result

Gene information

Detail information of g57335

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g57335	Scaffold_31002:HRSCAF_287462	114658	128834	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g57335.t1
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_022016706.1	1.6e-16	CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 12-like
Swissprot	O22971.2	2.4e-17	SOS2-like protein kinase PKS10
trEMBL	A0A8X7VWL7	3.9e-17	Uncharacterized protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G29230.1	68.12	1e-19	94.4	ATCIPK18;ATWL1;CIPK18;SnRK3.20;WL1	CBL-interacting protein kinase 18

>>>Show top 3 blast result

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g57335	AT1G29230.1	69	22	0	178	246	63	131	68.12	1e-19	94.4
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g57335	AT4G18700.1	69	27	0	178	246	15	83	60.87	2e-18	90.1

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g437016.t1; g57335.t1
Allium fistulosum	AfisC4G01831
Allium sativum	Asa1G02582.1; Asa1G04227.1; Asa5G05271.1; Asa7G00970.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
-	-	-	-	-	-	-

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0140096

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K07198	PRKAA, AMPK; 5'-AMP-activated protein kinase, catalytic alpha subunit	EC:2.7.11.11	Apelin signaling pathway	ko04371
			FoxO signaling pathway	ko04068
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			AMPK signaling pathway	ko04152
			mTOR signaling pathway	ko04150
			Autophagy - animal	ko04140
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			Insulin signaling pathway	ko04910
			Glucagon signaling pathway	ko04922
			Adipocytokine signaling pathway	ko04920
			Oxytocin signaling pathway	ko04921
			Axon regeneration	ko04361
			Longevity regulating pathway	ko04211
			Longevity regulating pathway - multiple species	ko04213
			Circadian rhythm	ko04710
			Thermogenesis	ko04714

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network