result

Gene information

Detail information of g221912

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g221912	Scaffold_53761:HRSCAF_436847	102289	107770	-

Sequences

CDS

>g221912.t1
ATGTCCAAATATGATGCAATCAAAGCACTTGAAATCTACAAAAGAGCAGGCCAGCAGGCAGAAAGTCTTGCTGAGTTCTACGAGTTCTGCAAAGCTTTGGAGCTTGCCAGAAATTTCCAGTTCCCAACTCTAAGACAGAAGTTCAAAAGTACTGGCGGTCGCGATAAAGGAGTCAGAGGTTCTTCCACTGAACATCAAATGGCAAGAGAATTTACGTTAGAAGAGTTGGAACAAGCTACCAAGAACTTCAGCGAAAATAATTTGATTGGTGAGGGAAGTTTTGGTTTAGTGTATAAAGGCTTGCTTTGTGATGGTACTGTAGTTGCAGTCAAGATGCGTCATGGGTCTCCAAAGGTAGAATTCGTCGAAGAGGTCATGTATATATCTAGCATTTGGCATCGTAACCTAGTCACTCTTGTTGGTTATTGCCAAGAAGCCGGACTTCAAATGTTAGTTTTCGAGTATGTACCAAATGGAAGCTTAACTGGACATCTATACGGCAGCGAGAAAGAATCAACAAGGCTCGAATTTAAAAGGAGGCTTTATGCAGCTATAGGAGCTGCTAAAGGATTGTCTCACTTGCATAGATTGGTTCCACCATTTATACACCAGAAATTCAAAACAAACAATGTGCTGGTCGATGAAAATTTTATCTCTAAAGTAGCAGATGCAGGTATTGTTCGATTACTACAAAGGATCGAAGATGCTGGACCATCTCAAATTTCAAATGCCAGTGTCTTCCAAGATCCCGAGATTGGGAAATCAGAACCTGTATCAGAAGCAAGTGACGTGTATAGCTTCGGTGTGTTTCTATTAGAGCTCATCAGTGGTCAAGAAGCAGAGAGAATCGAGCTATCAGAGTCAACCACTAGTTTAGCACAGTGGGCAGAAGCACATATTGGTGCAGATACTTTCATTGACAGGCGAATGCACAAAAGCTATACTTCTGAAGGAATGAGGGACATGGTGCGATTGATGATGCGATGCTTAAGGGACAGTCGGCTGGAAGTTTGTATGGCTGAAGTAGGAGAGGCATTGAATGAATCATGGAGTTTGACTGAGCAGTGGAAGGCACTGCAGTTCGTAACAGTTCGACGGAAGTGGAAAGGAGGTGCTGATGATAGTTGCTGTGGGAAGTGTGTTGTAACTGGTAATAGACAGAGTGAAACTATTGTGTGGTTGGTTGATATGGCAATGTAA

