result

Gene information

Detail information of AfisC1G00827

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G00827	chr1	135622422	135628976	+

Sequences

CDS

>AfisC1G00827
ATGTTATTTCTAGACCAAAAGTGCTTACTTTTACTTGAAGCCATAAATTCATATCATTCTTCAGTGGAAATTTCTCAATCAATCTCAAATGAACATTCTTCTCTTGCAAAAGTACCTGCTGTAAGAGATTATCACAAGGGACGTGGAAGGCAAATTCACACCCAAAAAAAGAATGCAGGCAACAATGATGAAGCAAATAATAGTGTTGCAAGTATCAAATATAATGGTACAAAAGAAGAGGATAAGAAAATTTTCATTGAAAGAAAATTGGAGCAGTCAAAGCATTTCTTATTTGAAAAGCGTATGCCAACAAGATTGGACAATCATACAGCTTCCAACTTAATGGAGAATAAAAGTTCTACCTCAGCATTTCTTTCCATATTGGAGGATCCTCATGCACTCGAACAAAGAAAAGAGTGCCAAACAAATGCTGCAGCTTTCAACCAAATGAAAGCCAATAATAATATGTTAGACATCTTCCAAGAGACGAATGATAACAATTCAGTTGAACTATACAAAGAAGCAGCCTCAAAGGTTAATTCATCCGATAATATGGTGGCCTCTTCATTGCAAAAGAACAATCATACTATAGACGAAGTCACGCCTATCAAACCTAAATTGCAGACAATTAAAAAGGAAGCTGAAGAACTTACCTTGAAGAAGAAAAGAAAGAGGGAAAATCAGTATGACATTGTGGTCGTTCAAAAGAGAAAGAGTGATTTATTGGTGGACAATAACAACAATACAACTGTTTCCATCAGTTTTATAGGTGATGATAACAAAGTAACCAATGCCTTGCAATTGTTTCGAGCAATATATAGTAGGAACTCTAGCTATAGCTTAGCGTACAAAGAATATGTAGGAAAATATGGTATATCCAACCAAGGGGTCGTTGGGAAGATTCCTGGAGTAGAAATTGGAGATGAGTTTTATTTTAGAGCAGAAATGTACATAGTTGGTTTGCATTGTCAGCTTGTAGCAGGCATTGATTATGTTGAACTAGATGGTAGAAAAATCGCTATCAGTATAATATCGTCTAATAAAAAATGCGATAATGATGTACTGATGTACTCAGGACCAGGAACATTTGACAATGGTAAGAAACTTGAGGGTAGAAACTTAGCATTGAAAAATAGCATTGAAGATAAAATCCCAATTCGTGTAATTCTTGGACGGACGCTTTCAGGTAAAAAAACATATGTATATGATGGATTGTATACAGTGGAGAAATATACTATTGAGAATTGCAAGTTGAAGTTTCAGCTGCGTAGAATTCCCGATCAAGCAACAATTGATATTAGAGGAGTAGAAATATTGCCTAATCCACCATTTTATGATATTTCTAATGGCAAAGAGGACAAGCCAATCAAATTGGTGAATGATGTCGATGATGAGAGGTTTCCTACACCATTTAATTACATTACCAAGTCCATATATCCTTCTTCATATATCATTACCAAGCCAAAATGTTGTAATTGTATGGATGGGTGTTCTGATTTGGTTAAGTGTGTATGTGTTGTGAAGAATGGTGGGAGTCTTCCATTTAATTCCGATGGAGCTCTCGTGGAATGCAAACCTTTGGTTTACGAATGTGGTCCGGATTGTAAGTGCCATTCATCTTGTGACAATAGGGTAAGCCAACATGGCATCAAATTTCCTTTGGAAGTTTTCAAAACTAAAATGCGTGGTTGGGGGGTAAGATCGTCGTCTTTCATTCCTAGTGGTAGTTTCATATGTGAATATATTGGAGAGATATTGGAAGAGGAAGATGCCGAGAAGAGGACCAACGATGAGTATTTATTTGCAATTGGAAGCAATTATCATGACAATTCTCTTTCGGACGATGTCGTTAGTAGTATACCCAGCTTGCAAAAGGATGCATGTCGTGAAGTTGATGTGCCGGGTTACTCCATTGATGCATTGAAGTACGGTAATGTGGCAAGGTTTATCAATCATAGTTGTAGCCCTAATCTTGTTGCACAAGAACTACTATATGACAATGATGACATAAGGGTTCCTCGCATTATGTTATTTGCTGGAGAAGATATCCAACCTAATCAAGAGTTGACATACGATTACAACTACAATGTTGATCAAGTTTATGATGCGAATGGTAATCTAAAGAAAAAGGAATGCCACTGTGGATCTTCCGAGTGCATCAATTGGTTGTATTGA

