result

Gene information

Detail information of AfisC1G05099

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G05099	chr1	928400990	928406962	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC1G05099
ATGAATGTAAGGTATAATATTTGACGAATGTTTTGAATAATAAAAACGGGTCTTATATTTACCTCTACATCATCCTGTAAAAATAAACATGTAAGCACGTGAAATCTAAAGTGAGCATTAACAATCGATTAACATTTATTTCGTTCATAAAAATATTATTTAAACTGAGATTTGTAGATCCTTCAAACCATAATTTACTTTGTTAGTGAAACATTTGTTCTTTTCACATTTACTGCACGTTTTCCAAGATCGTATATTATATGGTGAATCTATTAAATTTGATATTTCAGTAGCTTTTTTTGTAAGCAATTGATTGTATGAAGGCAATTGATCGTATGAAGGTCATTAGCAATTTGATATTTCCAAAAAATGCTTGCACTGTGCTCTTTGAGTGTATTTTTTGAACAATGCGTCTGTGCTCAAAAGTCTTTCAATTACATATCAGTTTAAATAATAATATATCTACCTTTATTTATATCCATTAAAATTTCCCAAGTTCTAGCGATTGAGAAGCCATTTTAACAATTTCCGTGTTTTATTACTTACCAACTATTAGGTTGATTGAATGTCTGAACTCTATGTATGAATAGGCCTTGCATTCTATAATTATGGTGGACAAAGATGAAACTAGGGAGAGTAAATTCTCAGTTTGAATTCTCAGTTTGAAAAATATCTACACTTTTATGGAGACATGTAATGTTTGGTGGCTGTAGCTACAATATCAACTAAAATTATGGAACTTGTATATTTAAGCGTGATGTTTTCATAGTCTCTATTTTTTTCCTTTAGATTTTTCGATGCCATTTTACATTTTGTTTTTATTTCTTTGCTTATGCTTTGTTTAAGCTTACATTTTATTATTTACTCCTTTACACATTCATGATTTAATTGTCACCTGCTATGTTTGGTAACACGTTAATAATCTACAATGTTACTCACTGTTCTATTACTGATTTCCCCCCTTCATTTTTGATTTGCAGAATAGGTACTGAACACGAAAAGTTCGGTTTTCAAATCAACACATTGCGGCCAATGACATATGAGCAGATTGCATATTTGTTAAATGGTATTGCAGAGAGGTTTCACTGGGAGAAAGTTATGGAAGGAGATTATGTTATTGGACTTAAGCAGGTGAGTATTCCATGCCTGTTGATTCAGTAATTATGTTCGAAAATAGGTAATACGTTTCTTCTTTTGGTCACTGTATATATGAGCTAATTATTCATATGAACAACCTGCTTTAATTTACCATTGACTTTGGTTCAATATTCTATGTTTTACCAACCTTACTTTTGTTGGCATATATGTAGCTCGGAAACTATTTCCAGTGAAGTCGCTTTTAGCTAAGCCTTTTGGTTTATTTTTATACAACACATCAAATTATTGTAACTATGGTGATTGAGAATTCTTACTACCTACTAATTCAAAATTAAACATGGAGGATATTTTTAATTCACAATTACTTTCCACAGATTGTTCAGTTTCTCTACATTCCTGTGACACAGAATTAAGTAGTTTTTACTGTTTGAGCAGGGGAAACAAAGCATCTCACTAGAACCTGGTGGCCAGTTTGAGCTTAGTGGTGCACCCCTCGAGACACTACATCAGACATGTGCAGAAGTTAATTCACATTTATACCAGGTTCATGCTATAGCTATAAACTTCTCTGTTTTTTTTCTTGTTCTGCTAATTGTGGTGTTGAGAATAGTGAATATTGCATCGATCAAGTTACAAACAATTAGCGTGACAAATATGTGATTTGTAGCAAGTCAGGGCTAATCTATTTGCTTGCTAGAATGGTGTTGAGAGTAATGAATATTGTGTTGATAAAGTTACAACTAACTTGATATATATGTGATTTGTGGTAAGTCGTGTCTTCTCCATTTTCTTCCTAGAATGACTTTGGCCGTGTGATAGAAGCCGTGGATTCTTTTAAGGTATTCAATGGATTATTCAATGATACTCTAGGAATATTATATAATGACGGTGAACATTAGAATCGAAGATTAACATGTCATATTTTTGACTAAGATATAACATAGCAATTTTCCTGAAGATATCCTTGACAAATATATAAGTCACACAATGTTACAAACTTTATAATTTTTTTTATCTCTTGTTTTTTTTAGTAGGGTAAAAATTTGTCTGGACATGCTACATGTTTTAATATTTTGGAGATAGACTATGCATGAGTCCGTACTGGGTAGAAAATTCGTGGCTGTCTAATTGTCATTATATCGCTGAAAGCTATGTTTTAGCTAAATAAAGAATGGGAAAATGGATGATGTTCACATGTTCATAAAAGGTTCGACATATATGCTTGTGTCTTTAGGTTTGAACCGATCATAATTTTCAAATTATGCATGCAATACATAGCTTTTATTTGTAAATTTGTATAAGTGTTCTATATTCAGCAGGGCAAAAATACTAAAATTGTACAATTGTTCAATAGGTAAAAGCGGTCGCTGAGGAAATGAGAATTGGCTTCCTAGGAGCTGGTTATCAACCAAAATGGGGTTTGAAGGACCTACCGATAATGACAAAGGTACTTTATTTTGTCAAATATTACCGTTGTAAAGCCATTATCTACACCACTCATATTTAATCCTCTGCCAACTGCCTAGTGCTGTTAGTTATTGTAGTTTTGTGTTTATCTCTTTAATCTCAAACTAATTGCTCCGTGATTTGAATTATGATATTTGGTCCTAGTACAATAATTACTGTGACCAATAGTCTATTATTTCATGTCTCAATTGTTTTTGTAAAAAAAAAACCCCTCTTTTTCGACAATCAATTGCATTGTTTTAAAACGCGAAAGTGTACATGAGGTATTTTCAGGTCCATAAGTTGAGGCATAAACCTCGAAACGCTGAGACGTAAGCTTTTCAAGTTAAACTAAAATGTAAAACATATATTGAAATTTGACATTTTAAAATTAACCTAGGCCTTTAGACGGTCGGATACGGATTCAGATAGTGCTAAATCTGTATTCGTATCCGAAATCATTTTCGGATATCTGTATTCGTGGATGCGGACGTATACTGGATATTTTTCGGATATTCTTCGATCGATTCATAACTAATAAATCTAAATAAATAAATATAAATTTTTGATTCATTATAAATCCATTTCAGTATTAAATATAAAAATAATAGTAAATACGCTAAGAAAAATAATTTTAAGCAGCAAATATTGATTTTTATACGCATATTGAATTTTTTACCTAGATAAACTAGTAAATGACAATCATTTTATGTACTAAAATACATAAAAATATAACTATAATCTTGATAAAAACAACCGGACGGATAATTATTGAATGTGAATATGACCATATCTGCATCCTTATCCATTTTTCAAATATTGGATAATTTTTCATATTTGGGATACAGATTCCGGATTTTTGGTGTACTCATTGACAAACCTAAATTAACCTATGCAAAAAATGAAGAACAAATCATTGAGGAATGATTCTGAACATGCATACATATCTATATAAAAAAATGATTAAAAATAAATAACTGGAATTTGTATGATTTTAGTTTCGATTCTGCTAAATTTATTTGGAGATTCGCAAAATTCCAGTTTTGATTTCTTCCTATTCAAATTGATCTAGAAAATTTATTTGGAGATTCAATGAATTCTATTAAGAATTTTTTTTAAATAACAATGAGAAAATTCATTACATAGTTCTTGATCATTGTTTCAGAAACATTCTTACTTAGTTATGTCAATGTTGAAATTAAAAAGTTAAAAAACATTCACCTTCGTTTTCTCAATTTTGTTATTTTTGTTTTCCATTAAATAACTGAAGTTTAATAACTTTTGTTAGTGTCAATATTTGCAATTAATGGTAAAAAGATTCTTGACTCGCATGCCTCAACAGTTTGAGACGTGTGAGGTGTACGCTTTATATGCTTCAAATTATTGTGAGATGTAAGTTTTAGAGGTAAAAAATCTTTTGAGAAAAGCCTCGAGACATTTTATCTCTCATTTCATCGAGACGCTCCTTGATGTGAGTTTTTTTAAAACAATTATCAGTAGTGCCTGTGCTAACTGTTAAAAAATTATTCAAATAGGGGCGGTACGAGATTATGAGGAATTATATGCCAAAAGTTGGTTCCATGGGACTTGATATGATGTTTCGGACATGTACAGTTCAGGTAATAACTTATTTTTTAAATTAGTTGTAAAGATAAATCAGCTTTTTCTCTCAATCTCCTTGCATGAATCCATGAGATACATATTCTAGAATTTAGTAGATTCAGCCCTTTTATGCCATTAGGTTAATCTCGATTTCAGTTCCGAATCAGATATGGTTAGGAAATTTCGAGCTGATCTTTCTCTACAGCCTGTGAGTACATGCTTTACATTCTCCACTTCCAAATTCTATGTTTGTTTTCCCTTCATCAAACCATTGAATGTCATGTGAACAGATTGCAACAGCAATATTTGCAAATTCACCATTTACCGAAGGAAAACCAAATGGATTTCTTAGCAAGAGAAGGTTGCTTGCATTTTCTGTTTGCTAGCATGCATTATGTTTAATATTAACCTCCACAGCTCTAAATGTCTTTTTCGGTCAATTTCTGCAGCCATATCTGGACAGACACCGATAATAATCGTTCTGGAATGCTTCCATTTGTTTTCGAGGACTCATTTGGGTATGACCATCTCATATGCATTATGCGCGCGCACGTGTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTAATACAAATGCATATGACAAAAACATCTGCTTAGTATGCAGTCACATGTAAACATTAATAATTACATATGAGATAATCAATGCTAAGATATGTTTAGTATAATGTTTGTGTCATTTGTGGATATACTCTTTTCAACAATAAATGCTGAACACAATATAATCCCATTTTCTGACATTACATATTAGATATTCCATTTCCATTTTTTAAAGAAGAAGATGACTCCACTTTCATGGTAGCTTGTCTAAGTTATTTATTTTATTCTTGAAATAGTAAATGATCAGTCAATAAAGTTGAGATATAGTTTGCTTAAACACATATCAGCTGTAAATAAAACCTCATATCAATGTATTATGTCGTTTTCATAGTGAGCAACATCCGATATATAGAAAAATGAATGTAAAATTAAGGACAGTTTAAATTGAAAACAGTTGGTTGTCGAGCCATTGGTAAACCAATGTCCTTCAAAAGTATTAACATAAAATTCTACAAATGGCAGTGGTGCATTGTTTTGATAAATTTCACGAGGTGAGGTTAGATTATATTGGTAGAAAAATATGAAATTTTGTACTTTATTGTATTCTATGTGGCCCCCATCAGACTGCAAATATTATTAGCCAGTGAATATCGGTATAATGATCATTTATTTTGTGGAATGTGTTGATATATGTTGACTTAAAATACGTAGAAAATGAATGGAAGACTACCAGTAAAGTAAGGCCTCTAGAAGGTGGATCTTATTTAGTTCTTTGATTTGATAACACCACAAAAAAGTCATTTTACCATCTTCAAAATCATCCTGCATTGCCGAATTGAAATTTTAATATCAAGCTTGATATGTTAATTGTTACTTCTTTCATACAACACCAAGTGTCATGAAGGGTGCATTTGGAAAAAAAACATCAGTTGCTACACAAATTTTTACTTTCTATTTTCTTGGGCACTATCATGTAACTGACAATATGATTATCAGTGAATATGAGTTTTATGATAATTCTTTTATCTTTCAGGTTTGAACAATATGTGGACTATGCTCTGGATGTTCCGATGTATTTTGTCTACCGAAACAAGAAATATATTGATTGCTCTGGACTCTCTTTCAGGGTCCGTATCTGTACTAAATCCCTTCACTGCTTATATGATGAGTTTATATTGTTGATATAATGCTACTGGTATTTTGAACTTATAGGATTTCATGAAAGGAAAAACTTTCACCTGTTCCTGGGGAGTTACCAACACTAAATGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	AAL61610.1	6.3e-142	gamma-glutamylcysteine synthetase
Swissprot	Q1W2L8.2	3.2e-135	Gamma-glutamylcysteine synthetase
trEMBL	Q8W1X9	4.5e-142	Glutamate--cysteine ligase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G23100.1	84.58	4e-132	467	ATECS1;AtGSH1;CAD2;GSH1;GSHA;PAD2;RML1	glutamate-cysteine ligase

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G05099	AT4G23100.2	253	39	4	256	109	361	84.58	4e-132	467
AfisC1G05099	AT4G23100.3	253	39	4	256	109	361	84.58	4e-132	467
AfisC1G05099	AT4G23100.1	253	39	4	256	109	361	84.58	4e-132	467

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF04107.10	GCS2	Family	25	256	236.8	2.8e-70

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0002213	P	defense response to insect
GO:0050832	P	defense response to fungus
GO:0005739	C	mitochondrion
GO:0004357	F	glutamate-cysteine ligase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0006750	P	glutathione biosynthetic process
GO:0009408	P	response to heat
GO:0009570	C	chloroplast stroma
GO:0009700	P	indole phytoalexin biosynthetic process
GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009908	P	flower development
GO:0019761	P	glucosinolate biosynthetic process
GO:0046686	P	response to cadmium ion
GO:0052544	P	defense response by callose deposition in cell wall

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K01919	gshA; glutamate--cysteine ligase	EC:6.3.2.2	Cysteine and methionine metabolism	ko00270
K01919	gshA; glutamate--cysteine ligase	EC:6.3.2.2	Glutathione metabolism	ko00480

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network