result

Gene information

Detail information of AfisC1G05772

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G05772	chr1	1061596447	1061600163	+

Sequences

CDS

>AfisC1G05772
ATGCACTGCCGCCTATACATGGATCCTTGGTTTGAAGGTAGTGTGAATGGTTTCACCAAAGTCAAGTTGAGGATGGGTTTTGTGGGTTTTGAGTATTTGGCTATCGGGTTTCGGGTATTGGTTATCGGATTTGATTTAGTGGGTTTTGATTTAGTGGGTATGGGGGATGTTGAAGGTATGATGGTCGGCAGTAGTCTGGGGTTTAATGTGTGGATGGATGAGCTGTTTGAAGTGTTTGGGCAGTGGTTGTTTTGGAGCAGCATAGAAAAATTTGCAGAACTGAGTACATCAACGGGCCAGTTATGGTTTGAAATTACTAAAGTAGTTAATGTTCCAGAAAGGGGAGCAAGGAAGCATCTTCGTGGTGACAACATACAGGCTATACCATTCTGCAACTGTATAATTGGATTTGAACCAAAATCGCTTGATGAATGGCTTGAGAGTGATTACACACAAGGCTGTAAGAGAAAGAGTCAGTTGCAATGTGGTTTTAATAGAAGCCATTTAGAAGTAGACAGGTATCTTCCCATGGATGACATTAGGTTACCTGATAACCAACTAAGGTTAAACGTTGATGATATTTCAGATTGCAAGAACTATTGTTTGAGCAATTGCTCGTGCAGTGCTTACTACATAGCTGATAATTCAAACTGCTCTTTTTGGGTCGGAGACTTGCTTAATCTTGAAGATCAATATGCATCTGACAAGTCGGGCAGTGGAAATTTCTTCCTCCGTCTTGCAGCATCAGAACTTCCTGATCCTAAGACAAAAAATTCTAGGAAAGCAACAGTCATAATCATGGTGAGCATTGCTGGTGGAGTGCTGCTATCAGCCTATGTAGTTTGTTTTTTATGGAAAATGAAGAAAATAATTAGAAGAATAAAAATAAGAATTACCTTAGAAGCAACTTCTGGGTCCAATGAACATTCAACTAATGGACAAAGGGAAGACAATATCGAACTTGCTTTGTTTGAAGTTAGCACCATTGTTACCGCTACAAATTACTTCTCTGCAGCTAACAAGCTTGGAGTAGGTGGATTTGGACCAGTGTACAAGGGAATTCTTGGACCCGATCAAGAGATAGCTGTGAAAAGACTCTCCAAAGCATCCATGCAAGGAGTGGAGGAGTTCAAAAATGAGGTTACGCTTATTGCTAAACTTCAACATAGAAATCTTGTTCGGCTTCATGGTTGCTGCATTCACAGAGAAGAGAGGATGTTAATATATGAGTACATGCCAAACAAAAGTTTAGATGCTTTTCTTTTTGGTGTTGAAAGTGCAGAAGGCAAGCAGAATTGA

Protein

Gene

>AfisC1G05772
ATGCACTGCCGCCTATACATGGATCCTTGGTTTGAAGGTGAAACTCATTGTGTTAGGTTGGAGTTGCTGCCTCACTTAGCTGCACCTATCCTACGTTTTGAGATTAGATCGAATGGCACCAGATCCAAATCACTGAACTCGCCTCGTTTGTAAATCGAAGGTAGTGTGAATGGTTTCACCAAAGTCAAGTTGAGGATGGGTTTTGTGGGTTTTGAGTATTTGGCTATCGGGTTTCGGGTATTGGTTATCGGATTTGATTTAGTGGGTTTTGATTTAGTGGGTATGGGGGATGTTGAAGGTATGATGGTCGGCAGTAGTCTGGGGTTTAATGTGTGGATGGATGAGCTGTTTGAAGTGTTTGGGCAGTGGTTGTTTTGGTAAGAACATTAAGATATGTTTATTTTTACAGTGACAGAAAGAATGCTATTAATGCAATGGACCTTCAATTGGATTTGTTTTTCATTTATTTTTGACATAGTTATTTTTTGGGAAGTGGAAATATGGAGTTGCAGCACTTTTTCTTACTAAAATTATGGAAATATGGAAATATGCACTTGCTTCTTAGATTGTTTCGATTTTTACAGGTTTTGTAAGTGACTTTGATAAAATAGTGGAAGTGCCTGTGGAAAATGGAGAATAGAGAAGAGGAGTGCTATGAGTAGAATACTGCACAGATTTCAGCATTGTTGTTAGCTGAGGTTAAAACTCGAGTGGTGAAGAATGAGCATATGTATGGTTTTTATATATAGAAACTATTAGCAAGGTATGGCATTTTCAATTTTGAATTTTCTTCTATCTTTATCATATCCTTTTTTTTGTTCACATAAAATGGTGTGGTGAAGAATGAGCATGCCTTTTATTTTCTTTGTAACTTTGGTGTCGTACACTTTGAATAGTATTGGTCACATGGAAATATTAAATTTGTTTGCCTTTCCGTCGTATCATTCCATGGTTAGGTCATATGCAGTCGCAGATAGGAAATATTAAAATTGGAGTGCTTGTAATATCAAGGTTGAAGTTTTTTTTTACTGTGAGGGTTTTTCCATCCTTTCTAAATATAGATATAGATGCAAGATAACTTTAACAAAACTAAATGGCTTCGCTTATTACGACAGTACATAGACTATATGTTGGATGGATGATGTTGTGATATGAAAAGGGGTAATGACGTATCTAAATCATTTTTTGGAAATGTAACCATTACTTAACAAAATATAGGAGCAGCATAGAAAAATTTGCAGAACTGAGTACATCAACGGGCCAGTTATGGTTTGAAATTACTAAAGTAATTACTTAAAGGCTTTGACTGAGTTCAGTTTTCATCTCTTGCCTCCTTTGCATATTCATATCTTTTGCTTTTCATTCTCGCCAGCAACTTTTTCATCATGATCTTATGTTAAATCAAAACGTATTATACTATATATAGCTACTTTGATTAATAAACTCCCAGTTAAACTCTGTTGATCTCTCTATACATGACACCAAACTGTCTTAATTTCTCCAAGTTCATTCATTTCTCTATTATTGTATTTGCCAAATCCTCTTGTTTTCATAGAATGTTATGAGGATTTTCCTGATTCAATTGTTCGTTACAGGATGACACATTAATTAGTTATACTTTACTTTTTCCCTAACTAATTTCTGCTAATGGGGTTACCTCTTTGTATTTTGGAGAGCCCTGATACCCTAATGTTCTTTTACGTAACTGTTTATTTCAAAATAATGACATTTGAATCTTATTTGTTTATTTGATCAGGTAGTTAATGTTCCAGAAAGGGGAGCAAGGAAGCATCTTCGTGGTGACAACATACAGGTAACAATCTCCAAGTTCCTGTATTCGTTTGGTTGTTAAAAATTTATGTGATTTTTCTTCTTCTTCTTCTTATCATCATGATCATCTTCCTGTATTCGTTTGGTTGGGTCATTGACAATAGAATAATATTATCTATGGACATTATTGGTTTGGTTGTCAACTAATTCTAGTTTGTTTGTTAACCTACTTTCTGATTTAGATAATAAATTATTTATGTGTCCTATACTTGATATATTACTTAAAGTGGTTCAAAGCAAGCCCCAATTCTTCTATTAACATCAGAGTTATAAAGTTACTATATAGATGTCCCACATACTCACTAAATACTTCAAACATAAACAATTTACGTAAAGTGGATTCCGATTGTTAATAAAATAAATATAGTGACAGAGCTGATGAGGTTCTGAAGCAGTTAGTTGCCAGTGATGTGGCTGTAGAGGAAGACATGTGAGTGATTACACACAAGGCTATACCATTCTGCAACTGTATAATTGGATTTGAACCAAAATCGCTTGATGAATGGCTTGAGAGTGATTACACACAAGGCTGTAAGAGAAAGAGTCAGTTGCAATGTGGTTTTAATAGAAGCCATTTAGAAGTAGACAGGTATCTTCCCATGGATGACATTAGGTTACCTGATAACCAACTAAGGTTAAACGTTGATGATATTTCAGATTGCAAGAACTATTGTTTGAGCAATTGCTCGTGCAGTGCTTACTACATAGCTGATAATTCAAACTGCTCTTTTTGGGTCGGAGACTTGCTTAATCTTGAAGATCAATATGCATCTGACAAGTCGGGCAGTGGAAATTTCTTCCTCCGTCTTGCAGCATCAGAACTTCCTGATCCTAAGACAAAAAATTGTATTTTCATATTACCTATAATAAAATGTTTTGGGTACCATAGTTTATGACATTGATACTCGGCTAACACAACTGCAACTCATAGCTAGGAAAGCAACAGTCATAATCATGGTGAGCATTGCTGGTGGAGTGCTGCTATCAGCCTATGTAGTTTGTTTTTTATGGAAAATGAAGAAAATAATTAGAAGAATAAAAATAAGAAGTATGTACATCCTTGTGATATTTTCATGATTGAATGCAATGTAATATGAATAGACTCGTACATAATATATGATAATAACTATTACATTGCCAATGCAGTTACCTTAGAAGCAACTTCTGGGTCCAATGAACATTCAACTAATGGACAAAGGGAAGACAATATCGAACTTGCTTTGTTTGAAGTTAGCACCATTGTTACCGCTACAAATTACTTCTCTGCAGCTAACAAGCTTGGAGTAGGTGGATTTGGACCAGTGTACAAGGTAAATATTGCTTTTGATATGCTTCTAAATATTGCTGGAAAATGTGAAATCTTGTTCTTTAGGGAATTCTTGGACCCGATCAAGAGATAGCTGTGAAAAGACTCTCCAAAGCATCCATGCAAGGAGTGGAGGAGTTCAAAAATGAGGTTACGCTTATTGCTAAACTTCAACATAGAAATCTTGTTCGGCTTCATGGTTGCTGCATTCACAGAGAAGAGAGGATGTTAATATATGAGTACATGCCAAACAAAAGTTTAGATGCTTTTCTTTTTGGTACGTCCAGGCATAAATCTAGCAAACCTGCACAGTACAAATATCCATTCCTACAATATTTTGACTCAAACTAGACTTAACTGTATAACTTGATAAATATCTTTTATTCACATTGAATATATTTAATTACAGTAACGATATTTACTTCTGCAAATATGTCACATTGAATATATTTAATTACAGTAATGATATTTACTTCTGCAGTGTGGTGTTGAACTGTAGGGTAGTAGTGGGAATGTTGGATTGTTGTTCTCTGGTGAAATGTGTTGCAGGTGTTGAAAGTGCAGAAGGCAAGCAGAATTGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	TQD76391.1	3.9e-69	hypothetical protein C1H46_038065
Swissprot	O81906.1	6.7e-58	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase B120
trEMBL	A0A540KQ96	2.8e-69	Receptor-like serine/threonine-protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G21390.1	41.99	7e-60	228	B120	S-locus lectin protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G05772	AT4G21390.1	312	147	7	130	422	319	615	41.99	7e-60	228
AfisC1G05772	AT1G11330.1	308	146	9	129	422	316	608	43.18	6e-58	221
AfisC1G05772	AT1G11330.2	310	146	9	129	422	316	610	42.90	1e-57	221

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08276.8	PAN_2	Domain	171	227	50.5	1.5e-13
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	339	421	59.2	3.2e-16

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005773	C	vacuole
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009875	P	pollen-pistil interaction
GO:0031625	F	ubiquitin protein ligase binding
GO:0032497	P	detection of lipopolysaccharide
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0052033	P	pathogen-associated molecular pattern dependent induction by symbiont of host innate immune response
GO:0071215	P	cellular response to abscisic acid stimulus

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network