result

Gene information

Detail information of AfisC1G00838

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G00838	chr1	136829363	136846165	-

Sequences

CDS

>AfisC1G00838
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Protein

Gene

>AfisC1G00838
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Functional annotation

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Best hit in Arabidopsis

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g104871.t1
Allium fistulosum	AfisC1G00838
Allium sativum	Asa7G01056.1
Arabidopsis thaliana	AT3G58690.1
Oryza sativa	LOC_Os05g11750.1; LOC_Os05g11750.2; LOC_Os05g11750.3

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	106	373	154.3	3.4e-45

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0002221	P	pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0046658	C	anchored component of plasma membrane
GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009941	C	chloroplast envelope
GO:0010068	P	protoderm histogenesis
GO:0035420	P	MAPK cascade involved in innate immune response
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048367	P	shoot system development
GO:0071323	P	cellular response to chitin
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900426	P	positive regulation of defense response to bacterium
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway
GO:1905393

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network