result

Gene information

Detail information of AfisC1G03415

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G03415	chr1	636313690	636320328	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC1G03415
ATGGTGACTACGGGAGAAAAAGAGTGGTATTTTTACTGTCCAAGAGACCGTAAATATAAAAACAGCGCACGCCCGAACAGAGTCACAGGAGCTGAGTTCTGGAAAGCTACAGGAACTGATAGACCAATTTACTCCTCTGAAGGAAATAAATGCGTAGGGCTAAAAAAGTCGCTTGTATTTTACAAGGGTAGAGCTGCAAAAGGCACGAAAACTGACTGGATGATGCATGAATTCAGACTTCCTTCTGCCAACGATTCATCCTTCCCTAAAAGAATCCTCGAAAAGACAATTCCCATCGACGTATGTCCGATTATATGTACAGAAGAGTAAATAACTGCATCATTGGTGGGCAATGAACAATATAAACTTTAGTTAATATGTATTTGGAATATTTGCAGGAAGCATGGGTCATTTGTAGAATATTCAAGAAGATGAACTCTTTGGCTTTGGCGCAAAGAGCGATAGCTCGGTCATGGGGATCACAGTTCGAAGAAACAATCGCTACCGAATCAGACATGTTTGCAAATCGACTTGGTGTATCAGACACCATCTCTTGCAGTACTACGACTACTACAAGCACTGAGCCATCTTCTTCTTCGGTTCAATTCAACTTTCCTGCATTAGAATTTGACTTGCTCGATTTTGCAATTTCTCAAGAAGATGTGCCACTGGACTCTGTGTTGCTCAACTTTAGCCAGGCTCCACATAGTACTGAATTGAGGGTTGATTTGCCTTTGGGATTTAATGATGAGACAAGGGCAAGCCAAGATAGGATCACTGTTACTGATACACAGGGGATTGATTTTCCCTTCAATTTGTCACCTGTTGTATGTGAAGACTGGAAATCAAATTTACTGTGGGATTCGCCTTCTTTTTTTGATGAGATATCTACTGGATTGTTCACAAATGTATGAGATTTGTGATTTTGAATTCATGCATGTTAGAAGCAGAGTTGATGGGTAGTATGTACCTTATAGTCCTGTGAAATTATAATTTCAGCTAACAGATAAATTGATAGACAGAAGAAGTATTTTGCTAATTCAAATGATGGAAAGAGCAATCGGCTCACACGGTAACAATCCAAGCCATGTAATTATTTCCCTTGCTATTCCTTTCGCGCTCAATTCAGTCTTTCCAGGCCCCTTTTCACCCTTTTGTTTCTAAATTTAATAACGTGAGAAATTAGGGTTGCATCCGTATAAGTTTCCCCCTCAGAGTTTCTCCTGCTTTTTTGTTTCTCCATTCTCCATTAAAAGTGATTTCAAAATTTTGATCGGAATCATCAAAATCGTCTCTATAATTAACATCGTCTTCATAGTCCATCAAGATTGACATCGTGGAATCATACAAATATGATCGTGTTCGATCCGATTTATCAAATTGTCGATATCGTTTTCATCAAATTATATACGAGGGTATTTCTTTGTTTTCAGATTGTGTTTACCAAATTGATTGCGATTAAATAATTGTTTCAATGTTCATTGTTTTTATTTCTATATTTTATTGTTGATTTTTTTTTCATAGCATCTTGCTGAATTGAATCATGCAGATGATGTCATCTCTGTTTGACAACAGTTGTGCAAACAAGTATTTCTGAATTGAATATAGCATCTTGGTGAATTGTTGTAATTTGTTATTCATTGTTGTGCAAACAAGTAATTCTGAATTGATGGTGCTAGGTTTATTGTTCATTTTTGTAATTTGTATATAACATCTTGCTGAATTGTATTCTGAAAAAGCATAGAACGTTAAGTATTTATTTTAGCGAACTGTCATGCAATTTTGTATTTGACAGTCAAATATATATCAAGCAAATATTTGCTCGACAAATATTTGCCTGATATACATTCGACTGTCAAATATTTCAGTTTTCTTTTCTTTTTTGTTCTTTTCTTTTAATATATTGTATTTGTATTTGTGCAGGTCTTCTTCTGTTGATGTTCTTGTTGTTTTTATGTTGGACACCGATACTTATAGCAGAAGGCTTGGTTTGGGTGATTTTATGTTGAGATTGAGAGAAGGTATATATGAAAATTGGCATGAATTAACATCCAGTTCTATTGTATTTGTTTATGAAAGAGATGATAGGAAAAGAGTAATTGAAACTAGTTCTGATTTGCATTGTATATTGTTGCTTGTTGGTCATAGTCGTGAAGATTATCTACTTGTTACTATTATATCAAAGGATTTATCTATATGTAAGAGGTTTGACAGTAGTTCGGTTGATGTTAGTTTTTCGTCAGTTGCTAGTTTTTTTATTGAAGGTGGTTCATGTGATTCTTCTATGGTTTTTTTCTTCATTTGATTCTAGTTCTTTTTTGAACCGGTTGTTGATTGTAGCAAACCAATATTTACTGGAGTAGATCAAAGATTTCGTGGTAGTGTTAAAGAGTTTCGATTGTATCTTACGATATACTGTATTAAGAATGGATGCAAAGTAAATATTGTTAAGAATGATAGGGGTATGTTACAGCTATTTGTTCACGTGAAGGTTGCACATTTCGTGTTCATGCTTCTCGTAAATTCAATCTTCTGGGTTTTTTTGTTATTAAAACTATGCAACCTATTCATTCTTGTGGAGCTGGCATTGTTGATGTTAACCATCCACATGTTTCTAGCAATTTAGTTAAGAAGTTGGTTGTTGATTTTATTCGATCAAATCCTTTAATGAAGACGAAAGACATTGTTCATTTATTCAAGATTGAATACAATATTGGTTTATGTTACTATTATGCATACATGTAAGAGATTATCTCTTGAAAAAATCCATGGAAATGATTTGCTTTCTTACCATCATTTAAAATCTTTCTATCAAGCTGTATTTTTTTTAATCCTGGAAGTATTGTTAAACTTTAAGGTCATCCTACTAGTCTTGAATTTGAGATAGTTTTTATTGGGTATGAAGCATGCAAATATGGGTTTGGCTATTGTCGTCATTTGATTTTTCTTAATGGGACTTTCATGAAAGGTAGAGAACAAGGTTGTATTATGTCTGCTACTGCTAAGAATGTTAATCAAGATATGATATAGTCTTAGATTTTTTTTTTACATTTTTACTTGTTTTGATATTTGAAAATTTGAGCATGTATTTGCCTAGCAAATATTCGATATTTCTATGCTATTGTAATTTTGATATGTTCAGCAATTTTTATTTTATGAATATGACATATCTATTTTTACTTATATTAGGGTTTTTTCCACTAGTGTTAATATTGTATCTGATGAATATGAACCTAATTGGCCTTTGTTTTTGACAAAGCTTAGTGAAATGTTAGATGATGATGATGATCATGTTTTCACCTTTGTATTTGATCAGTAACATGGTCTTTTGCTTGCTGTTCCTCGAGCTTTTCCAGTTTCAGCTCATGGTTATTGTTACTATCATTTAAAGAATAATTTGAAGAGTTTTTTTAACAAAAAGGTGTCCTCAAGGCAAAAGGAAATGGATCATTTCTTTGTTTTTAAAGTTTCCAATGCTGCTACATTAGATGTATTTAATCATGCTTTGTCTGAGTTTAGGCTTGCTAGTGGGGCTGCAGTAGCAAGTTTTTTGAATGGTTTGTCTTTTGAAAAGTTTGCTAATTTTTTGATTGAAAATCGTTTTGGGGAAATGAGTTCCAACTATGATGGAAGCTTTAATCGTTGGATTTTGGAGGAAAACATTTACCTATCACTGGATGTTTGGATAGAATCCGTTTGAAGCTTATGAAACTTATGTTGGATCGACGTGAAGTAAGTAAAACTTGGAATAGTTATTTATGCCCAGTTATAGAAAAACGTATAAGGGATTTGTACCTCAAGGGTGTTCAATGGAAAGTTAGTAGATCTACTATTAATGTTTACAATGTTCAATCAACTCAAACTTATCATGGAGATTTGAGTATTCGACGATGTAGTTGTAACTTGTGGCGCATTGAGGGATTTCCATGTGCTCATGCTATTAGAAGTATACTTGCTCTTGATTTGAATGTTTATTATTACATTGAAAACTATTTCAAAGTATCCTTACATCTTATTCTCATCTGATTCATCCACTTGTTAATTTTCGAATGGAAGATGTTTTACTAGAAGATGTTGAAGTTCATCCACTTAAAAGAAGATGTGGTGCAGGAAGGCCTCCGTCTTAGATCGGATTAAGTCGACTGGTGAGGTGAATAAGTCTAATCGATGTAGGTTATGTAAGAAATTAGGACATAACAAAAGGTCTTGTTTGTTAAGAAATCAAACGTAATTTTTATACATTATATGCTTTATGTTTTGAAGATTATTAATGTAATATCGTATTTTATTTGACTGAATTAAATATGTGTTCTTATTTTGTCTTATTAATCTATTTATTTCTCTCTTTTCGACTATAAGTTATTCTAGTAAATTTGTATGAATGAGAAGTATTAGAGGGTAAATATTTGTCCTGCTTATATTTGCCATTCAAATTTTAAGTAGCTTTGAGTCAGATACAGTTGGCTAATTTTCTCATTGGCTTTAAATGTCGGTTAAAACTGTCACTACTCAATCGTAAAAATGCAGTAATATTTTGACATGTTCCTTATATAATGAAGTGAGCGAGGCCAATAGAGATATTCTTCTAGTTAATATTATGGACATAATATAATGTGATGAAAAAAGGAAGATAATGTTGTGGGTGATACATTGATAGAGTTTTAGATCAAGTATTATTAATGGTGTTTGGGTAAAAATTAAAAAATATAAAAAAATGATGTGATTGGAAAAGACTCATTAGATCTTGGAAACAAATCTGGCAGAATCAGTTCTACAACATTTCAAACAAAACATTTCATTATTGATGTTATTGAATCGGTATTCTGGTATTTTGTAGAATAACAAATATCAAAGGGCAAATATTTGTCCGGCTTATACTTGTCATATGAATATTTAGTAGCTTTGAGTTTGATTTCAAGTTTCAGTAGTTAGTCTGTTTGTTTTTCTTTGTAAATCTCGCACTTAGTTCTGCATCATTTCGAACAAAAAATTTCAGTATTGATGTCCTTGAATCGGTATTATGATAATTTGTATAATAGCAAATATCAGAAGGAAAATATTTTTCAAGCAAATATTTGCCCGGCTTATAATTTCCATACAAATATTTAGTAGCTTTGAGTTTGATCTCAACCATCAGCAATTAGTCTATTTGTTTTTCTTTCTGTCTCAAAAATATATTTAGTAAGCTGTTTTAATATTTACTAAGCTATTTTAATATTTAGTAAGTTGTTTTAATATTTATGTAACATGTGTGCATTAGTCAGATACAGTTGATTAATCCTATTAGGTTAAAATTGTAACAACCTAGGATTTTGGTCATTTAATTTCGAATATTTGATTAATTTTAATTATTTAAAATATTGGGTTAAAAGCTTTAAAACTCGAATTAAATTATAGGATTGTTTAAAATCTTTGAATTGTGAATAATTATTTGAATTAAAATATGGGATTTTTTAAAAAAAAAATTGAAGTGTGAATAAAGAAAAATTGAATAATGATTTAAATGCTGAAATCATGGACTTATTATATGAATGATGATTTAAATATTTGGATTTTAAATTGAATATGGATTAAATGGACTTGTTTAACTCCTTTTTAATTATTAAATGTTATCAGTGAATTCCTTTGTAAGTTATTTACAGTAATAAATGGTTCAAATAAATAATCAAAAATTTTATTTTTATTTTTACTACTCGAATTCTATTGACGTATTTTTAATTTATTTTGTTGATTTTTCAATGATTTTTAATTGGGAAAATATTTAAGTTGTAGTTTGACGATTTTCGGCAAAAAACTATGATTTTGTGTTTTTTCGAAATTCAATAACCAGTGTATATTATTCTAGTTTTAGAGTAGCATCATTGTTCTAAGCGACCATACTTTTGTTTTGTCAATCGAAGTCCGTATGCAAACGGAATGCAGTGCCGTGAGATACCGATAATAACATTTAATATGTATATATGTATATATATGTATGTATGTATATGTATGTATGTATGTATATATATATATATATATATGTATGTATGTGGCTTAACTCAAACATTTCGTACAACAACTCGCCAACATGATTCCCTGTTTCTCTGCTCTTGTTTTACTTCACAGGGAGAATAAGAAAGTAGTGGCCGTATACTTTTAAAAATCAAAAATCAGAAGTTGTAATAAAAAGGAAAACTTGTATTTTTGGATCTAGAAAGTATATACCTTTAAGATGTAGTATTGTAGGAGGTTGCGATTGAGGCGTATGCAGTTCTACAATGATGTCAAGAGTGGTTATTTACTAGGATTGGCGATCGCTTTAGCTGTGGTCGATGGGAGGCCGTGAGGATGGACAGAATGGGTTCATGGTGGGGGCGCATATCTCTGGTCGGGCTCTGGTGACTTGCGGTGGCCTCTAGGGCGGTGCGACATTGTGGGGTTGTGTGCAAGCTTCGGTCGCGTTCAATCATAGGCATACAAGCTCAAAGTGGTGATGATGGAGTGATGGAGAATCCGAAGGCGAGTGCAGTAATGAAGTTGGTTTTGGATCTCGTTGAGAATGGGGGTGTGGCGGTGGAAGGAAGTTCGGCCATGTTGGTGGGTTTTGAGTTACAAGCAGAGGAGGGAGTTTTATTTTGGGGAAGATGGTTTATGTGGTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020255504.1	3.0e-65	protein FEZ-like
