result

Gene information

Detail information of AfisC1G01714

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G01714	chr1	296115581	296122892	-

Sequences

CDS

>AfisC1G01714
ATGGCGGCAGCAGTTGCAATACGAACGAGCAGTGGCAGCAATGGCGGAATAGACAAGCATATGGATAGTACTGGAAAATACGTACGGTACACGGCGGAGCAAGTGGAGGCGTTGGAGAGAGTTTACGCGGAGTGTCCTAAACCGAGTTCTATGCGGAGGCAGCAGTTGGTCAGAGACTGTCCTATTTTGTCCAATATTGAACCTAAACAGATCAAAGTCTGGTTCCAGAATAGAAGATGCCGTGAGAAGCAAAGGAAAGAATCTTCACGCCTTCAGGCAGTCAATAGGAAGTTAACTGCAATGAACAAGCTTGTAATGGAGGAGAATGAGCGCCTTCAAAAACAAGTTGCCCAGCTAGTTAATGAGAATGCTTATATGAGACAACAATTACAAAATGCTTCTTTTGGCAACGATGCAAGCTCTGATTCAGTTGTCACAGCACCCCAAAATCCTCTAAGGGATGCAAATAATCCTGCTGGACTTCTCTCCATTGCTGAAGAGACCTTGGCGGAGTTCCTCTCAAAGGCTACAGGGACTGCTGTCGATTGGGTCCAGATGCCCGGGATGAAGCCTGGTCCGGATTCAATTGGAATTGTTGCTATATCAGAAACATGCAGTGGAGTGGCAGCACGAGCCTGTGGTTTAGTGAGTTTAGAGCCTACAAAGATTGTTGAACTACTTAAAGATCGTCCATCCTGGTTCCGTGATTGCCGAAGCCTTGAAGTCTTCACCTTATTTCCAGCTGGAAATGGAGGTACAATTGAATTAGTTTATATGCAGATGTATGCACCAACTACGTTAGCTCCAGCGCGTGATCTCTGGACTCTTAGATACACAACTACTTTAGAAGATGGGAGCCTTGTGGTCTGTGAGAGGTCTCTCAGTGGTTCTGGAGGCGGTCCAAGTGTTGCTGCTAGTCATCAATTCGTAAGAGCTGAAATGCTTCCAAGTGGTTTCTTGATTCGTCCATGTGATGGTGGTGGTTCCATTGTACACATTGTTGATCACTTAAATCTAGAGGCATGGAGTGTGCCTGAAGTTCTAAGACCTCTTTACGAGTCTTCCAGGGTCGTTGCTGAGAAAATGACTACTGCAGCACTGCGGCATATCAAGCAAATAGCACAAGAGATTAGCGGTGAAGTGGTGTACACTCTTGGAAGGCAGCCTGCTGTTTTGCGTACCTTTAGTCAAAAATTGACCAGAGGTTTTAACGATGCTGTTAATGGATTCGTCGATGATGGATGGTCTGTTATGGGAAGTGTAGATGGTATTGAAGATGTAACAATTGCTACAAACTCTATGAAAAAGACCCTTAATAATGTCTCGATGCCTGATGGGGTGATTTGTGCTAAGGCGTCAATGCTACTTCAGAGTGTTCCTCCTGCATTGCTTGTTCGTTTTTTGAGGGAGCACCGATCAGAATGGGCTGATTACAATATGGATGCTTACTCCGCTTCTGCAATTAATTCAAGCTCAAATTTATTTCCTGGATTAAGGACAGAAAGGTTTTCTGGGAGCCACACAATTATGCCTATTGCCCATACCATTGAGAATGAAGAGTTTCTTGAGGTTGTTCGTCTCGAAAGCCAAACTCTCACTCCAGATGAAGTTATATTGACCAGGAATATTCATCTGCTACAGCTTTGTAGTGGAATCGATGAAAATGCTGTTGGAGCTTGCTTCCAACTTGTATTTGCTCCAATCGATGAGCTTTTCCCAGACGATGTTCCTCTCCTTCCTTCTGGTTTCCGGGTTATTCCATTGGGGAGTAAATCAAAAGCTTCCAACCCTAACCCTACACTAGATCTAGCATCTAGTCTTGAAGTAGGATCTGCTACAAACAGAATCAATGGCGAAACATCTCCAAATGAATGCAACTCCCGATCAGTCTTGACTATAGCTTTTCAGTTCCCTTATCAATTTCACCTTCAAGAAAGTGTGGCTGCCATGGCTAGGCAGTATGTTCGAAGCATTGTATCCTCTGTGCAAAGAGTTTCTATGGCGATAACTCCTTCACCCTCTGGATGCATCTCAGGTGGCAGATTGCTTCCTGGATCTCCTGAAGCTGCAACTCTTGCTCGATGGATTTGTCACAGTTATAATTACCATTTGGGATTAGATTTGCTAAGATCCATTGATGACTCGGGAGAACAGTTGCTAAAACTTTTGTGGGATCATCATGACGCTATTTTGTGTTGTTCTATTAAGGTGCAACCAGTTTTTACATTTGCCAACCAATCCGGGCTTGATATGTTAGAAACGACACTAATTGGTTTACAAGACATCACTCTTGATAAGATTTTCGATGAGCCTGGAAAGAGGGCACTTTACTCTGACTTCACCAAGTTAATGGATCAGGGCTATTGCTACTTGCCAGGAGGCGTATGCATGTCAGGAATGGGGCGACATGCAACGTATGACCAAGCTGTTGCATGGAAAGTTATTGGTGAAGAGAACAGCACACACTGCCTTGCTTTTGCTTTCGTCAACTGGTCTTTCATTTGA

