result

Gene information

Detail information of AfisC1G03106

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G03106	chr1	572605606	572620547	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC1G03106
CCTAAATCCAAAACGTAAATCATAGAGGATTAAGACCTCTGAAATTTTGATGGTGGAAAGCAAAATATTCAAAATCAGTGCGTCTTGGAGATGGCCTAGGGCGTGGTGAACTGACCGGTCAAATTATCCTTTTGATCGTCCTTTTATTTTTTAGCTGTCAATTTAATATTTCGCATTTTAGCTTTCCGTAAACTAACTAATAACGCCGAAATAGTCCTCTGTTTTTCTTACGTACATTTTTTGACAGCTCCAAGATAAAGAAACATATTCCCAAATTCGACGGGTTTCCTACTTTTCGTTTCTTCTTCCTGAATTCGTGATAATTTAAAGAGTAAATCGATCATTGAAACGGAGAATTGGATAAAATATTCAGAAATTCAGGTCAAGTTTCCAATTTCTGGAGGTAATTTAATCGTAAATTTTGGATTATTGTTACGATATATTATGGACGCGATTTAATTTAAAAGTTTGGTGATAAGTTAGTGTTTCTCTCCGGCGAAGAAATTATCGATTTTGAGGGAAAACTAACCCATTATGTTGGTCTAATCTGTTTATGTTCATGAAAGAAAGATAATTTGATGGATTTGTTTTGGTTCTTGTCCCTTGACATATAATTATGTGCTGTTGCAAAGAAAATATAGCATTTATTAACCTGGAAAACATATCATATAATATCTGCGATACCTTTGCTTGTGGTATTCCAACAACAATTGGAGCATGTTTGACAACTCTGTGTAACTAATCAAAACTATAACATATTTGTATTCCTGAGCTTGTGAATTTCTTATAAGGAGCTTACAAAAGCATATTAGAAATAGATATTTGTTAACCCGCCTTTTGGCAAGGCCGCGGACAGACGGGTTTAACCTAATCAACTGCATGTTCGTCGAGGCTAGAGTACGATGGATTCAGTTGATTGGATGGATGGATGACGCAACATGCTTGGAAGATGAAAATATGGTTGGATAAAGGTTGATCAATGGTTCGGCTTGATGGAGGTTCGGCATTGGGATCGTTCGGCATAGAGAAATGTTCGGCACTGGACGAGCGTTCGGCATAGAGGAATGTTCGGCACTGGACGAGCGTTCGGCATAGAGAGATCGTCGTTCGACATTGGATGGAGCGCTCGGTATAAATCTCGTTCGGCATCTAGAGCAACGTTCGGCATTGGATGGATCGTTCGGCATCAACGAGCGTTCGGCATAGAGAGATCGTCGTTCGACATTGGATGGAGCGCTCGGTATAAATTTCGTTCGGCATCTAGAGCAACGTTCGGCATTGGATGGATCGTTCGGCATCAACGAGCGTTCGGCATAGAGAGATCGTCGTTCGACATTGGATGGAGCGCTCGGTATAAATCTCGTTCGGCATCTAGAGCAACGTTCGGCATTGGATGGATCGTTCGGCATCAAGGAGCGTTCGGCATTGGATGGGTCGTTCGGCATACCTCACCTCGCTCGGCATTGCACCTCGCACCTCCATACCTCGCACCTCCGTACCTCGATACCTCGGTACCTCGTACCTCCCAACGTTCGGCATGAGGAGATCGTTCGGCATTTACACCTTGTTCGGCATTCAGCGTTCGGCATCTATGGTTCGGCATATGGAGACCACTCCATTTGGGCTGAGGTACTCGGCTGGCAGGCCCACTAGGGAAGTCCAACCCATCTTTGTCTATAAATAGAGAGGCAGGGGCACAGTAAAAGAGGATCTTCTTTCTGCTCTCTTACTTTCTCTTTTCTAAGGCTAAGGCAACTCTGCCATTTTGTAACTGTAATCGATTATTACAGCAATAAAAAGCAAACTTCTGGAGTGGACGTAGGCCGGAGTTAGCCGAACCACTATAAAATCTGTTGTTCTTTACTGCTTTCATTTCAGTTTTAACTGTTCTTCACATTATTGCTCTCTACATACATTCTATCTCTGAGCTGTGATTGGTATTTGGTGCTTTCATCTGGATTTGGGGGTTAGTGACCAATTTTGGAGCTAACACTTTGGTGCTTTCACTGAGAATTGAAACACTCAGGAACTTTGGAGTTAGGAACTTGGATCCTAGAAAGCAATGGCTAGACCACCAACAAGGAAGCAAGTAGCGGAAAGAAGCAATCAGGAAGGAAGTCAAGTGGCCTCTTCTGGAGCTGGAGAGGATCATGCATCCATCTACATAACTCGGGATGAGATGCAGGCAATGATGAATTCTATGCAGGAGCAGATGATGAAACGACAAGAGGAGATGATGCAGGCTCTTCTCAGGCAATTTGAACAACCAAGAACTGCAGGAGCTCAAGTTCATGGAACTGGACCAGAGGAACTCAACCAGCGGACAGATGGAGTGATTCAACAGGAGGCAGCTCCCAATCAACAAACAGCTAACAATCTAGATGGACCTAGACTCGGGGGCACACCACCAGGGAATGTTGGACCAGTTCATGGAGGGATACCGGATGACGCTACGCGGCCTGGCGTCGATAGGAATACAGGAGTACGTGATGAAGAATATGTGCCAGAATTTCCTCGGGGACTTGGGAGGCAGTCTGGATTAGTTGGAAACACTGGATTGGCTGACATTATCAGGCGGACTATTCGCGGAGGTCTAACAAACAGGGATTCAGAGGGAGTTAACAAAAGTCCGTTTACCCGGAACATCAGGACAGCTAGGAATCCGTCCGATTTCAAACTACCCACTCTGGAAGTATACAACGGGAAGACGGATCCCACCGACCACTTGATGAGGTACACTAGGCATATGGAAGTGCTGGGGGCAACGGAGGAGGTTATGGTCCGATGTTTCCCCCTGTACTTGACTGAAATTGCTGCTATGTGGTTCAGACAGCTGGAGGATGGATCCATTGGAACATGGACAGAATTGGTGGACAAGTTCTTAAGTCAATTTCGAGTTCACATAAAAAGGCCAAAGAACGTGATGACACTAACATCAGTCAAACATGGGGTAGATGAATCGCTCAGGACATTCTTAACTCGATTTAATGCAGCAGTTGCTTCGGTGGATCGGCCAGATCCATCAATGGTTCTGATGGCTGCGGTATCAGGAGTCAGAGATAATTCGGAGTTCAAAGTATCGTTGGTACGGGACCCACCGTTGGATATTGGGGAATTCTTTCATGAAGCTGAAAGATTTCTTCGACAAGAGGATGCATGTTTGGACATGAGGTCAGAGGAAGTAAACATGACTAAGGATGGAAGACTACTCAGCGAAAGCTCAGGTGGGGGCAAGGATAAAGGGAAAAGGAAGCGCTGGGGAGAACCAAAGTTCTCCACTTACACAGGATTGAACGCCACGTTGGAGCGGATTTTCTTAGATACTCGAGATCGTCTTCCCTATCGAAGGCCATCGAGGAGGGAACCCACAGAACGTGAAAGGGGATCAGGAAAGCACTGTCTCTTTCATGACCTGGACGGGCATGATACTAACAGCTGCCGACATCTAAAGGATATAATCGAGGAGCATATAAGGAATGGTCAGTTGCGACAGTATGTTAGAACTCGGAATGCGGCGGTGGAATAGGAACAGCCACCGCCTACCTTGAACGATGAGGGCGCGAGGCCCAGGAATGGTGACCGATTGGTCATCAACTAATCTTGATAGTTTGGAATAAGTAACAAACTCCGGACAAACGGTTAAATCACTTACTCATGTACGGGGTCGGAGATAACCCTCAGGCATGCTCTGAGATGATGGCTTACCGAGACGCCCTGGTTTGTGAAATCCGTTTCTTCCTTTGACTTGGACATTTGCTTTTTCTGGTTTGGTTTTGGAGTTTGGTTTGAACTCCTTGTTTTACTCGTTTTCTGGTTTGAATTCTGGTTTGAATGTTTGTTTTTCGGATTGGATTTTGGTTGGATTTTCTCTGGATTTTGGCTTAAAGGTCGTCGAATATGGACTATGCTCGGCAAGGGTCCGGAGAGACCAAGATTCGGCCTAGGACTTAGGCCATATATTATCGGTTACTATTTCAGGTCGTCGAGTATGGACTATGCTCGGCAAGGGTCCGGAGCGACTAGGATTCAGCTTAGGACTTAAGCCACGGCATTACCTGCGCCCAGGGACACTGGGCCACGATCGTCAAGTGTGGATTGCGCTTGGCAAGAACCCGGAGAGGTTAGCTCAACGTCCAGGGACACTGGGCCACGGTCGTCAAGTATGGATTGCGCTTGGCAAGAACCCGGAGAGGTTAGCTCAACGTCCAGGGACACTGGACCACGGTCGTCAAGTATGGATTGCGCTTGGCAAGAACCCGGAGAGGTTAGCTCAACACCCAGGGACACTGGGCCACGGTCGTCAAGTATGGATTGCGCTTGGCAAGAACCCGGAGAGGTTATCTCAACGTCCAGGGACACTGGACCACGGTCGTCAGTTGTGGATTGCGCTTGGCAAGAGCTCGGAGAGGTTATGGATTTGGATATCGATCCAAAGAGGTCCTAAAGTCGGTTATTGGTTATTGGATATGGATGAAACATGGACTTTGGATATTGGACTTGAGGCTATTCAAAACACACCTTTCACAGCAAGACATGTTTTGGGGGGCAAGTGTTAACCCGCCTTTTGACAAGGCCGCGGACAGACGGGTTTAACCTAATCAACTGCATGTTCGTCGAGGCTAGAGTACGATGGATTCAGTTGATTGGATGGATGGATGACGCAACATGCTTGGAAGATGGAAATATGATTGGATAAAGGTTGATCAATGGTTCGGCTTGATGGAGGTTCGGCATTGGGATCGTTCGGCATAGAGAAATGTTCGGCACTGGACGAGCGTTCGGCATAGAGGAATGTTCGGCACTGGACGAGCGTTCGGCATAGAGAGATCGTCGTTCGACATTGGATGGAGCGCTCGGTATAAATCTCGTTCGGCATCTAGAGCAACGTTCGGCATTGGATGGATCGTTCGGCATCAACGAGCGTTCGGCATAGAGAGATCGTCGTTCGACATTGGATGGAGCGCTCGGTATAAATCTCGTTCGGCATCTAGAGCAACGTTCGGCATTGAATGGATCGTTCGGCATCAAGGAGCGTTCGGCATTGGATGGGTTGTTCGGCATACCTCACCTCGCTCGGCATTGCATCTCGCACCTCCGTACCTCGATACCTCGGTACCTCGTACCTCCCAACGTTCGGCATGAGGAGATCGTTCGGCATTTACACCTTGTTCGGCATTCAACGTTCGGCATCTATGGTTCGGCATATGGAGACCACTCCATTTGGGCTGAGGTACTCGGCTGGCAGGCCCACTAGGGAAGTCCAACCCATCTTTGTCTATAAATAGAGAGGTAGGGGCACAGTAAAAGAGGATCTTCTTTTTGCTCTCTTACTTTCTCTTTTCTAAGGCTAAGGCAACTCTGCCATTTTATAACTGTAATCGATTATTACAGCAATAAAAAGCAAACTTCTGGAGTGGACGTAGGCCGGAGTTAGCCGAACCACTATAAAATCTGTTGTTCTTTACTGCTTTCATTTCAGTTTTAACTGTTCTTCACATTATTGCTCTCTACATACATTCTATCTCTGAGCTGTGATTGGTATTTGGTTCTTTCATCTGGATTTGGGGGTTAGTGACCAATTTTCGAGCTAACAATATTCAAGTCGCAAGTATGTGTTGCTTGCAATGAATGAATTTCATAAGTAATTTTGATCAAGCAAATGGTTAAAATAACCTTATGATTTCAAATAATCTACAAAGGAAGTTCCATTATTTACATACTTTGATACGTTCAGTTACATGCTTTGCTATACATTAATTACTCACCAAAGTCAACCTATTTTAAGTTTAAATTAAACTAAGGCCCCGTTTGGGAACAACTTATTTTCCTACTTATTCACTTTTTAAGTAATCCTATCAAATAGTGTTTGGCAACTATTTTTTGTTGTTGTTGTTGACTTATTAGTCAAAATTTTAACTAATTTCGTAAGGAGTAAAGAGTTGCTTATGACTTATAAGTTACTTTTGAAAGAAGTAACTTGTAAGTCATTTTGAAACAAGTAGTTGCCAAACAGACCCTAAATTCAAACATTTTTACTTAAAGTTACTATTCAAAAGTAATTAGAAGTTACCATTCAAACCTCCTTTAAAGAAGATTAAAAAAACAAGTTGCTAGTAACCGGGCTCTTGGAAGTAATCTTTCATAGTTGCCCTAATATTACAGACTTGTAGTTGTTTTGACTAAAAAGCTTTCCACTGGTTGGTTGCAAGTTGTAATATTATGATAATTTTATAATTTCTAATCCGGATCTTGAATCATTTGGGATGGGTAATCAGGAATTTTTGCAAGTGCACATATGTTCATATTCCAATGTTTGTTCAGGACACGCTGTTGCTGAACCAGCACCCAGTTCAATGGTCACTTAACAGCTACATCCAACGGCTATTTTTCTGCACCTCAACCATCTTTTCTTAAATACAAACAATTTCAACTCAGTTTCTTACTGATTTTCCTCTTCATTTACCTGGTATTTAGAAAATTGAAAAGGATTTCATCATTTAATATGAACACTTGACAATCTGAATTTAATAATTTTACTTTGGACGATAATGAGGCAAACCGTTCAACTTCAACGGAAGTTAAATGTTACTAACCTTCATAAATATTTTGATATATCCTCCTTTGTTGCCAATTCTCAAATGGGTCAATTCGTGAAAAGGATCAAAGTTGGGGTACTTTTTGGTTGAATTTAGCTCGATATTACGGTAGAATGCATTCTGGTAGAAAGCATTTACTTACCTCGCTGAGGAAAGTCCGGGGAAGATAAATCGGGAAATAAAAATTTTCAAATCTCAAATTTACAAGAGTAGAACAACCCGATTGACATGAGACCAGAAGATAATTTGGTATATTATTAACTTTTCTACCTTTAATATACTAATTTTTTATGTATTTTTTTTTCCTTCTATGTAATGTACATAGGTATAGCAACTGAATTGTTTTTTGTTTCCATATAAAAAACATGTTCTTAAGCTACTATTTTCAGTTCATGACTGTTACAATTTGCTTCGTCAATACACAAAATGAAAATCTAGCTGCAAAGAGTGTACGACATATTGAAAGCAAAGCAAGAACAAAACAAAGCACATAAAATAGGATCAAATGCTAGTCCATACAAATTTTAAGAAAGTAAAGATATGAAATATATTGGCAATACGGGCGATTGAGTTTGTTGCTCCAAATTAAGATGTTATTAGACCTTCAAAGGTTAAATTACTAAGAAACATATTTGAACTCAAGATAAGATAGCGTGCTAAAGCTGGTTGGACGAGAGGTATTTGAAAGCGACGAAACATAGACATAGTTTCATTTTAAAGAAATTATTGAGGGCTATGATAGAATAACTAATACTCATGCGAAGGCTTATGCCAAAAACATGCTGATGTGATTGCAAATTGGTTTGACCAATATGAATGAAATTCAACAATGATATTGAAAGAAAAGACGGATATTGCGAAAAAAACAATTTTACATTAAAATATTATTATATCTTTTTTTTTAATGTTTTTTTATCCTTATGCGGGTAAAAAAAATATTGTATCCTTTACTAAGTTAGGAAATGTTATATCTTTGGTTCAGTAGATTGTTATTTTTTAATCGTATTTTACAGAATCAAATTCACACGTATTGAGTTTAAATTCATGCAAATAAACTTTTGCGTATCATAAACACAAACACTTACACAAACTCTTACATTAATAATTGATTTCCATCAATATTATAATTATGTTCGATAGGATCATCTTGCAGTTTATTATGTAGGGTGTTCTTCGCCATATATTATTGGCTGATCAATGTGTACATTTAAATCTTCGTTAATTAGTAGACATCTCAAAATACTTTAAACATTTATATCTTCATTAATTAGTAAACATCTCAAAATACTTTAGACATAGTAATAATACCGTCACAGACATCTTCTTGATCTTCCACGTCTCTTCCCCCTTCAATAATCGTGGATTATACAGAACTACATATGTAAACATAATTTTTGTCAATTTTTTCATGCGATCATAAGCTACATGGGTTACTAACGGTTGCAGACCTAAAAGCACACCAAAAGCCCTAACTATATGTTTTCATAGTATTTCTTGCACTCGATCAAACCTTTTTTTGCTTAGCAGAAGTCAAATTAGATAATACTTTGATAATGGTGCTATATTTAAGATATATACCATCTTCAATATAGCATGTATGGTTGTATGTCTCATTTTCTACTGTAAATGACATAAGACTTGAATTTCCAAGTGTAAGATCATAAGTAATAAATGAAATGTTCAACCACATTGATTAGGGCTATCAATGAGTCTCGAAAAATCCAAAATCCGTCCGCATCCGTATTTGAAAAATGAAAAGATACCCGAAATTGAAAAAAACGGATACAGATACGATAGTGTCCGCGTTCAAAAATTACCCGTCTGTATTTTATCAAGATAACAGTTGAGATTATGCATATTTTACTACATAAAATAATTGATACCTATTGTTTTATTATGGTAATAATTCGTATGTTGTATAAATGAGTGTTTGCTACCAAAAAATGATCATTATCATTGTATATTTTATTTCTTGTATTTATGTGAGTATTATTACTGAAAAGGATTTATGTCAGACCAAAAAAATCAAATTTTTATTATTATATTAATTATGAGCGGAGTGGATAAATAGTTGATATCCATCCATATTCACAGATATCTAATATCCAAAAATGATTTCGGATGCGGATGCGGATATGACATTATCTGCATCTGAAAGTATCTATTGATAATCAAAATGGGATTTAAATCATAAATCACAAAGTTTAAATATTAAATTGAAATGAGATTTAAATTGTTAATCGTAGATTCGAAATATCCATATTTAAAGGTTTGTATGCATTTTGAAGTTGATCTTGATGTTTGAACTTCTACAATTGAATTTAAAACTTAATTTTCTCTTTAATTCCATTTTTATTCTGTTTTAAAAACATTATAATGGGAATTGTGAATCTAAATAAGTATATTAAATAGGTTAGTATGAGTTAGATGTGTCTTTGATTGTGTTTATAACAATGTTTGAATCGGAATGTAAATCGAATCGTATAGGGAGGGATCCGATCTGAATCGGGATTTAAATCTTAAGATTTTAAGATTTTTGATAACAATGATTGATATGACTAACATTGATATCTTTTTTAAATCCTAGCATGCTAAAAAACATATAGAATCTATTAATCATATGAAGCAAAAGCTTCAAAAATAATAGTTAGTTTTTGTTCCTTTTCTTATATGCTCCATGAAACTTTTTGTGACGGTGCTTTCAGTTCTAATACATTCAGTCAAGACTTCCTAACACTTTAGATCATTCTCTGTTGTCGTGCGTTCAGATAATCTATCAAATCTGCAGAGAAATTGTAAGCTCTCCTCATTGCAGTTGTTCTAGTGACCAGTTAGATCTTGCGTTTTTGCAGCATTAGATTTGAAAACAAAGAATTTACCATGTTCTTTGATCTGTGATGATTGTTCTAAACAAAATATTGCTTCATTCTGATTCTCCTTCAAAAAATGTTAGTGTTGTAAATTGAATTCTGCACAAAGTAGTCTTGCATCAATTGTTTGTACGTTGAATAATGACAATCGATGTAGTGATGACCCATAATAAGGCCTCCATGTTTGCTAAATCACCCCTACACCTTGATATGCCATGAACAAATTCTGTTGGCATTGGAATGTGCTGATTCTAATACATCGTCATCAGATCACTGTCTAATAGAATAATTTTTGTTGCTGGCGGGGTTCCTTTGAAAATATTGAAAAATATACCGTTAGTTTTTTTTGTAAGTTGTAGAGGTATTATTGTGAAAGTTGTATTTGTATGAATATAAGTGTTAATTTGCCAAACAACCTCCCAACTACGGGTGCTTGTTGAACAACATCTTCAAGCGTTTATTCAACAAGAGTTCACATTCCCCACTATTGTGGGGAAATCCAATTACGGATTGTAATATCATGATGGATACTCTGTTAGACTGCCCTCACTGCACACACACACACAGACATATACACACACACATATACATATACATATATAAAATCAGGCGAAAGATACTGAAAAAGAAGAAGAGATAAATTGGTAAAGAACATTACTTTTTTGTAAATTGCGTGAACTAATTGTGTGCTCAATTCATATACATAATGCAGAGTAAGACTATATAAGATATTGGGTTTGCTGTGGATCTTTGGTATTCAAAGTGTTTGTGTGCTTTCATTTTACCTCTTGATATATGGATAGCTGCATAAATAGTTGTCAAAAGCATGCCTAAATGTGTGCTTTAGCACAGTGCATACCCTTCATATTTCTCAATAACTGTTTTTTTGGGAGAGAATAGTCTGCTGAAACGAAGCTAATTAACAAACATATGCAGGATGCAGAGCCAAATTGTGTGTAATGGATGCCGATATGTTCTCCTCTATCCGAGAGGAGCAACTAATGTTTGTTGCTCAATTTGCAATACAATAACCACCGTACCACCTCCAGGTATTTTCTCCTGTTTAAATTATCAATCCTTTTCTTATTTTCTTTTGATTAGCATTAACATTTAGGAAGTAATCTTGATTCACCTCAGGCCTCTAGGCATGTTGCAGTGCCATGAGTTCACCAGCAAATATAAACGTACTTTAATTATCTTCAACAAGGTTCCTACTATCTTGGTTTTGTCATTTTGTAGATTGACAAAATTTTCTTGATTTAATATTAACTCTTGCAAAAAAGAAGCTATCAAATGTAAACTATAACTTGAGAGGATGGGTTGAAAGATTCGAAACCAATGAAATATCTCTATTATATGGTAGTCTCTTTCACCTTTACTGATGTACACAATCCACAGTGAAATTGTTAATTGAATAAGCTGGAATTAAACTCGTTGTTGAGTAGTAAATATGTAACCATGTGTGTAATTCCTTCATGAAATGTGACCACAAATCAAATAGGTTCCCAGAGCCTATACCACCAATCTGCGTGCCTATTCAAACAATGCCCAAAACTGAAGCTGGTCCAACAAGCACTTAATTTGTGTACTTCAAGTTTTGTTCATATTTCTTACAAATTTTTGTTTAAATTGTTCACATTTTAAATATATTTTAACATTTTGTAGAATTTTGCTTTTCATTTAAAATTTTATAATAGTATATACAAAAAAAAGAAAATCATTTTATGAAAGTTAAAAAAATTTTATTTTTAAATAGTTTAATTTTATTTTTGTAAATTTGCAAATAATTCAGATATATATTTATTATAATTATTTGTTGAAAATTCTCAAAAATACAAATTATAATTGAAAAATTAAGCAAAAATTAAAGTTGGTGGAATGCACTAAGTTTACCATTTTTGGTAAGTCAACTTTGTAAGTTACACATTCGAGCTAAAAAATGTAAGCAAAAAATAAAGTTGCATTAATACATTCGACTATATTCACATACATATAGTTTTTTTTGTTGTTGCACTTTTGCAGGAATGGAGATGGCTCAACTTGTCTGTGGAAATTGTCGAACATTGTTAATGTACACTCGGGGTGCAACGAGCGTCCGATGTTCCTGTTGTAACACAATGAATCTTGCTGGACCAGGTATTCATGTCAATATTCATTTTAAATTTAGTTTTCAAAACCTTTTCTCCAATAGGAGTTCATTCTTTGCATGATTTTAGAGCACCATAATTTTCCTACATTATATAAGCTTTCTTTCGAAATATATCTACATTTTTATTTTTATGCATTTCTGAATATCCAATATTGGAAACATGATGTTCACTTCCCAAGACCTCTTAGGTGATGATTTTATGACGTTCTGTCTTCATCTTTGTAAATTGACACTTAATGTTAATATTGCAGCATTAGTTAATCTACTTGATATATCGTTGATAGTATTTTTGATAAAGCTTAAATTACTTATCGATGCATCTAAACTCAAGAAGAATAGAGGTAGAGGTGCTTAATTTACAGATACATATTTTTCAGAGTATTATTCAGCCAAATTACAATATGTGACTTATTTTCTTGATTGTGTTAAAACTTTAAAAGTTTGTTCCATGTGTACATGGAAAACTCCAGCTTTCATAATATTGTGAACTAACCTTACATTTTGTAGAGGGAATTGTTAAAGAGGCTGTCATTTTGGCTTAGGGAAATAAAAGATAAACATGCAAATTTAAAAAAATTAAAATTAAAATTTATGAGGAGAGAATAAATCTATTGGGACACAAAATGATGACACAATTGGTGATACAATGAATCTCAACCATTCAATTGTCATCTGATTTCAACTCCATGTGTGAACACAACGAGATCCAACGGTCTAGATCTATTGTGCCACCAATTATATTTTATTTCGTGTTCAAATAGCCGGCCCCTGGTGTAACATATAGTTAATTCGTTATACAAAAATAATACTCATTTTTCCATCCCTAGCTCTGACATTTTCTCTTTATTGACCCTACCATCATGCGATCTCAAACCTACCTCCCTTGAATTCCACCGCCGTCCTCCGAAGTTTCCACCGACTGTCTCAAACATCCCTCCGTCGTAAACTCCAATAATTTCCTTTTTTCATTTGAAAAAATAAAATAAAATAATTTTTTACCCTTCAAGAACTACTAACTTAAGTGGTAAGTGGTATGACGCTTTAGACCGAGGTTCTAGAGGTCATGAATTCGACAATCCGATACATCAAAGTTAGTGCTCTACTTTATAAAGTACCACTCTTATTCTCAAATAAATTAATTTTATACCTTATTTTCAAAAATATAAACATAAGACCTTATACGTCCTTTAGAGACGTCGTTTGAATACTGAATAGAAGGAAAATAATCAACATCTCTTTCATATTCTTTTGATGGAGATGGGATGGAGATTGCGATGGTGATTCCTCCATAATATTCTAATTAGAGTATTAGGATTTACAATTAGGGAACTATGGTTTGAAGTTGGATAGACGGTGAGTTTGGGATAATTGTATGACAAAACGGAAGAAACATATATTATAGAATGATTAATTTAGCAATTTTGAAAAAAATTTGTATGGGAAGAGTCAATATTTTTATTCTCCTCTTAACAAAAATTTCCCCCAAAAAAAGTTACATTTTCCATTCCTTAGTCAAACTGATAGTCCCTTTTTAGCAGTTTCCTTTGTAAATACGTTTGGGTCTCCTCAAGAGCATTAATTTATCACTCCCTTTTATTTTTGTAGTTATTCTTATTTGTGAAGAACCTTAAATAGCACAGATAAGTATCATGGCATCTCATTGGTTTGTTCAAACTGCAAACAATAAATTTAGGTCAATTCCACTTTTAGTTTTTGCTCTCCAGCTCATGATCTCATTCACCAACTAAAATTTTGGGTTTATTTATATTCTCTATCTTGACCTCATGAGCTAATCCTCATGATACCTGTACACATTTTCTTCTTGTTTCCATCTTTATCCCAAAGAAGTCAATATAACAACTATATCTTGTTTTTCTTTGCAGTATTCTCTCAGCCTATTTAATTCAACATATGTCCCGCTTTGCATCTTCTTTTTTTTTAAAAAAAACATTTATTTTTTGTAATACAAGGGTTGATAGTATATATTAGGTTACTATATATCTAGAGGGTGTATGTTAATTCAATACCCCCATTATGGCTTTGTATGATCTAACTTCTAACATCAAGGTTCTTAAATATATATTGCAATTTTCTATGTTATTCAGTAAATCAGGTTGCTAATGTGAGTTGTGGCCAATGTCGAACTACTCTTATGTACCCTTATGGAGCACCCTCTGTCAAATGTGCAATATGCCATTATGTCACCAACGTTGGGGTATGTTATATTTATGTTTGTAATTCTCTGTCATTTTTCCCTCTTTACAATTTTTTATTTATTTCTAGAGACATGTTTACCGGCATCTTTGTTTGTTATTATTTCTGATCATTTTACAGCAAATGGTCAACCCTAGGGTACCTATCCCTGTTAATAGACCAAATGGAATCCCACCTGTTTTACCATCAACAGCAACTGTATGTATAAACTTTATTTCATCGTCTAATTTTTCCTGTACTTCTAAAAAAGTTGCTAGATTAGTTTTTATTTTATTCCCTTTTCTTTTTTTGGCGCAGCCTAATAGCCAAACAGTTGTAGTTGAAAATCCTATGTCAAGGGATGCAAGAGGAAAATTGGTAAATTCTATTTTTATTTTTATATTCTTTCTTCAACTGTGAACATAGGTGCTCAAATTAATTTCTTAGTAAGCAGAAGACTATTTGTACATCGGACCTCATAATGCAGGCATAAAGTTATTCTTAATATTAGAGAATTGCTTATTGTCATTTATCTCTTAGCATTTAATTATATATTGTACAATATTATTTTTATGTGTAATCAACATGAACACATATCTTCAGTTTTAACATATTATTGGCTTGCCAAACATGTGAATATTTATATTGGATGATGCAGAGCACATGTAGTGGTTAAGCACATATAGATTGGATATTGTTCTAAGATCAGTGTGATACAAGTGAATTTTTAATAGTTATAATTGATAAACTTGTTCCTAACCGACGTTTATTCATTTGACATGGTACAGGTGAGCAATGTTGTAGTTGGGGTTACCACAGATAAAAAATGATATGGAAATAAGGTTCAAAGGTTGATGGAGCATATGATTTATTGCAGAAAAGAACTGGTAATTCCTATTATTATGATATATTTATTTTACATATATTATGGGGAGATCGGTTATGGGATGAAGTATTTGAGAATGAAATGAGAGTATAAATATTTTTGTGAATGTAAATGGATTATATCAAGACATGGCATGGTGTACACCCTCAGCATGTATATTATTGTACTCATGCTGTCAACTGTGGAGTGCATAAATATTTGCTCATATATGTGGATGCTCAATAAGAAATGTTTACTCTCAGTATTTA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	POO03269.1	5.2e-25	Zinc finger, LSD1-type
Swissprot	P94077.1	1.5e-16	Putative zinc finger LSD1
trEMBL	A0A2P5FZT0	3.8e-25	Zinc finger, LSD1-type

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G20380.1	62.70	3e-52	201	LSD1	LSD1 zinc finger family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G03106	AT4G20380.7	185	54	4	1	171	6	189	62.70	2e-52	201
AfisC1G03106	AT4G20380.2	185	54	4	1	171	6	189	62.70	2e-52	201
AfisC1G03106	AT4G20380.6	185	54	4	1	171	1	184	62.70	3e-52	201

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF06943.9	zf-LSD1	Domain	7	31	40.4	1.7e-10
PF06943.9	zf-LSD1	Domain	46	69	48.3	5.9e-13
PF06943.9	zf-LSD1	Domain	84	108	53.4	1.5e-14

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0001666	P	response to hypoxia
GO:0002240	P	response to molecule of oomycetes origin
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005576	C	extracellular region
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006351	P	transcription, DNA-templated
GO:0008131	F	primary amine oxidase activity
GO:0009536	C	plastid
GO:0009862	P	systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway
GO:0010104	P	regulation of ethylene-activated signaling pathway
GO:0010310	P	regulation of hydrogen peroxide metabolic process
GO:0010602	P	regulation of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate metabolic process
GO:0010618	P	aerenchyma formation
GO:0016575	P	histone deacetylation
GO:0034051	P	negative regulation of plant-type hypersensitive response
GO:0034052	P	positive regulation of plant-type hypersensitive response
GO:0045595	P	regulation of cell differentiation
GO:0048364	P	root development
GO:0051568	P	histone H3-K4 methylation
GO:2000121	P	regulation of removal of superoxide radicals

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network