result

Gene information

Detail information of AfisC1G01296

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G01296	chr1	223624835	223628293	+

Sequences

CDS

>AfisC1G01296
ATGGCAGCTGAATGTATTTTAAACATGGATTTGTCACACAAAACACGAATCTTTAACCTTCCTCTCTGGATTATCATTTGCTTGAGCATAATTGCATTGTTAATTCTGTTCTTATTGATGCTATGTATATGGGTTCTTTCAAATAGAAAGACTACGACAATGAACGAGAAATTCTCCCTCACCCGCATTCCTATCAAATCCAAGGAAATTAAAACCGATCGCCAAACATTAGTACAAAGTTTATATGAAAAGGAATGTCATTCACATGGTACTCTTTATAACATGGGTTTGAAAAAGCAAGTGGTAATGAGCATATCGTCCGAAGCTGATAATATGAGTCAGTGTAGCTCAGTTAATACAGAAAGAGTTGTGAGTCCATATGGATTACTATCTGCATCTCCTTTAATTGGTTTACCTAATACACCACAACTTGGGTGGGGGCATTGGTTCACTTTGAGAGATCTTGAATGTGCTACAAATCAATTTAGCAAGGAGAATGTTATTGGTGAAGGTGGATATGGAGTAGTTTATAGGGGATGTTTGGTTAATGGAACTGAGATTGCAGTTAAAAGGCTGCTTAACAATATGGGACAGGCAGAGAAAGAATTCAGAACAGAAGTTGAGGCGATCGGTCATGTTCGTCATAAGAATTTGGTTCGGCTTTTAGGTTATTGTGTTGAAGGAGTTCACAGGATGCTAGTGTATGAGTATGTGAACAACAGGAATTTGGAGCAGTGGCTTCATGGAGCAATGCATCAACATGGTGTTCTTAGTTGGGAATCCCGAATGAAAATCATTTTAGGAATAGCAAAGGCGCTTGCTTATCTCCATGAAGCAGTAGAACCGAAAGTTGTACACAGAGATATTAAATCAAGTAACGTTCTTCTTGATACTGAATTTAATGGCAAATTGTCTGATTTTGGATTAGCTAAGCTCTTGGGTGTAGGAGAGAGCCATGTAGCAACCCGAGTAATGGGAACATTTGGATATGTGGCCCCTGAATATGCTCATTCTGGACTGTTAAATGAAAAGAGTGATGTTTATAGTTTTGGAATACTTTTGCTGGAAGTTGTAACTGGCCGGGAGCCTGTCGATTACAACAGACCTCAAGAAGAGGTGAATCTTGTGGAATGGTTTAAAATGATGGTGGGCAGTAGGAGAATCGATGAACTAGTGGATCCTAATCTTGACCCGAAACCTGCAGCAAGAATTTTCAGACGTATCCTTATAGTTGCTTTAAAATGTGTGGATCCTGATTCCGGAAATAGACCTAAGATGAGTCGTGTTGTTCAAATGGTTGAAACCAAAGATGTTCCCTGTCTCCTGGTATTATTCAGTATCCTATACCTCTCTTTTAAACTATTTTCTAAACTGCTAGCATCATCTAATGCAAAGGCCATTGCTTTGACTTTTGATAACTACTAG

