result

Gene information

Detail information of g316766

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g316766	Scaffold_66494:HRSCAF_449580	236911	252321	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g316766.t1
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020246016.1	1.3e-60	LOW QUALITY PROTEIN: lysM domain receptor-like kinase 3
Swissprot	A8R7E6.1	1.7e-39	LysM domain receptor-like kinase 1
trEMBL	A0A5P1E7P0	9.6e-61	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G21630.1	43.24	4e-51	198	AtCERK1;AtLYK1;CERK1;LYK1;LYSM RLK1	chitin elicitor receptor kinase 1

>>>Show top 3 blast result

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g316766	AT3G21630.1	259	131	7	3	251	11	263	43.24	4e-51	198
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g1039.t1; g235354.t1; g271431.t1; g27304.t1; g279802.t1; g300907.t1; g302680.t1; g316765.t1; g316766.t1; g33059.t1; g378422.t1; g383008.t1; g393291.t1; g481938.t1; g521281.t1; g530779.t1; g86512.t1
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Oryza sativa	LOC_Os08g42580.1; LOC_Os08g42580.4; LOC_Os09g33630.1; LOC_Os09g33630.2; LOC_Os09g33630.3

Pfam domain

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Gene Ontology

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GO:0050896	P	response to stimulus
GO:0051716	P	cellular response to stimulus
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GO:1901698	P	response to nitrogen compound
GO:1901700	P	response to oxygen-containing compound
GO:0140096

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13429	CERK1; chitin elicitor receptor kinase 1	EC:-	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network