Protein

Gene

>g221912.t1
ATGTCCAAATATGATGCAATCAAAGCACTTGAAATCTACAAAAGAGCAGGCCAGCAGGTATCAGTTACCATTCTTAGCTTCACAGTTTGCATTCTGCAATGTGAAAATAAGCTAGTTATTGAGTTTTATTTTAAATGCTGAATAGGCAGAAAGTCTTGCTGAGTTCTACGAGTTCTGCAAAGCTTTGGAGCTTGCCAGAAATTTCCAGTTCCCAACTCTAAGACAGGTTTTCTTTACTTAAGTTACACCTAATATTTATGTGCTTCTTTGAACTTACTCTGGGAATATTCTTATGTCTAAAATTGATTTTGATGCAAGCCAGTAAGTTGGAGATGGTATAAGTGCAGTTGTGGGTTTGTGAGATGCTGGTGGTAATTGAAGGTCAGTAAGGGGTTTCAGGTGGAGGAAGTGTTGTTTGCTTGGTTTGGTGGGTGATGAAGTTATGTGGCAGAAATGTATGTAGCAGTCAGATGCAAAGTTTATGGTAGAAGTAAAGTAGCACTGTATGTTTTGTTGTTGGTGATGACAGATGAAGCAAGAGGAGATGTTGTGATGCAAGTGGGTTGGAGGAAGTCGGGGAAATTGATGGTGTAGTAGGTTTGAATGGCAGAGGGAATGGTGATGTTGCTATGTGGTTTAGAGAAGTGACAGTAAGGGGTACTCTGGGTGGTAGCCGCAGCTTGTTTATATGGTGAGTGGCAGTGATCAGGTGAAAGAACTAAATTCAGGAAACATGCAGATTCGAAAAATAGATCCCTTTCTTCTTTTATTAAAACGATAAACATCGACCTAAGGTACAATCAGACAATCTTACCTACAAAGTGTGAGATACAGAAATCTTATATTATACAAATTTAAGACTAAAACACAAGTCTTTATCACGTTTTGATGAAGATACCAGAATAAACCAGTTAAGCTATCATATCATGAAACCTAAGTAGATTAGCATGTGCTAAGCCACTTACAAACAATGTCATTTCAGCAATTAAGGGATAAAATCCCACTTGCCATTTTGAATATCTATTTCCCTTGTATTATGACTTAGGTTAGGAAAATCATGAGAAACCTCGAATAGAGGTATAAATCAAAACGGCTGATCCATACACGGTGCCAAATGACTTGTTATTTAAACAACTACAAATACTAGGGCAATGATAGATGACTTGCTATACAAGACATCACTGAAACTAGGAAAACAACTCTTCTGTAATAACTAGTTTTCTATAAGACGGAATCTTCCATACCAAATTTAATTTATGCACCTTTTTGCTGTTCCAATCTGAATGCTCCCTCGCTGATGGCAGCAGACAAGATTGCAAGTGAGAGACAGCACAAAACAGTTGGAGGACAACAAAAAAATTGGAAAAATCATCAGAAGATATTCCAAAACAGTGCAATATCATTATTAGTAGGTTCACAAAATATTTTAAGTGGGATGCACACTTTCCAGTAATATCAGATGAAACGTATATATGCTTCCTGCTCCTAGCACTGGAAAACATATTTACAATCAACTACCTAGTCACAAGAAATGACAGAACCCTCACACTAAAGAAAATCATCATTTATCAAATAATTTTTTCCAAAATTGTGTAAAGATATCATAATCTTATCAGAAAATTCTCTGTAATTTTTCCCAAAATTTTATCTTTACATAGATCAGGTATGTTAACGGCACTTTTAGGATCCGAGTATTACTGCTCTAGAATTTTAGTTCCTTAGTTTACATTTGATTAAGGATACATATAGAGAGGAATAAAGAGTATATTTGGTGATTGAAGGAACTTTAGCTTGAGCCTTTCGTCATTCTCAATTTTTGCGTTTAATTTCACAAAGCTGCAAGGCTTTAGCTGTACAAAACAAATTTATACCGGAATTAAGATTCCAAATGATAATTATTACAAAACCAATATTGCAACTATTAACCTTTGTTGATAATTATCTCAATATTTTGCATCGACTCACACTAATCAATTCCAACAATCACTTTCCGTATGCTATGAAGTTTTCCATTTACTTATGGATATTTGTTTTTTTCCTTTAATAACATATATTCAGTTGTATTTTTACTTTCAAAATAAAAATGACTAATGTCAATTTGATTATTATAGGAAACAGAATCGATTGGAAGGTTGAAATCTGGATTTGAACACTCCGAAACATGGTAATATGAGTGAGAACTTTTTTTATGTTATGATTATAAGTGCACCCATTTTCAATTATGGTTTTGCCCACCTGATTGTACAACTATAACAGAAAGTCTAAACTTCTCACTGAAGCTTGCAAAGGACGGAGTACTTGATGTTGTTTAATGCGTACAATGTGCAGGCTATACATGTCAACCCAAAACCTTTCCTGAATAATTTGACTAGGAAGCCTGTGATTGCAAAACTGAAGTGGGGAATGGAATACAAAGGTAACCTTTCAACTTTCAATGTACGCATTGACTATCATTTTCCTGCAGCAATAGTATTGCTCTTGTATTATTTTTATGGACGTTAATTAAGTTGCATATCTAACAACATTTAAATGCTTGAAATTGTTCTCAGGCTTTCTTGTCTCAGTGCATTCTTATATGAACCTGCAGGTAAAAAATATAGTATTTAATAGTTTTAGAAAAAATTAGACTTATTCAGCATATTTAGGTATTTCTTCTAAACCTGAATTTATTTTTCTAGCATATTTAGGTATTTCTACTCTGCCATTCATTAGCTGGTTTGCTGCAACAGGTTAACCGAGCATTTGATGGGGTCGGTTCTAATTTGATATCACAGTTTTGATTACGATCAACTCCAACCATTTAAGTTAATGATTGGTTTATCAAGAAATTTGTTGCACTTGCAGGCATACAAGTTGCTCATGAAAGCTTTCATCGAGCACGATAAGGTAAGTTTAGGCATCTAATATTTCACCCGTTCAATCCATTATTGAATAGCTGATATTGGGAATCACATTTGAATTCGACTAATTAAAGATTGTTGTATGCACAACTATAACCACATCATAGAATATCAACAAAAATAATTAACATGTTAAGATTTTTTTTTTGAAACTTGAATATGTATGATGAAATTGTATTAAGATTTTTTACTTAATGGGAGAAGTGGTCTGCAACAAAATGGAGTGTGTAAACTTAGTGTACAAGAAGGATGTGGTTTGGAGCAGTAGTATGATGTCCCTCATTCCTTCAGAAGTTCAAAAGTACTGGCGGTCGCGATAAAGGAGTCAGAGGTTCTTCCACTGAACATCAAATGGCAAGAGAATTTACGTTAGAAGAGTTGGAACAAGCTACCAAGAACTTCAGCGAAAATAATTTGATTGGTGAGGGAAGTTTTGGTTTAGTGTATAAAGGCTTGCTTTGTGATGGTACTGTAGTTGCAGTCAAGATGCGTCATGGGTCTCCAAAGGTAGAATTCGTCGAAGAGGTAAACCATTGCTTATTCGTTTCTTCTAATGTAAGTATTACCACTATTCTGGTTATATCAGTGAATATTTATGTTATATCACAAATAATTTCTCGAAACAGATTCATAATTCATATACCTCTATTTCATGACCTTATCATAATTTTTTACCGTTTCTTATAATAGATTTGATACCAGTGCATGCTATATGATCATGTCAGTTTTCTTTCAGAAGCAACAAAATCCTAATATAAAGAGGAAAAACATACATGAAAGAATCGGGTTATAAAAGAATGTATTCATGTCCATCATATATTCAGATACTTCAAAGGGTGTATCGATCATGATTGCAATCAAACTCTTCTCCTTTCCCAACTCAATTCGCTTAATTGTCAACCTCCTAGGGGGGCGATCTTAAAACACAATAGGCTACCAAGTGACAAACCTCATTTATGCATATCACTGTGTGACACATATTTAAAAATATATGAACAGGTCATGTATATATCTAGCATTTGGCATCGTAACCTAGTCACTCTTGTTGGTTATTGCCAAGAAGCCGGACTTCAAATGTTAGTTTTCGAGTATGTACCAAATGGAAGCTTAACTGGACATCTATACGGTAATCATACATCCAAGTAACGAATTTACATTGAAAATATAAATTTTTTACTGATTATTTCGTTGTAACAGGCAGCGAGAAAGAATCAACAAGGCTCGAATTTAAAAGGAGGCTTTATGCAGCTATAGGAGCTGCTAAAGGTACATATTCATATCTGAATACACCTTTTTGTTTCCACTTTTTTATGGCAGTTTCGTATGATTTTACAGTTCATATTGTTGTTTCAGGATTGTCTCACTTGCATAGATTGGTTCCACCATTTATACACCAGAAATTCAAAACAAACAATGTGCTGGTCGATGAAAATTTTATCTCTAAAGTAGCAGATGCAGGTATTGTTCGATTACTACAAAGGATCGAAGATGCTGGACCATCTCAAATTTCAAATGCCAGTGTCTTCCAAGATCCCGAGTAATCATATTTACCTAAATGTTTCAGAATAACATATCAAATTATCGTCATCCTATATGAGTTGATTATGTTTTGTGTGCATATATGCAGTGTGCATGTTTAATTATTGAACTTTTATTCTTAAAACAATATCTGTTTTTATTCTCAGGATTGGGAAATCAGAACCTGTATCAGAAGCAAGTGACGTGTATAGCTTCGGTGTGTTTCTATTAGAGCTCATCAGTGGTCAAGAAGCAGAGAGAATCGAGCTATCAGAGTCAACCACTAGTTTAGCACAGTGGGTAATGCAGCAAATCTCACATACACACACACACACAGACACGGACACAGACACACAGACATAGACAGACAGACACAAACACACACACATTGATACTAGTATTTAATCTGTAGAACAATATTGATATATATCAGGCAGAAGCACATATTGGTGCAGATACTTTCATTGACAGGCGAATGCACAAAAGCTATACTTCTGAAGGAATGAGGGACATGGTGCGATTGATGATGCGATGCTTAAGTCTGCATGGAGTGTATTGACATGGAGTGTATAGTCGTGGTTAATGGAAGTACTGATGGTTGTATGCAGAGAGGGTGGTTGCTATCGGGGGAAATGCTTGTGTAGTAATGTGGAGTTGAATGTAACAGATTGTAGATGAGGAAGTGGGATGGTCGGCGATGCAGGGTTGTTGAAGTAACTGTTGGCAATGGCAGTGTGTGAGGGGACAGTCGGCTGGAAGTTTGTATGGCTGAAGTAGGAGAGGCATTGAATGAATCATGGAGTTTGACTGGTAGATGGCAGAGGGATTAGGGCACTTGTGTGTTGATGTGTATGTAGGGTGGATGAGTGGTGATGGAAGAGTGTTGTTTGTGATGGATTAGTATGGTTTGTTGCATGTGGGTAGAGCAGTGGAAGGCACTGCAGTTCGTAACAGTTCGACGGAAGTGGAAAGGAGGTGCTGATGATAGTTGCTGTGGGAAGTGTGTTGTAACTGGTAATAGACAGAGTGAAACTATTGTGTGGTTGGTTGATATGGCAATGTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_017699436.1	1.0e-95	probable serine/threonine-protein kinase At1g01540
Swissprot	Q9LMN7.1	5.3e-41	Wall-associated receptor kinase 5
trEMBL	A0A8B9AQK5	7.3e-96	probable serine/threonine-protein kinase At1g01540

