result

Gene information

Detail information of AfisC7G02571

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G02571	chr7	515254623	515268334	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G02571
ATGGCGATATCTTGCTTTCTCTTTCTCTTGTTTATCCTTTTCTCTTCCTCCACTGTATCAACATATGATTCCGAATCCAAGGAAAAAAATTTCTCACTTTGTGATTCATTTGGATATAAATGTGGAAATCAAACCTACGACATCTACTATCCTTTTCGGCTAAAAACAAGTCCTCGCTACTGTGGTCTTCCTGAATTTGAACTCTCATGCACGTCTGAGAATAAATCACTAGTAACCCATGTTAGCAATAAGGAGTATAAAGTGAACTACATCGATCACACACATCGTCTGCTTGGTGTAAGTGATACATCCTTTTATTATGTCGAAGGTCAGGCGTGTGATTCCATATTCACGAACACTGGTGTAAACCTTTCCCCTTTCAGTTACAGTTCAAATGATGTTAACCTCATGATTTTGATGAACTGCTCATCTGATCTTTCTTTACGTTACAATAATTTTGGAAGTATTACATGTCCGGCTTGGGATTCACGATATAAGGCATATTATAATTTTTCAAGCGATGTACAAGATGGTGTTTGGAATAAATGCAAGTCAGTGGCCATCATTCCCATAAATCAAGCTTTTGTGGTTAACTTGAAAAATAGCTATATGTATATAGAAGATTTTATGGGGGTATTGTTAAAAGGTTTCGAATTGAGTTGGAAACTGGATGACACGTTCTGCAATAAGTGTATGGATACAAATGGAACATGCTACACAGATGAGAAGGGTTCATTGCCATGCTATTGTTCTGGTGGCACTGTTAGAAAGGATGGAAGCTGTGACAGTATGTCCTTCTCTCTTCTTTTCCTCTCTTTTTTTCCTTAGTGTTATTGGTCACTATTTAGATTGAATTTTAGGACCGATATGAAGGTTTAACTACTTGTTACAAGTTTCAATTTTTGAGGAAATTTGACGTTCATTGATGCATTCATTTGATTATTGAACCATACTATCGAATTTTTATTTGGGAACCCATTGCAAATTATTTGGATACTTGGAGGCACTGAGAGTTTAAGGATCTGTACAAGGCGTAGGATTGAAATTTGAAAATAGAAAGAGAACATGAATCATTATACACGGTAAAACTTGCTTATATTTGCAAACATACAGTTTAAGAGTCGATTTTACTTTGTGAAAGTACGATGCTTATGTCACACTTTATATATTATTTTCGATCATTTGTATATAAAGGCTAGAGTACTACTCAAAATTACTGTTGTTGCTTGTTAGATTGGTTCATAGTGAATAAGAGGTGCCTTGTTTTATCGTAGCCAGTATCAGTTTAGAATCATTACCACCGAGATATTTTTTGGTTCTGACAGAGTGTATCTTCAGATTGTTTAATTTGTGAGTATCGCCTCACCATCTTCCTTTGTTTCCTTTAACAAATCGCAGTCAGATGACCTCAGTGATCCTTAACAGTGTTTTTTCCCATTTTGATTAATCTTTTTTGAGTTTAAACGAGAAGAGTCAACTATCCATCGGTATAAATTCATCAGTTCACATCTTAATTACAGTGTTATAAAACATATTTCAACTTTTCTGTTTGTAGATTAATAGTTTGGTATTTTTAATATATCTTGTTGAAATATAGCAATCTTTCCACTTGCCTTGTCCTACTTGTTAATTATTGCACACCAATAAGGAATAACTCTGGTAATTGGTGTAATATTATACACCAATAGAAATTAATATTCAACTGGATGGCAAAGTCAGGGTCAAGCAATTCCATCGCCATCTTATCCTGGCTTTGTCTTAGCTGTTAATTCCATGCGAGTATAGGCCTATGCATTATGTAAAATTAATTAGCAACGATTGTTACTTGCGAGTAATGAGTCCACACTCACCACCAATAAGAGGACTTGTGTACCATTGATGCTACTAAATTTCTTCGCGCCCTCACATATTTCATTCATATACTACACCTTTCAAACTTCTTTTATGGTTTTATTGACCACAGTGAGCCCCTTTGAACCTTCAGCAACATGACTTTAAAGTACTCTAACACAGGTCGTTGAGTCCACAAATCTTAGTTTACTATTACACCTCTTTCATGCTGCCTTCTTCACAATATATTGTATATTTTTCCCCTCTTTGCAAGTTTGCAACCTTTTTATGTTCCTTTATCTCTAATGAACCTAGTTCTCATTTATTCTCTTTCATTGTTGATTCTTATTTCTCTATCTTCTGCTTATGAATCGCCCTTTTATGAGATATCAAAGTTTGGTTGTGCACCAGCAAATTGTGGAACTGTTAGAAACATAACGTTCCCATTTTGGGTAGAAAATCAACAAGCGTCTTACTGTGGGTTTCCATCTTTCAAACTCAGTTGTAAAAACCAAACATTGACTCTCGCTAATTCAGCTCATTTTTCGTTACAAGTTAAAAATATCTTCTATGAAAACCGATCTGTTTTAATTGCTGATGAAACAATTGCTGGCCTCGCTCTCACATGTGGATTTGCGAGTTTGCCACCACTCTATTTTGATCAGATGGTTTTCAATATCAGCCGTGCCAACAAGAAGTTTAGGTAGTGTTTGGTTTAAAAACGAATTTTGTGTTTTTGGTTTTCAATATGTATATCAAATATGAAAAGAATGGAGAGACAGCGGAAGGGATGAAAGAAAGACGGATAAGAGGACGAAGGAGATAGAGGGACGACGGAAGAATAGATTGTTTCACGTGCATTTGGTATTTTCCAAAACGCGGAAAATAAAAAAAAAATTGTTTTCTATTTTGTATGTTAACTTCGTTTTTTAAATCGATCGTTTTCGACAATATGAATGTGTCATGTGCATTTTTGTATGGACGAAAACCCAAAACTAAAAATACAAACCAAACACTACCTTACTTTCTTATACAACTGCTCTAAGCCGCCATCTACATCTACTTACCGCAAGATCAATTGTAATTCTAGTGCTGTTACCACATATGCAGTATGGGACACTGATCGGAGATTTCCTGAGATGTGTGGCCCTGCCGCTCCGTATACGTTCGTTGCAGGTTACATGGGTGGTAATATTAGTAATTATTTGAGGGCAGTAAATTATGGGTTTCTTCTAGATTGGTCTGCAAATCAATGTGAAGAGTGTGAAAATACCTATGGACACTGTGGATACAATGAATCGTATAATGGTTTCATGTGTATTTGTCCTGACCGAAACCATTATAGAAGTTGTTTTCCAGGTGCTGATCTTGGTGAGTGTTTTATATCATTCTCTCATAATAGCATCCAACTAGAAACCATTTTGATGCTTGGGTTAAATTCCGACGATACTTGCTCTTTGTTGTGTTCTTTTGGTTTTGTGTCTGCTTTCATGAAGGCAAGTAGTAACATATATAAGACATACTTAATTAGATTATTTTTCGTACTTGCTATTGAACCGATGTGTATGAAGCACTTTTTCGAATTCCCAATTTGTGCTCTGCTTGTCTTTTGGTATGAACAGTTTTTGGAATTTAATGACCTTTTGTGAACATAATCGACTCACTATTAATATTATCGTTGAACTTTTTTATTTTATCGTGATATTTTCTGCCAACTAAAGATCATCTTTTGCTGATAATCATTCAGAGTTGGATTGTGTGCCTACAAAAAAATTTCATTGATACTAATAATCGAGTTAGACATAAATCAGAGATGGATAAAAGTCGGGACTAAGAAACATGAATATTGATGCTTTAATGTAGCCATGCTCTTAAACTAGATGCTAGTGCTAATATCCAGACTAGTAAATAGCTTCAACTTAGGACCACCATTTCAAATGTGATAGTTTACATTGAGTTACTTTGATATAACTTACAAGAAAAGAGTCACAGGTCCCTATTTTTGATGTTGTTGTACAAAAAGTCCCTGCAGAAATGAATTTGTAAATTTGGTCCCTATTTTTCAAAAATAAAAAAACGCAAAGCGTCTTGCACTATCTAATTTTGAAATATTTTTCGAAATTTTTGAAATTTTCTAAAATTTTGAAAAGCGCAAGTTAACTTGCACTTTCTATCGGAAAAATGCAAGCTAGTTTGTGCTTTCTAATTTTGAAATTTTTGAAAAGCGCAAGGTAACTTGCGATTTCTAATTTTGAAATTTTCTCGAAATTTTTAAAAAATTTAAAATTTTTGAAAAGCGCAAGGTAACTTACGCTTTCTATCAGGAAAACGCAAACTGTTTTGCGCTTTTTGATTTTGAAACTTTTGAAAATTTAAAAAGAACAAGCTAACTTGCGATTTCCGATTAGAAAAAACAAGGACTAAATTTATATAATTATTTCTACAGGGACTTTTCTTGTAACATCATCAGAAATATGGACATTTCGTGCAAAGCCCCCATAACTTATGCATACTAATATGGGGTTTAGGAACCCTGAATCGTTTTCTTTTATATCTAACTGTATAATTAAGTTCAGTATCTTGTCTGATAATGGCCATGTTACTGTATTGTTATTATAATCTTATTTTCAATTGTATTAACCTTTTTGTTTAATTTTTGTGCCGCAGAGAAGAAAAAGAATTTGGGAGCTATAATAGAAGTTGGTAAGTAAATTACTTCATCTAGCCATTTCATTTATCTTCCAGAATTTTGCTGATGTTGCCTTCGGTTAACAGTTTGTGGCCTTGGAGGAGCCCTCCTCCTTGGAACATGTATTGTTCTATTCTTATGCGTCCGTAAAAAGAAAAAGCTGAAAGCTTCTTCAACATTATTTTTCAAAAAGAATCCTGGAGCAGTAGAAACTTGTTATAATACCCATATTTTCAGTTATGATGAACTTGAAAAGGCGACTCGGGGGTTTCATGAATCTAGAGAGCTTGGCCATGGTGGTTTTGGTACCGTCTACAAAGGTATTTTTATTCAACCCTGTTAATCCGATAAGCAAACAGTCATTTGACCACTAAATTTATACAATTTCCTTCCAAATTATTAAAAACTTTCCTCACGAAACTTATCTTTCTTGAAATGTCATGATAATTGATCGTCTTTAGAGGTGAAGTATGAATATTTT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_026662615.1	1.4e-155	LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.2 isoform X9
Swissprot	P0C5E2.3	7.0e-115	Probable receptor-like serine/threonine-protein kinase LRK10L-1.2
trEMBL	A0A8B7MV30	2.3e-155	LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.2 isoform X8

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G66880.1	35.81	2e-121	433		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G02571	AT1G66880.1	874	436	25	39	831	416	1245	35.81	2e-121	433
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AfisC7G02571	AT1G66880.1	204	122	10	284	465	15	208	24.51	2e-06	52.0

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF13947.3	GUB_WAK_bind	Domain	40	143	30.0	6.4e-07
PF14380.3	WAK_assoc	Domain	175	253	42.9	6e-11
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PF14380.3	WAK_assoc	Domain	429	475	44.3	2.1e-11
PF00069.22	Pkinase	Domain	552	822	168.6	1.5e-49

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0004683	F	calmodulin-dependent protein kinase activity
GO:0005516	F	calmodulin binding
GO:0006468	P	protein phosphorylation
GO:0009311	P	oligosaccharide metabolic process
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GO:0042542	P	response to hydrogen peroxide
GO:0048527	P	lateral root development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network