result

Gene information

Detail information of AfisC1G01421

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G01421	chr1	241383725	241412889	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC1G01421
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Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G11260.1	71.13	6e-52	199	HY5;TED 5	Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G01421	AT5G11260.1	142	41	0	20	161	25	166	71.13	6e-52	199
AfisC1G01421	AT3G17609.2	119	56	1	30	146	23	141	51.26	3e-24	107
AfisC1G01421	AT3G17609.1	77	27	0	70	146	51	127	64.94	9e-23	102

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00170.18	bZIP_1	Family	82	143	55.5	4.1e-15

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000977	F	RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009740	P	gibberellic acid mediated signaling pathway
GO:0010017	P	red or far-red light signaling pathway
GO:0010099	P	regulation of photomorphogenesis
GO:0010114	P	response to red light
GO:0010218	P	response to far red light
GO:0010224	P	response to UV-B
GO:0031539	P	positive regulation of anthocyanin metabolic process
GO:0042753	P	positive regulation of circadian rhythm
GO:0080167	P	response to karrikin

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K16241	HY5; transcription factor HY5	EC:-	Circadian rhythm - plant	ko04712

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network