result

Gene information

Detail information of AfisC1G05604

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G05604	chr1	1031572632	1031578755	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC1G05604
GCAGCGGTCCGCTTGCCTCCCAAACCAAACGCCTCTTTCTGTTAACTCTTCCTGTTTCTTTTCGCGCTTCTTACGAAGCGGTGACCTCATCGTATGGCCTCAGCGGAGGAGAATACCGCATCAACAAACTTAGTAGCTCCTACAAAATCGCCGCAACCGCCGAACCAATCAGCTGCTTCCACGTCACAGGCCGACTCTTCGGTGGCCATATCGCCGTACCCCGCCGTCTACTACCCTAGCGGCACTCCTCCCTTTTATCCTCCTCCCATGTGGGGCCCTCAGGTCTCTCTCTTGTACACTAATTTACCTCAATTGTATTCGCTTCCTTCAAATTAACTGTAATTGTTGGATTTGCAACTAGAATATTTTACGTCATACCTCTAGAGTTGAATTCGGGGCAAATTACCGTATTCCTATTTTTGGATCGAGTTTATCTCCTCACGTGTGTTTACCTAAGTGAAAATGTCTCCAATAGATTGTCTGTAAACGATAGCGTTTGTTAAAATATGTTATTTGGTTGATCCAACTGGCTGCAATTTTATTATTCATGCTTTATATACTGATGATTTGGATTTTGCAATGTTTTGTAGCAAATGATGTCGCCATATGGGACGCCGATTCCATACTCTTCGATGTACCATCCTGTGTATGCACACCCTAACGTGGCAATGGTGGGGTTTACATAGTATGTTAGAAAAGTGGATTTAATTGAAGTTTGCTTTTAATTATATTAATACGTAATGAATATGCAGGTTTCAGGTTACCCAGCAGCTGAAGTGAGTGGGAAACCGAAGGGAGATGGAGGTAAAGGCACATCTGGATCGGCTGGTGAATATGGGTCTCATAGGCGAGTGTTTAGAATAGAGTGATCTTTGGTTTGAATTTCAAGTATTTTTTGAATTAATGGAAACAAATAAACTAGCATATATGTGCAATGTAATGTCTGTCAATAAATATACAAAAAATTTGAAAATCGCGTTCGCATTGAAAATTTGTATGTGTTCAAAATTCAAAAAACACACATATTTTATATCCAAATGATTTTCGGATATGGGTGCAGATAATGGTACATGATTTGAAAAATTATGGTTAGAATACTGCAATTTCTTCTTCTTCAAAAACTGCATTTTAAGAAAAAAAAAACTGCAATCTTTTATTGAAAACTTCAATTTTTAGATGATGAGCTGCAATTTCATATGAATTTTTTTGGATCACTGCACATTTCGATTTTTGAATAGTTTTTTAAGATATCTGAAAATTTCCTGTAAATATCCGATGTTACAGATACATATATGAATTTTCAGATATCTGGAATTCTGGATATAGATAGGGATTAGGATGTAGTTTCTGATTTGTAGATTCAAGTATAGATACAACATTGTCAGTCTCCGCCCACATCGGTGACAGGCATAGTAATCATTCATTATATCTTGATCAAACTAGGTTCCCCCTTTGAAGTATGAGTTTGCACTATACTTTAGTACATGGTACATAACTATATGATGTCTTAAAGTTTATAACTCTATTAAACCGCTTCCTTTCAAGATACTTTGTCATAAGTTTCAATATGTAAATATTAAGAACTTTGGCTGCCTTGTTGGTGCACCATTGTAATAACGACAAGCACCCAATGCTGCATCTGACCATTTCACTACACTTGATGTATTCATACTAGCAAGTAGTTGAACTACCGCTCTGTGCACTTTCTGTGAGTTCTTAGCTTATTTTGTGTAATGGATGCAGTGGTGGTGAGAGTGGCAGCAATGGTTCATTTAATTCAAGAGACAATGGGAATGAATCACAGGTGTGTGATAATTTCAGATTAATAATTATGAAGGTATATCTACAGATTGGATTAGTGTAGCTTGGGTTCCATCACTTCGGGTTGGGGTTGTCAAATATTTGATATGGGAATTTGGTGACAATGTTGACATAGCATCCTACATAGGGACTTTAAATGTCATGACCTTCAGTTTAAGAGTGCATTTTCAGACATAGCAGTGAGTGAACCGTGGTTCAGTGAATATGTTTTTTGATAAGTTGGACTGTGCTAGAAGTCTAAATGTGAATTTGGATGTAAATATGTAGGAACTCAATTTGAAATTCATCATTTAAAGACAAAAACTTACCTTAGGGTAAAAGCTTACATTAAGGATATGGACTCAATAAGAAGTGAACAGTTAAAAAAAGTTTCACATTGCTAAACCAATAAAAGATGCATATTTTTTTACATCAAATCATTTGTTCGTAGTCTGAGCCCTTTTGGACATACAATTGGTTGTATGTTGTGGACAGAATGAATGAAATTAAACCCACAAGTCATGCACCACTGCTGTCGGTTGACTGAACAGTCGGTCGGTTGATCAATTTTTAAATGGTGGAAAATGTTTGTTTTTCTACATTTTCCTCTACCTTTTCTCTAAACTAAGAAAAAACTATTTTAAAAAAAAAGTGCATTTCAAAAGATTATGGCAGATGCCCTTCCTTTGTGTTGGATATAAGTTCTTGTACCACTGTTCATTTCCATTGCTTGGTCAGTACATCACAAACTGTGACTTGACTCTTACATCCAATGTGCAATTTCTGACGTCTAATGTGGAACAGATTGAACACAATGGTACTGCATTACTTATGCCATTTTATCAAACTGTACCTTCTTAGAAATTTGTGGAACCTCGACAAGTTTGATAGATATCATCACTGATTAGCTATTGTTGGCATGTGTGTTGTTACTAACCTATTCAGTCTACACTGTCTTGAATGATTATCAGTGAGACAAAAATCTAACTAAGGTGTTAAGCTCAATACTAAGTCAACACCCAAAGATATGCTTTATTTAGTGGAACTGTACATTACTCATGTTGGCTTTGCTTATTATAATTAGGATGCTGCTCACAAAAGAACATTGGATGAGGCATTCCCAGAAGGTAACTTTGGTATTATGTTAAAAATACACAATCTTTATATTACCTGAAGCTATAACAAACAGTGCCAAGATGATTAATTTCTCTTATTTTCCCTCTACAGGGGAAGCTGCAGATCCCAGTAAAGATGCTCAAAACAATGGTATTAGTGCTGAATCATATTATAGTGGGAGAAGGCAAAGAACTGTGTCAAAACTCCCGGTTTCAGCTCCTGGGAGAGCAACTTTACCTGTTGCTCAGTCCAATTTGAATATGACTATGAACACATGGAGCGGTCAGCACATGCCTAGGGTCAGAGAAAACACTAAATTGCACTACATTTTCTTTTCATGACAGCTTGATACAGATTTAAGTGCTACTATTGATGTTTTATGTTCCATCATCTTTTTAATATATTCAATGTTCTACTATTCAGGATGAGAAAGAATTGAAGAGAGAGCGAAGAAAGCAATCAAACAGAGAGTCAGCCCGAAGATCGAGAATGCGTAAACAGGTATTGACTTTCTGAAATCTTGCCTAAAATTTTCGTTGTACTGCATCGACTGTACATGCATTGGTATGTACAACATTAAACCTTACTAAGCTTTAGTATGGCGACAGACATATGTTTTTCCTGAAATATAGCCTAAAATAGGGTTTTGAAATATGTGATAAAAATAAAATATGATCATCACACAAAAAGGATAAAGACTTGATGGGCCAGGTCACTTCGTCATTAAGGCTTGCATCAAAATAATGTAGCCATGCAATTTTTGTGTCTGTGTGCTAGTCCTAAAGCCACTTCTATACTAACATGCTTAGCAACAGTAAATTTATGTAGAAATTTATATATTTAAACCTCACCTTGCAAGAAATAGATGTTTGTTTCCATGATTTTGGGATAGAAGAGGATTCTTTCTCTTAATGGTTACTTGGTTGCTCTTACAATTCATATTAGATAGAATGTAGTGTGGCTTGTCATTCTTCATCCATTTTACTATTTGTTAAAGTCGAAGATTTACGGCTATTTGGATAGGCTATTCTTCTTCTTCGTCTTTTTTTTTGGGGTTAGTTAAATGATTTTCATGGGATGATCAAGGGTTCCGAACTTATTAATTGTACAGGCATCTAAAAAAAGGAGGGAAAAAAAGTAAACCCTAGCCATGTATGCATCAACTTTTCAAGTTCTATATTGCTTACTGCATTGAAATAAAACATTTTTTGTAGGTTGCTGCTTTTCATCTTTATCCATTAATTTAATTTCCACTTCTGTTATTTTTCACGTTGTTACCAGCAAGAATGCGATGACTTGGCAAAGAAGGTAAATGAACTGAGCAGCGAGAATATTGCACTCAAAAGTGAGGTGGAACAACTGACCAAACTTTGCAAGGACCTTGAAGCAGAGAATGTGTTGCTTATGGTTAGTTACCCATTTCTTTTTATATTAGTAAAAGAATCATTGGTTCCTGTTTTTTATGTTAGTATAAAAAAGGTTCATGGAGCAATGTATGAATATATAAATTTGCACTTTTTAGATAGAAAACACTAGTTGACTTGCACTTTTCAGAATTTTTTCAAATAAAAATACACGTAAATAACAATTATAACTACTCACGAACAGAGAAATTCGATTCTTTTTATTTTTAAAAACTTTTCGGAAAACATAAGTTAATTTGCACTTTCAATCAGAAAATTGCAAACTAGTTTGTGCTTTCTGGTTTGGAAAGGTTTGGAAAAATCAGACACCTGATTTACAGAATCGTTGATACAAGGACTTATTATATCTAAATCAAAAATAGGGGTCTGATGTGCAAAACCCCTCATTATATTCCATTTTTCTTAATGTTTTACCCATTGTTTAAGATGCCGGCCGGAACGTTGGAATTCCGACCATTCCGGTCCGGTTCTAACTTTAAACGGGCCGTAATTCCCCAAAATCCCGTTTTGGTCACAAATCAAACACTCAATTTACCTGTACAGGCAGTGCAACGGCATAAACAATAGAATTAGAGGAAGGCTTGAAAAGGCATGTGCCATGGACCATCTTGATATAGTGGCAACAAACAAAAATTGGGATTTTGTAGGGTTTATAAACAAGTTTTATTTGGTGAAAGAGAATGGAATCGGAACTAAAATCAGGGATTGCTCAGAAGTTGATTTGCGTTTTTTTTTTCATTTAGTTCTTGGGCTTTTGTTATATCTGGGTAGAGAAACTGTTTTTCATTTGGTTTTTGGGCTTTTGTTATATCTGAGTAGTGAAACATAAAATTGAGATTTGTTTATTTTTTGACTTGCTAAATTACAATTATATGAAACTGCATGTCCACTTCCAATTATAATTATTATACTGTTTATATAAATTTATAGTATTTATTGGGGTATTTATAAACAAAAAATTCTGAAACACTTTGAAATTCAGCACTGGAGCTATAATGGAATTTCCAAAATTTGATAATTGAAAATGACTGGAACGAAAATTGGAATTTTGAACCTTGGTTTTACCTTGAGATGGTCTTTAATAGTTTTGTCCATGGATTTGCTGCTACAAGTAAAGATAAATTTAATGTCAGATAACAATTTCAAATTTACCGAAATTATCAATAGAGTATAAAACACAAAATAACAGTAAAAGCATAAATGTCATAAACTCTTTAACACAAACTCCCTATTTATTTATTTACCAATTTACTGTGTTATTCCATGTTATTGATGATGATTTTCTGCTTTTCTTAAAACAGGAAGACGTGAAGCGCGTGGCTATGACCAGCTAAAATATTTTCGAATCCTAAGCAGTCATCTGTGAATTCTTCTAAAACAGCATCTCCTACATTTTGTTAGAGAACGGCAGTTTCGATCAAGACAACATAAAAATTTGCTTTCGCTGATTTTGAATCATTAACCTATGGTCTATCCTTCACAAGTATGCTTATGTTAATATATGTTTAAACATGGGAGGGTTATCTATTTTAGTTTTATTTAGATTTTTTAAAACCCTTGCATATTACGCTAGGCAAATGTGATGGGTTATATACTACTAAATAGTTGAAGCTAGTTAACGAGTATTTTATGTTGATACAAGTTTTATATCAAAGTGTTATGTCTGCGATTATACTAGTATAAGTTTTATATTGAGGTGTTATGTCTAAGATATTGTTGTTTTGCTGTAAATGAAATATGATGGAAAATTTCAAATGCTTGTGTAGCTTCAAACTCCGTGTTTG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020256629.1	1.9e-27	DNA-binding protein EMBP-1-like
trEMBL	A0A5P1FBN3	1.4e-27	BZIP domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G36730.2	37.76	2e-34	142	AtGBF1;GBF1	G-box binding factor 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G05604	AT4G36730.2	294	121	14	37	293	22	290	37.76	2e-34	142
AfisC1G05604	AT4G36730.1	294	122	14	37	293	22	292	38.10	9e-34	140
AfisC1G05604	AT1G32150.1	323	121	14	38	286	54	358	34.06	1e-26	117

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07777.8	MFMR	Family	1	88	35.8	7.7e-09
PF00170.18	bZIP_1	Family	221	283	69.5	1.8e-19

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0042802	F	identical protein binding
GO:0009637	P	response to blue light
GO:0019760	P	glucosinolate metabolic process
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09060	GBF; plant G-box-binding factor	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network