result

Gene information

Detail information of AfisC8G00822

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G00822	chr8	165145309	165152957	+

Sequences

CDS

>AfisC8G00822
ATGGATGACGGAGTTGGGAACAGCGAGGACAAGAATTTAGGGGTTGATGACGAATCCTCCGCTCCTTTGCCTGAAAAGGTCCAAGTAATGAATTCACCAATATATAAAGTTGAAAGAAAGCTTGGAAAGGGAGGCTTTGGACAAGTGTATGTTGGCCGTCGTATATCATTTGTCAATTCAAGTTCTAGGGTGACCGCTGCCAGTACATTAGAGATGGCTTTGAAGTTTGAGCACATAAGCAGTAAAGGCTGCAATGGTGGTCCTCCTTATGAATGGCAAGTATACAGTGCTCTTGACGGTATCCATGGGGTTCCCCGTGTTCACTACAAAGGGCGTCAAGGAGATTTTTATGTGATGGTGATGGATATACTCGGTCCCAGTTTGTGGGATGTCTGGAATGATAATGCTCCTTCAATGACAACAGAAATGGTTGCTTGTATTGCTATTGAAGCAATTTCTATTCTTGAGAAGATACATTCTAAAGGATATGTGCATGGTGATGTAAAGCCTGAAAACTTTTTACTTGGGCCGCCTGGAACTCTTGAGGAAAGGAAACTATTTCTTGTTGATCTTGGTTTAGCTACTAAATGGAGGGATAGTTCTACGGGTCGGCATGTTGAGTATGATCAACGACCAGATGTTTTCAGAGGAACTGTACGCTATGCAAGTGTGCATGCTCACTTAGGAAGGATCGGAAGTAGAAGAGATGATTTGGAATCCCTTGCTTACACACTAATTTTTCTGCTAAGAGGGCGATTGCCTTGGCAAGGATATCAGGGAGAAAACAAAGGTTTCCTTGTGTGCAAGAAGAAAATGGCCACATCCCCAGAATCTTTGTGTTTTTTCTGCCCCTTACCTTTCAGACATTTTGTTGAGTATGTTGTCAATTTAAAATTTGATGAAGAGCCCAATTATGCAAAATGCATTTCACTTTTTGATGGCATTGTGGGTCCAAATCCAGATATTAGGCCAATTAACACAGATGGGGCTCAGAAGCTCATATATCAGGTTGGTCATAAGAGAGGTCGACTACTAATAGAAGACGATGATGATGAGCAACCTAAGAAAAAAGTTCGTATAGGTATGCCTGCAACACAATGGATTAGTGTCTATAATGCAAGAAGACCTATGAAGCAAAGGTACCATTATAATGTCGCAGACAATAGGATTGCACAACATATCGATAAAGGAAACGAAGATGGATTATTTATTAGCTGTGTTGCTTCTTGTGCAAATCTCTGGGCTTTAATCATGGATGCTGGAACTGGATTTAGTTCACAAGTTTATGTGCTGTCGCCAAATTTCCTTCCCAAAGAATGGATTATGGATCAATGGGAGAAAAATTATTATATTAGTGCAGTAGCAGGTTCAAATGATGGTAGCTCGTTGGTAGTCATGTCAAAATCTTCCAATATAGGTTCACAATATGCACAACAATCCTACAAAGTTAGTGATTCTTTTCCTTTCAAGTGGATAAATAAAAAATGGAAAGAGGGATTTTACGTAACTGCCATGGCTACTTCAGGAACTAGATGGGGTGTTGTGATGTCTCGAAATGCAGGTTTCTCTGATCAGGTTGTTGAACTTGACTTCTTGTACCCAAGCGAAGGTATTCATAGAAGATGGGATAATGGTTACCGTATAACTGCAACTGCTGCAACATGTGATCAAGCTGCATTTGTGCTAAGTGTACCCAGAAGGAAACCAACTGATGAAACACAAGAAACACTTCGGACATCTTCCTTTCCTGGTCAGCATGTCAAGGAAAAATGGGCGAAAAATCTGTACCTTGCATCTGTTTGTTATGGGAGGACAGTTTCTTGA

