result

Gene information

Detail information of AfisC8G02015

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC8G02015	chr8	401318725	401323115	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC8G02015
ATATATCCGCGAAGCAAAGAAAGAAGCCAGAGTGATACACGGATCATAACCGAAACATGGAGATAAAAAAGAGCGCGACCATCAGAAAAGTTAATGGCGTGAAAGAACCAACGAGGTACTTGAACAATCTTTTTCCCCTTTATTGCTGTTTTTTTTTTGAGAAAATAAGAAGAGAGTTTAATTTGATAGTATTTATCTTTTGAACTTTTACGTTTATGTTGCCAAAGTATCTTAAATTTCCCTAAAAAGCAAAAGCACCGGCTCAATTTGGTTGACTGAGAATGTATTTGGTGACGCAAATGGGGTATTTGAAATCAAATTTTTTTATTTAATTAACTCATAGTTATTTAATTTTTTATCTTTGATTCTGTAATATGCGTTTGATCATTGCAATAATACCAAATAAATTATGGAATTTTATTAAAATAAACAAATATATTTTTAAATTTAAATAAATAAGTTATAATATTTTAAATTGTTCGAATTCAGTTGAAACCAACTCCATAATACAATCGCAACGTAAAAAACAGCATTTCAAACGGAGTTCGTTTGCAAAAGTTATCAATTTTAGAAAATTATAAAAATGTAAATTTAATTAGTTCTAACATTACTAAGTAACTTATAAATGGAGAGTTGACGTCAGTACATTGACATCCGATGCATCAGACGTTAATGCATCTTTCTTCAACTTTCCCACGACGGAGTTGAAAATATGGACATGTCCATTGCCACAGTACAGGTCGGATTCAATGATAAACCACCGTTTTCGTACTTGAAGCTTGAGATTTGATATGTGCGTTGTTGCCTTCTAATGATATTAAAAGGGAATTGTTCGTTTCTTATTTATTTCGTTGTTCGTTTTTTATTTATTTCGTTGTTCGTTTCTTATCTGTTTCGTTGTCCCTCACCGTGCCTTGTGGTGATGTGGGGATATCAATGGCGGTAACTTCTTTGTCGTTGATCGACGATGGTCACCAACGGAAACGGGCCATTTAATTACTGCGAACGCTGCCTAAGTGTTCTCATAGGGCCAATGAATTGCAACCATCAATCACACTGATTTGATTAAAACCTGATATCTACCCTCTATAAAAATGACGATGCTTGAATCAATGATTGTGATGCAAGTGGTATCTGATGACAGCTAAGCAATTGATCTCCTTTTTATTTACTAGGACATGAATTCTATTTCTTTCACTTCATATTTGATATATATATTTTACTAACATGTACAAAACATGATGATTCTCAGAGGTATGCGATCTCACGTTCTAGTAAATCGATCATCATTGCTGTATATAGCATTTTATGAAGTTCGAGTAAAGTGGATTTACAGATTTGCTATCTAAAATGCAATTTTGTTCTCCAGCTACGCTAGTTTTAAAATAACACGGATGATAATCGGTGGAATTCAAGGGTTCTATGCAATTGAACCCGTGGGATGGACCATTGAATTCCACTGACCACCACTTTTACAATGGTGTAAACATAATTATATTCTACTATTTAAGTTAGGCAACCAGATTGATGGGAATGTTTACCTTAATCATGCAAAATGATTAATTTTAATAGGCATAGTAACAGAAAAACAATGTACGACCATTAATTTGTTTTCAATGTTTCTTTGTTCGATTGTTTTTTTAATTGACTTCATCCTTTTATTTCTCACATCAGTTTTTATGATACTAATCTTTATATCAACAGTTTTAACTATCTTCTAACAAATAAATAAATATAAAATTTAAAATGGCTGTAGTTTAATTAACTATTTTTTTTTTTGGAAAAAGTCTCATCAGGGGTTCGTCTAGGAATGTAAATGTAAATGTAACGACATTGGCTGGGGGTATTCAAACTCCAAAAATGCTGAGTTATCGTCTTGTTTTCACAAAAAAAATTAAACACAAAAATACCTCACAAAAATACTCATTATTTTTTATCTAAATTTATTGTTTTATTTTATTTTTTCAAATTTTTTATTTACCAAGCAGAACAACTACGTGGTACCTTCAGGATACCACGCAATGCCACTGTGTGGTACCTTGTAGGTAGGGTATTTTTAGATTTTTTTTGTTTTTGGGTGACTCGTCGAAATAATGGATTTTTTTTATTTTTATTTTTTCAAACTTTGAGGGGGCAATTCAGCACATTTCTGGGTTCAATTAGAATTTCTCATAAACATAGGAGACTTCATCAGTATATAATTTATTTATTGAGTTTTGACCATTATGAGGTAAAATCTATTTTAATTTTTGGGAATTTGTTTTGATGTTTCGTTTATGTTTGTAATATGTTGGTAATTGCTTACGAGTTCAAATCACCTGTCTCCCTGTATCCAACCAATCGGAGACGTCGATTTTCAACCATTTTGCAATTAAACTGTTGGAGAGAGAAAGGAGGTTTAATTACAAAATCGTTAAAAATCGGCATTTTTGATTGGTTGGGAACAGAAGGGACGGGGGTTTGGGTACAGGGGATTTGCTCTCACATTTAAACTCCTAGAAGTTTCTAACTTTAGGAATTTGCTACGTACAAATTTCAACGTTTGTCACTAATTAATTAATTGCCTACGGTTCTACATTTAAATTTTGACAGGAGTAATGCTACACATAGAATAACTCTTATGATTTTGTCTTATGCTCTAAATAATATTTCCCTCATCTTTTATTTATTTACTTATTTATGTGTTCTTATATCTTAAGTAATAATTTCTTAGAAGATAAAAGGGTTCACAGCTGCATGCAACGATTCAACGATCTGTTATGTAGTGTTTAAGGTGTTGATCGATTGACCTTCAGTGATCATTCGTAATATAGTTGTTATTTAGTTGTTATTTTCATATTCTTGACCAAATCGGATTGGTGATGATCAATTAGTAAGCAAATTACATAAATAATTAGTATATTTAACACAATAAAAATGAGTGAATGAGAAACATTGCTGATACGAAGCAATCACACTTCTGTTCAGAACATGTAATGCTACACTGATTTTGTTTTGGAGATGGAGTATATATCTGGATACTAAAAGCCTGGATTTGTTCAACTCACTTAATTGTTTTTTATTTTCAAGAAAATATCATAATCCTGATGTAGTTTTTGTTCATGTGTTCAGATCTGATAATGAAAATCCTGGAAAACAAAGAAGACGGCGCCGCGGAGAATCAGTAGAAGAAATCCTTAGAAACTGGAAGGAAGAAAACGAGATAAATGGCATAAATGCTACATTAAATGATAGGAAAGTGCATGCAAAAGGGTCAATAAAAGGGTGCATGCCCGGAAAGGGAGGTCCATTAAATTCTACATGCACATACCGTGGAGTCAGACAAAGAACATGGGGCAAATGGGTGGCTGAGATAAGAGAACCGATTCACGGTAAACACTTATGGCTCGGCACTTACGACACTGCATTGGAAGCTGCCCATGCTTATGACTATGCTGCTAGAACCATGTTCGGACCCAATGCTCGTGTTAATTTTCCTGATAATTCATGTTCTCTAGAGTCCAACACTGTAAGTTCAGAGAATCAGGGTTCAGTTGATCGGAAACCAAGCATTGAGCATGATCAGGCGAACGAAGTGTTTACAGATGATTCGTGTTCTTTGAAGTCCAACACTGTTGGTTCACAGAACCAGGACTCAGTTGATCAGGAAGTAAGTTTTGAGCTTGATCAGATGATCAGCCTGGATGATATTTTTGATACCATAGATATGAACTCCGAAGGCAACAATATCGACTTGTTATGTCAATCTCTTTGTTCACCGGTTGATGAAGATGGGAATGTGGATATGGTTAGGAACTCAGACTATATGGAGCAAGAACTTGTAGATTTCGATTATCGAGCATTGTATGAAGGCATGTTTAATTATGATGCCAAGGACGATGGATTGACATATGAAGACACAGAGTTATTGTCAGAGAACTTGAAGAATAAGGAATCCTGACCTTGTTTATAGCATTTATTTGGAGCGTTTAATTCATAGAAGGGATCTGGTCAGTCCTATACCAGATTTTAATATTTATTGTCAACCTGCTTGGGGACGGTCAGCGATTAACAAATGAATGGATACTTTTTGCAGAGAGACGGTACAATTTGGATGGCAATTCTTTTTTGTAGTGGCAATTTAACGCTGTTGTTTGACTGACGTAACTCCTTATGTCAGCAAAATAAAACTTCAGAAATGGTACATAATCCACGCTCTTTCTGCATAAAAAATTGTTCTAAGTAATGGTAATTTGCAGTTTCTAGTGCTTTTGCTAAAACTGCTGTGGACGCCTAATATAAATTATGTAGAAACAAATTTCTTTTTTCTGATTGTTTTCTTTTTTTAGAATGTTTCTAAACGTTGTAACATCAACATCCACTGCTTGACTTAATCAATAGGCTTGATCTTA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	TMW84164.1	2.1e-34	hypothetical protein EJD97_025690
Swissprot	Q0JQF7.1	1.7e-36	Dehydration-responsive element-binding protein 2A
trEMBL	A0A6N2ARK1	1.5e-34	AP2/ERF domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G40340.1	49.65	4e-32	135	AtERF48;DREB2C	Integrase-type DNA-binding superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC8G02015	AT2G40340.1	141	63	2	28	161	8	147	49.65	4e-32	135
AfisC8G02015	AT1G75490.1	119	47	2	48	159	5	122	53.78	2e-29	125
AfisC8G02015	AT2G40350.1	121	53	1	28	142	3	123	51.24	4e-29	125

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00847.17	AP2	Domain	85	134	47.5	1.5e-12

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0009555	P	pollen development
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009873	P	ethylene-activated signaling pathway
GO:0010143	P	cutin biosynthetic process
GO:0010166	P	wax metabolic process
GO:0010200	P	response to chitin
GO:0010224	P	response to UV-B
GO:0010286	P	heat acclimation
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0034059	P	response to anoxia
GO:0034605	P	cellular response to heat
GO:0042542	P	response to hydrogen peroxide
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:2000070	P	regulation of response to water deprivation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09286	EREBP; EREBP-like factor	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network