result

Gene information

Detail information of AfisC1G00220

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G00220	chr1	30523779	30543216	+

Sequences

CDS

>AfisC1G00220
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Protein

Gene

>AfisC1G00220
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_006352828.1	5.2e-50	PREDICTED: B3 domain-containing transcription factor ABI3-like
Swissprot	P26307.1	6.0e-43	Regulatory protein viviparous-1
trEMBL	M1BS61	3.8e-50	VP1-ABI3

Best hit in Arabidopsis

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AT3G24650.1	40.00	4e-41	166	ABI3;ABI3;SIS10	AP2/B3-like transcriptional factor family protein

>>>Show top 3 blast result

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AfisC1G00220	AT3G24650.1	230	114	4	301	507	452	680	40.00	4e-41	166
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02362.18	B3	Family	399	486	50.5	1.3e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
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GO:0010601	P	positive regulation of auxin biosynthetic process
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0016301	F	kinase activity
GO:0016310	P	phosphorylation
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GO:0043167	F	ion binding
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GO:0048573	P	photoperiodism, flowering
GO:2000034	P	regulation of seed maturation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network