result

Gene information

Detail information of AfisC1G01955

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G01955	chr1	338636800	338642987	-

Sequences

CDS

>AfisC1G01955
ATGGGCAATTCATGCCGTGGAACTTTAGGCAGCAAGAAATTTTATCCAGATTCTCCTGAAAATAAGTCAGTGTCACACAAACAAAAAAATAGCTCAAATCATTCCAATCACAACCAGATCGTTGAAACGCCAGCAAAATCAAACATGGAAGGGAAAAAAGCTGAAAGTCCCCGTGGTATATTGCGGCGAGGAATAGATCCAGGAGTCCATTCGGTTCTCGGCCATAAAACTCAGAATATTCGTGATATTTACACTTTAGGCAGAAAACTTGGGCAAGGTCAATTTGGCACGACATACTTATGTACTGAAAATGCAACTGGAATCGATTATGCATGTAAATCGATATCAAAAAGGAAGCTTCTTGCAAAAGACGACGTGGAGGATGTTAGGAGAGAGATTCAAATAATGCACCATCTTTCAGGGCATAAAAATGTGGTTCAGATAAAGGGTGCATATGAAGATCCTTTGTATGTACATATTGTTATGGAGTTGTGTGGAGGTGGTGAGTTGTTTGATAGGATTATTCAGAGAGGGCATTATAGTGAGAGAAGAGCAGCTGAAATCACAAAGATTATTGTTGGGGTTGTGGAGGCGTGTCATTCACTTGGTGTTATGCATAGGGATTTGAAGCCGGAGAATTTCTTGTTGGTTAACAAGGATGATGATTTGTCACTTAAGGCTATTGATTTTGGGCTGTCTGTATTCTTTAAGCCTGGTCAGGTTTTCACCGATGTAGTTGGGAGTCCATATTATGTTGCCCCTGAGGTATTATGCAAGTGTTATGGGCCAGAAGCTGACGTCTGGACTGCTGGCGTGATACTGTACATTTTATTGTGTGGTGTGCCTCCATTTTGGGCAGAAACCCAACAAGGAATATTCGATGCAGTATTGAAGGGTGTGATTGATTTTGATTCTGATCCATGGCCATTGATATCTGACAGCGCCAAAGATCTCATTAGAAAAATGCTTTGTTCTCGTCCTTCAGAACGATTGACTGCTCATCAAGTACTGTGTATGCATCTTCTGATAATTATCACACGATACCGAAATTCTTCAATTTCTTCAGTCCGTGTTTTAGCCCATCCCTGGGTCTGTGAAAACGGAGTTGCTCCTGACCAAGCTTTGGACCCAGCAGTCCTCTCCCGTCTCAAACAATTTTCGGCAATGAATAAGTTGAAAAAAATGGCCTTAAGAGTGATAGCTGAAAGCCTTTCTGAAGAGGAAATTGCTGGATTAAGAGAAATGTTCACAGCAATGGACACTGACAACAGCGGTGCAATTACATTTGACGAGCTCAAGGATGGTCTCAGAAGATATGGTTCTACACTGAAAGATACAGAAATACGTGACCTCATGGAAGCAGCTGATGTTGACAACAGTGGTACTATTGATTATGGAGAATTTATTGCTGCAACTGTACACCTCAACAAACTGGAGCGGGAAGAGCATTTGGCAGCTGCTTTTAGATATTTTGACAAGGATGGAAGTGGATATATAACAGTTGATGAGCTTCAACAAGCTTGCAAGGAGCAAAATATGGAAGATGTTCTTCTTGAGGATGTTATTAAGGAAGTTGATCAAGATAATGATGGAAGAATTGACTATGGGGAATTTGTTGCAATGATGCAAAAGGGGAACATGGGAATTGGAAGAAGAACCATGAGAAACAGTCTAAATATAAGCATGAGGGATGCACCAGGCGCCCATTCAAATCATTAA

