result

Gene information

Detail information of AfisC1G01783

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G01783	chr1	309821729	309839307	+

Sequences

CDS

>AfisC1G01783
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Protein

Gene

>AfisC1G01783
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Functional annotation

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nr	XP_020259863.1	1.2e-165	serine/threonine-protein kinase GRIK1-like
Swissprot	Q5HZ38.1	8.9e-126	SnRK1-activating protein kinase 1
trEMBL	A0A5P1EXE8	2.0e-162	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G60550.1	68.59	3e-127	451	ATSNAK1;GRIK2	geminivirus rep interacting kinase 2

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Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G01783	AT5G60550.1	312	96	1	73	382	80	391	68.59	3e-127	451
AfisC1G01783	AT3G45240.2	304	97	0	73	376	81	384	68.09	3e-123	438
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g499199.t1
Allium fistulosum	AfisC1G01783
Allium sativum	Asa7G02110.1
Arabidopsis thaliana	AT3G45240.1; AT3G45240.2; AT3G45240.3; AT5G60550.1
Oryza sativa	LOC_Os03g50330.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	101	361	198.0	1.6e-58

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0016049	P	cell growth
GO:0016020	C	membrane
GO:0009615	P	response to virus
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009628	P	response to abiotic stimulus
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0018107	P	peptidyl-threonine phosphorylation
GO:0033554	P	cellular response to stress
GO:0034645	P	cellular macromolecule biosynthetic process
GO:0044444	C	cytoplasmic part
GO:0044710	P	single-organism metabolic process
GO:0045860	P	positive regulation of protein kinase activity
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048731	P	system development
GO:0090304	P	nucleic acid metabolic process
GO:1901700	P	response to oxygen-containing compound

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network