result

Gene information

Detail information of AfisC1G03581

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G03581	chr1	670290843	670300274	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC1G03581
GTGTCCCCTCTATTATAACCTCCTTCCCGTATCAATACTATTATAATCAATATCTCAAAAAGCAAGAAAAAGAAGAAACCCATAGCATTAAAAAAAAATGCATATCAATGGAGTACTAACTGACTCCTCTATCGACCTCGCACTGCATATTGGCCTCCCTAACAACAACCCCTCATCTTCCATTTCAAACCAAGCCTCATATAATTCTCAAAGCCAAGGAAGTAGTTCTTACAATAATCTTCCATACATGGAAGCTGAAAGCTCTTTGAATCCACAACCAATAAGAGGGATTCCAGTTTACAAGTACATAAATAACAATTATGGGCTAGTTTATAAGTACATGAATAAGATTAGTGGGATTGGTCATAGTCAGCAGCAACATCATAATATGATGAGGTTCACATCAAGAGTGGCGGGGAAGAGGAGTATGAGAGCACCGAGGATGAGGTGGACCAGTGGTTTACATGCCAGATTTGTTCATGCTGTTGAGCTTCTTGGTGGTCATGATAGTAAGTTCTTTTTATCCTTTTTATTGTTTGTTGCATCATCAGATGAAACTATTTGTTTTTGCAGTTTAGGGTTTCCAATGAAATAATGAAATAGCCCTAATTTCTGTATGTCTAACATTTGGGGAAAGATGTTAACGTTCAGTGATTTGAGTGTGTAGATACGTTATTCATTTTTATCTCGTTGGTACAACTTTAATTTTTGTTTGAAGGTAGGTGCTGCTTCACTTCATTTTTGGCATCTTTTGTAGAAACCTAAAATTTCAACTTCATTGATATGTAATCTGATTGAATTCAGAAACCCTACTTGAATTGGGGGAATACATCTAGGTACATGAATTTTTAATTATTGAATTTTTAATTTTTAACTGTAGGGGCTACACCAAAATCAGTGTTGGAACTGATGGATGTGAAAGATCTTACACTAGCCCATGTCAAAAGCCATTTGCAGGTATTCTCTACAGTTTAAAAGTCTCTCTCTTTGTTTTTTCCACTACACATTAATTACTCCCGTTGTCCCTAAATTAAGTCTTTTTTAGGAAGTTAGAAAATGTAACTTTCGAAACACAATATTCAGTTCAATATTTAGAATGTATTTTTATTTCCGGATGATGTAACAAAAGTATACTTTGTGTAATCAGCTGTGTTCTTTATTTTTGTCTAAATAGTTACTAGATATGTACATTATTTTTATCTGCACCGAATACCGGTGTATTTCTTTAATTAATTATTATTATTTTTAATATTATTTATGTAAGAAAATATTGCAACGTACTCAAAGTTTAGACAGTCGGTCCTTTTCACTTTCATTCATGGCACAATAGCCAGTAATGATGCAGTAAATGAGATATGACTGGATGAATGGGCTGCATTTTCCAGACAAATACTGGCAAAAAAGCAGCCATCATTTCACAATAATGCTCTTCCCACCCAAAGGGACTCAAACCTATTTTTTTCAATAATAATCAAAGGCACTTCTTTTTTTTCTTCATGCTAACCTTGTTAAAAAATTTCATAAAATTTTACTCTTCCAAACATCAAACTTTTCAACGGACTAATAATGACGTATTTTCATTTTTTTTTGTTCGGTGAACAACCGTCAATCAACACTGTTTTACACGACGATCAATCATCAAACAACAGTAGTTCAGTGGTTAATAATCGTTGAAAACGGTGTTGAACGATGGTTGTTGGTCGTGCAAAATGACATTACGCGATGGTTGACTTTAGCATTGAGAAGCACACAAATTTTTTTGCTTTTTTTCTATGATATTAAAAAATGCGGAATTGGATGCCCTTAGCAAATTAAGAATCTTACCAATCCTCATTAAAATGTTAGTTTGTGTATTTATGAACTTACCTAGTTTTTCTAATTAACTTTTGCATTTTATTTTCCTATAGATGTACAGAACTGTAAAGACTACTGACAGGGCTGCAGCTTCTTCAGGTTTGCATATTATTTATTAATTACTCTCAAATTCAATTAATAAATAAATTGATGTCGAAACTTGTGATGATATGAACAATAACAATTCCATGTAATGAGTTTTAGTGTGCTTTAATTTGAAACAGATGGCTCCGGGGATGATGATTATTCTACAAGGTTTATTGATCAAGAAGGATTAAATGACAATTTAGATTATACTACATCCAAGACTAATGTAAATTCAACAAGATGGAGCAACTCATCAAGGTAACTAAATATTGATCATGTATATGTTTCCAAGAATAGATGTGCTTTGAACAAGGATTAGGCATAATAATAGATGCAGATGTTATTCCATATGTGGATCTTGTTCAAGTTTTGAAGAGAAGTAAAAACTAAAGAGAAAAGAATGACCTGCAAAATGAACAAGAGCAAAATTTAAATGTACTTTAATGTGTATACTAGGTAATAGGTAGTCAGGAGTGGCACACAATACCCGCTTAGAATGCACATTAAAAAAAAATACAGATTTCTCTTTTGATGATTCAAATCCTTTGGCTTTCGTGCATCATTACTCATCGGTACAAAATCATAGCTTAGTACAACTCATCAATTAAGTGTAAGTCGATTAATATATGTCTACAGTCCACTAATTAAGTGAAAAATAATGTTGAGCTGTCTCTAAAAAAAATGATTATCGTAACTCGATATATTTGTATCTTGGGCTTTCAACGAAGTAGCCGAAACCGAAAAATCCATCTGTATCCATATCCTAAATATGAAAATAACTTGATATCCGAAAAACGGATACAAATGCGAATATGAGCATATCCGTATCCGATAATTATACATCCGGTGTTTATCAAGATTATATTTTTTTTTTGTATTTTAGTACATGAATAACTGTCTTTACTATTTTATTTCGACAAATATTTTTTTAATGTATATAAAAATCAATATTTACTAGTTAACATTATTTTTCTGCCTGTATTTTATACTTTTTATATTTTTAGTATCGAAATGGACTTATAATAAATCAAAATTTTGTATTTAGTTGTTTAAATTTATTGGTTGTCAACTGGCCGAAGAATATTAGATAAACATCTGATATCCGTCCTCATCCACGGATATAAATATCCGTTATTTGAAAATGATTTCGGATACGGATACGACACTATCTGAATCTGTATCTGATCGTTTACAGGTCTATTTGTATCTAGCATCTATTCAGTGTTTTTATTTTGATATGATTCTACTACTAGTAAATACAATATTTTATGGCCTACAGTATGTTTGATATTTATTAGTACAAATAGATATTAGTACAATATGTAATTTCTCCGATATTTGGGTCGTTTATTGTCAATGCTCAAAATTAGTCACAATTTTGGCATCATGCCCTTGTTTTAAGAGCCTGGACACATATAACCAAAAGGCTAACCCTATCTGTTGACTTAAGTCTTCTTCCCATTTTGATTTACTGCATATTCTATTGTTTTGGTCGGACAGTGTATTGATATCTTGGAGTTCGATTTGTTTTTTTGCTATTAAACTGAAGTAATTCAGTATTTAATTTCATTGCATATTTGCATGGTTGATTGGATTAGATTCCAGCAATGTGTTTTTGACCTGACATGCTTCATGCATGTAATAAAAAGTTACTATATGCTTTTTTAATCACTGTCTCCACTGAATTCCCACTATTTTCACCTGGCATGCTTTTAAATCATTTCACAGTTTTACCAGTTCTTTTCTTTTGTTTTTAGTTTTTACCTTGTAAACAAAGCTAAGAGCGATTACTACATTAGTGCTCAAATGGTTAATATGAAAGTTTCAGTTTGCTTTTTATTCTTCATTCAGTTGTACACTCGTCCATATTTCAGCATATTTCTTTCTTTCTTGTGCAATTGATTTTCCTGTTTAGGGCGACTGGATTTAGTTTTTTCCTTCATGATTTATGATTAACAAATTATTTATTTCAGCAAAACTGCAGCATGGTTGCATACAAATTCAAACATCGACTTAGATGGGGCCAATCAAACATACATTTCATCCCGAAATTCCCAGGTGATTATTTACTAAACGAATTGATATTGGCATCCATTTGCATGCCTATACTATCCATTTAAACCGAATTCTTTTGACATCATTTTTGTCACCAAAAGTTGTATAATATCAGTATCAACAGTCTGAGAAATGACCAACTCCTTACCAGTTCACACCCCTTCTAGTTCTCTCTTCTTTGAATGCTCGCCCCTTTTCAATTCAAAGGTTGTGCAGTAGTAATAATAATAGCACGGGATTATCTGCATTTTGAATCGGGCTTAGAGACTGGCCTAGGTAATGGTGTGCGTCCATATTGTACATCCTTAAATGCATAATGGAGCACACCACGCCTATAGAGAAGAAGAATGTTATATACTACTAAATTTACATTTTCTTGATCAGTGTTTGAGCATTTTTGAAGGCCCCAATCAAGTATGAATTCCACAAGGAACACTGTCCCTAAGTCTTTAAGCTATTGCATGGCTTGGAGACTTTATCCTTGATCGCTTCATTCGACACATTCGTGGAGCCTTCTGATCTTCTGTATCACAAGGGAAAGGTGCTGCATTTAACGTACATATTGTGATCGTCGTGTTTACATAACTGTCGGAAGGATATGACATTTTCTTTAGGACTAGACAGCGCAGACTTCACTTTTGCCAAGATCCTTCAGCAAAAGGGATGCAAGTAGGGATAAGCGTTTGGTTGATTTGGTTTATCCGATGATGAAAATTGTTAAACCAACCTAAAACCAATAAAAATAAAAATCAAACCAAACCAACCAAATTAAGTTTGATTGGTTTGGTTGGTTATCCGATTTAACCGAAGTAGAAATATTTTACACTTTGCGTTTGGATTATTCATTGTAATTTCAAATAAAACATAAAAATATGATTAAAGTACTCTTATTTATCATTCTTATACTTTCTAAAAGTAATTTTGATACGTATATGATAAATAAAATTTGGTTTGATAATCTAAATAATTTATTATAAAATCAATAATTTTTAAAATATAATAAA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_022853841.1	2.1e-47	transcription repressor KAN1-like isoform X2
Swissprot	Q93WJ9.1	2.2e-41	Protein KANADI 1
trEMBL	A0A8S0U127	1.5e-47	Transcription repressor KAN1-like isoform X1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G16560.1	47.88	2e-47	186	KAN;KAN1	Homeodomain-like superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G03581	AT5G16560.1	259	105	10	42	279	151	400	47.88	2e-47	186
AfisC1G03581	AT1G32240.1	200	79	6	95	276	192	386	49.00	4e-39	158
AfisC1G03581	AT4G17695.1	241	114	6	60	278	91	319	38.59	4e-34	142

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	115	166	28.1	1.5e-06

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000719	P	photoreactive repair
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0003904	F	deoxyribodipyrimidine photo-lyase activity
GO:0005618	C	cell wall
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007623	P	circadian rhythm
GO:0009536	C	plastid
GO:0009555	P	pollen development
GO:0009650	P	UV protection
GO:0009944	P	polarity specification of adaxial/abaxial axis
GO:0009956	P	radial pattern formation
GO:0010051	P	xylem and phloem pattern formation
GO:0010158	P	abaxial cell fate specification
GO:0010229	P	inflorescence development
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0016036	P	cellular response to phosphate starvation
GO:0055063	P	sulfate ion homeostasis
GO:0071486	P	cellular response to high light intensity
GO:0080060	P	integument development
GO:1905392

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network