result

Gene information

Detail information of AfisC1G04724

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G04724	chr1	858650196	858661206	+

Sequences

CDS

>AfisC1G04724
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Protein

>AfisC1G04724
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Gene

>AfisC1G04724
TGCAGATTTCTTTGTTCTCTTTTGCCTCTATTTTCCTTCATCAATATTTTAATTGAATTAAAGCAAATATTTAATTGATAAATTAAAATTAAAGACAAGGTCCATATTTCAATATATAGAGGTAAAGGTAAGACAAGTTACATAACGATACCGGTCTCAACAAAACCACTCCTGGTTTTAAGAAACCATTTTCGGTTAATGTCTGGATCTGTGGTCATCACCTCTGAAATTGAAATTAGGGATTTGAGATTCAGATATATTTTGTGATAACTTACATTTTCTGCCCATTTCTTGGATTTGTGGACTTTGGATCTCAACAGAAAGAAAAACCAATTTGTAAGTCATACATAAACATAATCAGATTAAGATTCATTTATGTATATTGAATATTGGTTGCTGATCTATGATTTACTGTGGTCAGATTTTCTTTTGGAATCACTAATGGATTGAATATCAAATAATAGATACCTTGAAATTAAATTTTAGGTTTAGTAGAGATGGTTATATTCTAGATCTGATTTTGCAGTATGATTAATTAACTATGGCTATAGATGTCAGAAACTTGTAGCTAAGTTTATACAGTTAGGTTTTAGAATTTTATTTATTCCTTTATAATCTAATGAATCCAAGAATTAATTGCAGATTGTTTTGTATTTTGATTTAAAAGATTATTTCCCATTTTAGTTATGTATTTTTTGTTTGATGTGCTATTTTACGTTCAGGTGATGTTAGTGAAATCAGAATTGATTCTATGTTTGGTTTAGAAGTAAATGAAATCTAATTGAGAAAATGCTTAGATTGTGGCGAGGATGATGTTTAACAATAAATTGTCTATTGATGCAATTGGATATTAAAATGTTGATTAAGATCATTATGAATATCTGAAATGTACAGGCAGTATAAACTTCTCGTTCTAACATGATGAAATGTATCTTTGTGGTAAACATCTACCCCCCTACTAAAGTATGAAATGTATTTGTGTATCTTGAATAATATTGATATTATTATCTTTATATGCATGAGTAAATTTCCCCTTTACGTATTTTCTTAACATATGCTTTTGGGATTCACATATTACTGTAGATTGGTATACTATGAGCTTGAGCCACAGAGCGTCAATATGTGCAATCTTAGCATATAATTCTGCTATACTATATTGTTATAAGGTTTATAATGTTTATCAACAATTTTTAGAGCAAGAATTTGATAGGCTGCTTCTTCCATAGCTATTGAAAATAATTTAATTTGTTATATTGCTAATAGTTGCTCATACAAATTATGAGTAATGATATCATATGTCGTTAGTACCATTTTATGGGTTCTAAGTTTTGCGTAATGGAGCTGAGACTAAGATGAAGATTGAAATTGTTCTTTCTTTTAAATCAGTTATTTTGAGTGCTTTAACATGTCATTAATTATTCTTTTATATTATTATTGTTATTATCAATTGTTATTGTTATTTTATTATTAGTACTGTTGTTATTGTTGTTATAAAGAAGAAGATAATAATAATAATAATTTCAAATACATGCATCCGTCTTGGGTAGAACGCAATATAACGTAGAGATATACTGTGTTGAACAGACAACAAGAAAGGAGCTTGCACAGTTTAGTTTTCTTATGATTGGAGTTATGTTTTGCTTGTTCATCAAATTCTCTTTTCAAATAAAAAGAAAAAATCTTCATTTTTCATCAAATAAAAGTTGACTAGATTAGAGCAAAATGTTATGTAATTCTAATGTAGTGCTTTCTTCACATTTTGGTTATGTATGATTCTGTCTTTACTTTAAAGCATAAAAGCCACTACCAGCATGTTTTCTTCATGAATTGTTTATGGAGATTATATGGACAGAGTTGAAAAATTAGTAAATCAGAGCGGAAAATGCCATTGCAAATACAAGATGGTTGTTATACGAGTGGGAATTGGGCTATATATAGTTGAACAATAAATATTTGTAGGGTATAGACTTGACTTGATAGTAACTAACATGCTTTGTTTTCGTCAATGTTTTCCTTAGTTATAATGGGGACAGAATGCATTGAGGCTATGTTAGACGAATCTGAGGTTATTCTTTCAGTTCCACCTGGCTTTGGCCCGCTCACTACATTCACTTTACAAAGAGTTGAAGAAAATACCCCAACATCTACATCCACAGTTACATCTACCAGTACTTTTAATTCAATACAAACTCCAGTCGATGCTGAGGTGAGCACAAGCGATGCGGGAAGAATAAAGAAGTCACTTAGACATAGAACATGGGTGAATTATAAAGACGATGGCTATTCAGATGAAGATTTAGAATCCGAGTTGAATGAGCCAGTAGTTAGTGCTAATCCATTCTCTTTTTACATATGTTATTTATACTTATATTCAATTTTGCTTGACATATTTGTGTATTTTTTAGGTTAGACCAGTAAGAAAAAACTTGCCAAAAGGTGTGATACGTGGTTGTTTGGAATGCGACAATTGTCAGAAGGTTGGCTTGACGATTTATATGAATATGTTTCATTTGCTTTTTGGGTCGTCTTAATTTTATAACTGACTAGTCATTCACTGTGCAACTTGCAATTAACCACCTATTTGTTTTCATGAGTTGGGCCTTTAGCATGCTTGAAGGCATTTTGGATGTCAATTTTTTGGTTATTTCTACCTTGTTTTTTTGGAATGTGAGAATCTTCATAATGCTGGTTTGATGATATGTTTATGTTACTATTTTTATTCATTTATATATTTCATTTATGCAATTTAGTAAAAGTATCTGAATGATCATTCACCCATGTAGCTTCAGTTAATCATAAACTTGTTTTTTGACTAATGTGTTTAGGACATTAGAATGTCATTTTTTTAGTTGACAAGTCTTCAGTTGTATTGAACAACTTAATGTAATGAAGTGTGAATTTTGAGGTAGAAAACCTGTGCAGTATTGATCTGTGATATAAAAGCAATGCTGTATACTTTGTAAACCCAAATTAATGTTCGTGCATGTTATAACAGGTCACAGCAAAATGGCGTCCGGGGGATGCCTGCAGACCTGTTCTTGATGAAGCGCCAGTATTCTATCCTACTGAAGAGGTCTTTAAATTTGCCTTTGTTTTCTGTGTTATGCAATATGCTACTTTCTCATGCTTCTGAAAAGTTCTCTCTAATTATAAATTACATCGTCTGCAGGAGTTCAAAGATACTCTTAAATATATTGCACAGATTCGGCCAATGGCAGAACCTTATGGAATATGCAGAATTGTTCCACCAGCTTCCTGGAAGCCACCATGCCCTCTAAAAGAAAAGGATGTTTGGGAAAATTCAACATTTGCAACTCGCATCCAGAATGTGCACAAGCTTCAAAATCGTTATTCTGCAAAGAGATTATGCAACATGATGAAAAGAAAAAGGAGAAAGATTTCAAAAACTGAAACTGAATATGGAAATAGTAACGAAGACAACATGAATGCAAATGAACTTAGATTTGGTTTTGAACCTGGTCCAGACTTCACTTTAGAATCATTTCAGAATTATGCTAATGATTTCAAGAAGCAATATTTTCAATCAAATGACGGTGCACCACTGCCAGATAAAATTGAAGGTGAATATTGGAGGATTGTCGAGAATCCAACTGAAGAAATTGAGGTATTGTTCTGAGTTTATATTTGAAACCCATTTAGTTTGTTCTGTTTAGGCGGATGTTAATTTGTAATTTTGTAGCTCAATCTGATATATAATCTGCATTTCTATGTTAAGTATGATTTTTATGCATGTTTATTTTCGTTTATTTTATAGTTTTGGATTTGGTCAACTTTCTTCTGTCTTAAGTATAACACATCGCCTGCGTGCACACACATATCATACATTTCTTGTATGCCCATAAACATGAGTTTGTTGTCTAGGCTCATTAATTTGGAAAACAGAGAATAAAGTTGCTTCACTTTTATGCGAACATCAATATAATCCCTAAATTTTACATGTTACCGACAGCGATGAGCTACCTAGCTTTACATGGGCTCAGTTTTGGAATTTATAGCGAATTAGTTGTTAATTTTATAGGTTCTCTATGGTGCTGATTTGGAAACTGGAGAATTTGGAAGTGGATTTCCCAAAACATCATCTGAATCAGAGGAAGATCCATATGTCAAGTCAGGATGGAATCTAAATAACTTTCCTCGGCTTCCAGGTTCCATTCTCTCCTTTGAAAGTGGAGACATATCTGGAGTAGTAGTTCCTTGGTTGTACGTAGGAATGTGTTTCTCGTCATTTTGTTGGGTAAGTAAACTGTGATTTTTTTCCTGCTAAAATTATTGAATCTGTGAACTTATGTGTAGTTATGTAATTAGCACGTAGAAGACCACCATCTTTTTTCGCTAAATTATTTGCACTGGGGAGATCAAAAGGTATGGTATGGAGTTCCTGGAAAAGATGCCTTAAAGTTGGAGGGAGCTATGAAGAAACATTTACCACATTTATTTGAAGAACAACCGGACTTACTTCATAATCTTGTAAGTGATTTTGCATGCTCGCACATGCTATCATGAATTTTTCCGATTAGCAATGATTAGCAGAAAATTGGTCCGTTACCATCAGACACTTTGGATTTGTCAGACGCTAACTGTCAAATTTCCATTTATCCCCCTAAACACCACACCCCATCTCCTTTATACTAATTAATTAAAAAGTAATCACTAATAACAATAATTATTACAACACAAATCTCTTTCCAATTCTCCTTTTACAACACAAAGCACATACTCCTTCCACTGAACTTTCTCTTTTTCAGCTCCTTTCAAATACCCCTTTCCTCAGTCCCTTCTGTTTCGTCAAGTACGCACCCTAATTCTATTTTGAGCTCTAGGAATTTAAATCTCAAGCATGTTTTTCGTTTACTACTGTGCCATTTCAAGTGCTTTAATTTGTACAGTATTGAAATGTAATCTTGTACTCATAATCACATCTATTTATGTATGCAAGTTGCAATTAACTTATTAGTTACAACGACATTTTTCGATGTTGC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Functional annotation