Swissprot	Q9ZVH0.1	9.9e-50	NAC domain-containing protein 9
trEMBL	A0A5P1F6X4	2.1e-65	NAC domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G26870.1	65.44	2e-48	190	ANAC009;FEZ	NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G03415	AT1G26870.1	136	44	2	4	138	74	207	65.44	2e-48	190
AfisC1G03415	AT5G39820.1	139	36	4	1	126	68	205	64.03	3e-48	189
AfisC1G03415	AT2G43000.1	112	35	2	3	114	68	170	60.71	1e-34	144

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02365.12	NAM	Family	8	80	42.7	7e-11

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0001666	P	response to hypoxia
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005992	P	trehalose biosynthetic process
GO:0006561	P	proline biosynthetic process
GO:0008361	P	regulation of cell size
GO:0009414	P	response to water deprivation
GO:0009416	P	response to light stimulus
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009611	P	response to wounding
GO:0009620	P	response to fungus
GO:0009718	P	anthocyanin-containing compound biosynthetic process
GO:0009733	P	response to auxin
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009744	P	response to sucrose
GO:0009751	P	response to salicylic acid
GO:0009825	P	multidimensional cell growth
GO:0009835	P	fruit ripening
GO:0009867	P	jasmonic acid mediated signaling pathway
GO:0009908	P	flower development
GO:0010120	P	camalexin biosynthetic process
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0019760	P	glucosinolate metabolic process
GO:0042538	P	hyperosmotic salinity response
GO:0042542	P	response to hydrogen peroxide
GO:0043424	F	protein histidine kinase binding
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0045770	P	positive regulation of asymmetric cell division
GO:0046982	F	protein heterodimerization activity
GO:0048103	P	somatic stem cell division
GO:0048829	P	root cap development
GO:0051091	P	positive regulation of sequence-specific DNA binding transcription factor activity
GO:1900056	P	negative regulation of leaf senescence
GO:1900057	P	positive regulation of leaf senescence

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network