Protein

Gene

>AfisC1G01714
AAACACACTCCTACTGTTCTCTTCCTTCTTCTTCTTTAAAGCTGTCCCTCTGTCTGTCACCCTACTTTTTCATTAACTCCCCCTGCTTTTTCTTTTGTTCTTTCTTTTCTTCACTATATATTTTTAATCCCCCTTCTTTTTTCTCTGTGTTATTTTTATTTGCTTTCTTTGATCTTCAATCATGCCCAGACTTTTCCTTCTTCAATCCCGATCATCCTCCTTATTTTTTGATGCTTTTCATGAAAGATAAGCCTAAAATTCTGTCTTATCAACTCTAGAAGAACCAAATCCCCTTCTTTTCTTCTTAAAATCAAGCTTAAGTTATCTTGCATGTTACTTATCTAGAAGATCTGCGCTTGAAAGTTAGGGATTTGCCACTTTAATCTTTCTTAAACAGTGACTTTCATCATCTACTATTACAATTTTGCCACCGTTTAAGAAAAGAAAAAGCTGCAATCTTTAAAATTTAGTAAGTTGGTGCGATCACAAAAATGGCGGCAGCAGTTGCAATACGAACGAGCAGTGGCAGCAATGGCGGAATAGACAAGCATATGGATAGTACTGGAAAATACGTACGGTACACGGCGGAGCAAGTGGAGGCGTTGGAGAGAGTTTACGCGGAGTGTCCTAAACCGAGTTCTATGCGGAGGCAGCAGTTGGTCAGAGACTGTCCTATTTTGTCCAATATTGAACCTAAACAGATCAAAGTCTGGTTCCAGAATAGAAGGTATTAACTGATTGTGCCTGTGATTTATTAAACTTCAGAATTCTGATGTTGCATTGTGTATTTTTTTGTGATGCATCTTGATCTATGCTTTTGTATGAACTGTATTCAAAATGTATGGGCTATCCTGTAATTTTGAAGTTTTATGATGTAGAACTACATGGGAAAAATCATATTTTGATGAATATCGGATTGTTATCCAAGTAAATTTTTTCCAGTCTTTTCTGAAGATGTAAATTACTTTCCATTAACGTATCCAGAAAATGAATATGCACTTTTCTGTGTACTTGTTTAGATAACAAAGCCAAGTTTAGTTTGCTTGTAGCAAGATGAATCTAATCTGCAATACTTTCGTGGTTGTTAAAGTATTGAAGTTTCAATGCTTCAAAATTATAGAAGCTTCTATAAGCTACAACTCTTAAATTTTGTTTAGTACCATAAAATGATTATCATGCTTATCCCTTGTGAAAATAGTTGTGTATTTGTGGGTTGAATAATAGATGTAGGTTAAGTAGTTTAATATACAATATCAAAAGCTCGATTATGGGTGTCAAGTTCTTGGTAGCAAAACTGGGTTCTGATATTTTGATCTCCAACTGAAGATGTTTTTACACATATGTCTCTACCATGAGTCTGTAATTTGCATATATATATATTTCTTTGCTGTAAAATATGTGATATTTGCAGATGCCGTGAGAAGCAAAGGAAAGAATCTTCACGCCTTCAGGCAGTCAATAGGAAGTTAACTGCAATGAACAAGCTTGTAATGGAGGAGAATGAGCGCCTTCAAAAACAAGTTGCCCAGCTAGTTAATGAGAATGCTTATATGAGACAACAATTACAAAATGTAAGCAACCACTATCATGGCTTACCTTCATAGTCTTTTCTTTGTAATTCATATTTTTATCTATTTATTTATTTATTTTTTATGTTAGAACTAAAACGTTGGAAATTCTAGTTCATTTTCAAGGTTTACAGAACTTAATAAATTTTATAGCAATTTGATCATTTAATTAACCAAACACTTGTAGCTTCTAATTCTATTTATCATTTTAAATACCACATTCATAATTTGAGCATGTTTTACAATTCAGGCTTCTTTTGGCAACGATGCAAGCTCTGATTCAGTTGTCACAGCACCCCAAAATCCTCTAAGGGATGCAAATAATCCTGCTGGGTAAAGTCTATAGTCATATTTTTAGTTCCTCCCTATTGTTATTTTACTAAGTGCATGATTGATACAAGTTGTGCTATACTTTGTTTTGACAGACTTCTCTCCATTGCTGAAGAGACCTTGGCGGAGTTCCTCTCAAAGGCTACAGGGACTGCTGTCGATTGGGTCCAGATGCCCGGGATGAAGGTACATTTTATAGCTAATTTTTCAAAATGTGTTTTTAATTAATGATGAAAATTCCAAATAATAATAATAATAGTTAATTTTCCCATCCAGCCTGGTCCGGATTCAATTGGAATTGTTGCTATATCAGAAACATGCAGTGGAGTGGCAGCACGAGCCTGTGGTTTAGTGAGTTTAGAGCCTACAAAGGTAATTGATTATAAATCTATTCTCTACCGTCAATGGAATTAAATGTTTCAAAAAACAAATTATGATGTTGGTAAATGTTTAACAATGTAATCTGAACAACTGTGCTAAATTTAGATCTATTATTTTAGCGAATGGAATATTAATTACTTCTTTATGAAACAAAATATATGATGTAGATGACCATTTAGAATGTACTATAAAAATTTGTAATGTAGGTAATTATTAAGAATGTACTATAAACAATTTGTGATGTAGATAAATATTTAGAACGTACTATAAACAAAGTTGCCAATTTTGAATACATCCTCTATGTAGAATGGGGATACTAAGAACTTTAAGAAAGCGATTATGATATAAATTAATATCTATACTGTAACATTAACTAATTTGATATTTGTTAACAGATTGTTGAACTACTTAAAGATCGTCCATCCTGGTTCCGTGATTGCCGAAGCCTTGAAGTCTTCACCTTATTTCCAGCTGGAAATGGAGGTACAATTGAATTAGTTTATATGCAGGTCAGCACCAGTTTTAACCACCAATACTACCCATTATTTTTAAACAAGCATTATGATATGATTTGCTTTGATGTATATCATAAGATGTATGCACCAACTACGTTAGCTCCAGCGCGTGATCTCTGGACTCTTAGATACACAACTACTTTAGAAGATGGGAGCCTTGTGGTATATTTCACATATAATTTAGTGTTAAAACTTGGTTATTTATAAATTTCTGAATATTACAAGTAATTGAAATTTGAATTACAAGGTCTGTGAGAGGTCTCTCAGTGGTTCTGGAGGCGGTCCAAGTGTTGCTGCTAGTCATCAATTCGTAAGAGCTGAAATGCTTCCAAGTGGTTTCTTGATTCGTCCATGTGATGGTGGTGGTTCCATTGTACACATTGTTGATCACTTAAATCTAGAGGTTATAATCTATGCTAGTACTGATATTACTGGCTAAATACTACTACCTAGTCCATCTCTACATAAAATATTTGGTTTTTTAATGTATCAGGCATGGAGTGTGCCTGAAGTTCTAAGACCTCTTTACGAGTCTTCCAGGGTCGTTGCTGAGAAAATGACTACTGCAGTTAGTGTCAATATTTATCATTAACCTGTTAAATGATAAATGGCATACTGATTAACAAGTTTTTTATTCATTGTAGGCACTGCGGCATATCAAGCAAATAGCACAAGAGATTAGCGGTGAAGTGGTGTACACTCTTGGAAGGCAGCCTGCTGTTTTGCGTACCTTTAGTCAAAAATTGACCAGGTAATTCCTTGAATCTAAAAATAATAGAGGTATATATGATGATGCTAAATGATGAAGTATTTGCTATCTTTGCGTATTTTAGAGGTTTTAACGATGCTGTTAATGGATTCGTCGATGATGGATGGTCTGTTATGGGAAGTGTAGATGGTATTGAAGATGTAACAATTGCTACAAACTCTATGAAAAAGACCCTTAATAATGTCTCGATGCCTGATGGGGTGATTTGTGCTAAGGCGTCAATGCTACTTCAGGTAAGTCCTGCATAAAACTGTTAATTAATCAATATTTTGATCTTGAAGTTGTGTGCATAATCTTGTATTGCTAAGTCTAATCATTCCTTAGTAAGAGCATGTTTTACAACTATTTGTAACTCAGTTAAAATAACTTGTTAAGTTACCTATTATTATTATTATTATCCATATTTTTGCCAACAACTTATGAGGGGAGAGAATAAGTTGTTAAAAAATTTGTAAGTCATAAACAACATATGCTTGCTCACGACTTCAACTTTTAAACTAAAGTTCATTATAAATTTAACTTATCCAAATAATTTTATGTTTTTACTATTCATTTATAACTATCTAGAAGTTATTTTTCCAAACAACTTTTAATTAAAATTTCTTGTAAGCAATCATAAAATAAGTTGTTCCCAAACTTGCTCTCTAACTGAAAAACTGTTTTCCACTTTAGATGTATTATTGCCAGTGTTGACAATTTTTTTCCTAATAGAGTGTTCCTCCTGCATTGCTTGTTCGTTTTTTGAGGGAGCACCGATCAGAATGGGCTGATTACAATATGGATGCTTACTCCGCTTCTGCAATTAATTCAAGCTCAAATTTATTTCCTGGATTAAGGACAGAAAGGTTTTCTGGGAGCCACACAATTATGCCTATTGCCCATACCATTGAGAATGAAGAGGTACATACCGTCAAAAGTAAAATTTCTTTATTGATAATATATTTGCCTACAAGGCTAAGTATTATATGAGGAATGTCTTCCGTTGCTTTACTAGATAGTGTATTAGTCACTTCATCTTTTCTTGTTTGTATTTTTTGATATATTCGGTCTTTATTGTCGGCATGATCAATTTTGCAGTTTCTTGAGGTTGTTCGTCTCGAAAGCCAAACTCTCACTCCAGATGAAGTTATATTGACCAGGAATATTCATCTGCTACAGGTATTGTTCTTTGTTGTATACATTCCCGGACCCTGTTAATTCTAGTTTTCAGCACCTTGGTCCTTCAAAACTTTTAAGTCATATCAGTATCACTAAGAAAAGTTTGTCTTCAGCTTTGTAGTGGAATCGATGAAAATGCTGTTGGAGCTTGCTTCCAACTTGTATTTGCTCCAATCGATGAGCTTTTCCCAGACGATGTTCCTCTCCTTCCTTCTGGTTTCCGGGTTATTCCATTGGGGAGTAAATCAGTTAAGTATTTTATTTGTATGCCTATTTTATGATATATAGTGCAAACATTTTTTTTTCCAGTGACTTATCAAAGTTCTATGATTTTGATGCAGAAAGCTTCCAACCCTAACCCTACACTAGATCTAGCATCTAGTCTTGAAGTAGGATCTGCTACAAACAGAATCAATGGCGAAACATCTCCAAATGAATGCAACTCCCGATCAGTCTTGACTATAGCTTTTCAGTTCCCTTATCAATTTCACCTTCAAGAAAGTGTGGCTGCCATGGCTAGGCAGTATGTTCGAAGCATTGTATCCTCTGTGCAAAGAGTTTCTATGGCGATAACTCCTTCACCCTCTGGATGCATCTCAGGTGGCAGATTGCTTCCTGGATCTCCTGAAGCTGCAACTCTTGCTCGATGGATTTGTCACAGTTATAAGTATGTAAATTTTTAGTGTTTTTACTATTTTACGGTGTACCTGGTTTTGATCTCTACCTAAGTATGATCCATGCTTGTTCAGTTACCATTTGGGATTAGATTTGCTAAGATCCATTGATGACTCGGGAGAACAGTTGCTAAAACTTTTGTGGGATCATCATGACGCTATTTTGTGTTGTTCTATTAAGGTATGACTTGCATTTTCTTTGTATGTGAATAGGGATGTTTTGGCTCACAGTATTACAATTCTTCCATTAAAACAAGTATAAGATGCATCTCCGTTTTTATATTATTTTTGAAACTGATGTTAAAACTAATACTGTATTCTCTTCAAATCTATTATAATATTTCATTATATTTTATGAATGCTATATAAATGTTAAATCTAATGTTCTCAAATGCTGTCAGTGCAATTATTTGCAAGATAAATATATGAGTTGTGGATATTACCTTGTTACTCAGTTTAGATAATAAATATTCAAACATACATAGTATAAAAAAGTGAAAAAATAGCTATGATGAAGGTTGAATTATGAAGAACACTTATATTTTAAAAGGAAATACTAGTTGCGCAAATATTACATCTTTATTAATAGTTGGAATAGAAACACATAAATCTTTGGTCCGACCACGAATTTTCAAAAATGCATTTATATGCAAACAAAAGGTCTCGAATCCCATAAAGAACAAACATTAACGTCTATTTTTAAATAGAAATTTTGAAATATAAATAAAGTTACAAGTTCGAAATTTTATTTTCCCATAAAAAAATTTATAATTTTTTTACTTATATTTTTCAATTTATTTTTATACAAGCTATATATATGAGTTTTAAATTTGATTATCGTATAAGAATTTTTTATATGCACGTGCGTTGCACGTACCATAACATCTCATTGAAAATAAAAGCAACATGGTAGGTGGAGTAAATTTCACCTGTAAATATTTGAATTATCAGGTGCAACCAGTTTTTACATTTGCCAACCAATCCGGGCTTGATATGTTAGAAACGACACTAATTGGTTTACAAGACATCACTCTTGATAAGATTTTCGATGAGCCTGGAAAGAGGGCACTTTACTCTGACTTCACCAAGTTAATGGATCAGGTACATTTTCTACTTTATCATTGATTTTACAGATTTTGTATGCCATGTCTGCTGGAACCTCATTAGAAGTGGAATTTGAATGGGTTATTAGTCTATTTTTGCCCCTTCCTTTTCCAAAGTGGGCTTGACTAGTGGTCATTGCACTGCTAAAACTTTAATGCATAAAATAAGAAACAACAGTGGCCAACAACCAAGTCATCCATTCATTAAGAAGTGCAAACTATTTAAGAAATCAGTAATCAGTGTTTACCAAATATTCTAACTCAGTGGCGCAGAGATATGCATACCCTATGATGTAATACAAGTGCACCGCCCCACTGCTATTGTATTGATTAATCAACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGGCAGTAGTTTTAACAGTAATGCGACAGTGATACTGTTGAATGCACTGCATCAGATCGGATCAGATCATTAGTGCTTATTTAAAAATAAATTAAATTTTATCATGGTCTTGTTATTATATTTGTAGGGCTATTGCTACTTGCCAGGAGGCGTATGCATGTCAGGAATGGGGCGACATGCAACGTATGACCAAGCTGTTGCATGGAAAGTTATTGGTGAAGAGAACAGCACACACTGCCTTGCTTTTGCTTTCGTCAACTGGTCTTTCATTTGAACCTGTTTTCATTTTTCAATTTTTTGTAAAACTAAAAAAGGAAATGGTAAAATTTGTTTGTTCTTCTTTTTGAAAGTAGATGATGTATGGCATTGCTGTTGTGATCTTGCATGTTGGGTTTTGAGGTGAATGAGAAGTGACAGAGTTTTGAATGCTATT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	BAM08932.1	0.0e+00	class III homeobox-leucine zipper protein
Swissprot	A2Z8L4.2	0.0e+00	OsHox9
trEMBL	I0IUI3	0.0e+00	Class III homeobox-leucine zipper protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G60690.1	70.49	0.0	1223	IFL;IFL1;REV	Homeobox-leucine zipper family protein / lipid-binding START domain-containing protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC1G01714	AT5G60690.1	837	226	10	13	834	12	842	70.49	1223
AfisC1G01714	AT2G34710.1	841	248	11	18	834	18	852	66.94	1130
AfisC1G01714	AT1G52150.1	848	282	10	5	834	1	836	63.21	1097

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00046.26	Homeobox	Domain	27	84	58.3	4.3e-16
PF01852.16	START	Domain	164	372	160.3	3.6e-47
PF08670.8	MEKHLA	Domain	691	833	161.3	1.2e-47

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0008289	F	lipid binding
GO:0009880	P	embryonic pattern specification
GO:0008284	P	positive regulation of cell proliferation
GO:0009733	P	response to auxin
GO:0009845	P	seed germination
GO:0009913	P	epidermal cell differentiation
GO:0009944	P	polarity specification of adaxial/abaxial axis
GO:0009965	P	leaf morphogenesis
GO:0010067	P	procambium histogenesis
GO:0010072	P	primary shoot apical meristem specification
GO:0010075	P	regulation of meristem growth
GO:0010089	P	xylem development
GO:0045597	P	positive regulation of cell differentiation
GO:0048263	P	determination of dorsal identity
GO:0048364	P	root development
GO:0048497	P	maintenance of floral organ identity
GO:0048825	P	cotyledon development
GO:0080060	P	integument development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09338	HD-ZIP; homeobox-leucine zipper protein	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network