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G26700.1	49.68	2e-74	276		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
g221912	AT3G26700.1	312	142	6	53	353	52	359	49.68	2e-74	276
g221912	AT5G48740.1	299	179	6	68	358	593	889	36.79	1e-46	184
g221912	AT1G70460.1	296	163	6	49	333	324	612	38.85	2e-46	182

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g159227.t1; g185099.t1; g188090.t1; g216985.t1; g221912.t1; g304354.t1; g357029.t1; g36126.t1; g414784.t1; g420082.t1; g491650.t1; g491651.t1; g51640.t1; g58866.t1
Allium fistulosum	AfisC2G04408; AfisC2G06125; AfisC3G08842
Allium sativum	Asa6G02036.1; Asa6G03575.1
Arabidopsis thaliana	AT3G26700.1
Oryza sativa	LOC_Os01g70970.1; LOC_Os05g30820.1; LOC_Os05g30820.2

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07651.13	ANTH	Domain	1	46	39.7	2.5e-10
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	86	330	117.6	5e-34

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
-	-	-

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K04733	IRAK4; interleukin-1 receptor-associated kinase 4	EC:2.7.11.1	MAPK signaling pathway	ko04010
			NF-kappa B signaling pathway	ko04064
			Toll-like receptor signaling pathway	ko04620
			Toll and Imd signaling pathway	ko04624
			NOD-like receptor signaling pathway	ko04621
			Neurotrophin signaling pathway	ko04722

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network