result

Gene information

Detail information of AfisC1G02577

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G02577	chr1	475471238	475482085	+

Sequences

CDS

>AfisC1G02577
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Protein

Gene

>AfisC1G02577
GTCTTAATTCTTTACAAAAAAAATGGGAGCTTGCATTTCCTACGCGTCACAAAGATTTCTGGAATCGATCAACAAAACAAGCAACTCTAACGATGTTAAAACCATAAAGAAGTCGCGAATAGGTTATGGAAAAAGAATCGATTTCGGCTATGATAATGATTTTCATAGCAGGTATCTGATTGGGAAACTGTTAGGTCAGGGGCAGTTTGGACTTACTTTTGTTGCCATTGATAAGGAGACTGGAGATCGAGTGGCTGTTAAAAGGATCGATAAAAGCAAGGTATCTTTTTTCTTTTATCAAATTATTTATTTAATTATTCATTTTGAAATCATGTATTTGATTTTATGGAGTATTTCTATCTATCTATTACGGTGCATTGTAGTATTTTTAGGTCTGTTGCAGGAAAATCTGGTACTTATTTCCTTTCAGCTTTCAATCCACACACAACCTGTATTATATACTAGAAGAACAGACAATAGTTTCATTTTATAATGTGACACTCCTTGGCGATGTAAGATCACACTGGCTACGCTGTCCATGTGAATATGCACAACGTAAGTGCTAAGGGCAAATCATCAAATTTTACAAGCAAAAGCTTCAGAGGGAGTAAATTTTGGTTTTAGCTGGGATAACTATACTTTACTGAAAGGAAAATTTGTCTATATAGGCCACATTTTGAAAAAAAACAATATAATAACAAAAATAGGTCTGTATCGAAAGTATTTCTTGTGATTTACTTAAAGGATGTGTTGTGGGTTCGATGCATACTTCCTTAGAGTTTACAAGCAAAACTTGGTTCTTTATATCTTCAAAAAATAAAAAATAAAAAAATAAATAATAGGGGGAATTAATTTAAAGGACAAAAATTTGTATATTTTTAGCCTTAAGGATACGATCTCAATATTTTAACACAAGAACAAACATTCTTCTAAAAATTATTCATAAGAACAAACATTCTTCCAAAATTATTCATAAGGACAAACATTCTTCCAAAACTGCTACCGAACTAAAAACTATACCTAAAAACTGTTACCGATAACTACAAACTGATAAAACTGCTATCAATAGCTAAAAACTGATACCTAAAGAAAGTTATCCTTCAAGTTAGAATACTGAAGGTCTGTCCTTGAGGATAAAACGTTGAGAAATTTTGTCCTTGGTAATAATTTCCTGTAAATAATAATTGTTTCAAAAATGAGAAATGTGGAAAAAAAAATTGCATAAATATTGTAAAGGCGATTTTTGAAAAATCAACTATGGGCAATCTTTCAAAAGTCGCCTTCATCCTATTTTCAGTAAAACGCCGACGTGTCAAAACATGTCTATTCTTGTAAATACTTTCAAAACAAACCTATATTTGTTATTTTTTTCAAAATGTGGTCTGTATGGGCAAATTTTTTTTACTGAAATTAGGATAAGGGACAAAAATAGAAGACACCTGAATTCCATCTAACTCAATGGGGACGCCCGAAACGTTGGCAGTTGCAGTAATCAATTATGCCTCTCATAATTCTAAATTAAGTTTCGGTAAATCTTGAGCTAAACAAGTGTAGTTTTTTCACTTAGAGCATCTCTAGCAGTAGGGGTTTGGTGGAAAATGGGGAGAACTCCCTCTTTTTTTGGGCTTCCTCACGCTTCAACAGCGTCGATTTGGGCGTGAGAAAGAAGAAAAAATGGGAGTTTTTTCTATTTTAATTTTTTGAGTGTGGATTCTTAAACGGTTTTTTGAAAACCGTTTATGCCCTAAATGGTTTTTAGAAAGCCGTTTAAGAAGAAAATAGGATTTCTGAAGTCCGTTTGACTCTATGAACGGTGTTCATAACACCGTTTATAATTTTTTTTTCCTTTTTCTAGAAAGGCACAATTCCTCCCACTCGCCGTTGGAAGAGTGGGAGGAATTCACGATTTTTTTTCTCTCCTCCTCCTAAAATTAGCCACCGTGTTGGAGATGCTCTTAGTATTCTTTCACAATCCCTTCTCTAAAGCAAATTTATTAAAAAATAAACCATTTCCCTTGAGAAAGGACAAACTCGTCTTTCAGCTTGCATGTCTGATTAATGTATGCTTTCAAGTGCATATATTACAGCCTATCACCTACCACATACAACGCAATAAAACTACACTTTATGGATGTTTTTTCGATACATACCTCTGGAAATGAAAGTCCTCTTGTTACCCACCATTTTTTGGTTCTATGTATTTTAGTTTTTGTTTCTTCTCCACCATAGATTTTAGATTCAAACCAAGATGTACATCCCTCCACCTCATAGTTTTCTTCTCACCATTTGTTATTACGTTATCGATGTTCCCAATATCTGTATTTCTAGCATCCTCACCACTCAACTTAGTACAACTTGAAGTAGACTCAGGTTTACATCCATCAATGCAAAATTTCCAACAACTGCTCTTTTCTATTGGGAATTGTTCCTTGCATTAACACCATTTCTTTCCATTAGCCTATTATTTTCAAAATTGTCAACTGATTTCATCGTGTCAGGATTAGACACCCTTACTTGTGAACCATGATTGTCAGACTCACCCTTATTCTTTCCTAACTGTTTACCAATTGATGCACTCCATCTCTGACAAGAGCCTCCTCTCTTGACTTCAGCTTGGCCTCTATTTCCATTTCAGTCTCCAAATTACCAAATTTCTCATCTTCCTCAGGCATGTCAGTCACCTCAAAACCCATTGCTTTCATATCTTCAACACAGCCAACTTCTCCTATATCATATTCTAAGTTATCTTCTACCAACCGAAATACGTTCCCTTTCGAATAGACTTCCTTCCTAACCCTCTGGGTCAGCCCTCGAATCCACCGAAACCCTAACCAAGAAAACGTGTCAGGAGGTGAAGGAGGAGAGATGCATGGGGAATCATATTAAATTTTGAAAACATGCTCAAACTTCAAATCATTTTTAAGATCATTTCTACAAAATTTGGTTCTTTGAGTATTCAAGCACAATGAAGTGATGTTTCAAAGCAAACATTGAAATAGATGTTATGATAGTTGATTATTGACTTACGATATATAAAGGACTGGAAATTTTGAAATGTTTTAAATTCTTTCCGGAGATGATTGTTATAATATGTATTAAACATCTTTAATAAATTTGAAATAGCTAACTCAATGCATGAAAAGAGTGCTAAAGGAGTACTATAAAAGACCAGTGTCATGAAACCTTCAACTATATATACAAATCAGGTACAAAAGTTACACTTGCAGCATATAACTTTCCAAGGGTTAACATGATGAACACAGGGCATCCTATACAATCAAAAAGCTGTATTGCCTCTGCGCTGTGTCTTTCATAAAATTCTTCCATGCAGTTAAAATCAAGGTTTATGAACTTGGTTTTGGTGCTTATAAATTTCATCTTTTTTAGCCATTCAGTTTCTCTGATGTTATATGGACCCATACTTCTGTTCTATCAATTTTTATAGTGCCTTCCTTTTGTGTTGGTGAGCATGATTTGAAAAATTGGATGAAATTTAGTAGCCATTTATAAATCAACGGTCAATATAACCCAGAATCTTATTGTGAACTATTTGTTTTATATTATACTGATTATATAGGACGTACGCATTTTTAATTCAGAGTGTAAAAGCTTGTTTCCTCGTAAAGTGAAATGGATATCATCTAATAAGAAAGGGCATCCAAAAACATGACCTGAGATGTTTTCTCATAACCTCATAGGTACATGTTCTAAGTGAAAAATATGTTAATAACTGAAATTTATCCTTGCTATTGTGTCCAGTTGAGCTGTGATACAGGATCTCAACACTAATATATGATTTGTTTATTTTTGACAGATGACCAATGCTATTGCTGTGGACGCCGTGAAGCGTGAAGTAAAAATATTGCAAACTCTGAGAGGACATAAGAATATTGTTTTTTTTCATAATGCATTTGAAGATGATGACTATGTATACATCGTGATGGAGTAGGTCACCATTGAAACTAAGAGTGACTTTTAGCAAATATTGACACCGTCATGTGGCCTGACCTGTATATATATGCAAATTTAATCAGAGGTGCATGCACACAGAGTTACAGATACAAACGCGCACACACACGCACACACATGCACACACATTCATGCACATGCAAACACACACATACTTACCCCTTGAACCATGGTTCGAGATTCCGGCGTGGCCGGCACGCCGAAATTCCAACCATCCCGGTCCGGTTCCGGAGTCCACCAGACCGGAACTCGGCAAAAGTTCCGATTTCGGATCCAAAGAGAGAAAAAAAAGTAGATCTGTAATTGCCTAGAAAAATGCGGCAACATCAAAGATTGAACAAGAGAAGGTAGTGGTATCCGCGTACAACAGCGATGAAAAAAGAGGGAATATTAATTGACTTAGGTTTCTTTAGGTTTAGCAACAAGGACGAGGAATCAAATGATGATTCGGGAGCAAATTTTTTTACTCAAGGCTTCGTATTTTTTTTCTAGGGTTTGAATTGGGCTATTTTTGATTGGGCTTGCTAGGTTTTATTGACATTGAGCCGTAACTTTAAGATATAATTTTAGGGCTTGTTTTATTCTTTAAATCGGGCTTCTTAATTTCAGTTATAATCATATATAAACCCACTTTCAATATAATTGTTAGGTTATAACCACAACTATAAAAATTTATGTTGTTTATTTGTGTATTTATTGTAAAAAAATGTTTTAATAAGTAATAAAATCCGGAAGGGAATTAAAACGGAATTTCTGAAATTTTCAAAGTGGAAACGAAACATTGAAAATTTTGAAGGACCGGAGTGGAATTGAAAATTGGAATTTTGAACCTTGCTTTGAACATCATATTCCACCATTAGAAATGCAAACTATGTCATTTTTTTCAAAATCAAGTTGAAATACATGTCTTGTATTAATCCAGTAATCAGTTCTAGAAATAACACAGGGAAGTGCGAAAACAAACATTTGCAGTTTTTGTGCACTAGGTGGAGTTTACAGCACTATTTCTTCACATATTTTAAGTGAATGAA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020260857.1	1.1e-173	LOW QUALITY PROTEIN: calcium-dependent protein kinase 18-like
Swissprot	Q0D715.1	6.5e-171	OsCDPK5
trEMBL	A0A5A7RDZ1	1.4e-173	Calcium-dependent protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G17890.1	75.70	0.0	684	CPK16	calcium-dependent protein kinase 16

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC1G02577	AT2G17890.1	428	104	0	33	460	90	517	75.70	684
AfisC1G02577	AT5G66210.1	471	129	3	1	460	1	471	70.28	683
AfisC1G02577	AT5G66210.2	471	129	3	1	460	1	471	70.28	683

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	53	311	241.5	8.7e-72
PF13499.3	EF-hand_7	Domain	358	420	42.4	6.2e-11
PF13202.3	EF-hand_5	Domain	440	459	18.3	0.001

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005509	F	calcium ion binding
GO:0003779	F	actin binding
GO:0005773	C	vacuole
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004683	F	calmodulin-dependent protein kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005516	F	calmodulin binding
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005885	C	Arp2/3 protein complex
GO:0030041	P	actin filament polymerization
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009825	P	multidimensional cell growth
GO:0009931	F	calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity
GO:0010090	P	trichome morphogenesis
GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0010150	P	leaf senescence
GO:0010286	P	heat acclimation
GO:0010359	P	regulation of anion channel activity
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0080092	P	regulation of pollen tube growth

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13412	CPK; calcium-dependent protein kinase	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network