result

Gene information

Detail information of g414784

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g414784	Scaffold_78492:HRSCAF_461578	130338	135797	-

Sequences

CDS

>g414784.t1
ATGTCCAAATATGATGCAATCAAAGCACTTGAAATCTACAAAAGAGCAGGCCAGCAGGCAGAAAGTCTTGCTGAGTTCTACGAGTTCTGCAAAGCTTTGGAGCTTGCCAGAAATTTCCAGTTCCCAACTCTAAGACAGAAGTTCAAAAGTACTGGCGGTCGCGATAAAGGAGTCAGAGGTTCTTCCACTGAACATCAAATGGCAAGAGAATTTACGTTAGAAGAGTTGGAACAAGCTACCAAGAACTTCAGCGAAAATAATTTGATTGGTGAGGGAAGTTTTGGTTTAGTGTATAAAGGCTTGCTTTGTGATGGTACTGTAGTTGCAGTCAAGATGCGTCATGGGTCTCCAAAGGTAGAATTCGTCGAAGAGGTCATGTATATATCTAGCATTTGGCATCGTAACCTAGTCACTCTTGTTGGTTATTGCCAAGAAGCCGGACTTCAAATGTTAGTTTTCGAGTATGTACCAAATGGAAGCTTAACTGGACATCTATACGGCAGCGAGAAAGAATCAACAAGGCTCGAATTTAAAAGGAGGCTTTATGCAGCTATAGGAGCTGCTAAAGGATTGTCTCACTTGCATAGATTGGTTCCACCATTTATACACCAGAAATTCAAAACAAACAATGTGCTGGTCGATGAAAATTTTATCTCTAAAGTAGCAGATGCAGGTATTGTTCGATTACTACAAAGGATCGAAGATGCTGGACCATCTCAAATTTCAAATGCCAGTGTCTTCCAAGATCCCGAGATTGGGAAATCAGAACCTGTATCAGAAGCAAGTGACGTGTATAGCTTCGGTGTGTTTCTATTAGAGCTCATCAGTGGTCAAGAAGCAGAGAGAATCGAGCTATCAGAGTCAACCACTAGTTTAGCACAGTGGGCAGAAGCACATATTGGTGCAGATACTTTCATTGACAGGCGAATGCACAAAAGCTATACTTCTGAAGGAATGAGGGACATGGTGCGATTGATGATGCGATGCTTAAGTCTGCATGGAGTGTATAGTCGTGGGGACAGTCGGCTGGAAGTTTGTATGGCTGAAGTAGGAGAGGCATTGAATGAATCATGGAGTTTGACTGAGCAGTGGAAGGCACTGCAGTTCGTAACAGTTCGACGGAAGTGGAAAGGAGGTGCTGATGATAGTTGCTGTGGGAAGTGTGTTGTAACTGGTAGTAGACAGAGTGAAACTATTGTGTGGTTGGTTGATATGGCAATGTAA

