result

Gene information

Detail information of AfisC1G04928

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G04928	chr1	895893078	895896820	-

Sequences

CDS

>AfisC1G04928
ATGAAGAAGTGGACAATGAATAATATTCCACTTTCTTTTACTTTAATTTTTGGCATTAACTTGATTGTGCTTGCAAATGGAAGAAACACACCATTACACTCTCCATTTTATGCTCCTCTTCAGTCTCCCACTCTCAAATTTACGGGATCGCCTTCTCAAGAAATCCAGACAATTGTAGTATATAAGCACCACCATTTAGGAAAAGAATTGATCTTGGCAATTGCACTATCTTTAGCTGCATTTGCTCTGATTGTTGTATCTGTGCTGATAACCTGTTTACTCTGGCGACATAACCAATATAATGCTAATTGCAAGAAGAACAAAAGCTTAGATTCAACTAGTAAAGGAATCACATTAGCCCCAATTTTGGCCAAATTCAATTCATTCAAAATGGTTGGAAGAAAATTTTCTCTCGCCATGGTTGAATATCATATGTTAGAATCAGCAACTGATAATTTTAGTCAGAGTAATCTTTTGGGTTCAGGAAGAATTGGGTATGTATATAAAGCTTGCTTTATTGGAGGTGTTCAAGCAGCTGTAAAAAAACTAAATGGCAGTAAACAAGGCAGTGAAAAAGAATTTGAGAATGAGATAGATGTTCTAGGAAAGGTTCAACATCCGAATATAATTAACTTATTGGGTTATTCAGTCTATGGAGATATGAGATTTCTTGTTTATGAATTCATGGAAAATGGATCTCTTGAAACACAATTACATGGACCATCTCAGGGCTCTAAATTAAGCTGGCACATTAGGATGAAAATTGCACTGGATGCTGCAAGAGGACTAGAGCATCTTCATGAGCACTGCAATTTAATCCATAGAAACTTGAAATCATCCAATATTCTTCTGGATTCGAAATTCAATGCCAAGATATCAGATTTTGGTCTTTCGGTGATTGGAGGGAACCAGAACAAATCGAACATCAAACTCTCAGACACACTTGGTTATGTAGCTCCTGAATATCTTCTTGATGGTAAATTTACGGAGAAAAGTGATGTATATGCCTTCGGAGTGATTCTTCTTGAGCTTCTCATGGGAAGAAAACCAGTTGAAAAACTGGCACCTTCTCAATGCCAAACTATAGTCACTTGGGCGATGCCTCAGCTTACCGATCGATCAAAGCTTCCTAGCATTATAGATCCAGCAATTAGAAACACAATGGACTTGAAACATCTATACCAAGTTGCAGCTGTTGCTGTTCTCTGCGTTCAACCTGAACCTAGCTATCGGCCTCTAATAACCGATGTTCTTCACTCTTTTATACCATTGGTGCCTACAGAGCTTGGAGGGATGCTTAAAGTTTCTAATTGA

