result

Gene information

Detail information of AfisC1G04197

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G04197	chr1	778356429	778380716	-

Sequences

CDS

>AfisC1G04197
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Protein

Gene

>AfisC1G04197
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020262629.1	2.6e-173	homeobox-leucine zipper protein ROC5-like
Swissprot	Q6EPF0.1	9.1e-163	Protein RICE OUTERMOST CELL-SPECIFIC 5
trEMBL	A0A5P1F9F4	1.9e-173	Homeobox-leucine zipper protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G00730.1	44.75	1e-158	557	AHDP;ANL2	Homeobox-leucine zipper family protein / lipid-binding START domain-containing protein

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Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G04197	AT4G00730.1	657	307	10	260	869	152	799	44.75	1e-158	557
AfisC1G04197	AT4G04890.1	663	333	12	260	866	80	733	39.97	2e-138	490
AfisC1G04197	AT1G05230.4	646	343	10	260	868	82	716	39.47	8e-137	484

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00046.26	Homeobox	Domain	260	298	39.3	3.8e-10
PF01852.16	START	Domain	398	613	148.9	1.2e-43

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009827	P	plant-type cell wall modification
GO:0009845	P	seed germination
GO:0009913	P	epidermal cell differentiation
GO:0010091	P	trichome branching
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0043481	P	anthocyanin accumulation in tissues in response to UV light
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0048497	P	maintenance of floral organ identity
GO:0048765	P	root hair cell differentiation
GO:0048825	P	cotyledon development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09338	HD-ZIP; homeobox-leucine zipper protein	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network