Protein

Gene

>g414784.t1
ATGTCCAAATATGATGCAATCAAAGCACTTGAAATCTACAAAAGAGCAGGCCAGCAGGTATCAGTTACCATTCTTAGCTTCACAGTTTGCATTCTGCAATGTGAAAATAAGCTAGTTATTGAGTTTTATTTTAAATGCTGAATAGGCAGAAAGTCTTGCTGAGTTCTACGAGTTCTGCAAAGCTTTGGAGCTTGCCAGAAATTTCCAGTTCCCAACTCTAAGACAGGTTTTCTTTACTTAAGTTACACCTAATATTTATGTGCTTCTTTGAACTTACTCTGGGAATATTCTTATGTCTAAAATTGATTTTGATGCAAGCCAGTAAGTTGGAGATGGTATAAGTGCAGTTGTGGGTTTGTGAGATGCTGGTGGTAATTGAAGGTCAGTAAGGGGTTTCAGGTGGAGGAAGTGTTGTTTGCTTGGTTTGGTGGGTGATGAAGTTATGTGGCAGAAATGTATGTAGCAGTCAGATGCAAAGTTTATGGTAGAAGTAAAGTAGCACTGTATGTTTTGTTGTTGGTGATGACAGATGAAGCAAGAGGAGATGTTGTGATGCAAGTGGGTTGGAGGAAGTCGGGGAAATTGATGGTGTAGTAGGTTTGAATGGCAGAGGGAATGGTGATGTTGCTATGTGGTTTAGAGAAGTGACAGTAAGGGGTACTCTGGGTGGTAGCCGCAGCTTGTTTATATGGTGAGTGGCAGTGATCAGGTGAAAGAACTAAATTCAGGAAACATGCAGATTCGAAAAATAGATCCCTTTCTTCTTTTATTAAAACGATAAACATCGACCTAAGGTACAATCAGACAATCTTACCTACAAAGTGTGAGATACAGAAATCTTATATTATACAAATTTAAGACTAAAACACAAGTCTTTATCACGTTTTGATGAAGATACCAGAATAAACCAGTTAAGCTATCATATCATGAAACCTAAGTAGATTAGCATGTGCTAAGCCACTTACAAACAATGTCATTTCAGCAATTAAGGGATAAAATCCCACTTGCCATTTTGAATATCTATTTCCCTTGTATTATGACTTAGGTTAGGAAAATCATGAGAAACCTCGAATAGAGGTATAAATCAAAACGGCTGATCCATACACGGTGCCAAATGACTTGTTATTTAAACAACTACAAATACTAGGGCAATGATAGATGACTTGCTATACAAGACATCACTGAAACTAGGAAAACAACTCTTCTGTAATAACTAGTTTTCTATAAGACGGAATCTTCCATACCAAATTTAATTTATGCACCTTTTTGCTGTTCCAATCTGAATGCTCCCTCGCTGATGGCAGCAGACAAGATTGCAAGTGAGAGACAGCACAAAACAGTTGGAGGACAACAAAAAAATTGGAAAAATCATCAGAAGATATTCCAAAACAGTGCAATATCATTATTAGTAGGTTCACAAAATATTTTAAGTGGGATGCACACTTTCCAGTAATATCAGATGAAACGTATATATGCTTCCTGCTCCTAGCACTGGAAAACATATTTACAATCAACTACCTAGTCACAAGAAATGACAGAACCCTCACACTAAAGAAAATCATCATTTATCAAATAATTTTTTCCAAAATTGTGTAAAGATATCATAATCTTATCAGAAAATTCTCTGTAATTTTTCCCAAAATTTTATCTTTACATAGATCAGGTATGTTAACGGCACTTTTAGGATCCGAGTATTACTGCTCTAGAATTTTAGTTCCTTAGTTTACATTTGATTAAGGATACATATAGAGGAATAAAGAGTATATTTGGTGATTGAAGGAACTTTAGCTTGAGCCTTTCGTCATTCTCAATTTTTGCGTTTAATTTCACAAAGCTGCAAGGCTTTAGCTGTACAAAACAAATTTATACCGGAATTAAGATTCCAAATGATAATTATTACAAAACCAATATTGCAACTATTAACCTTTGTTGATAATTATCTCAATATTTTGCATCGACTCACACTAATCAATTCCAACAATCACTTTCCGTATGCTATGAAGTTTTCCATTTACTTATGGATATTTGTTTTTTTCCTTTAATAACATATATTCAGTTGTATTTTTACTTTCAAAATAAAAATGACTAATGTCAATTTGATTATTATAGGAAACAGAATCGATTGGAAGGTTGAAATCTGGATTTGAACACTCCGAAACATGGTAATATGAGTGAGAACTTTTTTTTATGTTATGATTATAAGTGCACCCATTTTCAATTATGGTTTTGCCCACCTGATTGTACAACTATAACAGAAAGTCTAAACTTCTCACTGAAGCTTGCAAAGGACGGAGTACTTGATGTTGTTTAATGCGTACAATGTGCAGGCTATACATGTCAACCCAAAACCTTTCCTGAATAATTTGACTAGGAAGCCTGTGATTGCAAAACTGAAGTGGGGAATGGAATACAAAGGTAACCTTTCAACTTTCAATGTACGCATTGACTATCATTTTCCTGCAGCAATAGTATTGCTCTTGTATTATTTTATGGACGTTAATTAAGTTGCATATCTAACAACATTTAAATGCTTGAAATTGTTCTCAGGCTTTCTTGTCTCAGTGCATTCTTATATGAACCTGCAGGTAAAAAATATAGTATTTAATAGTTTTAGAAAAAAATTAGACTTATTCAGCATATTTAGGTATTTCTTCTAAACCTGAATTTATTTTTCTAGCATATTTAGGTATTTCTACTCTGCCATTCATTAGCTGGTTTGCTGCAACAGGTTAACCGAGCATTTGATGGGGTCGGTTCTAATTTGATATCACAGTTTTGATTACGATCAACTCCAACCATTTAAGTTAATGATTGGTTTATCAAGAAATTTGTTGCACTTGCAGGCATACAAGTTGCTCATGAAAGCTTTCATCGAGCACGATAAGGTAAGTTTAGGCATCTAATATTTCACCCGTTCAATCCATTATTGAATAGCTGATATTGGGAATCACATTTGAATTCGACTAATTAAAGATTGTTGTATGCACAACTATAACCACATCATAGAATATCAACAAAAATAATTAACATGTTAAGATTTTTTTTTTGAAACTTGAATATGTATGATGAAATTGTATTAAGATTTTTTACTTAATGGGAGAAGTGGTCTGCAACAAAATGGAGTGTGTAAACTTAGTGTACAAGAAGGATGTGGTTTGGAGCAGTAGTATGATGTCCCTCATTCCTTCAGAAGTTCAAAAGTACTGGCGGTCGCGATAAAGGAGTCAGAGGTTCTTCCACTGAACATCAAATGGCAAGAGAATTTACGTTAGAAGAGTTGGAACAAGCTACCAAGAACTTCAGCGAAAATAATTTGATTGGTGAGGGAAGTTTTGGTTTAGTGTATAAAGGCTTGCTTTGTGATGGTACTGTAGTTGCAGTCAAGATGCGTCATGGGTCTCCAAAGGTAGAATTCGTCGAAGAGGTAAACCATTGCTTATTCGTTTCTTCTAATGTAAGTATTACCACTATTCTGGTTATATCAGTGAATATTTATGTTATATCACAAATAATTTCTCGAAACAGATTCATAATTCATATACCTCTATTTCATGACCTTATCATAATTTTTTTACCGTTTCTTATAATAGATTTGATACCAGTGCATGCTATATGATCATGTCAGTTTTCTTTCAGAAGCAACAAAATCCTAATATAAAGAGGAAAAACATACATGAAAGAATCGGGTTATAAAAGAATGTATTCATGTCCATCATATATTCAGATACTTCAAAGGGTGTATCGATCATGATTGCAATCAAACTCTTCTCCTTTCCCAACTCAATTCGCTTAATTGTCAACCTCCTAGGGGGCGATCTTAAAGCACAATAGGCTACCAAGTGACAAACCTCATTTATGCATATCACTGTGTGACACATATTTAAAAATATATGAACAGGTCATGTATATATCTAGCATTTGGCATCGTAACCTAGTCACTCTTGTTGGTTATTGCCAAGAAGCCGGACTTCAAATGTTAGTTTTCGAGTATGTACCAAATGGAAGCTTAACTGGACATCTATACGGTAATCATACATCCAAGTAACGAATTTACATTGAAAATATAAAATTTTTACTGATTATTTCGTTGTAACAGGCAGCGAGAAAGAATCAACAAGGCTCGAATTTAAAAGGAGGCTTTATGCAGCTATAGGAGCTGCTAAAGGTACATATTCATATCTGAATACACCTTTTTGTTTCCACTTTTTTATGGCAGTTTCGTATGATTTTACAGTTCATATTGTTGTTTCAGGATTGTCTCACTTGCATAGATTGGTTCCACCATTTATACACCAGAAATTCAAAACAAACAATGTGCTGGTCGATGAAAATTTTATCTCTAAAGTAGCAGATGCAGGTATTGTTCGATTACTACAAAGGATCGAAGATGCTGGACCATCTCAAATTTCAAATGCCAGTGTCTTCCAAGATCCCGAGTAATCATATTTACCTAAATGTTTCAGAATAACATATCAAATTATCGTCATCCTATATGAGTTGATTATGTTTTGTGTGCATATATGCAGTGTGCATGTTTAATTATTGAACTTTTATTCTTAAAACAATATCTGTTTTTATTCTCAGGATTGGGAAATCAGAACCTGTATCAGAAGCAAGTGACGTGTATAGCTTCGGTGTGTTTCTATTAGAGCTCATCAGTGGTCAAGAAGCAGAGAGAATCGAGCTATCAGAGTCAACCACTAGTTTAGCACAGTGGGTAATGCAGCAAATCTCACATACACACACAGACACGGACACAGACACACAGACATAGACAGACAGACACAAACACACACACATTGATACTAGTATTTAATCTGTAGAACAATATTGATATATATCAGGCAGAAGCACATATTGGTGCAGATACTTTCATTGACAGGCGAATGCACAAAAGCTATACTTCTGAAGGAATGAGGGACATGGTGCGATTGATGATGCGATGCTTAAGTCTGCATGGAGTGTATAGTCGTGGTTAATGGAAGTACTGATGGTTGTATGCAGAGAGGGTGGTTGCTATCGGGGGAAATGCTTGTGTAGTAATGTGGAGTTGAATGTAACAGATTGTAGATGAGGAAGTGGGATGGTCGGCGATGCAGGGTTGTTGAAGTAACTGTTGGCAATGGCAGTGTGTGAGGGGACAGTCGGCTGGAAGTTTGTATGGCTGAAGTAGGAGAGGCATTGAATGAATCATGGAGTTTGACTGGTAGATGGCAGAGGGATTAGGGCACTTGTGTGTTGATGTGTATGTAGGGTGGATGAGTGGTGATGGAAGAGTGTTGTTTGTGATGGATTAGTATGGTTTGTTGCATGTGGGTAGAGCAGTGGAAGGCACTGCAGTTCGTAACAGTTCGACGGAAGTGGAAAGGAGGTGCTGATGATAGTTGCTGTGGGAAGTGTGTTGTAACTGGTAGTAGACAGAGTGAAACTATTGTGTGGTTGGTTGATATGGCAATGTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_017699436.1	4.2e-97	probable serine/threonine-protein kinase At1g01540
Swissprot	Q9LX66.1	5.4e-41	Protein HERCULES RECEPTOR KINASE 1
trEMBL	A0A8B9AQK5	3.0e-97	probable serine/threonine-protein kinase At1g01540