Protein

Gene

>AfisC8G00822
TTTAAGTATTACTAATTACTTCGGTTTTTTGGGTTCTCGGATGAACTGATTTATTTTCACATCCTCTTTTTCATCTAAGCCTTGAAATCCCAAATTCCTAGATCTTTCTTTCCACTGAGCTAACTGTGGTTTCCCCTATCGGATCTTGACCAATCGATTTGGACATGTTTTTTTATATGGGTACTGCGTAACGGATTGCGTGTGAAGTCGAGGACAACGCAAATCCAAAAAACAAGAGTCAAAGAGGAGCTACAACAGTTGTTTCTGACGACGATCGATTTGAAGAAAATATTGTTTTTCAAGGAGGCGATAGTAACATTGATACTATTATTGAGAATAATAAATTTACAAATTAACAGAGAGGAAGGATTGCAGGGTGGAAATGGATGACGGAGTTGGGAACAGCGAGGACAAGAATTTAGGGGTTGATGACGAATCCTCCGCTCCTTTGCCTGAAAAGGTGATTTCTTTTTATTATCTTTTATATTTATTTTCAAAGGTTTTAGTTTCAAAATATTCCATTATATTATGGCTAAGTTTTGAGATGTACTTCAGTTGGTAGTTTATTTTATTTTATTTTTGATTGGGCATTTATTACGAGTGTTTTGCTTAAAGTTTGAGATTAATGATGGAATGTGAGAATCTGCTGGTAGAGAAGTTCTTGTGGATGTACCTTAAACTGTTGAAGTGCTTACATTTTACAGAAAAACACCATGAATAGTTCTTTTTGGCTGCTGATGTGCCAATGGGAATATGGGGAGTTTGGATTGAAACGTAAATAAAGAATGAATGATAGCAGAAATCATTTGTATAAATAAATAATACATAAAAAGGTGCTAAACATTTCACAAAGGCAGCCTGGTATGGATGTTATAGGAGAGGTCCTTTAAGGAAACAATGACCGATGGGAACAAACATATTGTATGGCCTTACCCAGTACCTACAATTAAACATATCATCTACTCATTGCACAAGGCTCCCACTTGAGCATGATCTGGGGTAGTCAGGTTGTATGCAGTCTTAGCCTTAGTACTGCAAAGATTATTTCCAAAACTTGATCAGTAAACGAAGCGCCCTTGAACATCAAATTCAACAATGTGTGAATAACGCTCACATTAAATTTACATATCAAAGCAATATATGCTATATAAAACATGTATTTTACTATATTTTTATTTTACTATATTTACTATATTTTACTATAAGACATATATTTTACTATATGTTCACAAAGTGAGATGTCCAACTAATGAATATATAGTAGAAATCAAGCACCGAGGCTAATTGATTCAGTTTTTGTGACAATGGAGGGTAAACATAATCACTGATATTTGATAGAAGGTCTACGAAGCATCAATGTAATTATCTTATCCGATTGTACGATCAGAAACGGTGATCGTCTTGGGATGTGGTTGCAGGATAGAATGCTTTTTCAAACTTTAATCATTATTGCTGTTGTTGATTTGTTAACCTTATCAAGAAATGTTCTTAAAAGAGAAGGCCATTGATAACAATTTAGCATATTACTTTTTTCTTGTGCATCATAATGTTAATGTGTATACTATACACAAATGATTTTTCATTTTGAGATTTGCCACTGTATCATAGGCTCAGGCTATATTTTCTATCAATAGGTCCAAGTAATGAATTCACCAATATATAAAGTTGAAAGAAAGCTTGGAAAGGGAGGCTTTGGACAAGTGTATGTTGGCCGTCGTATATCATTTGTCAATTCAAGTTCTAGGGTGACCGCTGCCAGTACATTAGAGGTTTGTTAGCTGAGCTAATGCATTTTCAAAGCATATTCAACGGGTTTTACTCAAAAAAAATAAACTATTGCAAAATTTTATTTGTATTTCAAACTAAACAAATCATTTACGTGTGTTAGATGGCTTTGAAGTTTGAGCACATAAGCAGTAAAGGCTGCAATGGTGGTCCTCCTTATGAATGGCAAGTATACAGGTTTGTGTTTCTAAACATGGGCTATCCTAACTCTTTGTATCATCATAACAATGAAACTCGCATGTATTATTTTTCTATTGGATTCTGAATCTGCAGTGCTCTTGACGGTATCCATGGGGTTCCCCGTGTTCACTACAAAGGGCGTCAAGGAGATTTTTATGTGATGGTAACATCCTGTTAGCACAATTCTTCTCCTAGCTATTTTTCTTTATTTTCTCCTTGAATGATCAAAAATTTAATTACGCAGGTGATGGATATACTCGGTCCCAGTTTGTGGGATGTCTGGAATGATAATGCTCCTTCGTATGTAACTAAGTGTCCGATATCAACAAAATTATTTTCTACTTGTAAAAATCTTATTATTTTATGTCTCTTATATTTTTTCAATGCAGAATGACAACAGAAATGGTTGCTTGTATTGCTATTGAAGCAATTTCTATTCTTGAGAAGATACATTCTAAAGGGTGGGCTATTTTAAAATCTGAGATGACATATGCTTATGATATTACAAAGTTTTTGACATAAATTGTATACCAATATGTCTGGTAGATATGTGCATGGTGATGTAAAGCCTGAAAACTTTTTACTTGGGCCGCCTGGAACTCTTGAGGAAAGGAAACTATTTCTTGTTGATCTTGGTTTAGGTAGATCACCATAATATACCCTAAAGTTCTCTAATTGTAGGTATTAGTCACCAGAAAGTTATTAATCAGCCTTGTGCTTTATACCCAGCTACTAAATGGAGGGATAGTTCTACGGGTCGGCATGTTGAGTATGATCAACGACCAGATGTTTTCAGGTGACTTTTAGTTTATTGGCAATATTAATTTCAAAAAATTTGTGATCTTACCAATCATGGGATTTGTAGAGGAACTGTACGCTATGCAAGTGTGCATGCTCACTTAGGAAGGATCGGAAGTAGAAGAGATGATTTGGAATCCCTTGCTTACACACTAATTTTTCTGCTAAGAGGGCGATTGCCTTGGCAAGGATATCAGGTTTAAGTTGTCAGCTAAAGTTTACAGCCCCATACGAACTTACACATCTCATTTAGATGCCTTCATTTTCAGGGAGAAAACAAAGGTTTCCTTGTGTGCAAGAAGAAAATGGCCACATCCCCAGAATCTTTGTGTTTTTTCTGCCCCTTACCTTTCAGACATTTTGTTGAGTATGTTGTCAATTTAAAATTTGATGAAGAGCCCAATTATGCAAAATGCATTTCACTTTTTGATGGCATTGTGGGTCCAAATCCAGATATTAGGCCAATTAACACAGATGGGGCTCAGAAGGTATAATACTTGCAAGCATTAGGCGTTATGTTGTAAATTATCATCAGATCCATGTCTAATTGTCAATCGGATGTTGTAAAGCTCATATATCAGGTTGGTCATAAGAGAGGTCGACTACTAATAGAAGACGATGATGATGAGCAACCTAAGAAAAAAGTTCGTATAGGTATGCCTGCAACACAATGGATTAGTGTCTATAATGCAAGAAGACCTATGAAGCAAAGGTACAAGATTATATGATTTTTAGTTAAACAGCCTTTAGCTGAAGTATAGCAAGCACTGTTTTACATTATTCTATGTTCTGTAGGTACCATTATAATGTCGCAGACAATAGGATTGCACAACATATCGATAAAGGAAACGAAGATGGATTATTTATTAGCTGTGTTGCTTCTTGTGCAAATCTCTGGGCTTTAATCATGGATGCTGGAACTGGATTTAGTTCACAAGTTTATGTGCTGTCGCCAAATTTCCTTCCCAAAGTAAGTTCTTTTTCCTCTTGGCATTTATTAATTAGAATTGCTAGAACTTCTTCTTTTACTAATGGAGTGATGCCGGGCCCACTTTTCAACTTTGTAGATTTTATTTCCTATTATTATTATCAACTCATCTTACATTTTTATTTACATGCTTGACTATTGTAGGAATGGATTATGGATCAATGGGAGAAAAATTATTATATTAGTGCAGTAGCAGGTTCAAATGATGGTAGCTCGTTGGTAGTCATGTCAAAATGTAATGATTATTTTTTGACTTATTAGGGGAATATATTATTATTTTTCCTTGACATTTTTTAGAGTTAATGAGTTTCTTATAGCTTCCAATATAGGTTCACAATATGCACAACAATCCTACAAAGTTAGTGATTCTTTTCCTTTCAAGTGGATAAATAAAAAATGGAAAGAGGGATTTTACGTAACTGCCATGGCTACTTCAGGAACTAGATGGGGTGTTGTGATGTCTCGAAATGCAGGTTTCTCTGATCAGGTGATATTTCTTTCATTTGTAATTAGACTTTATACTAGTTCTGCAAATAATCATAATAATATCTTGGCATAGGTATGTTTTTAACAGCCGTATGTGACTATTAAAAGTTGGGCAAATTCGCTGATTGTTCTAAACCCTTTCCCTAGGTTGTTGAACTTGACTTCTTGTACCCAAGCGAAGGTATTCATAGAAGATGGGATAATGGTTACCGTATAACTGCAACTGCTGCAACATGTGATCAAGCTGCATTTGTGCTAAGTGTACCCAGAAGGAAACCAACTGATGAAACACAAGAAACACTTCGGACATCTTCCTTTCCTGGTCAGCATGTCAAGGTTTGTTTGTACTCTTCTTTTGCTTTAGTTGTTTAGTTTTGTAATTTCTGTGTATGGTAAAAGATGGTATCAAGTTTCAGATTCTTTTGCTTTGTCAGCATTATTATTTCCAGATAATTACAACTTCAGTAAATACTCATCTTTCAGTTATATTTTTACGATGAAAATTGAGGGTATTTTTATCTTTTAGGTCTACTCAGGTATTTTGGAGCAGTGGTTCTGGTATTTTTACAGTTTCGTTCATTCATGAGCGTATTGGTTTTTAAAAGGTTTTTACAAGCAGATTTATGAACAGTAATACCATGCTTGAGAGTTTAATCTCCAAGTATCTTGAAACCTTTTAAAATTATAAAATTACACACGGATAAATTTTCAAGTGTTTCAAAAACCTCTATACAGACATCCATTGAAGGTTTCAAATCTTGGA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020264878.1	7.7e-297	casein kinase 1-like protein HD16 isoform X1
Swissprot	Q852L0.1	6.7e-229	Protein HEADING DATE 16
trEMBL	A0A843WDR8	1.1e-273	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G25760.1	81.11	0.0	1025		Protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC8G00822	AT2G25760.1	593	105	4	16	607	87	673	81.11	1025
AfisC8G00822	AT2G25760.2	596	107	5	16	607	87	676	80.37	1015
AfisC8G00822	AT3G13670.1	602	148	2	6	607	108	703	74.42	967

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	35	270	53.8	1.6e-14

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000139	C	Golgi membrane
GO:0000287	F	magnesium ion binding
GO:0001948	F	glycoprotein binding
GO:0002121	P	inter-male aggressive behavior
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005694	C	chromosome
GO:0005813	C	centrosome
GO:0005847	C	mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex
GO:0006281	P	DNA repair
GO:0006461	P	protein complex assembly
GO:0006909	P	phagocytosis
GO:0007030	P	Golgi organization
GO:0008360	P	regulation of cell shape
GO:0010906	P	regulation of glucose metabolic process
GO:0016607	C	nuclear speck
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0022008	P	neurogenesis
GO:0030877	C	beta-catenin destruction complex
GO:0032436	P	positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0042277	F	peptide binding
GO:0043278	P	response to morphine
GO:0045095	C	keratin filament
GO:0045104	P	intermediate filament cytoskeleton organization
GO:0045879	P	negative regulation of smoothened signaling pathway
GO:0048511	P	rhythmic process
GO:0051219	F	phosphoprotein binding
GO:0060069	P	Wnt signaling pathway, regulating spindle positioning
GO:0060828	P	regulation of canonical Wnt signaling pathway
GO:1904424	P	regulation of GTP binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network