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nr	XP_020247178.1	0.0e+00	lysine-specific demethylase JMJ703 isoform X3
Swissprot	Q53WJ1.1	2.1e-303	Protein JUMONJI 703
trEMBL	A0A6I9QDA4	0.0e+00	lysine-specific demethylase JMJ18

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G08620.1	58.32	0.0	777	PKDM7D	Transcription factor jumonji (jmj) family protein / zinc finger (C5HC2 type) family protein

>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g173576.t1
Allium fistulosum	AfisC1G04724
Allium sativum	Asa7G04147.1
Arabidopsis thaliana	AT1G08620.1; AT1G08620.2
Oryza sativa	LOC_Os05g10770.1

Pfam domain

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PF05965.11	FYRC	Family	1016	1104	73.2	1.3e-20

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0043970	P	histone H3-K9 acetylation
GO:0043992	F	histone acetyltransferase activity (H3-K9 specific)
GO:0045475	P	locomotor rhythm
GO:0045814	P	negative regulation of gene expression, epigenetic
GO:0046425	P	regulation of JAK-STAT cascade
GO:0048573	P	photoperiodism, flowering
GO:0048581	P	negative regulation of post-embryonic development
GO:0060444	P	branching involved in mammary gland duct morphogenesis
GO:0060763	P	mammary duct terminal end bud growth
GO:0061038	P	uterus morphogenesis
GO:0070193	P	synaptonemal complex organization
GO:0070822	C	Sin3-type complex
GO:2000242	P	negative regulation of reproductive process
GO:2000737	P	negative regulation of stem cell differentiation
GO:2000864	P	regulation of estradiol secretion

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K11446	KDM5, JARID1; [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase	EC:1.14.11.67	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network