result

Gene information

Detail information of AfisC1G03068

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G03068	chr1	567177912	567196348	+

Sequences

CDS

>AfisC1G03068
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Protein

Gene

>AfisC1G03068
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_012090178.1	7.2e-51	protein REVEILLE 6
Swissprot	C0SVG5.1	1.7e-41	Protein REVEILLE 5
trEMBL	A0A067JEF4	5.2e-51	HTH myb-type domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G09600.1	71.30	1e-42	171	LCL5;RVE8	Homeodomain-like superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g395533.t1
Allium fistulosum	AfisC1G03068
Allium sativum	Asa7G05706.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	58	102	34.5	1.5e-08

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0048574	P	long-day photoperiodism, flowering

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network