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G26700.1	49.84	9e-75	277		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
g414784	AT3G26700.1	315	145	6	53	361	52	359	49.84	9e-75	277
g414784	AT1G70460.1	297	165	6	49	334	324	613	38.38	1e-45	180
g414784	AT5G48740.1	306	181	6	68	366	593	889	35.62	8e-45	178

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g159227.t1; g185099.t1; g188090.t1; g216985.t1; g221912.t1; g304354.t1; g357029.t1; g36126.t1; g414784.t1; g420082.t1; g491650.t1; g491651.t1; g51640.t1; g58866.t1
Allium fistulosum	AfisC2G04408; AfisC2G06125; AfisC3G08842
Allium sativum	Asa6G02036.1; Asa6G03575.1
Arabidopsis thaliana	AT3G26700.1
Oryza sativa	LOC_Os01g70970.1; LOC_Os05g30820.1; LOC_Os05g30820.2

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07651.13	ANTH	Domain	1	46	39.6	2.6e-10
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	86	292	116.9	8.5e-34

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
-	-	-

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K04733	IRAK4; interleukin-1 receptor-associated kinase 4	EC:2.7.11.1	MAPK signaling pathway	ko04010
			NF-kappa B signaling pathway	ko04064
			Toll-like receptor signaling pathway	ko04620
			Toll and Imd signaling pathway	ko04624
			NOD-like receptor signaling pathway	ko04621
			Neurotrophin signaling pathway	ko04722

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network