result

Gene information

Detail information of AfisC7G04186

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC7G04186	chr7	788728257	788734430	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC7G04186
ATGATTACCTACAAAAATGATGTCGCCTCTGCCTATTCCCATCGTAACTCGCCCCATCGTCCAGTCGCAATCGTGAACCCCGATCATCGCCAGAAGCCTAACATCCCACCGCCTCCTCCCAAAACGTGCTCGCGACCTACCCTGACGCCGGCGGCCGTCACATCACTGATTCGCGAACGAGCTCGAGTTCAGGAGCATCACCGCGCCACCAGAAATCGCGATTTTCTACTCAACCCTAGCTTCGTGAATCCCCTATCTAGTTGCAATCGCTGTAAATCCTCTTGGTTCATGGGTCTCTAATTCGCGATCGAGTATATATTTATTTTTTTAAACGAACGATTTTCGTTCGTTCGTTATTTATTTTATTTTCCTTTCTCTGGTTCGATTTCATTTGGATGGTTTGGGAGCAAGGGGCAATATTGTTTTCAGAAGGGAGAGGTAATGGATACGCTATATAAAAAAAGTGGCTTCGGGTGTAAGCTGCTATAGCACGTGATTAGGGTGTTGGCTTTTATAATTATAAATAATTATTATATCCAACATATCTCGCATTGGGTAACTAAAAATTTGCAATTCCTATCGAGGCATGCCGCTAGGCGATTATAATGTTATACCCCTATTCTGAACGCAATGGAAAAGGTTTCGAGCCCAAATTCGATCGTATGGAGAAGATAGCTTTTTGGACCCAGTTATTATATTAAATTTCGATACAGATTTCAACGCGTTTATATATCGTACGATCATACGACAATTCCAATCACTACGAAAATTGAAATCCGATAATAATACAATATTACGGATCCAATGGAACTGGTTTCGTCGAATTCTGAAACTATGCCCCAGAACGCTGTTTTTAAATACCGATTTAAACGATAAAATTTCAAAACTTAACAAAACACTTCCAAATTCAAGTTTAACACTTTTACTATCTTTAGTACTATAAATATAAATTTTACAAGCCTTTAAAAATATTTTCTTACAGGCTCAAAACTGCAGATTCAATAATTTACCCAATTTCAGTTTATTAAATCCATTAACTTAATTGCTAAATAAATAATAATATTTGAAATTCAAGTTAAACTACCTTTCAAGTATTTAAAATCAATTAAATATTTCAATTTCAAATGCTTAAAAATTCCGGGTCGTCACGGTTGTTTTTCTAGATTTCTCTTTGTTGGTTTCTACAATTTTGATGGTTTTAAGTTTCATTGCTTTCGAAAAGTTTATAAATGGTTTTATAGGGGGGATACCCCAGGCTTTCGAAAAATTCAAAAGGTGGAACCTTTCGACTAGGTCGAAAAGAAACCTTCCGACAAGGTCGAAAGGTACGATTTTGTGAAGCTTTCGAAAGGATGGCTTCCAAAGGGGCTAACTTCCGATGTTTATTTGCTTTCGAATGAGGCTTCATTAAAGGCGTTCAAGGGCTGTTTTTAGCCATTTTTCTTAAGTAAAGTTTTACTAATTTGAAGGGGGTACTTAGAAGGGTTATAGCATAAAATACTTATCTTGGTTTGAATATGTAAGGGGGATCCTTATATAAATTGGATGTTATTAAACCTTGGGGACACCAGGGTGGGTTTAATGTTTTCGATACATAATTTGGGGTTATAAATAGAAATATGCTTTTGAAAATAAACATTAGGGCTATCAATGTGTTTTCATTTAATTTAACCTAATTGAGGCTACCAATGGGAATAGGATAAACATGTGGGATACATGGGAAAAATAAATATTCGTGGGGATCAAGAATTTTAGTGAATAATCATGGGGATCATGATATTTTAATTGGCCAAGGGTTGGGTTCTTGGTTAACTTAGGAAAACCATGGAATGTGCGGTGGATAGCCCACATCAAATTTCTAAAGTAAAGAATGTTTTGTCAGAGGTGGTTAGCCTCGGGATTTGGCACCCAAAGGTTTATAGCCATCCTAGGAAAATTATGGAGTGTGCGGTGGTTAGCCCACACCAACTTTTATAAAACAATATACGATGGATAATCTGCATTTATTTTGATAAATTTGGGACGGATGGTCCTATTTAAGTTTTGACGGATAGTCATTTTAAAGATTTTAGAGGGGAACTCTAATAAATGGATTTTAGATGAGAAATCTAATAAATTGCTTTTAGAGGGGATATCTAATAAATGGGTGGATGGGATATCCAATATATATATATATATATGATTTATAGCTTTATTTCATATTATGTTAAGACTAATCATTTTGGGTGCAAGAGCATAATAAATGATTTGCATGTTTTGTTTTGGATACTAGTGAGGGGAAAACCTGTTCCGCTTAGCGGCGTGGTCTCACTAGATATTTATTTATATTTATTTATGATAAGAGATGATTTGGAATTATTCATACCAGACTTATTGTTTGACTCGAAGTTTGTGTTTCTCCACAAACTCTCGGGTACTCAAAATTAATTTGAGTAGTTTGAGAGTGGGAGACTTTCAAGTTTTTGGACGAATAAGCTTCCAGAGATGTACAGGAGGCAGTGTTACTATATAGGAGCTATTTTGTGTTTTCCGTTGCGATGTACTAAAAACTGTAAAGTTTATATTTATTAGTTCTCTGATCATCATAAGGGGACATCTTCATATGTCGCTCTTATCATATTTTGTACATGTATATGTGATCTGAACGTGGTTAACGTCTGGGATTATGTAATTAAATCTTAAATTGTAATTTGCATGAAATGAGAAATTCTGTTAATTGGAAGTTTAAAATTTTTCATATTCATGTGTTCTAGTATATCAATATTAACTATGCCACATTCGGTCGTCAAGAAATAACAACTACGGATGTCTGTAGCATTAGTAGCGGTTAGTTTTGGGCCTCAAAAGGCGGGATGTTACAATTAATATGAAATATTATTTTTTAAACATATTAATATTTCACACACACACACATATTGTGACATTACTTATCTTATTCAGACGTTTATTATTCAAAGTAAAAAAATTATATATGTGTGTGTATATGAAAATTATTTTATTATTAATTCATTTGAATAATATTATTCAAAGTGATAATAAATTAATTCATTAAATATTTTGAATAAGCGATAACATTGTAAATCAAGTTAACATAATGATAATATAATTAAAATTAAATTTGAACCAAATTCATCCAATAAAATATTTAATATGATTTACTGTTAACAAAATTATTCATGATAATAATATTATAAAAGATTTATTGCAAAATAAATTAAAAACATTTTTTTTGACATTTTTCGCTTATCCTTCATAGTCGATGCATCTGATCTAACAACTTGGGATCTCTTTATTGTATCAGGAGGTATCATCCATCAAAATCTACTTAGATGACCTCATGGACAAACCTTGGGTACTTACTCCGACTACTCTCCCTAAAACCTTATGTTATTCGGTTAACACTCACACAAGGTCATCCTAAACACCATCGATCTTCTTCCAACGCCTCCAAGCTCTACATTAACCATCAAAGTCAATTCATTTAACTCTCACAATTCACATCTTATAGACCCTACATTGGTCACCTTGATCAATCCACCATCATTTGCTCAAGTTACCTTTAGAGCCTAACTTCAAAACAATTCTGAACATAGCTCTCACTAAGTTGCCTACTTGGGTCACATCTTGAGCATCACTTTAATTCCAATCTGAACGCCTCTCCAGCCCACTCTAGTATTTAACTTGCTTTCAAATGACACAATTGAACCTAACTTTTCCCCTTTTCACTTCAACACTTGGCATCTCCAAGCACAATTTACATATGTTAAGCATGCCGCTTCTTAGTTCAATTATTTTCTTCAACTGTTTTCTATCTTTTTTTTGAACTACAGCTCATACAAGCTCGCCTTCAACTTCACGGGCCATGGATCAAAATCCACGCATCAAAGTCATCTAGTTAAAAACATCAGATTGATTTCTAACTATTAGATCCTGCATGTAAGAAAGATACCTATAGTTGAATGCCTCTCTCAGGTCATAACCCAAGCGGACCTCATATGTTCCTAGCGTCATCCAATCAATCACCTCCATCGCCAAGTTCACCTAGATTATCATTAGAACTCGTTTTCTTGACTGCTGTTGAAATTTTCTGGCCAATACATTGACTAGTTCCGAAATATACCATGGATCTGAAAAACATAACATTTTTAAATCTCACTTTCAACCATAGATCTAAAGTCGCAAGCCAATCAATATTAAGTAGACAAACTATCATATCATGTTTTCATGGACATCAAGAAATATAACTCTGAATCATATTGTAATCCTCAAATTAGAATATCATCGTCAAGTCTCCGAATATTGATATTACCATAATATACATACATATATACATACAAAATATATATGTCTGTACGCGCGCGCATATGTATGTAACTATAAAAAAGTCAGAATATTGTTGTGTGAGGTTTGGGCGAGAAATAACTCACCTTAGTAACAATTTTGTTTGCCACCTCTTGAGATCTAAGTTGGTCCACATACTATACTTGTTTTGGTTATCGTACATTACTTTCTTGTTGTCTCAATATCATTACATCCTTGATCAAGCTGATGAGCTTAGTTGACAAACTCAATAATTCTCAACTTCTTTCTCTCTTTTTTCAACATGATTAATACACATCAACATGATTCAATCACACGACCAATAAATTGACAACCAAGAGATATATCATTGTTCGACACGGAACATTCAAAATTTGCTATGTATTTACACTATAAAAGATTGGTTTGGACCATTTATTTATACTAAAGAGCATTAAGATATATAGTAATATTGGTTTTGACAAAGGTTTTTGCAAGTTTGAATATTGTGATTTAAAAGTTATGCGATTTGTAATATATTGGAATGTTGGCAGAAAATTTGCATGAGTAACAAAATGACAAGATTTCGGCTAGTATGTCCACATACTTGAACATCGAAAGTTTGAGTAAGTGGGGTTTGTTCTTGTCCAACTATCCATATCGGGAAGCAACCGAAGGTGCAAGCGTTGTCACGTTCTGGCCCGATCCAAGAACAAGGCTGCAAACGCAGCCGCATGGGGCAACGGATGTGGAGAAGACGGCGGAAAGATGATAATCATGTTGATTTTTTAAAATAATTATAATTATGTAATGTTGAAACACGGTTTATATGATAATTGTGTTATTTCTGAAATGATTTGCTCATTGCTCAACATAACAAGTGACAATGGTTCAATACCCATCACATAAACTTAGTTTTCAGGAACATTTTTGTTTAAAGTCGGTTGCAGCAGCAAATTAGATTGAACCGGCCTGGTCATGTTAATGTTTCACTCTTTTCCAATAAGCATGTTAAACATGTTACATCACACACAATTATCATATTTTCAATTTCAAACACAGATGAAATGAATGTTGAAGCGACAAAGTGCATTTCGGTTCTCCGGTTCAGACAAATTTAACAAACAATTTTCTATTGATATGAAACGTCGCAATTCAAAAAAGAAAAAGGACTTTTATGAAAATAGTCTTATCTCCTTTTATTTCCAGGATTTTCCTTTTCCCACCATATTAATCTAAACACTTCTCTCAACTCTTAAACCCTCACTCTCACTCCCTTTCCGCCCACCAAGATCTCTTCACTCTAATTTATCTCTAAAATCAGCCGATCCGATCCCAGTACTCTGATTCCTGTTCATCGTCTTGCTAGATAGATCAGATCTCAAATTTCATGATGGATCCGTCCAATGAAAAGGTACTCTTTGATCCGATCTCGTTTCATCAATCAATTACGTTGATTTACTTCATATTTATTTACCATCTTTTGATTTCAGGATCCGGGATCCACAGATCCGACCACAAGAGGCAGCTCAGATTCATCAGATTCTACAAATCACGCTCCCAAGTGCTGCTCCGATTGCAAAACCACTAAAACCCCGTTATGGAGAGGCGGCCCTGACGGTCCCAAGGTAATTTATTAACCAGATCTGCATATTAGGGTTTCGAAATATCGATCTATTTCTGATAGATATCTGTTTTTATTATGCCTTTTTGCAGTCTTTGTGTAATGCGTGCGGGATCAGACACAGGAAGAAGAGGAGAGAAGTGAAAGGGATGTCAGGGATGAAGAAGAAATGGAAGCAGAGGTTTTTGGGAGAGGAAGAGCAAGCCGCCTTCCTTCTAATGGCTCTGTCATCTGGACTGCTCTATGATTGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020254910.1	2.4e-28	GATA transcription factor 16-like isoform X2
Swissprot	Q8LC59.2	1.9e-14	GATA transcription factor 23
trEMBL	D6MJX0	2.5e-19	Transcription factor (Fragment)

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G49300.1	51.38	5e-19	90.9	GATA16	GATA transcription factor 16

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC7G04186	AT5G49300.1	109	23	4	99	177	30	138	51.38	5e-19	90.9
AfisC7G04186	AT3G06740.1	110	25	3	97	172	33	142	46.36	1e-16	83.2
AfisC7G04186	AT5G26930.1	43	8	1	105	146	26	68	79.07	2e-15	79.0

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00320.24	GATA	Domain	107	141	63.2	1.1e-17

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000977	F	RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001085	F	RNA polymerase II transcription factor binding
GO:0001228	F	transcriptional activator activity, RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific binding
GO:0003682	F	chromatin binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005667	C	transcription factor complex
GO:0007623	P	circadian rhythm
GO:0008270	F	zinc ion binding
GO:0009416	P	response to light stimulus
GO:0009735	P	response to cytokinin
GO:0009740	P	gibberellic acid mediated signaling pathway
GO:0009910	P	negative regulation of flower development
GO:0010187	P	negative regulation of seed germination
GO:0010380	P	regulation of chlorophyll biosynthetic process
GO:0030154	P	cell differentiation
GO:0045944	P	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network