Protein

Gene

>AfisC1G01296
TGCTCTAAAGGATGTATAAATGATTTGCCGCATGCATCCCTCCGCTTTCTCTTCCTGTTTCCCCCACTTCTTTTATCTTCATCATTTTCTGTTTTATTACCCATGGGTTAACAAATTCATGGATTCTCTACATATAAAGTGGAGGAAGTAATTCAACCCATCATTTTATTTTTCTTCAAATTATTAAATATCAGGAGGAAACAAAAAAAAAAATCAACCATTGGGGGTTTTTGGCAGCTGTTGTTGTAGTGAAACCTAGCACTGTTGGATTTTCATTTTCATTTTGTTGGTTTAGGTAATCAACATTTTCTTTTTAGCACGAGCTTACCACTTCAATGTAGTGTACTACCGTTTAGTCCTCGATTTTTGCTTCATCTTCTCCAAATACTTTGTAAAGACTGGAATATATAGTTTATAAGTGATGTTCAAAATATGTTTTATGTGAATTAACGAGGATTTAAAGGGTAGGAATAACGAATATTTACCTTTCTATATTATCTCATTGCTTTTGCTTGATAGGTTGATAATTTTATGCTTTACTGTCTTTATATGTTGTTATAACCTTCTACAAATTGAAAATAGTAAATCAGTCAATTTAACTAATTGTCATTTTCTGAAGTTGTTTGGACAGCAGCTTAAAAATTTCTGAAAGTATCTGATTTTTGGTTTAAGCGTAGCTTGTTTATGAATCTATATAGCAATCTTAACAATTACAGTATGCTAAAGCTAATAGAAGGACAGTGAAGAAGCAGAAGTGAAGTTTTATTTTTTGCTTGTTTTGAATATATCCAAAACTTGCCTTTGAATCTGATATTCTCTGGAACTTTCTGTAACAATAAATTGCTACATAACACTCCAAATCAAATGATTAAGCCTACTTTGTTTTCTATAATGCAGAGGCAAAATGGCAGCTGAATGTATTTTAAACATGGATTTGTCACACAAAACACGAATCTTTAACCTTCCTCTCTGGATTATCATTTGCTTGAGCATAATTGCATTGTTAATTCTGTTCTTATTGATGCTATGTATATGGGTTCTTTCAAATAGAAAGACTACGACAATGAACGAGAAATTCTCCCTCACCCGCATTCCTATCAAATCCAAGGAAATTAAAACCGATCGCCAAACATTAGTACAAAGTTTATATGAAAAGGAATGTCATTCACATGGTACTCTTTATAACATGGGTTTGAAAAAGCAAGTGGTAATGAGCATATCGTCCGAAGCTGATAATATGAGTCAGTGTAGCTCAGTTAATACAGAAAGAGTTGTGAGTCCATATGGATTACTATCTGCATCTCCTTTAATTGGTTTACCTAATACACCACAACTTGGGTGGGGGCATTGGTTCACTTTGAGAGATCTTGAATGTGCTACAAATCAATTTAGCAAGGAGAATGTTATTGGTGAAGGTGGATATGGAGTAGTTTATAGGGGATGTTTGGTTAATGGAACTGAGATTGCAGTTAAAAGGCTGCTTAACAATATGTAAGTTTTGTTTAATTGTATGTCAAAATAGCGTAAACATCTTATGATTTGAAAATTACTCACTTTAATTATTCAATTTCAAAAAAAGCTTGCATCACAAGTATAATTGTTGGGTCAAATAGACAGGGAAATCACATGTAATGCTATTGCTTTAACAAACATGTGTTTACTAGGACACAAGTGCTGTTGTTGGCATATCTGTTATGATATATTTTTCTTTTTGTTCTTGTTTCTAATTTCTTAAAGATGGGAATATTGTAGGGGACAGGCAGAGAAAGAATTCAGAACAGAAGTTGAGGCGATCGGTCATGTTCGTCATAAGAATTTGGTTCGGCTTTTAGGTTATTGTGTTGAAGGAGTTCACAGGTGAAATTTTCTTTAGTTTTTTATTCTTCTACATCTTCATTTTGATTAAACTTTCCTTGAGAGCTAAATATCCAATGTAACACAAGGTGAGATTATTGAATTAAGTAATCATACAGAATGTGCATGAAGGAAATGTGATATCATCATGTTTCTTGGTAAAGCATGATTCAAATGGTTGCATGCATAGAGTATGTGTATGTAAGCTATATTAAGGTACCACCACATCTTGCCAACATCGAAGTCAAAATATTTAATGTGCATTATAAGTTTTCCTTAAATATAGATTTTTTATATATGTTACTTGTATATTAATACGAAGCTTTTATTGGGATTATTAGGATGCTAGTGTATGAGTATGTGAACAACAGGAATTTGGAGCAGTGGCTTCATGGAGCAATGCATCAACATGGTGTTCTTAGTTGGGAATCCCGAATGAAAATCATTTTAGGAATAGCAAAGGCGTATGTTTTGAATTGCTTATGAGAAACGAACAATAGCTTTTATCTTTTTACCACATTAGTTATGAACAGCACATTGTTGCATCATGCAGGCTTGCTTATCTCCATGAAGCAGTAGAACCGAAAGTTGTACACAGAGATATTAAATCAAGTAACGTTCTTCTTGATACTGAATTTAATGGCAAATTGTCTGATTTTGGATTAGCTAAGCTCTTGGGTGTAGGAGAGAGCCATGTAGCAACCCGAGTAATGGGAACATTTGGGTAAATAGTTGTATTTTGACAGTGATTGTGAAGGAATATTTTGATTTATGCGTTGGGTTATTTCAGATATGTGGCCCCTGAATATGCTCATTCTGGACTGTTAAATGAAAAGAGTGATGTTTATAGTTTTGGAATACTTTTGCTGGAAGTTGTAACTGGCCGGGAGCCTGTCGATTACAACAGACCTCAAGAAGAGGTAATTTATTGAATTAAAAATTTTGGGCTTTTGTTTTTTATTTGTATTATGTAGGTATATATTAAGAGTAATGCTATATAATTGGATATATATTAAGGTGAATCTTGTGGAATGGTTTAAAATGATGGTGGGCAGTAGGAGAATCGATGAACTAGTGGATCCTAATCTTGACCCGAAACCTGCAGCAAGAATTTTCAGACGTATCCTTATAGTTGCTTTAAAATGTGTGGATCCTGATTCCGGAAATAGACCTAAGATGAGTCGTGTTGTTCAAATGGTTGAAACCAAAGATGTTCCCTGTCTCCTGGTATTATTCAGTATCCTATACCTCTCTTTTAAACTATTTTCTAAACTGCTAGCATCATCTAATGCAAAGGCCATTGCTTTGACTTTTGATAACTACTAGGATCGAGGAAACAGAAGAAGTGAAACTACAAGCTTGGGGAGTGCTGATCTTGATAACAAAACCAAAGCCGTAGTAGTGTCGGTTGAGAGAGTGTAGTTTTATGTTTCTAAATTCCATGTTCTTTCTTTTCTTTTTTAACCGTGTAGATACAGTTTGAATTGTTCAAGTTATCCAAGCAATTTCATCCATTTTCTTCAGTTGCTGTTAGTATAAGCTCTCAGTGCCAATACAGTTTAATATTTCCTGTAGTTTGTTAAACTCAGCATAACTGAATTTCAT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020267330.1	6.9e-168	probable receptor-like protein kinase At2g42960
Swissprot	Q9SJG2.1	3.3e-151	Probable receptor-like protein kinase At2g42960
trEMBL	A0A5P1EUH7	5.0e-168	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G42960.1	59.87	1e-158	556		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G01296	AT2G42960.1	466	154	7	1	439	1	460	59.87	1e-158	556
AfisC1G01296	AT3G59110.1	467	173	6	1	439	1	467	56.96	8e-156	546
AfisC1G01296	AT1G56720.3	465	163	5	7	439	5	456	55.27	1e-147	520

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	163	431	164.7	2.4e-48

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0016021	C	integral component of membrane
GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0006950	P	response to stress
GO:0007166	P	cell surface receptor signaling pathway
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0010068	P	protoderm histogenesis
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048367	P	shoot system development
GO:1905393

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network