Protein

Gene

>AfisC1G01955
ATTGGAGATGGCCTAATGTAGTTGTTCCTGTGCTTTTAATTCATCCAATCATTCTCAAATCAAAGGTCCAGCCTATTAGAATATTTTCGTTTAATAATTCACGTTGATACAACAACTTTATTAATTGGTCAGCGACCTTTTTAAATAATCACTAATTAATCTTTAATAAATTGATTGAGCTGAAATTTCCAAGAACCGCGTTATATCACAATTTTTTAATACATCGATCAGACATTAAAATATAGTCAATTGATTGCTGAAGAAAATTACAGTCAGATGCAGTTTGATTGATGGCTTCATTTTGGTTTGCATCATTTTGATTATCGTAGTTGATTCAGATCCCAGTGTTCTAGATATTCGTGGGTTTGATTCACTTTGAAAACCTAGATCCCCAAATTCGAGAATCCTTGCATATCAGGAATCAGTCTTGCCTTCCAAATCAAGGATCCACGCAGAGTATCAAATTTTTGCGTTTCCAGCAAAAAAGGCATTATCTTTATCATTTCTTGATTTTTTTTTTCATTTTGGATGGATTTGAGCTGAAATATTTTTAAATGAGATAGTAATCTTTCATGGGCAATTCATGCCGTGGAACTTTAGGCAGCAAGAAATTTTATCCAGATTCTCCTGAAAATAAGTCAGTGTCACACAAACAAAAAAATAGCTCAAATCATTCCAATCACAACCAGATCGTTGAAACGCCAGCAAAATCAAACATGGAAGGGAAAAAAGCTGAAAGTCCCCGTGGTATATTGCGGCGAGGAATAGATCCAGGAGTCCATTCGGTTCTCGGCCATAAAACTCAGAATATTCGTGATATTTACACTTTAGGCAGAAAACTTGGGCAAGGTCAATTTGGCACGACATACTTATGTACTGAAAATGCAACTGGAATCGATTATGCATGTAAATCGATATCAAAAAGGAAGCTTCTTGCAAAAGACGACGTGGAGGATGTTAGGAGAGAGATTCAAATAATGCACCATCTTTCAGGGCATAAAAATGTGGTTCAGATAAAGGGTGCATATGAAGATCCTTTGTATGTACATATTGTTATGGAGTTGTGTGGAGGTGGTGAGTTGTTTGATAGGATTATTCAGAGAGGGCATTATAGTGAGAGAAGAGCAGCTGAAATCACAAAGATTATTGTTGGGGTTGTGGAGGCGTGTCATTCACTTGGTGTTATGCATAGGGATTTGAAGCCGGAGAATTTCTTGTTGGTTAACAAGGATGATGATTTGTCACTTAAGGCTATTGATTTTGGGCTGTCTGTATTCTTTAAGCCTGGTAAGTGATAGCTTTTAAATAGATGTTGGATATGACACTGGTTGGTGTTGCCAAAAATAACATTAGTTCATTAGTGTTGGATGCCAAATATATGATAAAAGTGCAACTTACTGATATGCATACATAAGATTTTGGATTTAACATTTTGGGAATGGTTGTGCTAATCTATTAAGAATTACATCTGACACGTTGAAGAATTATAAACATGATGTGGGAAAATGTAAGCACAATGATTACTTCATCTTGGTTGTTTCTATAAAATGCAGTTAATTATGTGTACTCGGCTTAAGTCTATATTAGATGAGAATATTAGACAAACAAACATGTATTAGTGTATTGTTATTTAGATGTTTAGCAATGGAAAGTGATTGTTCATTGAACATTATGTTACACATGTTTTGGTTTATGATTTATGTAGTAGATAGAAATTTTTTTTTCCCCTTGCTACAAGTCTAGGACGCAACTAATAATTAGTTGTACAAAAAAACATATTTCTGATTCTCTAGCAGTTAAATATGACATATGTTGCCTTCCATGCACATGTTCACCCAGCTGCATTTGAAGCAATTAGATAACACATTATGGTATACATTAATTTACGTGCAATCGAAGCATTTATGACTTACTCCTTCAGCTGAAGTGGTGTCCTCTCTCTCCAGCACTTGTTCGTGCAGCGAAAGATAAATCCTCTTTCTGCTTTCTTCCACCAACAGGAAAAGCACATATTTTTGTTTAAGCATATTTTAGCAATATAAGCATTATTTTGGGTATAAGATTCATAAAATAGATACATAATTATGATTCACTTCCATGTAAATATTAGCTTAAATGTTACGTCACATTTTTTTCTGCATTCCATCAATGTTCTGTACCTTTTTTCACCTCAAGTTTATGTAATATTTTTCTTGTATTTACATTCTGTTTTGGTACAAGTGTTGTGCTTTGCTATCATTATGGTTGTTGGTATCGGTATGCATTTTCTCACATCCATCTGGCTGTAATGAAATTCAGGTCAGGTTTTCACCGATGTAGTTGGGAGTCCATATTATGTTGCCCCTGAGGTATTATGCAAGTGTTATGGGCCAGAAGCTGACGTCTGGACTGCTGGCGTGATACTGTACATTTTATTGTGTGGTGTGCCTCCATTTTGGGCAGGTGCAACTTTATTTGTCCAATTATATTTATATGCAGCTAAATTTCATAAAACAGTTCAGGCAATGGATTAAGTAATTTAACTATTTCTTTTATCAGAAACCCAACAAGGAATATTCGATGCAGTATTGAAGGGTGTGATTGATTTTGATTCTGATCCATGGCCATTGATATCTGACAGCGCCAAAGATCTCATTAGAAAAATGCTTTGTTCTCGTCCTTCAGAACGATTGACTGCTCATCAAGTACTGTGTATGCATCTTCTGATAATTATCACACGATACCGAAATTCTTCAATTTCTTCAGTCCGTGTTTTAGGTTTATCTTACAAGTCCGAGTAGCTCTTATAGTTATGTCATCTCACAACCTCTATTTGAGCATGTCTTAATTTCTTGATCTACAGTTTTCTAGTATGGAACATAAGGTTGTCATTCTATCATGTACACAACTTCAACTAGGGGCTTTGCACAACAGGTCCCTATTTTTGATGTTGTTACAGGAAAAATCCATGTAGCAATGAGTATATAAATTAGGTCTCTGTTTTTTCTAAATTAGAAAACGCAAACTAGTTTGCAGTTTCTTGATAGAAAGTGCAAGTTAACTTGCTTTTTTCAAAAATTTCAAAAAATTTTAAAAAAATTCGAAATAAAAAAAACTGCAAGTTATCTTGCATTTTCTGTCAGAAAAGTGCAAGACACTTCGCATTTTCTATTTTTCAAAAATAGGGACCAAATTTACATATTCATTTATGCAGGGATTTTTCTTATAACAACATCAAAATCAAAGACCTGTGGCTCTTTTCTTGCTTTAACTATGTTTTACAAGGGTTGAAATTACCTTGTTCGAAATACTCCTGTCCCGGTGCCCAGCCAATCACCGCAGATAGTTTTTTACAAAAAAACACACACCCTCTCACTCCTGGTGAAGGGGTTTTTGGCAAAATTTATAAAAAACTCTGTGCGGTGATTGGCTGGGCACACCGGGACATGGGCATTTGGGATCAGGTTATTTCAACCCGTTTTACAAGGTAGATGCATAAACATAAATTTACTCGATGCCCATGCAAAATTTTGGTATATGTTTAATGTCTTATTCTAGTTATCAGCTATCAAATCATCAATAAGCCCTTTAACCTTGAATAATTATCATTATGCTTTAATAACTTGCCAGCAACATGATATTTTGTCTCAACAATTTGATTACTATGTTAGTTTTGTTCTGTCTTGAGAAATTAATTATACTAAATAAAAAATATGTCAAGTTTTTCTTTGTATCTTCTTGTGTCCATTGTTTTCTGACTGGTGACCCATATGTATGACATCAATGCACTTATAATCCGTTCCATCAAAAACAACTATATTCTTCAAAATAACTTACTGAACAAATAGTTTAAATGTACAAACACCCACTACCTAGCGTGATTGAATTAAACTTTTGCACTATTATTGTCAATAGTGAACTCTTATTCGTAATAGTTCAGGTTAGATATCCAGTTTCATAGTTATTTTCTTGACAATATTTCTTGTCCTTGCTCAGCCCATCCCTGGGTCTGTGAAAACGGAGTTGCTCCTGACCAAGCTTTGGACCCAGCAGTCCTCTCCCGTCTCAAACAATTTTCGGCAATGAATAAGTTGAAAAAAATGGCCTTAAGAGTAAGCAATTTTCTTCTTCTAGAATTTGTTGCCATACTTCGTAACTCTATGAAGCTTTTAATTAGGCAATTGACAGCTGCACCAATTTTTTTCCTCTGGCTCTCAGAGCAAAGTGATGTGCGCTATTTGTTGTTTATCTTGTCTATATTTTATAGGTGATAGCTGAAAGCCTTTCTGAAGAGGAAATTGCTGGATTAAGAGAAATGTTCACAGCAATGGACACTGACAACAGCGGTGCAATTACATTTGACGAGCTCAAGGATGGTCTCAGAAGATATGGTTCTACACTGAAAGATACAGAAATACGTGACCTCATGGAAGCAGTAAGTGTACCCTGCTAGAAAAATATAACACTCATTGCATAGTTGCATTTATGTGGAGTAGCAGTGTAGCATTAGGTTATATGATATGCTGTACTCCTGTGCAGCTCTTCTATTTTATTTTTCCATTTCTTTCTTTTTTTATATGTTAAGAGATGGTTTAGTTACTTTATAACTACTTTCAAGGCACATGCTCATGTTTGCCTGCCTGCGTCGTGTAAGTTTAGCTTTAGGCAGTTGCTTAGTGTAGTTAGTTGACCCTAAATCCTCCTTTTATGAGTGTGATCTTTTGACTACATGATAAAGGCAATTAAAAAAGATTCTTGTTTGAGTGAAAAGGTTTTTATGCATATGACTTTATTAAATTTTTTAGCACTGACTAGATGAATTGTGTTAGGCTGATGTTGACAACAGTGGTACTATTGATTATGGAGAATTTATTGCTGCAACTGTACACCTCAACAAACTGGAGCGGGAAGAGCATTTGGCAGCTGCTTTTAGATATTTTGACAAGGATGGAAGTGGATATATAACAGTTGATGAGCTTCAACAAGCTTGCAAGGAGCAAAATATGGAAGATGTTCTTCTTGAGGATGTTATTAAGGAAGTTGATCAAGATAATGTAAGTGCAACCAATTTTATACCCAGTACCCATTTCAAACTCTAAGACTGCTGCATTTTTACATGTATTAATGTTTACATAATATACATACATATCATCAACCTAAGAGAGGAGTTCAAGTCAAAATAGCCGTTCTTGAAAATGATCTATTTGGATTAAATTTTTATTTGTTTACAGAAAACTGGGAAGGCATGGGCATTTCATTTTCAGTGAAGACAATCTGATTAGTTTTCGTTGGTTGTGGTTGTCCTAAACGTAATTTCTTTTATAAGGTTAATGTTAATTTCCGGTGACGACCCTCCTAAACATTTGCATATTGAAAGAATTTTTGGATTAGGTTCTAATTTTACTTGGCATAAAAATAATATTGTAATATAACTTTGAAAAGCAAATATTATGTTAAGATTAATAAAATAGGATATCATGAGCTTAAAATATTTTATCATGTGTGCTAGGTTACCTAATATTCCAAACAGCCCATAAACATTAATTGATTACTAAGTCCATTAGGTACCATTTTAATAAAAAACAATTATAAGATATCATAATTTTGTTCTTCAACTGCAACTTTTTATGTTTATTCGTAGCACATTAAAAATTTACAAATGCTTCAACCACTTCAGCTGGTAATAAATATTCATAATTCTTCGTAAAAGCATTGAATAAAAATATACTTTGTGAATAACCCATACCGTGGTTTCCAAAAAATTAAACTTGTACTAAGGTCAGGTGATTTGGACATAGTTTTGTCAATGCACATATGTTAGTATGGCGTCTTAAAAAAAGTTTAACGGTTAATTACTTGAAAATGATGTCGCAGGATGGAAGAATTGACTATGGGGAATTTGTTGCAATGATGCAAAAGGGGAACATGGGAATTGGAAGAAGAACCATGAGAAACAGTCTAAATATAAGCATGAGGGATGCACCAGGCGCCCATTCAAATCATTAATTAATCTGTACATGTTGAAACCAGAATTATTTGCTTTATATTTATGTTGTTCTTAACCATTCTCTCCCCATTTTCAATTAGGGTTGTGAAATGTGTGCGAAACCAAGTACTTCATCTAATTTTATTTGGTTATTAACTAGAGAATGTGTAAGTTATGTTGTACAGCTATTGCGTTTACTGTTGAGTGAATTGGTGATTTATCA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020260122.1	5.6e-233	calcium-dependent protein kinase 26-like
Swissprot	Q38872.1	1.6e-211	Calmodulin-domain protein kinase CDPK isoform 6
trEMBL	A0A834ZJR6	6.1e-221	Calcium-dependent protein kinase 26-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G17290.1	76.88	0.0	893	ATCDPK3;ATCPK6;CPK6	Calcium-dependent protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC1G01955	AT2G17290.1	571	97	3	1	564	1	543	76.88	893
AfisC1G01955	AT4G35310.1	579	101	5	1	565	1	556	76.17	884
AfisC1G01955	AT4G38230.2	493	59	2	72	564	42	509	82.96	848

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	84	339	234.4	1.3e-69
PF13499.3	EF-hand_7	Domain	412	471	42.5	6e-11
PF13499.3	EF-hand_7	Domain	482	543	48.5	7.9e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005509	F	calcium ion binding
GO:0005739	C	mitochondrion
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004683	F	calmodulin-dependent protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005777	C	peroxisome
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005516	F	calmodulin binding
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005789	C	endoplasmic reticulum membrane
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009931	F	calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity
GO:0010359	P	regulation of anion channel activity
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0019252	P	starch biosynthetic process
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:1902456	P	regulation of stomatal opening

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13412	CPK; calcium-dependent protein kinase	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network