result

Gene information

Detail information of AfisC1G02685

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G02685	chr1	495895510	495900094	-

Sequences

CDS

>AfisC1G02685
ATGAATCTAATTATCATTCTACTCTTTCTTTCTTTCCCAATTCTTTTGTTTTCTCAAAACCAGACAAATTTACCGTGTCCATTAGATTTTTCAGTGTTGAACAAATTCATATCTGCTGCTAAAGAAAATCGATCACTGTTACCAAATGACACTCCTACTTTGTGTCAATACGCTTTAGGAGCTTTGCATCTTGTAGAATCTAAATTCTTGAAAACCAACAGTTTGTTTTATCCTCCTTTAAATTCTTCTTCTTCATGTTGGAATAATTTCCAGAACATAATTGCTCCTTTCTTCCCCCCACCTTTTAATTTGCTTAGAGATTGTGGGTTTCAAGCAAACTGGATTTCTCAAGGATGCATGAACATTTCAACCCGCTCCGATTTCGAGAAGATTGTACCACAATCTGCAATACAAGACATGAACCGAAACTGCAACCAATCACTAGGAAGCTCAGCATTTTCATCACAGTGCACTGCATGTTCTACAAGCTTAATTCGTGCCAAGTCTTATCTTCCTGGCCCTGATATTGGTAATGTCACTCAATGCACAAACTATCCTTCTATGTATGCTGCTGGATTACTCAATCGATTTGGCCCCGACGACAATGATACTGCCTTATGTCTATTCTTACTGAAAACCCAGTCTGATATAGACAATAATAACAATGGTGGTGGTTTTCAGAATTGGATAATTGGAGTTATTGTTGGCAGCATTTTGTTATTGGTGTTGATTGGGTTATCAGTTTGGTATCTAATAAGAAAAAGGGAAGATAGAAACAGGAGGTTGAAGAGAACAAAAGCCACAGATACAAAATCACAAGCTTTAGAATCGATCAGCGCTAGCACCACTTTAGTTAAATACAGTTTCGAGGAGATTAGAGCTGCCACTAAAAAATTTTCTAGGGACAACATTATAGGAAAAGGAGGATATGGGAATGTGTATAAAGGGAAACTAAGAGATGGATCAGAAGTTGCATTAAAAAGATTCAAAAACTGTTCAGCTGCTGGAGACGAGAGCTTTGCTCACGAAGTTGAAGTAATTGCAAGTGTAAGGCACGTAAACTTAGTTGCATTGAGAGGATATTGTACTGCCACAACTCAAATGGAAGGGCATCAAAGGATCATAGTATGTGATTTGATGAAGAATGGAAGTTTGCATGACCATTTATTTAGTTCTGAAGGAAAGAAGCTAAGTTGGCCTATAAGGCAAAGAATAGCGATAGGGACAGCAAGAGGGTTAGCGTACCTACATTATGGGGCACAACCAGCTATACTTCATAGAGATATAAAAGCAAGTAATATATTACTGGATGATATGTTTGAACCTAAGGTAGCAGATTTTGGACTAGCTAGGTTTGCACCTGAGGGTATGTCTCATGTTAGTACTAGAGTGGCAGGTACTTTAGGGTACGTCGCACCCGAATATGCACTGTATGGGCAGTTAACTGAGAAAAGCGATGTGTACAGTTTTGGGGTGGTTATGCTTGAGCTTTTAAGTGGGAAAAAAGCTTTTTTATCTTCTGAAAATGGGCAGAATGTGCTTCTAACTGACTGGGCTTGGTCATTGGTGAGGGCAGGAAAGCCTTTAGATGTGATTGAAGATGGAATAGATGAAATGGGGCCTAGAGAGATTATGGAGAAATATGTACTTATTGGTGTATTGTCCTCTCATCCTCAGTTACATGCAAGGCCCACTATGGATCAGATATTGAAAATGATGGAGTCTGATTCTTTAAGTGTTAGTAGTATTCCAGATCGACCTTTGCCTCTTGTAGCAAATTTGGAAGAGATTGAAAGATCGATTAGTAGCAACGGGTCGGGGCAATTGTCCAGCAGTGTTTCTGGGTTTCAGTCGTTTGGTGGTGGAAATGAAGTTGAGGTTCTAATTGATAGAACCGAGGCAGATATTCTTGTGGGTCGTAATGAATCTGAACCTAGTACGCCTGATTAA

