATCCTCACGAAAAACAGAAGAAAGCTCTATTTCACTACAACAACAGCAGAAAAACAAATGAGGAAATATATTGAGTGTTGTGGCTTGTGGCATTTAATACACAGAAATTATGAACACAGTGGTGTACTGGCATGGTTACATGTATTTATACAGCAAAATACTCCAAATCACAACAATTAACCAGATTAGAAGGCATTGGAAATATAAAATAAATGTTATCATTTTGTTTCACATAGAATCATATACATGCCCCCTGGTGTTTATGTGACATTCTGTCAACTTACTTTAGGAAGTTAACTTTTGACTTAGAAAGACATATACTTACATGGTATGGCTAACCAAAACTATGGTATTTTTTCTTTTTCTTACAAATCGCTTATAGGATATATATTTTACAGGTAAACATGGTTCTTTTAGAAGCTTTGAGACTTTATTGTCCTGCTATCATGATCACACGACAAAACAGTCGAGAAATGAATTTGGGAGGCATAATTTTACCTAAAAATACAACATTAACCATTCCAATCCCGATAATTCACAGGAAAAAGGAGCTATGGGGAGAAGATGCAAACGAATTCAATCCACTGAGGTTTGAAAATGGAATAGTGAAAGCTGCAAAGCATCCAAATGCATTGTTATCGTTTTCAATGGGTCCAAGAGCATGCATTGGTCAGAATCTTTCAATGATGGAAGCGAAGATAGTGATAGCTATGATTTTACAAAGATTTTCATTCACATTATCCCCTGATTATAAACATATGCCTACAGATATGCTTACGCTGCAGCCTCAGTACGGACTACCTATTGTTTTCAAGCCAATTGAAGACGTGGATCTAGGAAATAACTGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020275069.1	4.9e-204	cytochrome P450 709B2-like
Swissprot	F4IK45.1	2.3e-145	Cytochrome P450 709B2
trEMBL	A0A5P1ED63	3.6e-204	Cytochrome P450 709B2-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G46950.1	50.00	3e-149	525	CYP709B2	cytochrome P450, family 709, subfamily B, polypeptide 2

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC6G06901	AT2G46950.1	488	238	3	26	507	84	571	50.00	3e-149	525
AfisC6G06901	AT2G46960.2	500	233	8	21	508	22	519	50.60	2e-148	522
AfisC6G06901	AT4G27710.1	511	268	4	4	506	7	517	45.99	3e-138	488

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00067.19	p450	Domain	88	490	249.2	6.6e-74

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0016020	C	membrane
GO:0008395	F	steroid hydroxylase activity
GO:0009416	P	response to light stimulus
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009741	P	response to brassinosteroid
GO:0010268	P	brassinosteroid homeostasis
GO:0019825	F	oxygen binding
GO:0016131	P	brassinosteroid metabolic process
GO:0016709	F	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen
GO:0033466	P	trans-zeatin biosynthetic process
GO:1902382	P	11-oxo-beta-amyrin catabolic process
GO:1902386	P	glycyrrhetinate biosynthetic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K20660	CYP709; cytochrome P450 family 709	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network