Protein

Gene

>AfisC1G00827
GGACGAAGGTTTTTTTACAACCTATTAGAACTTATAGATTAAATTAACCATTATTATCATGTTATTTCTAGACCAAAAGTGCTTACTTTTACTTGAAGCCATAAATTCATATCATTCTTCAGTGGAAATTTCTCAATCAATCTCAAATGAACATTCTTCTCTTGCAAAAGTACCTGCTGTAAGAGATTATCACAAGGGACGTGGAAGGCAAATTCACACCCAAAAAAAGAATGCAGGCAACAATGATGAAGCAAATAATAGTGTTGCAAGTATCAAATATAATGGTACAAAAGAAGAGGATAAGAAAATTTTCATTGAAAGAAAATTGGAGCAGTCAAAGCATTTCTTATTTGAAAAGCGTATGCCAACAAGATTGGACAATCATACAGCTTCCAACTTAATGGAGAATAAAAGTTCTACCTCAGCATTTCTTTCCATATTGGAGGTATTAATTATCTATTTTATATCTGTTATATGAACTTTTGTTTTTAAATGTTCAAAATCAAACTTGTTTTTTGCACATGCATTGCATCAATTTATTTTATGTCATTTTCTTCACTTCATGTTTCTCCTATGTAAATTTAATTTTTAATATGGAGTAAATTTTTGTTGAAAAGTGATATGTTTAATAATTTCTTTATTTGTTGCAAAGATGTATATGTGAACTGTAAAAAGTGACCAAAACTGATGGTTAAGATAAAATTATATGGCTTACAACTAACAATTTTGGAAATTATTTTGCATATAAAATATGGCGTATATGATTCGATTGAAAATATATTATCCTGATAAAAAAAATTGTAATTGAAGTAACGAATAAACATTTTTTGTGTTATAAGTATTTATAATTAATCAGTAATGTTCGTTTATATGTTATTTTTCAATCAAATATAAATTATACGTTTTATTTCAATAATTAAACAATTATATGGAAAAAAACAAATAAGGAGATTCGAAACTGAAACCAAAACCGAAATTGAAATTCTTGAAATTTATGAATTACATTGAAAATTTTGAAATTACGAAGACCGAAACCGAGATCGAAACCGGGGTCTCTAATCTTGATTGGAAGTTTGTCTGAAAGTTGCTGATAATTATGTTTACGAACATTTTTAGTTAAATATTTTTGGTTCACATCCACTGAATGTCAAACATTAACTAGTCCACATTGCAAGAATGGACTTGGATGTGTAGATTGCGAATGAATGTCAAAACATATTGAGACAGAACAAGGATTCCCAACTTGTAGAAATGTCAAAAGCTTGAAATGAGAAAAAACACGTGTTAATATAAGAAATTATAAAATATTGTTATGAAATTTATAATACCGAGAAAAGAACAAAGGAACCCAGTGCACGAGACTCGCGCATGGTAACGGGCTCTGGAGAGGTCGATGATGTACACAACCTTTCCCTCGTACTGCGAAGAGGCTGTTTCCAGACTCGAATCTGGACGTTCAAATCACCATGTGGGTGATATAACCATTGGGCCAAAGCTCCACCTCTGGGAAAAGAATAGTATTTTCGGAAATTGTTATGGTAGTAAACACTAGATTTTTTTTCTACCACTTATATACAGTGTTGTAAAAATCTTTCTAGGCTCCCGCCTAGGCCCCGCCTAGATGATACTTACTGCATTATCTTAGTATATTAACCGGTTTATAAGCACCATTTGTACAACAATTTAGGTTTGATGTCTCTTATAAGTATCAAAATGTTTGTTTCAAGAAATTTTATCTCCATAGTTGCTTCCAAAACCATCTAAATCCATGGTATCACACTATGGATCAATTAATACTAAACAAAATACTAATATTTTATCCAAAATCCATTGGTTTATCTAAAACGCCTAACTTTGATTAATCCCCGATTAATCCCGCCTAGACGATTAATCCCTAGTCCATGCTTACCGTCTAGCATCCGCCTAGCGATTTTTACAACCTTGCTTATATAGCATGTTGAATAAATTATCTAATAGTTTTTTTTCCCAATAAAAAAATCTTTTAAATTGAATATAATAAGTCCATTCCTCTCGTAGGAAACTTACTTTCTATTTTGTAATGTGTTTTCATCTACATGGAATTGTGTTTCTTAAAATTTTGTAAGAAACATCAAACCTTTTGTATTAACTTTTGATTGACCTGCTGTTTAATGATCATGTTGACCTGATTATATAAACCAATTGGGTCTTTTCTTGTATCCATTAAAATATATTGACAAAGATTAATATGTTTTTATTACCAACAGATTAGTGCCAACTCATGCTACACACATCATGTTGAAATTATGTAATTGAAATAATCACAACATCATTGTGATAGCTGCAAAGGATATTCCAAAGCAAATTCAAGAAAAAATGGTTAAAAATTGGAATATACAATGAGTTTATTGCATCGAAAATGCACGAAATCAACACTTATTATATATTACGTTGAGATGCAACTAGATTATATATGACATAATTTGGTTTCATAATTTTTTTAGAACGAGAGTAGTATTTTATTCAAGCAGTGCGCTCATTTTGATGCCCCAAAGGTTTGAACTCATGGCCTTTAGAATCTCAGTTTAGAGTTTCATATCACTTGCCACTTGAGCTAGTGGTCTTTGAAGTTTTATAGTTTAAATTTATCCATAAAAATCCCAAGTTACATGTCTAATTCTATGTATGAAATATAAAAATGATAAAATAAATTGAATAGAGCGTAAATCAGAAAACATCACATGCCTTTCGGAGCATCATATCACAAAATTTACTAAATATTCGTCAAATAATGCAACTCCTAACAAAGTATTTTCAATACCATGTAATAAACTAAAAATAACTTCTAACCTTACATTTATTAAACTAATGTTTGGGTTTAGCATTAAGTATTTGTAAATCAAATGCCTTCCCTACAAAGATTCTTGCTTTCTTTTAGAAGATAAATGATATTTTAGTTCTTCTATCATTGCTTAGTGCGTTGAAATTATGTTTCTGATGATTTTCCAAAGTTAACATGCTTCCTCTTATAGATTTAGTCCTTGCTACTACTTTCTTGCAAAAATTCTAGCTTATTTTTAGGGTCAAATAAATAAATGAAAAATAACTTGAAATCATGTTAGCAATCACAAAGCATCCATAAATGTAAATTTCACAAATTATTGATTTATATTTGATAATAAAGAAGACAAAGTAGTTGGAGGATGTCATTATGTTATTATATGATGATAACCTATTTGTAGCCATTGAACGTTGCTATGCATGAATTTTAAAGCCGGCCTATAATGAAAGTAACGAGTTTACTTTAAACAAATTTCGAAATAAAAACAAATAGTTTACACATGTTATTAAGTTAAATTCAGGTATAGTTTAGACAGATTTTAAAATAAATATGAATACCTTCATAAAAGTTGACAGAAAATATAAAGAGAGAGACCAAAAAGAAACTAATCCGTTGAGGAAAAAAAAGAGTTTTAATCTTATTATCTAAAATGAAGCTTACATTTTATTTTTTATTTTGAAAATTATGAGAAAAATAATTAAGAGGTTAGATTCAACTTCATAGCAAACTTCATATAAGACATAGTATTAGATTAGTTTGGTTAACTTTATGTTTTATATCTCTTAGAGTTATAAATGAAAATTAAAGCTCATAGCAAAAACTTAGTGAGCTAATTTTACGCTTATATATCGAAAAAGAGAGATGCTAAATTAAAGCTCATAGCAAAAATTAAAGCTCATAGCAGTAATTTCAAAGTTGCAGAACTTTCAAAGTGGGATGCTAAATTCAAATATGCATTCCTCTTATTTTTTGAGACAACAGAAACATAAGTGTGTTGGAATTTAAACAAAAAACGAAATAAAAAATCAAATCATTACTGCTTAAACAAGTAAAAAATTATTGAGATATATTTGAAACTATTTTCCCGACAGCCTTACATGTCTACTTCCAACTGATATTTTACTTCACCCAAAACTGATATGTCAGTAAAGATAATAGCAATGAAGTTATTATATCAGCATCATGCTTCATAAGGTTGCAAGCAAATATATATGATTGTATGATTGGATGTGAGCATTTGAACCTAAGTCCCTTTTTCATAATGCATATTCACATTTAATCCTTGTCATTATTGTTTTCAAACCATTTTTTCACACTACAATATCATAATAAACAATTTTTAAAATGTGATAATTTCCTGTACAAATTTGGATTTGATGATTCATTTCACTATTAAATCACATGCATGGTGAAAACTTTAATGATATGTGTTGTTTTTTTATACTTTTGTGTGGAAATGATATACTTAGATCATGGTATTCTTTTGTAAATTGGATTTGTGATCAGTTTTTATTTGTAATAACACATACCTCATTATTTTGTGAGTAATTTGAACTTTCTTTGGTCATTTACGAACAAAAATGCATGTGTTATGGACCTGTTATGGAATGTAATAAGCGGTAGGGAACTTTTATGTGTTCAAGTTTAATTTTAAGGACCTGTTGTTGAATCTTGCAGCATATCAATTGATGTCTTAGTTTTTGGTTGAATATTTATAAATCTTTGAATTTGATCAGGATCCTCATGCACTCGAACAAAGAAAAGAGTGCCAAACAAATGCTGCAGCTTTCAACCAAATGAAAGCCAATAATAATATGTTAGACATCTTCCAAGAGACGAATGATAACAATTCAGTTGAACTATACAAAGAAGCAGCCTCAAAGGTTAATTCATCCGATAATATGGTGGCCTCTTCATTGCAAAAGAACAATCATACTATAGACGAAGTCACGCCTATCAAACCTAAATTGCAGACAATTAAAAAGGAAGCTGAAGAACTTACCTTGAAGAAGAAAAGAAAGAGGGAAAATCAGTATGACATTGTGGTCGTTCAAAAGAGAAAGAGTGATTTATTGGTGGACAATAACAACAATACAACTGTTTCCATCAGTTTTATAGGTGATGATAACAAAGTAACCAATGCCTTGCAATTGTTTCGAGCAATATATAGTAGGAACTCTAGCTATAGCTTAGCGTACAAAGAATATGTAGGAAAATATGGTATATCCAACCAAGGGGTCGTTGGGAAGATTCCTGGAGTAGAAATTGGAGATGAGTTTTATTTTAGAGCAGAAATGTACATAGTTGGTTTGCATTGTCAGCTTGTAGCAGGCATTGATTATGTTGAACTAGATGGTAGAAAAATCGCTATCAGTATAATATCGTCTAATAAAAAATGCGATAATGATGTACTGATGTACTCAGGACCAGGAACATTTGACAATGGTAAGAAACTTGAGGGTAGAAACTTAGCATTGAAAAATAGCATTGAAGATAAAATCCCAATTCGTGTAATTCTTGGACGGACGCTTTCAGGTAAAAAAACATATGTATATGATGGATTGTATACAGTGGAGAAATATACTATTGAGAATTGCAAGTTGAAGTTTCAGCTGCGTAGAATTCCCGATCAAGCAACAATTGATATTAGAGGAGTAGAAATATTGCCTAATCCACCATTTTATGATATTTCTAATGGCAAAGAGGACAAGCCAATCAAATTGGTGAATGATGTCGATGATGAGAGGTTTCCTACACCATTTAATTACATTACCAAGTCCATATATCCTTCTTCATATATCATTACCAAGCCAAAATGTTGTAATTGTATGGATGGGTGTTCTGATTTGGTTAAGTGTGTATGTGTTGTGAAGAATGGTGGGAGTCTTCCATTTAATTCCGATGGAGCTCTCGTGGAATGCAAACCTTTGGTTTACGAATGTGGTCCGGATTGTAAGTGCCATTCATCTTGTGACAATAGGGTAAGCCAACATGGCATCAAATTTCCTTTGGAAGTTTTCAAAACTAAAATGCGTGGTTGGGGGGTAAGATCGTCGTCTTTCATTCCTAGTGGTAGTTTCATATGTGAATATATTGGAGAGATATTGGAAGAGGAAGATGCCGAGAAGAGGACCAACGATGAGTATTTATTTGCAATTGGAAGCAATTATCATGACAATTCTCTTTCGGACGATGTCGTTAGTAGTATACCCAGCTTGCAAAAGGATGCATGTCGTGAAGTTGATGTGCCGGGTTACTCCATTGATGCATTGAAGTACGGTAATGTGGCAAGGTTTATCAATCATAGTTGTAGCCCTAATCTTGTTGCACAAGAACTACTATATGACAATGATGACATAAGGGTTCCTCGCATTATGTTATTTGCTGGAGAAGATATCCAACCTAATCAAGAGTTGACATACGATTACAACTACAATGTTGATCAAGTTTATGATGCGAATGGTAATCTAAAGAAAAAGGAATGCCACTGTGGATCTTCCGAGTGCATCAATTGGTTGTATTGAAAGTATTTTACTCCCGGATGGCGATCTCTTTTTATTCGTTTTGAAATTAAGGCATAAAATTTTAGTATTATTAAACTTTAGTTTAGTTTTCATATATTCTAAAATTAAAATGAACAAAATTACATTTCCTAAAAGTTAGTCTCACCTACTTTTATTAGTATGGTATGAGAAAAAGCATGACATTGTAATGAAAGCGCACTTCGAACTCAT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_010919768.1	7.8e-139	histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH6
Swissprot	O82175.1	3.6e-112	Suppressor of variegation 3-9 homolog protein 5
trEMBL	A0A6J0PHE2	5.7e-139	histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH6