Protein

Gene

>AfisC1G02685
AATCAACAAACCTGTAGCAAGAAGCAAAACTCAAAACAAGATCTCTACTTTCTACCTTCTTCTTCTCTCAACTATCAACTAAACCCAACTGCTTTGGAAAAAGAAAAGACAATAACATTCCTACCGACCAACCCGTCAAAATTTGAGCATCATCTTCAAAGCAAGTGAAATTCACTAAAACTATGAATCTAATTATCATTCTACTCTTTCTTTCTTTCCCAATTCTTTTGTTTTCTCAAAACCAGACAAATTTACCGTGTCCATTAGATTTTTCAGTGTTGAACAAATTCATATCTGCTGCTAAAGAAAATCGATCACTGTTACCAAATGACACTCCTACTTTGTGTCAATACGCTTTAGGAGCTTTGCATCTTGTAGAATCTAAATTCTTGAAAACCAACAGTTTGTTTTATCCTCCTTTAAATTCTTCTTCTTCATGTTGGAATAATTTCCAGAACATAATTGCTCCTTTCTTCCCCCCACCTTTTAATTTGCTTAGAGATTGTGGGTTTCAAGCAAACTGGATTTCTCAAGGATGCATGAACATTTCAACCCGCTCCGATTTCGAGAAGGTACAATTGCCGATTTTCAGTTTATCTGTTTAAGTTTTGATTTGAACTATGTATGTTTGATGTTGCAGTTAATATTTGTTAAAGGGCACTTGACCATAAATTATTTTAACCCAGGGGTTGTTGTGTTTCTGCCTAATGTTTATTATGCATTTGGGATGTCTATAATAAGCACTCAATAATGGCACTTGACATAGATGGCACAACAGTTTGGTCCAATTGTTATCTGCCAGATAGAATATATATTGCCTATACTAGGAGAGGAGGTTCACATATTGCACTACTTACGCGCAATGCCCAAAAGGTTAAACCATTTAGCTGCTAAAGGTCAAGTCATAAAATGGAAATCATGGTTAAGTTAACTTTATTGAAAGCACATGCCTAAATTGTTATCATTTGTTTCTAGTCTTTAACCTGCTCTCTTGGTGTGTAGGTAGAATAATGGCAACCTATTATATCATTCTTATTAAAAGAATCAGGTAGAAGCTGAGACATATGTAGGTATCTTATGCTTCTTTGTACACTCCTAACTTATTGCAAGCAGATTACAGAAAAAACATCTTAGTATAATCATAATTCTATTTTTGAAGTAGACATGTAGCCTACTTAACCTGCACTTCCACTTATGCAATATTAAATTTTGCCTTTTCTTAATCAACTACTTTTGGTAACTCTTAACAGATTGTACCACAATCTGCAATACAAGACATGAACCGAAACTGCAACCAATCACTAGGAAGCTCAGCATTTTCATCACAGTGCACTGCATGTTCTACAAGCTTAATTCGTGCCAAGTCTTATCTTCCTGGCCCTGATATTGGTAATGTCACTCAATGCACAAACTATCCTTCTATGTATGCTGCTGGATTACTCAATCGATTTGGCCCCGACGACAATGATACTGCCTTATGTCTATTCTTACTGAAAACCCAGTCTGATATAGACAATAATAACAATGGTGGTGGTTTTCAGAATTGGATAATTGGAGTTATTGTTGGCAGCATTTTGTTATTGGTGTTGATTGGGTTATCAGTTTGGTATCTAATAAGAAAAAGGGAAGATAGAAACAGGAGGTTGAAGAGAACAAAAGCCACAGATACAAAATCACAAGCTTTAGAATCGATCAGCGCTAGCACCACTTTAGTTAAATACAGTTTCGAGGAGATTAGAGCTGCCACTAAAAAATTTTCTAGGGACAACATTATAGGAAAAGGAGGATATGGGAATGTGTATAAAGGGAAACTAAGAGATGGATCAGAAGTTGCATTAAAAAGATTCAAAAACTGTTCAGCTGCTGGAGACGAGAGCTTTGCTCACGAAGTTGAAGTAATTGCAAGTGTAAGGCACGTAAACTTAGTTGCATTGAGAGGATATTGTACTGCCACAACTCAAATGGAAGGGCATCAAAGGATCATAGTATGTGATTTGATGAAGAATGGAAGTTTGCATGACCATTTATTTAGTTCTGAAGGAAAGAAGCTAAGTTGGCCTATAAGGCAAAGAATAGCGATAGGGACAGCAAGAGGGTTAGCGTACCTACATTATGGGGCACAACCAGCTATACTTCATAGAGATATAAAAGCAAGTAATATATTACTGGATGATATGTTTGAACCTAAGGTAGCAGATTTTGGACTAGCTAGGTTTGCACCTGAGGGTATGTCTCATGTTAGTACTAGAGTGGCAGGTACTTTAGGGTACGTCGCACCCGAATATGCACTGTATGGGCAGTTAACTGAGAAAAGCGATGTGTACAGTTTTGGGGTGGTTATGCTTGAGCTTTTAAGTGGGAAAAAAGCTTTTTTATCTTCTGAAAATGGGCAGAATGTGCTTCTAACTGACTGGGCTTGGTCATTGGTGAGGGCAGGAAAGCCTTTAGATGTGATTGAAGATGGAATAGATGAAATGGGGCCTAGAGAGATTATGGAGAAATATGTACTTATTGGTGTATTGTCCTCTCATCCTCAGTTACATGCAAGGCCCACTATGGATCAGATATTGAAAATGATGGAGTCTGATTCTTTAAGTGTTAGTAGTATTCCAGATCGACCTTTGCCTCTTGTAGCAAATTTGGAAGAGATTGAAAGATCGATTAGTAGCAACGGGTCGGGGCAATTGTCCAGCAGTGTTTCTGGGTTTCAGTCGTTTGGTGGTGGAAATGAAGTTGAGGTTCTAATTGATAGAACCGAGGCAGATATTCTTGTGGGTCGTAATGAATCTGAACCTAGTACGCCTGATTAAAAAGGGTATGATTTATTGATGTTGTTCTTTGCGTTTTGATTGTTTTATTACATTTAATCCACATTGTAAAGGGTTGTTTAAAGACTCACAATTTCAAAATTGCACCTTTCCAGTTTGTGTAGTTGGAGAGGGCATTGTAGCATACATAATGTTATTTCTTTGATAATAGAAGTCTGTAATCTGAAAGCTGAATGTTTAGAAACAAACATTCTTGGTTAAATAGTCTTAATAGTAGACATGAATTTGGTATACAAATTCCACCCTCTGTTTTTGTAAACAGACTTGACCCTTGTGATCAAATTGACTAAATTGCATATGATATTTGGGTTTTGAGTGCAAACTCAGTATTATGATATATATTTTTATTATTATTATTATCAGATAGCATTTCCAGCTTTTGATTGGTATTTTAATATTAAAAAAATACTCATGTAGAAATTATGGAGAAAAACCATGATGGTTGTTGCATCAAAATTTGACGCAAATGTGAACTATGTGTCAAAGTTGATGCATGAAATTAGTGCTCACCTGTATACCTGTCAATGGATCGGATACTATTCGGATAGATTAAAATCTGGATCCGAGACTATGTACTAAAACTATAATCTTAGTTTGGTCCGAGCCTGTTCATACTCATTGCCCAAGTAAGTCTGCTTGGTAGAAACTGGTGCCCTGAAAACTTTCCCTCAAACAAAAGCACTTGAAAATTCCAAAGTAGAAAAATAAATGGCATACAAAAAATATACACACTCTTATTTTTGTTACAATGACCAAAATAATTATCCGATAGGGTGTAAATAGAGCCCTATAGTAATGAATCCGTACCAACCCAGCACTAATAATTATCAGGTTGGGCCTGGATCTAGTGAATCAAAGCCGAACTCATCCCCGTGTTAATAAAGTGGATTCGGATCGGGCTGGAGTCAAAATCTGTATCTATTGATAGGTCTAGTGACATGCATCAGATTTTGTGCATGGAGTACATACACAAGGTGTTCATGCAGCACGCATGTCAAAACATCGGAGCAAATCACCTGGACACATAGTACTTCAAATTTTTCAAAAAGAAAAAAGTTTAATCTAGGTTTTACTTAACTACTTAATTGCAAAATAATTGGTTATGTGGTATGTAAATTGTTGCAAGTTATTCTCAGAATTCATTGGCAGAAAAGTTAATGTGATGAATGGTATCATATTTTATTTCCATCCCTCTTAGAATATTCTTTTTGTAGGTTGGTTGTTAGATGGCCAACCTATGTATGTATGTTTATATGTATGTGATACATTGATTGTGCTCAAAACTCACTGAAAACCCTATATATAATACAAAAGTAAGGCAAGGAGGGTGCATGTGGGCACAACTTACTTTTGGAATATAAATGTATCTGATCTGATGATTGATGCCCATGTGGTGGGTTTATTAGCTTGCTTGCATTAACACTTGTTTTGCTACGTAATTAGTTGAAAAGTTTTATTTGTCTATCCATGTAATACTGAGACATTACTGTGGAATACAAATTCTGGTTATATGGTTTCAAGCAATTTCTCTTTATGCACTTTAGTGATTGTTTTCTTTGTTTTTATTTCATTTTATAATGAAATGTTTCTGGGAGATACTGAAGTTTTTGCTATTTTTTCCTTTCAGCTTAAAAGCTTTCCAGAATACAATTCACCTTTTGTTTTATCAATTGATGAAGTAAGTATGTCTTTTTCATTCTTAATTCTCTGCACATATTTGAGCTTGTATGCCTGAATTTATGATTTTTCGAACTGGG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	RRT49545.1	6.0e-223	hypothetical protein B296_00046682
Swissprot	P93050.1	7.7e-191	Receptor-like kinase in flowers 3
trEMBL	A0A426YCT7	4.3e-223	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G48010.1	56.32	0.0	690	RKF3	receptor-like kinase in in flowers 3

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G02685	AT2G48010.1	625	245	8	5	624	7	608	56.32	0.0	690
AfisC1G02685	AT1G11050.1	626	320	21	26	621	27	621	39.14	2e-96	350
AfisC1G02685	AT1G56140.1	358	191	6	230	587	637	974	41.06	1e-70	264

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g185022.t1
Allium fistulosum	AfisC1G02685
Allium sativum	Asa7G02321.1
Arabidopsis thaliana	AT2G48010.1
Oryza sativa	LOC_Os01g28730.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	300	510	145.5	1.7e-42

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005576	C	extracellular region
GO:0004702	F	receptor signaling protein serine/threonine kinase activity
GO:0040007	P	growth
GO:0009941	C	chloroplast envelope
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network