Protein

Gene

>AfisC1G04928
TGAGCTCGTTTATTGTCTCTTTTACAGAAATTCAATTCTTTTATTAAATAGAATATTCAACTTGCTCAACAAATTATATTAAACCAATTTGACTAGCTTTCGCCTACAGTCTTTTGCTATTACTTATCCGGGTCATAACTTCTGTGCAACCGCCACATGATGCGATCTCTCTCTTTTCTGTTCAAAAGTTCTCATGTTTTCCGTGGAACTGTCTCTGTCCTTTCTTCTTAATTATGACATAAAATCATATTTAATGCTCATATGTATTAATTATTCATCAAATAAGAAGTAGAAACAAACCCAGAGATCTCACTCTGTTACATTGGATCTCTCTAAAGAAGATGAAGAAGTGGACAATGAATAATATTCCACTTTCTTTTACTTTAATTTTTGGCATTAACTTGATTGTGCTTGCAAATGGAAGAAACACACCATTACACTCTCCATTTTATGCTCCTCTTCAGTCTCCCACTCTCAAATTTACGGGATCGCCTTCTCAAGGTACCATTTTTATGAGAAAAGATCGATCATTTATGATTTTTATTCGAGGGTGCTTTATGGGGTTTCTTGGTTTTTTGTTTCTACAAGATTTTAAGTTACCAAAACTTGATCTAGTTGTATTTAAAATTGCATAACCTTTGCTGCTTTAATCTTTTCTCATAAAAGTTCCATGGGCTGTGTTTATGTATGATTTTAGTGGTGAAAGTGCGATCTTTTTGTTAGTTTGCTACTGTATTTGGCTGAGGTTTTACATGCAGTTATGATGCTCAAGAAAATTTCTTACATTTTGTCTGCATTTAATCGATTTCAGAAATCCAGACAATTGTAGTATATAAGCACCACCATTTAGGAAAAGAATTGATCTTGGCAATTGCACTATCTTTAGCTGCATTTGCTCTGATTGTTGTATCTGTGCTGATAACCTGTTTACTCTGGCGACATAACCAATATAATGCTAATTGCAAGAAGAACAAAAGCTTAGGTATGTATTCTATTTACTTGGTTTATATATCCTATATAATTTTCTATTTGAATTTGTTGTGAGATCATATTACTTAAGTATGCAGATTCAACTAGTAAAGGAATCACATTAGCCCCAATTTTGGCCAAATTCAATTCATTCAAAATGGTTGGAAGAAAATTTTCTCTCGCCATGGTTGAATATCATATGTTAGAATCAGCAACTGATAATTTTAGTCAGAGTAATCTTTTGGGTTCAGGAAGAATTGGGTATGTATATAAAGCTTGCTTTATTGGAGGTGTTCAAGCAGCTGTAAAAAAACTAAATGGCAGTAAACAAGGCAGTGAAAAAGAATTTGAGGTGAATAACTTGCAATCTGATTATAATCTCTTCTAGTTATGATGAAGACCTCATATTTGATCAGTCCAGTTTGCATCTAAATATTCATTTAGAGCCCGTTTAACAATTTCTTATTTCATATCTCCATAGAAGAAGTTTTGAAAAACAACCTTTTAGTAGTTTTGATCGAATATTAATAATTGAAAGTGCTTGGATGAGTTTGACTATTAAGTTAAAATGATTTAATTTTACTATTTTGATATTATGATTTATAGGTAAAGAATGTGTACCAAATTACATAATTGAACATATTATGATGAATATTAAATGGTAGCATTTACTTGTAAGTCATTTGAATAAGAAGACCATTTTAGTTATTTATTTGGTTAAAATATTCCACATTTGCACTATAATAAGTTGTGCTTGAATTTCTATTGCAGAATGAGATAGATGTTCTAGGAAAGGTTCAACATCCGAATATAATTAACTTATTGGGTTATTCAGTCTATGGAGATATGAGATTTCTTGTTTATGAATTCATGGAAAATGGATCTCTTGAAACACAATTACATGGTATGTATGTGCTATCTATTCAATTCAAGATATACAAATAGGAGTAAAGCTGGTAGTATTCAAAGTTGATGTTGATATGTAGGACCATCTCAGGGCTCTAAATTAAGCTGGCACATTAGGATGAAAATTGCACTGGATGCTGCAAGGTAATCAATCACATTCATTTCTTAATAATAAGATGTTGACTTTGTTTTAATAATTTTTAACAACTAAATATTTAATATGGTAGAGGACTAGAGCATCTTCATGAGCACTGCAATTTAATCCATAGAAACTTGAAATCATCCAATATTCTTCTGGATTCGAAATTCAATGCCAAGGTAAAAAGCTACCTTTTGCTTGGTTATTTTTTTCCTCCTTCACATTTATAACATTTGTGGAATCACTGACTATATTGTCATTTCTATTGTGTACTCAATAAAGATATCAGATTTTGGTCTTTCGGTGATTGGAGGGAACCAGAACAAATCGAACATCAAACTCTCAGACACACTTGGTTATGTAGCTCCTGAATATCTTCTTGATGGTGATTGTTTTATTTCATAACTTCAAATTCAGTACTCAATGTAAAATACTGAAAAAATAAAATAAAATGCATGATAGGTAAATTTACGGAGAAAAGTGATGTATATGCCTTCGGAGTGATTCTTCTTGAGCTTCTCATGGGAAGAAAACCAGTTGAAAAACTGGCACCTTCTCAATGCCAAACTATAGTCACTTGGGTATGCAAAATTCCAACTTTTTATTTAATAATTTCAGCACTTGAAAGGTCTCTATAAGAATCTGTTTTACAATGTAGAAGGTTTTTTATTTGATTAGTAAAAGTTCAGCTCATTAGCTGTATGTATGCAGGCTTTTATTCCCAAGGATTTTTATATTTTACCTTGTGCTTCAATTTAATGTTTCTAATCAAAACATATATAAGAAGCTTCTTATAGTGTTTTTCTCTATCATATTTTCAGGCGATGCCTCAGCTTACCGATCGATCAAAGCTTCCTAGCATTATAGATCCAGCAATTAGAAACACAATGGACTTGAAACATCTATACCAAGTTAGTTTCTTGCTTGTATATACATTCTCCATTTGATTTATTCTCCCTATGGGTATTTATGTCGTCCTTTTTGTATGTCACTACTGAAAATGATATTATATCAACAAATCACTATTTTGAAAGCGAGTTGAGAAGTGACAAGCGAAAAGTTCCGGTTCTGAAACAACTTATATTGAAACTTCTTAAAAAGAGTTTTGAATAATAACTTCTAAACAGTTTTAAATAGCGATTTATAAGTAAAACTGTTTGGATGCAATTTGACTTTTAAGTTAAAATTAGTAAACTAATTTGTTTAAACTAGTTATAAAATATGTCCACAAGTCATTAACAACAAATTGTTTTTCTCATACTGCTTTTGGAGTTTAGGAATGAAGCTCGATTTTATGATTCTTGAAAACATATAAATAGACCGTTATGTTACTGTTTATAGGTTGCAGCTGTTGCTGTTCTCTGCGTTCAACCTGAACCTAGCTATCGGCCTCTAATAACCGATGTTCTTCACTCTTTTATACCATTGGTGCCTACAGAGCTTGGAGGGATGCTTAAAGTTTCTAATTGAAACTAATCAAAGGATTGATATTTATAGTTGTATATGAGAGCATTTACTGTGTATTTTTGATAGAATTCAAGCTCATTTTTCTCTGAATTTACGTGTTGAATATAAAATTGTTAAAAGAGAAATGATTTGTTAAAGGGGTATTGAATTATAAGGAAAAAAACGTAATAAAGGTGAGAATGTACAAGGGGAGAAACATTGGGCTTGGAGGACAGGCCTCTACTAATTATCTATGCATAACAAAATTGCTTTGTGATGACTA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ONK70408.1	2.8e-171	uncharacterized protein A4U43_C05F33400
Swissprot	Q0V7T5.1	1.7e-104	Probable receptor-like protein kinase At1g80640
trEMBL	A0A5P1EWD5	2.0e-171	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G11020.1	56.71	2e-122	436		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G04928	AT5G11020.1	395	156	5	47	435	39	424	56.71	2e-122	436
AfisC1G04928	AT2G25220.1	424	181	7	19	436	2	413	53.07	2e-119	426
AfisC1G04928	AT4G32000.2	421	167	7	19	435	17	414	53.92	4e-119	424

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	156	415	157.5	3.4e-46

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009941	C	chloroplast envelope
GO:0010068	P	protoderm histogenesis
GO:0010183	P	pollen tube guidance
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048367	P	shoot system development
GO:0090404	C	pollen tube tip
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway
GO:1905393

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network