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G22740.1	47.48	1e-111	400	SDG23;SUVH6	SU(VAR)3-9 homolog 6

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G00827	AT2G35160.1	469	178	13	288	724	354	794	49.25	1e-111	400
AfisC1G00827	AT2G22740.1	476	207	11	288	724	319	790	47.48	1e-111	400
AfisC1G00827	AT2G22740.2	476	207	11	288	724	319	790	47.48	1e-111	400

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02182.14	SAD_SRA	Domain	298	428	101.5	3e-29
PF05033.13	Pre-SET	Family	447	544	59.6	3.5e-16
PF00856.25	SET	Family	563	694	82.2	4.7e-23

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0006260	P	DNA replication
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000790	C	nuclear chromatin
GO:0000792	C	heterochromatin
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003682	F	chromatin binding
GO:0005654	C	nucleoplasm
GO:0006306	P	DNA methylation
GO:0006974	P	cellular response to DNA damage stimulus
GO:0007154	P	cell communication
GO:0007275	P	multicellular organism development
GO:0010200	P	response to chitin
GO:0010216	P	maintenance of DNA methylation
GO:0018024	F	histone-lysine N-methyltransferase activity
GO:0018027	P	peptidyl-lysine dimethylation
GO:0031048	P	chromatin silencing by small RNA
GO:0034968	P	histone lysine methylation
GO:0044764	P	multi-organism cellular process
GO:0051052	P	regulation of DNA metabolic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K11420	EHMT; [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT	EC:2.1.1.355	Lysine degradation	ko00310
K11420	EHMT; [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT	EC:2.1.1.355	Longevity regulating pathway	ko04211

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network